Labeo rohita (rohu): 127162573
Help
Entry
127162573 CDS
T09007
Name
(RefSeq) fibrillin-2
KO
K23342
fibrillin 2/3
Organism
lroh
Labeo rohita (rohu)
Pathway
lroh04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lroh00001
]
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
127162573
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
lroh00536
]
127162573
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
lroh00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
127162573
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_CA
cEGF
EGF
hEGF
FXa_inhibition
TB
EGF_3
Plasmod_Pvs28
Fibrillin_U_N
EGF_FBN_1st
EGF_MSP1_1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
127162573
NCBI-ProteinID:
XP_050961325
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
2852 aa
AA seq
DB search
MSQGALRCSVGFVALLGILLIKISGIHGKATVHLDGSQRREKHDSLRGPNVCGSRLQSYC
CPGWKTLPGGNRCVVPICRNSCGSGFCSRPNTCTCPGGQIATTCAAKSSQQCNTRCMNGG
VCEEDHCQCAKGYTGSFCEQTVCEKTCRNGGRCVGPDRCVCVYGFTGPQCERDYRTGPCF
IQVRGKQCASQSSGFVCNKELCCATVGRAWGHPCELCPPLSASCSRGLTPNSRTGACQDV
DECKVVPGLCKGGKCINTVGSYQCQCPSGFQQHMSSLMCEDVDECSTVQRVCDGGRCVNS
VGSFSCVCLAGYLPSADRTSCLEQHTGVCFASVVNGRCAQEISGRFSKTQCCCDRGRCWS
QSTAHEMCPVPGSDEYFRICLVGSALSGFGEEDPDTHPQHPSGFSSASTDQIPHPLNDNG
LIKPQVHRIPQIPQISGNGNGFKSRRPVVVRVNETVNRCRLFPKLCLNGRCVPMGSDYRC
DCNTGYREDNRGQCSDVDECALEHCTNGNCVNTPGSYYCRCHAGFLRVPGKQACIDIDEC
LQNGLLCKNGRCLNMEGSFQCICNAGFKLTPDGKNCIDHDECAATNMCLNGMCINEDGSF
KCVCKPGFTLNSSGRYCTDVDECQTPGVCMNGQCVNTQGSFRCECFAGLTIGIDGRTCVD
THVRSTCYGAVKRGLCVRHLQQSVTKSQCCCANPDYGFGEPCRPCPGKNSGEFQALCASG
VGFSADGKDINECALDPEICSNGVCENLRGSFRCVCNGGYENDQTGRNCLDIDECVVNSL
LCDNGLCRNVPGSYSCTCPAGYTFRHDTETCDDVNECASSPCINGVCKNSVGSFSCECPL
GSKLDSTGLLCVDSLKGSCWLTLQDGRCEVNINGATLRSQCCATLGAAWGSPCEPCQSDP
KCERGFARPRGALCEDVNECEVFPGVCQNGHCVNTRGSFKCQCPESLTLDVTGRVCVDVR
SEPCFLTYDEDVCTHPVPGRLHMDVCCCTVGLAWGKDCELCPEPGTRHFDALCPRGPGFA
NKGDVLTGRAVYKDINECKVFQSICIHGKCRNTIGSFRCRCDNGFALDTNEQNCTDIDEC
VISPDVCGHGTCVNTLGSFQCDCFPGYESGFMMMKNCMDIDECERNLSLCNGGTCENTDG
SYKCVCPPGHQLSVDNSACEDVNECELSSTLCLNGRCVNVVGTYQCSCNSGYQTTPDRKG
CTDVDECTIENGGCELYCSNSDGSYSCSCGQGYAMMLDQRTCADVNECEEDVDICDGGQC
TNVPGAYHCVCHEGFTTSVDMRTCIDVNECELNTNICVFGECENTKGSFICHCEMGYAVK
KGTSGCTDVNECEINTHDCDTHATCVNTLGHYHCSCRDGWSGDGVRCADVDECSDRTHVC
SADAECVNTAGSYRCRCSDGFTGDGFTCSDMDECAEDVDLCENGQCLNVPGSYRCECEMG
FTHTPNSKTCQDIDECTFQNICVYGTCQNIPGMFRCICDEGYELDRTGGNCTDVDECLDP
VSCVNGHCENTAGSYQCNCPIDFELNPTGIGCIDTRAGSCFLDLAYRGHGGLACSVELGF
GVSRSSCCCSLGRAWGNPCDLCPPLNTSEYNTLCPGGEGFKPNPITIILEDIDECQELPG
LCQGGNCINTFGSFQCDCSAGYYLNTDSRMCEDIDECVLSSGVCGPGTCYNTLGNYTCIC
PQDYMPVNRGHGCMDMRKSLCYRNYSGSTCEHQLNFNTTQRLCCCAYNVGKAWNKPCQAC
PSPGTGDYRSLCGSVTGFGIDIETGQPKDIDECHEIPGICAHGVCINHMGSFHCECPTGF
SYSDLQLICEDIDECSSGEHVCQRNADCINQPGSYQCECSDGYILTPNGACSDRNECVEM
PSVCRHGDCVDFPGGYECMCHTGFTATQNRRMCVDVNECSHQPCGNGTCTNSIGSFNCIC
HQGFELASNSYCTDIDECAVFQSQLCRNGHCVNNVGSFQCLCREGYELTLDGKSCIDVNE
CILNHGICAPGTCMNLDGSFRCVCPDGYIVHNEHCVDVNECSEEPGICAYGSCFNSLGSF
ECVCKPGFVLSEDRRRCYDTRESFCFTRFESGKCSVPQAFNTSKAKCCCNIMAKEGWGDP
CELCPKEQDAAFQDLCPFGHGIIPGVGDARVDLNECLENQEICVNGRCINMDGSFRCECP
MGYMLDYTGTRCDDIDECSVENPCGNGTCSNVIGGFECLCEEGFEPGPMMSCEDVNECSE
NPLLCAFRCINTFGGYECSCPSGYSLREDGRMCQDVDECANDLHNCDSRGMECNNLIGTF
ICVCPAGMIRRMNDDMCQDENECLTQPGVCENGRCVNTVGSYTCECGVGFKADSTGTQCL
DYRKGFCFTEVLHTMCQMSSSSRVPVSRSQCCCNGGRGWGDQCELCPLPATANYKKLCPY
GHGYATDGTDIDECKLIPGVCTNGVCINVMGSYRCHCKPGYITSAAGTTCVDVDECGMSP
KPCNFICKNTEGSYMCSCPRGYTLQDDSRTCKDVDECQSRRHSCPFSCVNTIGGFTCKCP
AGFSQHHTACRDINECLAERGPCGQRGVCQNSVGSFSCECPQGFSLDSLDLNCHDVDECA
GDHRCQFGCQNVAGGFRCSCPEGYTQHQQWNQCVDDNECLNQGSCGSASCFNTLGSFKCG
CPSGFTFDPVSTSCEDVDECLSFMSPCRYSCSNTQGGFMCGCPAGYYRAGQGHCVSAVGF
GGGGLGAEEESGLSPEPCYGCKTNGHQKKSVRRRHTSKLTLEGVSLASVDVDQPLKLFLN
RSQLNPGEVILKLLPAVRALAQHVTYAITAGNGDGFFQIRRRAGVCHVHSTHRTSSMRRY
ILQIKSSVLSRDIDREERPAANLHMTLHVTLQ
NT seq
8559 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtctcaaggggctctgaggtgttcagtggggtttgttgctctgctgggaattttattg
ataaaaatctcaggaattcatggaaaagcaactgttcatttggatggatctcagagacgg
gaaaaacacgattccttgagaggacctaatgtgtgtggatctcgtctgcagtcctactgc
tgtccaggctggaagactctgccgggaggaaaccgctgcgttgtgcctatctgccggaac
agctgtggcagtggtttctgctccagacccaacacgtgcacgtgccctggtggccagata
gccacaacctgcgccgccaaatcatcccaacaatgcaatacgagatgtatgaatggaggg
gtgtgtgaagaggaccattgccagtgtgcaaagggatacacgggcagcttctgtgagcag
actgtctgtgagaagacctgtcgtaatggcggacgctgcgttggaccggaccgctgcgtg
tgtgtgtacggcttcactgggccacagtgcgagagagattaccgaacgggcccgtgcttc
atccaggtgcgcggcaagcagtgtgcgtctcagagcagtggatttgtgtgcaataaggag
ctgtgctgtgccacagtgggacgagcgtggggtcacccatgcgagctgtgccctccgctc
agcgcgtcctgcagcagaggattgacgccaaacagtcgcacaggagcctgccaagatgtt
gatgaatgtaaggttgtgcctggcctgtgtaaaggaggaaagtgcatcaacactgtgggc
tcatatcagtgccagtgtcccagcggtttccagcagcacatgagttcgctgatgtgtgag
gatgtggacgaatgctccaccgtccagcgcgtgtgtgatggaggacgctgcgttaattca
gtgggcagtttctcctgtgtgtgtcttgctggatacctgccgtctgcagacaggacgagc
tgcctcgagcagcacacaggcgtctgttttgcgtcagtcgtgaatggacgctgtgctcag
gaaatcagtggacgcttcagtaaaacccagtgctgctgtgaccgtggacgctgttggagt
caaagcacagctcatgaaatgtgtcccgtacctggatcagatgagtacttcaggatctgt
ctggtgggctctgctctgagtggctttggtgaagaggatcctgatacacaccctcaacat
cccagtggcttcagttctgcctctactgaccagatacctcacccacttaacgacaatgga
ctcatcaaacctcaggttcatcggattccccaaatccctcagatctcagggaatggtaat
ggatttaaatctcgacgtcctgttgttgttcgtgtgaatgagactgtcaacaggtgtcgt
ctgtttcctaaactgtgtctgaatggacgctgtgtacccatgggctctgactaccgctgt
gactgtaacaccggatacagagaggacaacagaggacagtgttcagatgtagatgagtgt
gcgcttgagcactgcactaatggaaactgtgtcaacactcctggttcctactactgcaga
tgccacgcaggctttctcagggttccaggcaaacaggcctgcattgacattgacgaatgt
cttcagaatgggttgctgtgtaagaacggccgctgtcttaacatggagggcagctttcag
tgcatctgtaatgcaggattcaagctcacacctgatggcaaaaactgcatagatcacgat
gaatgcgctgccactaacatgtgtcttaatggcatgtgcattaatgaagacggcagcttt
aaatgtgtttgcaaacccggattcaccctcaactccagcggacgatactgtacagatgtg
gatgaatgccagaccccaggtgtgtgtatgaacggacagtgtgtgaacacacagggctct
ttcaggtgtgagtgtttcgcaggtcttaccataggaatagatgggcgcacatgtgtagac
acacacgtgcgcagcacttgttatggggctgtaaaaagaggcctgtgtgtgcggcactta
cagcaatctgtcaccaagtcacagtgctgctgtgccaaccccgactatggctttggtgag
ccgtgccgtccctgccctggcaaaaactcaggtgagtttcaggccttgtgtgcaagtggt
gttggattttctgctgatggcaaagacattaacgagtgtgctctggatcctgaaatctgc
tctaacggagtgtgtgagaatctcagaggaagtttccgctgcgtctgtaacggtggctat
gaaaatgaccagactggcagaaactgtctggacattgatgaatgtgtagtgaacagtctc
ctctgtgataacggcctgtgccgaaatgtgcccggcagctacagctgcacctgcccggcg
ggatacaccttcagacacgacacggagacgtgtgatgatgtgaacgagtgtgcgagcagc
ccgtgtattaatggagtctgtaagaacagtgtgggctctttctcctgtgagtgcccacta
ggaagtaaactggactccactggacttttatgtgttgacagtctgaagggctcgtgctgg
ttaacccttcaggacggccgctgtgaagtgaacattaatggagctacgctgaggtctcag
tgctgtgccacgctgggagcggcctggggcagcccatgtgaaccatgtcaaagcgatccc
aaatgtgaacgaggatttgctcggccaagaggggctttgtgtgaagatgtaaatgaatgt
gaggtgtttcctggtgtgtgtcagaatgggcactgtgtgaacactagaggttcttttaaa
tgtcagtgtccagagagtctcacactggatgtcactggacgtgtctgtgtggatgtccgt
tcagagccctgtttcctcacctacgatgaagacgtgtgtacccacccagtaccaggacgc
ttgcacatggatgtgtgttgctgtacagtgggcttggcctggggcaaagattgtgaattg
tgccctgagcctggcactcgccattttgatgctctgtgcccaagaggaccaggcttcgcc
aacaaaggggatgtgctcactggcagagctgtctataaagatattaacgagtgtaaagtt
ttccaaagcatctgtattcatggaaaatgtcggaacaccattggaagcttcagatgtcgt
tgtgacaatggctttgcactagataccaatgagcaaaactgcacagatattgatgagtgt
gtgatctctcctgatgtttgtggtcatggcacgtgtgtgaacaccctgggcagtttccag
tgtgactgtttccctggctatgagagtggatttatgatgatgaagaactgcatggatatt
gacgagtgtgaacgaaacctctcactgtgtaatggaggcacctgtgaaaacactgatggc
agctacaagtgtgtgtgtccacctggtcatcagctgtctgtggacaacagtgcttgtgaa
gatgtgaatgagtgtgagttgagcagcacattgtgtcttaatggcaggtgtgtgaatgtg
gtggggacgtaccagtgctcctgtaactctggttatcagacgacacctgataggaaaggc
tgcacagatgtagatgagtgtacaatagagaatggaggatgtgagctgtattgtagtaat
tcagacgggagttactcctgcagctgcggtcagggttatgctatgatgctggaccaaagg
acatgtgcagatgtgaatgaatgtgaagaggatgttgacatctgtgacggtggtcagtgc
actaacgtccctggagcatatcactgtgtgtgtcatgaagggttcacaacttctgtggac
atgaggacgtgcatcgatgtgaatgagtgtgaactcaacaccaacatctgtgtgtttggg
gagtgtgagaataccaagggttcttttatctgtcattgtgagatgggttacgccgtgaag
aaaggaacctctggctgcaccgatgttaatgagtgtgagataaacactcatgactgtgac
acacacgccacctgtgtcaacacactgggacattaccactgctcctgcagggacggatgg
tctggtgatggagtcagatgtgctgatgtggatgagtgcagtgacaggactcacgtctgc
agtgctgatgctgagtgcgtgaacacggccggatcgtaccgctgtcgatgttcagatggc
tttactggagacggatttacctgctcagatatggacgagtgtgctgaagatgtggatttg
tgtgaaaatgggcagtgtctcaatgttcctggcagctatcgctgtgaatgtgagatgggc
tttacacacactccaaacagcaaaacctgtcaagatatagatgagtgcaccttccagaac
atctgtgtatatggcacatgtcagaatattccaggaatgtttcgctgtatttgtgatgaa
ggctatgagctggacaggaccggtggaaactgcacagatgtggacgagtgtcttgatcct
gtcagctgtgttaatggtcactgtgagaacacagccggctcataccagtgtaactgtccc
attgactttgagctcaaccccactggaatcggctgcattgacacacgagcagggagctgt
tttctggatttggcgtaccgtggccatggtgggctcgcatgtagtgttgagctgggattt
ggagtcagtcgttcatcgtgctgctgttctctgggacgagcatggggtaacccgtgtgac
ctttgccctccactcaacacctcggagtataacacactatgtcctggaggagaggggttc
aaacccaaccccatcaccatcatcctggaagatattgatgaatgtcaggagctgcctggt
ctgtgtcaaggtggaaactgtatcaatacatttggaagtttccagtgtgactgttcagct
ggatactacctcaacacggacagccgcatgtgtgaggatatcgatgagtgcgtgctcagt
tctggtgtttgtggaccaggcacctgctataacacactgggaaactacacatgcatctgc
ccacaggactacatgccagtgaacagaggacacggctgcatggatatgagaaaaagtctg
tgttaccgtaactatagtggcagtacctgtgaacaccagctcaacttcaacaccacacag
agattgtgctgctgtgcctacaatgtgggcaaagcctggaacaaaccatgccaggcctgc
cccagccctggcacaggtgactatagaagtctttgtggcagtgtgactggattcgggatt
gacattgaaaccggacagccgaaagatattgatgaatgtcatgaaatcccaggcatctgt
gctcatggtgtgtgtataaaccacatgggcagtttccactgcgagtgtcccacaggcttc
agttacagtgacctgcagctcatctgtgaagacattgatgaatgcagcagtggggagcat
gtgtgtcagagaaatgcagactgcatcaaccagccgggcagctatcagtgtgaatgttct
gatgggtatatactcacacctaatggagcctgctctgaccgtaacgagtgtgtggagatg
cctagcgtgtgtcgtcatggcgactgcgtggactttccaggtggatacgagtgcatgtgt
cacactggctttactgcaactcaaaaccgcaggatgtgtgtagatgttaacgagtgttca
caccagccatgtgggaatggcacatgtacaaactctattggctcatttaactgtatctgt
catcaaggatttgagctcgccagtaatagctactgcacagacattgacgagtgtgcagtt
tttcagtctcagctctgcaggaacggccactgtgttaataatgttgggtctttccagtgc
ctctgtagagagggctatgagctcactctagatggaaagagctgcatagatgttaatgag
tgtatattgaatcatgggatatgcgctcctggaacgtgtatgaatctggatggttctttc
agatgtgtctgtcctgatgggtatattgtccacaatgagcactgtgtagatgtgaacgag
tgttcggaggagcccggcatctgtgcgtatggctcctgcttcaacagtctggggagcttt
gagtgcgtgtgtaaacctggatttgtgctgtcagaagatagacgcagatgttacgacact
agagagagcttctgtttcacacgctttgagagtggcaagtgctctgtcccgcaggcattc
aacaccagcaaagccaagtgctgctgtaacatcatggccaaagagggctggggcgacccc
tgtgagctttgccctaaagaacaggatgctgccttccaggatctatgtccgtttggccat
gggatcattcccggtgttggggatgcacgtgtggacctaaacgaatgtttggagaatcaa
gagatttgtgtgaatggccgctgcatcaacatggatggctccttccgctgcgagtgtccc
atgggctacatgcttgactacacaggaacacgttgtgatgatattgatgaatgttcagtg
gaaaacccctgtggaaatggaacatgctcaaatgtgattggaggatttgagtgtctgtgt
gaggagggatttgagcctggaccaatgatgagctgtgaagatgtgaacgagtgcagtgag
aatcctctgctctgtgcgtttcgctgcattaacactttcgggggttatgaatgcagctgt
ccgtctggttactctctgcgagaggatggacgcatgtgtcaggatgtggacgagtgtgca
aatgatcttcataactgtgactccagaggaatggagtgtaacaacttaattggcaccttc
atatgtgtttgtccagccgggatgatccgcaggatgaatgacgacatgtgtcaagatgaa
aatgaatgcttgactcagccgggtgtttgtgaaaacggtcgatgtgtgaacactgtgggc
agctacacgtgtgaatgtggtgttggattcaaagctgactctacaggcacgcaatgtctt
gattacaggaaaggcttttgtttcaccgaagttctgcacacaatgtgtcagatgtcatcc
agcagtcgtgttcctgtcagcaggtctcagtgctgctgtaatggaggccgtgggtggggg
gaccagtgtgagctctgccctttgcctgccactgccaactacaagaaactctgtccatat
ggccatggctatgccactgacggaacagatatagatgagtgtaagctgattccaggtgtt
tgtaccaatggcgtctgtatcaatgtcatgggctcttacagatgccactgtaaaccagga
tacatcacctctgctgcaggaaccacatgtgtcgatgtcgatgaatgcggcatgtcccca
aaaccctgtaacttcatctgtaagaacacagagggcagctatatgtgttcctgtccccgc
ggttacacgctgcaggatgacagcaggacgtgtaaagatgtggatgaatgtcagagcaga
cgacacagctgcccgttctcgtgtgtcaacaccatcggtggattcacctgcaagtgtccg
gcaggcttcagccagcatcacacggcctgcagagatattaacgaatgtttggctgagcgg
ggtccgtgtggccagcggggcgtctgtcagaattcagtgggcagcttcagctgtgagtgt
ccacagggcttcagtctggactctcttgacctcaactgtcatgacgtagatgagtgtgcg
ggcgatcacaggtgtcagttcggatgtcagaatgttgcgggtgggttccgttgcagctgt
ccagaaggatacacacagcaccagcagtggaaccagtgtgtcgatgacaatgagtgcttg
aaccagggcagctgtggttcagcttcttgtttcaacacattgggcagttttaagtgtggc
tgtccatctggcttcacctttgaccccgtgtccactagctgtgaggacgtggacgagtgc
ttgtccttcatgagcccctgcagatacagctgctcaaacacacagggtggattcatgtgc
ggatgtcctgcgggatattacagagcaggacaggggcactgcgtatctgctgtgggtttt
ggaggcggtgggcttggagcagaagaggaaagcggtctttctcctgaaccctgctatggc
tgcaaaactaatggacaccagaagaaaagtgtcagaagaagacacacttcaaagctcaca
ctggaaggggttagtctggccagtgtggacgtggatcagccgctgaaattattcctcaat
cgctcacagctcaaccccggtgaagtcatactgaagctgttgcccgctgtcagagcgctc
gctcaacacgtgacatacgccatcacagccggaaacggtgatggattcttccagatcaga
cggcgggcgggtgtctgtcacgtgcacagcacacacaggacgtcctcgatgagacgctac
atactgcagatcaaaagttccgtcctctctagagacatagacagggaagagcggcccgct
gcaaacctacacatgacactccacgttacactccagtag
DBGET
integrated database retrieval system