Limosilactobacillus reuteri I5007: LRI_0915
Help
Entry
LRI_0915 CDS
T02701
Name
(GenBank) glucansucrase
Organism
lrt
Limosilactobacillus reuteri I5007
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Glyco_hydro_70
Choline_bind_3
KxYKxGKxW_sig
Choline_bind_1
Choline_bind_2
Fn3_Dep-1_1st
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AGN99124
UniProt:
R9WGF1
LinkDB
All DBs
Position
920993..926353
Genome browser
AA seq
1786 aa
AA seq
DB search
MEIKKHFKLYKSGKQWVTVAVATVAVSTALLYGGVAHADQQDQSSTTQDQTSAVNVDTAK
TVISTDQSTQTTNKNQAALNDKTGDQSKNNGTSGTVNDHTPAPVSTFASINNDERNQSYN
KQDNGNYGNVDTAYFNNNQLHVSGWHATNASQGTDSRQVIVRDITTNNELGRTNVTNNVS
RPDVKNVHNVYNADNSGFDININIDFSKMKDYRDSIEIVSRYSGNGKSADWWSQPITFDK
NNYAHLDTFEVKNGELHATGWNATNKAINYNHHFVILFDQTNGKEVARQEVRDGQSRPDV
AKVYPQVVGADNSGFDVTFNIGDLDYTHQYQILSRYSNADNGEGDNVTYWFNPQSIAPAN
QSNQGYLDSFNISKNGEVTVTGWNATDLSELQNNHYVILFDQTAGKQVASAKVDLISRPD
VAKAYPTVKTAETSGFKVTFKVSNLQPGHQYSVVSRFSADENGNGNDKRHTDYWYSPVTL
NQTASNIDTITMTSNGLHITGWMASDNSINEATPYAIILNNGREVTRQKLTLIARPDVAA
VYPSLYNSAVSGFDTTIKLTNAQYQALNGQLQVLLRFSKAVDGNPNGTNTVTDQFSKNYA
TTGGNFDYVKVNGHQIEFSGWHATNQSNDKDSQWIIVLVNGKEVKRQLINDTKDGAAGFN
RNDVYKVNPAIENSSMSGFQGIITLPVSVKNENVQLVHRFSNDAKTGEGNYVDFWSEVMP
VKDNFQKGNGPLKQFGLQTINGQQYYIDPTTGQPRKNFLLQNGNDWIYFDKDTGAGTNAL
KLQFDKGTISADEQYRRGNEAYSYDDKSIENVNGYLTADTWYRPKQILKDGTTWTDSKET
DMRPILMVWWPNTVTQAYYLNYMKQHGNLLPASLPFFNADADPAELNHYSEIVQQNIEKR
ISETGNTDWLRTLMHEFVTKNSMWNKDSENVDYGGLQLQGGFLKYVNSDLTKYANSDWRL
MDRTATNIDGKNYGGAEFLLATNIDGKNYGGAEFLLANDIDNSNPVVQAEELNWLYYLMN
FGTITGNNPEANFDGIRVDAVDNVDVDLLSIARDYFNAAYNMEQSDANANKHINILEDWG
WDDPAYVNKIGNPQLTMDDRLRNAIMDTLSGAPDKNQALNKLITQSLVNRANDNTENAVI
PSYNFVRAHDSNAQDQIRQAIQAATGKPYGEFNLDDEKKGMEAYINDQNSTNKKWNLYNM
PSAYTILLTNKDSVPRVYYGDLYQDGGQYMEHKTRYFDTITNLLKTRVKYVAGGQTMSVD
KNGILTSVRFGKGAMNATDTGADETRTEGIGVVISNNTNLKLNDGESVVLHMGAAHKNQK
YRAVILTTEDGVKNYTNDTDAPVAYTDANGDLHFTNTNLDGQQYTAVRGYANPDVTGYLA
VWVPAGAADDQDARTAPSDEAHTTKTAYRSNAALDSNVIYEGFSNFIYWPTTESERTNVR
IAQNADLFKSWGITTFELAPQYNSSKDGTFLDSIIDNGYAFTDRYDLGMSTPNKYGSDED
LRNALQALHKAGLQAIADWVPDQIYNLPGKEAVTVTRSDDHGTTWEVSPIKNVVYITNTI
GGGEYQKKYGGEFLDTLQKEYPQLFSQVYPVTQTTIDPSVKIKEWSAKYFNGTNILHRGA
GYVLRSNDGKYYNLGTSTQQFLPSQLSVQDNEGYGFVKEGNNYHYYDENKQMVKDAFIQD
SVGNWYYFDKNGNMVANQSPVEISSNGASGTYLFLNNGTSFRSGLVKTDAGTYYYDGDGR
MVRDQTVSDGAMTYVLDENGKLVSESFDSSATEAHPLKPGDLNGQK
NT seq
5361 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaaataaaaaaacattttaaattatataaaagtggtaagcaatgggtaacagtggct
gttgctactgttgctgtttcaactgcacttctttatggaggagttgcacatgctgaccaa
caagatcaatcttccacaacccaagatcaaacttctgctgtgaatgttgatactgctaaa
acggtgatttctactgatcagtcaacgcaaacaacaaacaaaaatcaagcagccttaaac
gataaaactggtgatcaaagtaaaaataatggaacttcaggaactgttaatgatcatact
cctgcaccagtttctacttttgcatcaattaataatgatgaacgaaatcaaagttataat
aagcaagacaatggaaattatggaaatgttgacaccgcttactttaacaataatcaattg
catgtttcaggatggcacgcaacaaatgcatctcaaggaacagatagtcgtcaagtgatt
gtacgtgatatcacaactaataatgaattagggcgtactaatgtaacaaataatgtttca
cgcccagatgttaaaaacgtccacaatgtttataacgctgataattctggattcgatatc
aatatcaacattgactttagtaagatgaaggactatcgtgattcaattgaaattgttagt
cgatacagtggaaatggtaaatctgctgattggtggtctcaaccgattacctttgataaa
aataactatgctcacctagacacatttgaagtgaaaaatggtgaattgcatgcaaccgga
tggaatgctactaataaggcaattaactataaccaccattttgtgattttatttgatcaa
acgaatggtaaagaagtggctcgtcaagaagtccgtgatggtcagtcacgtccagatgtt
gctaaggtatatccgcaagtagtcggtgctgataactcaggctttgacgtgacatttaat
attggcgatttagattatactcatcaataccaaatccttagtcgttatagcaatgcggat
aatggtgaaggagataatgttacttactggtttaatccacaatccattgctcctgctaat
caaagcaaccaagggtatttagactcattcaatatcagtaaaaatggtgaggtaacagta
actggatggaacgctactgatctatccgaattacaaaataaccattatgtaattttattt
gaccaaaccgcgggtaaacaagtagcatctgcaaaagttgatctaatttcccgtccagat
gttgcgaaagcttacccaacagtaaaaactgctgaaacttctggctttaaggtaacattt
aaggttagtaatttacaaccaggtcatcaatatagtgtcgtaagccgtttttctgccgat
gaaaacggtaatggtaatgataaacgtcataccgattactggtacagcccagtaacctta
aatcaaactgcttcaaatattgatactatcacaatgacatcgaatggattgcatattact
ggttggatggcaagtgataattcaattaatgaagcaactccatatgccattattcttaat
aatggtagagaggttactcgtcaaaaattaactttaattgcgcgtccagatgtagcagca
gtatatccttcactctataacagtgctgttagtggatttgatactaccattaagttgact
aatgctcaataccaggcgcttaatggtcaactacaagtattgttacgtttttctaaagct
gttgatggtaatccaaacggcactaatactgtaacagatcaatttagtaagaattacgcc
actactggtggaaactttgattacgtaaaagtaaacggccaccaaattgaatttagtggc
tggcatgcaactaaccaatcaaatgataaagattcacaatggattattgttctagttaat
ggtaaagaagtaaaacgtcaattaattaatgatactaaggatggggcagccggcttcaac
cgaaatgatgtttataaagtaaatccagctattgaaaatagttctatgtctggatttcaa
ggtattattactttacctgtatcagttaagaacgaaaatgttcaactagttcatcgtttt
agtaatgatgcaaagactggtgaaggaaattatgttgatttctggtcagaggtaatgcct
gttaaggataacttccaaaagggtaatggtccacttaaacaatttggtttacaaactatt
aatggccaacaatactacattgacccaacaactggtcaaccccgcaagaatttcttgtta
caaaatggaaacgattggatctacttcgacaaagatactggtgctggaactaatgctctt
aagttacaatttgataagggaacaatttctgctgatgagcaatatcgtcgaggaaatgaa
gcttatagttatgatgacaagagtattgaaaatgtaaatggttacttaacagcagataca
tggtaccgaccaaagcaaatcttaaaggatggcactacttggactgattcaaaagaaaca
gatatgcgaccaattttaatggtatggtggccaaatactgttactcaagcatactatctt
aattatatgaaacaacatggtaatttattgccagctagtttaccattctttaatgcagat
gcagatccagcagagttaaatcattactccgagattgttcaacaaaatatcgaaaagcgg
atcagtgagaccggtaatactgattggttacgtacactaatgcatgagttcgttactaag
aattctatgtggaataaggacagtgaaaacgttgattacggtggtttgcaattacaaggt
ggattccttaagtatgtaaatagtgatcttaccaaatatgcaaattcagattggcgttta
atggaccgtacagctactaatattgatggtaagaactatggtggtgcggaattcttatta
gctactaatattgatggtaagaactatggtggtgcggaattcttattagctaatgatatt
gataactcaaacccagttgttcaagctgaagaattgaactggctttactatttaatgaat
ttcggcacaattacaggaaataatcctgaagctaattttgatggtattcgtgtggatgct
gttgataatgtagatgttgacttattgagtattgcacgtgattactttaatgcagcatat
aacatggagcaaagtgatgctaatgctaataagcacattaatattttagaagattgggga
tgggatgatcctgcttatgtaaataagattggaaatcctcaattaacaatggatgatcgt
ttacgaaatgcaattatggatacattatcaggggcacctgataaaaaccaagcattgaat
aaattaattactcagtcattagtaaatcgtgctaatgataatactgaaaacgcggttatt
ccaagttataattttgttcgagcacatgatagtaatgctcaagaccaaattcgtcaagct
attcaagctgcaactggaaaaccatatggcgaatttaacttagatgatgaaaagaagggt
atggaagcatatattaatgatcagaattctactaataagaagtggaatctttataatatg
ccttctgcttatactattcttctaacgaataaagattcagttcctcgtgtttactatgga
gatctctaccaagatggtggtcaatatatggaacataaaacacgttactttgatactatt
actaacttattaaagacacgggttaaatatgttgccggtggacaaactatgagtgttgat
aagaatggtattcttacaagcgttcgttttgggaaaggcgccatgaatgctactgatact
ggtgctgatgaaacaagaacagaaggtatcggtgttgtaattagtaacaatactaatttg
aagcttaatgatggtgaatcagtagtgcttcatatgggagctgctcataagaatcaaaag
tatcgtgctgtgatcttaacaactgaagatggtgttaagaattacactaatgatacagac
gcaccagttgcatacactgatgctaatggtgaccttcactttactaatactaatttagat
ggtcaacaatatacagctgttcgtggatatgcaaatcctgatgtaacaggatatctagct
gtttgggtaccagctggagcagcagatgatcaagatgcacgtactgcaccaagtgatgag
gcccatactacaaagactgcttatcgctctaatgcagcccttgattctaacgttatttat
gaaggattctctaacttcatttactggccaactactgaaagcgaacggactaatgtgaga
attgcacaaaatgcggatctatttaagtcatggggaattactacctttgaattagctcca
caatacaattcaagtaaagatggtacgttccttgattcaataattgataatggatatgcc
tttactgatcgttatgatttaggaatgagtactcctaacaagtatggatctgatgaagac
ttacgtaatgctttacaagccttacataaagctggtttacaagcaattgccgactgggtt
cctgatcaaatttataacttacctggtaaagaagctgtaacagtaacacgttcagatgat
cacggtactacatgggaagtttcgccaataaagaatgttgtctatattacaaatacgatt
ggtggaggtgaataccagaagaaatatggtggtgaattcttagacactcttcaaaaagaa
tatccacaattatttagtcaggtatatccagtaactcaaacgacaattgatcctagtgtt
aagattaaagagtggtctgctaaatactttaatggtactaatatccttcatcgaggtgct
ggatatgtattgcgctctaatgatggtaaatactataatcttggtacaagcactcaacaa
ttcttaccgtctcaattatcagttcaagataatgaaggatatggatttgtaaaagaagga
aataattaccattactatgatgagaataaacagatggtaaaagatgcgtttattcaagat
agtgttggtaattggtattacttcgataaaaatggtaatatggttgctaaccaaagtcct
gttgaaattagtagtaatggagcttcaggaacttaccttttcttgaacaatgggacatca
ttccgttctggattggtgaaaactgatgcaggtacgtactattatgatggcgatggccga
atggttcgtgatcaaacggtaagtgatggtgcgatgacatatgttcttgatgaaaatggt
aaacttgttagtgaatcatttgattcatctgctactgaagcacacccattaaaacctggt
gatttaaacggccaaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system