Labeo rohita (rohu): 127157925
Help
Entry
127157925 CDS
T09007
Name
(RefSeq) deleted in malignant brain tumors 1 protein isoform X1
KO
K13912
deleted in malignant brain tumors 1 protein
Organism
lroh
Labeo rohita (rohu)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SRCR
Ig_2
Ig_3
ig
Ig_C19orf38
Bact_surface_Ig-like
SRCR_2
TM_ErbB1
EphA2_TM
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
127157925
NCBI-ProteinID:
XP_050957056
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1190 aa
AA seq
DB search
MPTLSLTSTHAVVSHGENIQFRCTTPKPRCNANAEFQLFGNGLSVSSQTHVSSVTFNHNV
DVSHQGSYSCQYSYQNNIKSPYSNTVNITVVNLQQPNISHSAPDGQFVVGSQGPVITRGH
SFTIICSTESQYPGGSFHLFRGSSITRSESAVNHSSSFSFPEADYSHEGTYSCVYEVSVS
SRSFRSSASELLLITITGLRLVSGSDSCCGRVEIRYNGQWGTVCDDNWDMNDTAVVCRQL
QCGSAISAPQSAAFGQGSGSIWLDDVGCSGSEGTLTQCSHRGLGRHNCNHGEDAGVVCSG
ELRMPTLSLTSTHAVVSHGENIQFRCTTPKPRCNANAEFQLFGNGLSVSSQTHVSSVTFN
HNVDVSHQGSYSCQYSYQNNIKSPYSNTVNITVVNLQQPNISHSAPDGQFVVGSHGPVIT
RGHSFTIICSTESQYPGGSFHLFRGSSITRSESAVNHSSSFSFPEADYSHEGTYSCVYEV
SVSSRSFRSSASELLLITITDLRLVSGSDLCCGRVEIRYNGQWGTVCDDNWDMNDAAVVC
RQLQCGSAISAPQSAAFGQGSGSIWLDDVECSGSEGTLTQCSHRGLGRHNCNHDKDAGVV
CSGELQMPTLSLTSTHAVVSHGENIQFRCTTPKPRCNANAEFQLFRNGLSVSSQTHVSSV
TFNHNVDVSHQGSYSCQYSYQNNIKSPYSNTVNITVVNLQQPNISHSAPDGQFVVGSQGP
VITRGHSFTIICSTESQYPGGSFHLFRGSSITRSESAVNHSSSFSFPEADYSHEGNYSCV
YEVSVSSRSFRSSASELLLITITDLRLVSGSDLCCGRVEIRYNGQWGTVCDDNWDMNDAA
VVCRQLQCGSAISAPQSAAFGQGSGSIWLDDVECSGSEGTLTQCSHRGLGKHDCNHGKDA
GVVCSGELQMPTLSLTSTHAVVSRGENIQFRCTTPKPRCNANAEFQLFQNGLSVSSQKHV
SSVTFNHNIDISHQGSYSCQYSYQNNIKSPLSNTVNFTVVNLQQPSISHSAPDGQFVVGS
QGPVITRGHSFTIICSTESQYPGGSFHLFRGSNITRSESAVNHSSSFSFPEADYSHEGNY
SCVYEVSVSSRSFRSSASELLLITITGSLLPVIGSAVSAVLLLLSVLIIILLLKRRQKQR
NKECLSKCSFTKGAANTYAGASHDNKNKEDDKAGYENVELREYMDHDDLY
NT seq
3573 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgccgaccctttccctgacctccacacatgcagttgtttctcatggagaaaatatccag
ttcagatgcacaacacctaaaccaagatgcaatgctaatgctgaattccagctctttgga
aatggtttatctgtatcctcccagacacatgtatctagtgtgactttcaaccataatgta
gacgtttcacatcaaggcagctacagctgtcaatactcctaccaaaacaacatcaagtca
ccttatagcaacactgttaatatcactgtggtgaacttgcagcagcccaacatttcccac
agtgctcctgatggacagtttgtcgtggggtctcaggggccagtgatcaccaggggccac
agtttcactatcatctgttccactgaatctcagtatcctggaggctcttttcacctgttc
agagggtcaagcatcaccaggagtgagtcagctgtcaatcactcctcctccttctccttt
cctgaggcagattattcacatgagggaacatatagttgtgtttatgaagtcagtgtctcc
tcacgctccttccgttcatctgcctctgaactgctgctcatcactatcacaggtctgaga
ttggtcagtggttctgattcatgctgtggaagagtggagatccgttataatggccagtgg
ggaaccgtgtgtgatgataactgggacatgaatgatactgctgtggtgtgcagacagtta
cagtgtggatcagccatcagtgcacctcaaagtgccgcttttggtcaaggcagtggatcg
atctggctggatgatgttggatgctcaggaagtgaaggaaccctcacacaatgttcacac
cgtggattaggaagacataactgtaatcatggtgaagatgctggtgttgtttgttcaggt
gagctgcggatgccgaccctttccctgacctccacacatgcagttgtttctcatggagaa
aatatccagttcagatgcacaacacctaaaccaagatgcaatgctaatgctgaattccag
ctcttcggaaatggtttatctgtatcctcccagacacatgtatctagtgtgactttcaac
cataatgtagacgtttcacatcaaggcagctacagctgtcaatactcctaccaaaacaac
atcaagtcaccttatagcaacactgttaatatcactgtggtgaacttgcagcagcccaac
atttcccacagtgctcctgatggacagtttgtcgtggggtctcatgggccagtgatcacc
aggggccacagtttcactatcatctgttccactgaatctcagtatcctggaggctctttt
cacctgttcagagggtcaagcatcaccaggagtgagtcagctgtcaatcactcctcctcc
ttctcctttcctgaggcagattattcacatgagggaacatatagttgtgtttatgaagtc
agtgtctcctcacgctccttccgttcatctgcctctgaactgctgctcatcactatcaca
gatctgagattggtcagtggttctgatttatgctgtggaagagtggagatccgttataat
ggccagtggggaaccgtgtgtgatgataactgggacatgaatgatgctgctgtggtgtgc
agacagttacagtgtggatcagccatcagtgcacctcaaagtgccgcttttggtcaaggc
agtggatcgatctggctggatgatgttgaatgctcaggaagtgaaggaaccctcacacaa
tgttcacaccgtggattaggaagacataactgtaatcatgataaagatgctggtgttgtt
tgttcaggtgagctgcagatgccgaccctttccctgacctccacacatgcagttgtttct
catggagaaaatatccagttcagatgcacaacacctaaaccaagatgcaatgctaatgct
gaattccagctcttcagaaatggtttatctgtatcctcccagacacatgtatctagtgtg
actttcaaccataatgtagacgtttcacatcaaggcagctacagctgtcaatactcctac
caaaacaacatcaagtcaccttatagcaacactgttaatatcactgtggtgaacttgcag
cagcccaacatttcccacagtgctcctgatggacagtttgtcgtggggtctcaggggcca
gtgatcaccaggggccacagtttcactatcatctgttccactgaatctcagtatcctgga
ggctcttttcacctgttcagagggtcaagcatcaccaggagtgagtcagctgtcaatcac
tcctcctccttctcctttcctgaggcagattattcacatgagggaaactacagttgtgtt
tatgaagtcagtgtctcctcacgctccttccgttcatctgcctctgaactgctgctcatc
actatcacagatctgagattggtcagtggttctgatttatgctgtggaagagtggagatc
cgttataatggccagtggggaaccgtgtgtgatgataactgggacatgaatgatgctgct
gtggtgtgcagacagttacagtgtggatcagccatcagtgcacctcaaagtgccgctttt
ggtcaaggcagtggatcgatctggctggatgatgttgaatgctcaggaagtgaaggaacc
ctcacacaatgttcacaccgtggattaggaaaacatgactgtaatcatggtaaagatgct
ggtgttgtttgttcaggtgagctgcagatgccgaccctttccctgacctccacacatgca
gttgtttctcgtggagaaaatatccagttcagatgcacaacacctaaaccaagatgtaat
gctaatgctgaattccagctcttccaaaatggtttatctgtatcctcccagaaacatgta
tctagtgtgactttcaaccataatatagacatttcacatcaaggcagttacagctgtcaa
tactcctaccaaaacaacatcaagtcacctttgagcaacactgtcaacttcactgtggtg
aacttgcagcagcccagcatttcccacagtgctcctgatggacagtttgtcgtggggtct
caggggccagtgatcaccaggggccacagtttcactatcatctgttccactgaatctcag
tatcctggaggctcttttcacctgttcagagggtcaaacatcaccaggagtgagtcagct
gtcaatcactcctcctccttctcctttcctgaggcagattattcacatgagggaaactac
agttgtgtttatgaagtcagtgtctcctcacgctccttccgttcatctgcctctgaactg
ctgctcatcactatcacaggctccctgcttcctgtaatcggttctgcagtgtcagctgtg
ctgctcttgttgtctgtcctcataatcatcctcctgctgaagagaagacaaaagcaaaga
aacaaggaatgtctttcgaagtgctcttttactaagggtgcagctaacacatatgcaggt
gcatcccatgataacaaaaataaagaagatgataaggctggttatgaaaatgtagaactt
cgtgaatacatggatcatgatgatttatattaa
DBGET
integrated database retrieval system
