KEGG   Labeo rohita (rohu): 127160704
Entry
127160704         CDS       T09007                                 
Symbol
si:dkey-14d8.21
Name
(RefSeq) LOW QUALITY PROTEIN: deleted in malignant brain tumors 1 protein
  KO
K13912  deleted in malignant brain tumors 1 protein
Organism
lroh  Labeo rohita (rohu)
SSDB
Motif
Pfam: SRCR SRCR_2 Lectin_C Hepsin-SRCR
Other DBs
NCBI-GeneID: 127160704
NCBI-ProteinID: XP_050959317
LinkDB
Position
Unknown
AA seq 1938 aa
MLYFFCFILLLDSVENAAVSKITVTSEVPVRLVDGSNACSGRVEIYKDSEWGTICDEGLD
DVEGNLVCYEAGCGPLISIQPSAYFGEGSGTLLTDDLNCFGNESSVLDCIWGNHTDVCDH
MRDAGVICDSTFRLQGGSGMCSGRVEIFHNRQWGTVCDTTWDLLDSTVVCKELGCGSPIA
VYYNAYFGKGTGPVWMDGVSCTGRESLLEDCAFSGWGVTTCTHADDAGVTCLEFMLADGL
NTCSGRVEVLYEHFGWGTVSANGWNLLGGDVICRQMDCGSALSVNGESAFGKGSGTTWLF
DTACTGTEISLKTCISDYEKKSSHNNDAGVVCRGKCEQQTATYDDYVKTARKMQCEFIRI
FLLSEVKLVHGQNFCHGTVQVRYTGDWGTICHYSWDPLDGIVLCRELGCGPFKAAYASAY
YGNGTGNILMDNVLCTGSESSLKDCSYSTSVNSLCTHSQDAGVACGGKFKQKQVSKMNKL
RLVDGDSICSGRVEVLKNNQWGSVCGDSWDMTDAIVVCRELGCGDPVEVKTGAYGSGIGP
IWMDDVKCTGNEAMLKNCKFNGWGVHNCDHASDAGVVCREVRLVNTNNKCQGTVQVYHDG
QWGTVCHNSWDLADGVVLCRELGCGGNAQPLASAYFGPSDGPIWMDSLRCKGAESNLRKC
QFGGWGNHQCIHAYDAGIICREIRNVLRIEVSADSGDPNNPLQMTKLLSKIKEELKNTGN
FSVKWRTQSNGQVFQEKKMFDPCSPVKPHSQYTVHHLSILVLLLVRNKQHSVPQSHCHNP
VLYTPLQHLLDPSHYHTLFPTDHHKEPPLVQNKSSITVTSGIRLVNGDSCSGRVEVLYNR
TRGTVCDDGWDLPDAAVVCRETGCRDAIEAKSGAYFGQGSGLIWMDDIQCDGNESALNEC
SSDGWGTQKCNHQQDDGVISVKLVNGINSCSGRVEVLYNGTWGTVCDDDWDLTDAAVVCR
EIGCGNVTEVKSAAYFGQGTGQIWLDDIQCVGIESTLNICLSNGWGKHNCSHRQDAGVIC
QCESKYSMNFMLVNGDNKCSGRVEVFHSRGWGTVCDDDWDLSDAAVVCREVGCGNVIEAK
GFAYFGRGSGQIWMDDVNCNGIKSSLMNCATRGWGIHDCIHDEDAGVICSYVKLVNGENC
SGRVEVLHNGTWGTVCDDDWDIKDATVVCREIGCGNATELLLLLPPPVLKETNVVRHNDY
TYINDSKSWIDALGYCQTHHQTLAHILNTTAHKYITKMLQDKEITDGVWIGLERTAMLWF
MQFFLLLACIGFTTAISTDELRLVNGSDSCSGRVEVFHNGIWGTVCDNGWDLTDAAVVCR
EVGCGNVIEAKRGAHFGQGSGQIWINDVQCGGNESTLRNCSSDRWGTCRCSHQQDAGVIC
QCELKISLQFEHXNNNNTFGKNNKXILSCLWIIAVRLMMGDNSCSGRVEVHYNRTWGTVC
DGDWDIKDAAVVCREIGCGDAIKATRGAYFGQGSDQIWMDDVKCNGTESSLQSCQSNRLG
IHNCRHQKDAGVICNVSVRLVNGDNSCSGRVEFLHDGQWKTVCDNDWDLTDAKVVCRELG
CGSVVDASHAYFGQESGQMWMNVQCTGVESTLKSCRHDNTSCRGKKGAGVICQPAIMVNG
SLSCSGRVEVRHNGQWGTVCDDGWDLTDAEVVCREMGCGNVTEIKSVAYFGQRSGPVWMS
NVSCNGTESTLKNCAFSGRVQQKCSHEKDAGVICGPKLRLQNGFSSCSGRVEVLHNGTWG
TVCDDGWDLTDATVVCREIGCGDALEAKRGAFFGSGSGPIWMNKVNCYEKEQTLKRCRSS
GWDVQNCSHSKDAGVICQYDYTYINDSKSWIDALGYCQTHHQTLAHILNATAHKYITKML
QDKEITDGVWIGLERSMLFACSPWLWTGGPYVEYASWHQEYAKDPGSKFCGKLLKEKPNR
FGWIDACCHERLPFICQG
NT seq 5817 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgctgtactttttctgcttcattctgcttctagacagtgtagaaaatgcagccgtcagt
aaaatcactgtgaccagtgaagttcccgtgaggttggtggacggtagtaatgcttgttct
ggacgggttgagatttacaaggacagcgaatggggcaccatttgtgatgaagggctggat
gatgtcgaaggcaacttggtctgctatgaggcaggttgcggtccactcatatctatacag
cctagtgcttactttggggagggttccggaacgttactaacggatgacctgaactgtttt
gggaacgagagctcggtgctcgactgcatttgggggaaccacaccgacgtgtgtgaccac
atgagagatgctggagtcatctgtgactccacctttaggttacaaggtggcagcggcatg
tgttcagggagagtggagattttccacaacagacagtggggaacggtctgcgacaccacc
tgggatctcttggactcaacagtggtgtgtaaagaacttggctgtggaagccctatagct
gtatactataatgcttatttcgggaaaggaacaggtccagtgtggatggatggcgtcagt
tgcactggtcgggagagtttgctggaagattgtgcgtttagcggttggggggtgaccact
tgcacacatgcggatgatgctggagtcacctgtttagagtttatgcttgcagatggacta
aacacttgctccgggagggtggaggtcctgtatgaacattttgggtggggaaccgtttca
gccaatggctggaatttgttgggtggagatgtgatctgcagacagatggattgtggaagt
gcactgagcgtcaacggtgaatctgcttttgggaagggttcaggtacgacgtggctgttt
gataccgcatgcacgggaactgaaatctctctgaaaacatgcatttcagactatgagaaa
aagagttcacacaacaatgatgcaggagtggtctgcagaggtaagtgtgagcaacagaca
gcgacctacgacgattacgtcaagaccgcacgcaaaatgcaatgtgaattcatcagaatt
tttctcctttcagaggtgaaactggtacatggccaaaatttttgtcatgggacagtgcag
gtccgttatactggagattggggcacaatatgtcactacagttgggatccactggatggt
attgtgttgtgccgagaactcggctgtggcccttttaaagcagcatatgcctcagcttat
tatgggaacggcacagggaacatactgatggataatgttctgtgtaccgggagtgagtcc
tcgctaaaggactgcagttactctacgtctgtaaacagcctctgtacgcattcacaagat
gctggagttgcctgcggaggtaaattcaaacaaaaacaggtttcaaaaatgaacaaattg
agattggtagatggagacagcatttgttctggaagggtggaggttcttaaaaacaaccag
tgggggtctgtctgtggcgacagctgggatatgactgacgctatagttgtctgtagagag
ctgggctgtggagatccggtagaggtaaaaacaggtgcttacggaagtggtattggacca
atatggatggatgatgtgaaatgtacaggcaatgaggccatgctgaagaactgcaagttc
aacggatggggagttcacaactgtgatcacgcaagcgatgcaggggtcgtctgccgagag
gtacggttggtgaatacaaacaacaagtgtcagggcacagtgcaagtgtaccatgatggc
cagtggggcacggtctgccacaacagctgggatctcgcagatggtgtagtgctctgtaga
gagctgggctgtggtgggaacgcacagcctttggcaagtgcttattttgggcccagtgat
gggccgatatggatggattccctcagatgcaaaggtgccgagtcaaatctgaggaaatgc
cagtttggtgggtggggaaaccatcaatgcattcatgcatatgatgcaggaatcatctgc
agagagattagaaatgtactccggattgaggttagcgctgactctggcgaccccaacaac
cctttacaaatgacaaaactactgagcaaaatcaaggaagagctcaaaaacaccggaaat
ttctctgtcaagtggagaactcagtcgaatgggcaagtgtttcaggaaaagaaaatgttt
gatccctgttcaccagtgaagcctcactcccagtacactgtgcaccatctatccatactg
gtcctactcctggtccgaaataagcagcactctgtgcctcaatcacactgccacaatcca
gttctttacacaccacttcagcatctgttagatcccagccattatcacacactgttcccc
actgaccatcataaagagcctccactcgtccagaacaagagctccataaccgtcactagt
ggaatcagattagtgaatggagactcttgttctggacgagtggaggttctttataataga
acacggggaacagtgtgtgatgatggctgggatctaccagacgctgcagtggtgtgtaga
gagacgggttgtagggatgctatagaggcaaaaagtggtgcttattttggccagggatca
ggactgatatggatggatgatatacagtgtgatgggaatgaatctgcactaaatgaatgt
tcctcagatggatggggaacacagaaatgtaaccatcaacaagatgatggagtcatctct
gtcaagttggtgaatggcatcaactcttgttctggaagagtggaggtactttacaatgga
acatggggaacagtgtgtgatgatgactgggatctaacagatgcggcagtggtgtgtaga
gagattggctgtgggaatgtaactgaggtgaagagtgctgcttattttgggcaagggaca
ggacagatatggttggatgatatacaatgtgttgggattgaatctacattgaatatctgt
ttatcaaatggatggggaaaacacaactgtagccatcgacaagatgctggagtcatctgc
caatgtgagtcaaaatattcaatgaattttatgttggtgaatggagacaacaagtgttct
ggaagagtggaggtttttcacagtagaggatggggaacagtgtgtgatgatgactgggat
ctatcggatgcggcagtggtgtgtagagaggtgggatgcgggaatgtgatagaggcaaag
ggttttgcttattttgggcgaggatcaggacaaatatggatggatgatgtaaactgcaat
ggaattaagtcctcactgatgaactgtgcgacacgtggatggggaatacatgactgcata
catgatgaagatgctggagtcatctgcagctatgtcaagctggtgaatggtgaaaactgt
tctggacgagtggaggttctccataatggaacatggggaacagtgtgtgatgatgactgg
gatataaaagatgctacagtggtgtgtagagagattggctgtggaaatgctacagagctg
ctgctgctgctgccaccaccagtcctcaaagaaacgaacgttgtacgtcacaatgactac
acctatatcaacgattcaaaaagctggatcgatgcactaggatactgccaaactcaccac
cagacactggcgcacattttaaataccacggcacacaagtacatcacaaaaatgctgcag
gataaagaaatcactgatggagtatggatcgggcttgaacggaccgctatgctgtggttc
atgcaattctttctgcttttagcatgtataggttttacaactgccattagtacagatgaa
ctcagactggtgaatggcagtgactcttgttcaggacgagtggaggtttttcataatgga
atatggggaacagtgtgtgataacggctgggatctaacagatgcggcagtggtttgtaga
gaggtgggctgtgggaatgtgattgaggcaaagcgtggtgctcatttcggtcagggatca
ggacaaatatggataaatgatgtacaatgtggagggaatgaatctacactgcgtaactgc
tcatcagatagatggggaacatgccgctgtagccatcaacaagatgctggagtcatctgc
cagtgtgagttaaaaatatccttacaatttgagcatnataacaataataacacttttggg
aaaaataataaataaattttgtcttgtttgtggataatagctgtccggttgatgatgggt
gacaactcttgctctggacgggttgaagttcattataacagaacgtggggaacagtgtgt
gatggtgactgggatataaaagatgctgcagtggtgtgtagagagattggctgtggggat
gctataaaggcaacacgtggtgcttattttggacaaggatcagaccaaatctggatggat
gacgtaaagtgtaatgggactgagtctagtctacagagctgtcagtcaaatagattggga
atacataactgtcgacatcagaaagatgctggagtcatctgcaatgtatctgtcaggttg
gtaaatggtgacaactcttgctctggacgtgtggagtttcttcatgacggtcagtggaaa
acagtgtgtgataatgactgggatctaacagatgccaaagtggtgtgtagagaactggga
tgtgggagtgtcgtagatgcaagtcacgcttattttggccaggagtcaggacaaatgtgg
atgaacgtacaatgtactggagtagaatctactttgaagagctgcagacatgacaatacc
tcctgtagaggtaaaaaaggtgctggagtcatctgtcagcctgctatcatggtcaatggc
agcctttcatgttctggaagagtggaggttcgccacaatggtcagtggggaacagtgtgt
gatgatggctgggatctgacagatgctgaagtggtgtgtagagagatgggatgtggcaat
gtgacagagataaaaagtgttgcttattttggacaaagatcaggaccagtatggatgagt
aatgtgagctgtaatggaacagagtctacactgaagaactgtgcattcagtggaagagtt
caacaaaagtgtagccatgaaaaagacgctggcgttatctgtggacccaaacttcgactg
cagaatggtttcagctcttgctctggaagagtggaggttctgcataatggaacgtgggga
acagtgtgtgatgatggctgggatttaacagatgctacagtggtgtgtagagagattggc
tgtggggatgctttagaggcaaaaagaggtgctttttttggcagtggctcaggaccaata
tggatgaataaagtaaattgttatgagaaagagcaaactctaaagagatgtagatcatct
ggatgggatgtacagaactgtagtcattctaaagatgctggagtcatctgccaatatgac
tatacctatatcaacgattcaaaaagctggatcgatgcactaggatactgccaaactcac
caccagacactggcgcacattttaaatgccacggcacacaagtacatcacaaaaatgctg
caggataaagaaatcactgatggagtatggatcgggcttgaacggagtatgctctttgct
tgttcgccctggctgtggaccggtgggccgtatgtggagtatgcctcgtggcatcaagag
tatgcaaaggacccagggagcaagttttgtggaaaacttcttaaggaaaaaccaaacagg
tttggctggatagatgcttgctgccatgagcgcctgcctttcatctgtcagggatga

DBGET integrated database retrieval system