Entry |
|
Name |
(GenBank) prophage protein
|
KO |
K21449 | trimeric autotransporter adhesin |
|
Organism |
lrt Limosilactobacillus reuteri I5007
|
Brite |
KEGG Orthology (KO) [BR:lrt00001]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:lrt02000]
LRI_2002
Transporters [BR:lrt02000]
Other transporters
Pores ion channels [TC:1]
LRI_2002
|
SSDB |
|
Motif |
|
Other DBs |
|
LinkDB |
|
Position |
pLRI02:complement(18847..22635)
|
AA seq |
1262 aa
MAENNQLSDETKNNSTDTSSTDASSAVIGNHENAVVPHKISNHDKLVQTMVMVDGEWINV
NDTNDQANMKEDVHKVNKKVVEAQKGIVEAKNTADSAVKYADSAVSASKVNSDAIAAQSS
AISEAKAAADDAASKAQFIKENASSEAAAIRNQVADVANNVSSVKADVASATSDVANLKV
DVQANSAAIIKTNEAVSVQSKSSSDAINELKIANGQVESIAKDAKNNATVAKQTADAATI
VAQDAKSNAVVAKQTASSATIEATNATSTASKAELSVNGLTTRVDGIEGDTKKLSGRVTS
TETILQQTKDQLLQKADKSVVDQANNLISQLSAEQKTMAGQISQKVSSSEYQTLKDKVNN
LRIGGRNLIPNSGTDIVIESKTTDPYPAWNNKAIYWNLTPGETYTFSVSATNTNGVEQAS
VRIFKSILDGKYINKEAAHWYFNADGKRRSFTFTTPNDAIPYDIWLYAGPMGTLQGKNFT
TTYHHPQLELGNIESDYSPNPDDAIASIKKNSTAIDENSKAIKLKADATEVNNLKGTVNS
HSASINLFSDQLKSMVTESKVNDIINGKGFATQNTVQSLIDQKSNTISESIVKLSNDVRN
NGGGINLLRSTDVFSKAYWIYDNIENQHKDSLVELGKVGTADSRIYQRLSIETTEHVFSV
SFDAQISDDCTDTDVIVSCGPYDALQNVHVSGKDLKHYKVENWTWAGTSNNFSLYVRNGK
IRLSKLKLEYGPVATPYAPAPSDNASVNQLQSVTASIDGLQSAVKNKVDQSQYTQLAGVV
QTKVSQSDFNRLDNQVNVQTLDNANIDNMKTTGHYFVHNLTGNPLGGWVYVDVTGNANDR
IRQDVYQDSGTKHAFRRWFGTYWTGWSTGAEESEITQLRNDINLRVKSGDLLSQINIAAG
HTLIQSNKIYFDADSFVMSPNSKAFIPSAYITNINADKINTGTLHSITINNGNGTFRVDP
DGNVYANSMHVNNGSIYQGTVLGADVYSISNLTSNSLDEVNDATQDWVKLKDGIIELHGA
NGDHYSSIVPIDVITTYSGDGGSTEVHHGLGILDSREVIIGSASLDSEHSNRITHSRNFS
VISRTHLGITNSYIQAQLDPDVEYGKGARFSIQKDNKVGFYVGEGENGNQVNVQFAGDGS
GFNVHGNFNVYGAKNSAVKTSQGDVAVSAYETAEYYFGDIGEGQTGDSGIAFVGIEKLFS
ETVNTSIPYQVFITAYGPGNVWVEQRKQDRFMIKSSQPNIKFGWEIKAKRRGYENTRLQK
VN |
NT seq |
3789 nt +upstreamnt +downstreamnt
atggcagaaaataatcagctctcagacgaaacgaaaaataattcaacagatacttcatca
actgatgcttcctcagcggtgattggaaatcatgaaaatgctgttgtccctcataaaatt
agcaaccatgacaaattagttcaaacaatggtcatggttgacggtgaatggattaatgtt
aatgatactaatgaccaagctaatatgaaggaggatgtgcacaaagttaataagaaggtt
gttgaagcgcaaaagggaattgttgaagcaaaaaatacagccgattcagcggtcaaatat
gctgattcggctgttagtgcatctaaggtaaatagtgacgcaatagcagcgcaaagctcg
gcgattagtgaagcaaaagcagcggctgatgatgcggcaagcaaggcacaatttataaag
gaaaatgccagcagtgaagcagctgcaattagaaatcaggttgcagacgttgctaataat
gtttcctctgtgaaggcagatgttgcgagtgccactagtgacgttgctaatcttaaagtt
gatgttcaagctaatagtgctgcgattattaagactaatgaagcggttagtgtccaatca
aaaagttcatcagatgcaatcaatgagttgaagattgctaacggtcaagttgaatcaatt
gctaaagacgctaaaaataatgctacagttgctaagcaaacagctgatgccgctactatt
gtggcacaggatgcaaaaagtaatgcagtggttgctaaacagactgcttccagtgcaaca
attgaggcaacaaatgcaactagtactgcatcaaaagcagagttatctgttaatggctta
actactagagttgatggcatcgaaggagataccaaaaaacttagtggccgagttacatct
actgaaactattttgcagcaaacgaaagaccagttacttcaaaaggctgataagtcagtc
gttgaccaagctaataatctaattagtcaactgtcagctgagcaaaagacaatggctggt
caaattagccaaaaagtttcatcctctgaatatcagacattgaaggataaagttaataat
ctaagaataggcggtcgaaacttaataccaaatagcggaacagatattgttattgagtca
aagacaactgacccatatcctgcgtggaacaataaagcaatttattggaacctaacacct
ggtgaaacatatacgttttctgtttcggcaacgaataccaatggtgtagagcaagcttct
gtaagaatctttaagagcatcttagatggtaaatatatcaataaggaagcagctcattgg
tattttaacgccgatggcaaacgtcgtagctttactttcacgactcctaatgatgctatt
ccttatgatatttggctgtatgcgggaccaatggggacgttgcaaggaaaaaactttact
acaacttatcatcatccgcaattagagttagggaatattgaatctgattactcccccaac
cccgatgatgctattgcttcaatcaagaaaaactcaactgctattgatgagaatagtaaa
gcgatcaaattaaaggcagatgcaacggaggtaaataacctaaaaggcactgtcaattct
cattctgcttctattaatctctttagtgaccagttaaagagtatggttaccgaatctaaa
gttaatgacattattaacgggaaaggtttcgctacgcaaaacactgtacagtcgctgatt
gatcagaagagtaacacgataagtgagagcatcgttaagctgtctaatgatgtcagaaac
aacggtggcggcattaaccttctaaggtctaccgatgtctttagcaaagcctattggatt
tacgataatattgagaatcagcataaagatagtcttgtagagcttggaaaagttggaact
gctgactcacgtatatatcagagattatctattgaaacaacagagcacgttttctcggta
tcgtttgatgcacagattagcgatgactgtactgatacagatgtaatcgtttcatgtggt
ccttacgatgcacttcaaaatgttcacgtatctggtaaagatcttaaacattataaggtt
gaaaactggacgtgggccgggacatcaaacaattttagcctgtacgtgagaaacggtaag
attcgattgtccaagttgaagttagagtatggcccagttgctactccgtacgctccagca
cctagcgacaatgctagcgttaaccaacttcaatctgttacagcctcaattgacggttta
cagtcagcagttaaaaataaagttgatcaatcacaatacacccaattagcaggagtagtt
cagacaaaagttagccaaagtgactttaatcgtttggataatcaagttaatgtgcagact
ttggataacgctaatatcgataacatgaagacaaccggccactactttgtccacaatcta
actggcaacccgcttggtggttgggtttatgtagatgtgactggtaatgctaacgacaga
atccggcaagatgtttaccaggatagcggcacaaaacatgcatttcgtcgctggtttggt
acgtattggacagggtggtccactggtgcagaagaatccgagattacacaattacgcaat
gatattaatttgagagttaaaagtggtgatctccttagtcagattaatattgcagctggt
catactttaattcaatctaacaagatttactttgatgctgattcctttgttatgagccca
aattcaaaagcctttattcctagtgcttatatcactaatattaatgcagataaaataaat
actggtacgttacattctattactattaacaacggaaatggtacttttcgcgttgaccca
gatggtaatgtttacgctaatagcatgcacgttaataatggttcgatatatcaaggaacg
gttttaggagctgacgtgtattcgattagtaatctgacttctaattctttagatgaagtt
aacgacgctacacaagattgggtaaaattaaaagatggaattattgaattgcatggtgct
aacggtgatcactattcttcaatcgtaccaatcgatgtgataacaacatatagtggtgac
ggaggctctacggaagttcatcatggattaggaatattagactctcgtgaagtaataatt
ggctcagcttctttagattccgagcatagtaaccgaattactcatagcagaaattttagt
gtgatatccagaacacacttgggaattacaaatagttacattcaagcacaattagaccct
gacgtggaatatggtaaaggtgctagattttccatccaaaaagataataaggtgggattc
tacgttggagaaggtgaaaatggtaatcaagtaaacgttcaatttgcaggagatggctcg
ggatttaacgttcatggtaattttaatgtttatggtgctaaaaactctgcggttaagaca
tcacaaggagacgtagctgtttcagcctatgaaacggccgaatattactttggtgatatt
ggcgaggggcaaactggtgatagtggtattgcatttgtcggtattgagaaattgttcagt
gagaccgtcaatactagcattccttatcaagtttttattactgcgtatggtccgggtaat
gtttgggttgaacaacggaaacaagatcgttttatgattaaatcttctcaaccaaacatt
aaattcggctgggaaatcaaagctaagcgaagaggatatgaaaatactcgtttacaaaaa
gtaaattga |