Limosilactobacillus reuteri SD2112: HMPREF0538_22113
Help
Entry
HMPREF0538_22113 CDS
T01551
Name
(GenBank) peptidase, M23 family
Organism
lru
Limosilactobacillus reuteri SD2112
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Prophage_tail
Prophage_tailD1
Peptidase_M23
MS_TIM-barrel
HrpB7
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AEI58319
UniProt:
F8DPZ2
LinkDB
All DBs
Position
2129773..2132241
Genome browser
AA seq
822 aa
AA seq
DB search
MWPTFKPSWEKNSTYQVTFSVFNYGDPLYDELDVESSFFLDGQEYIVKNCVENFDTNTKD
ITAWHVYNEINRIYKRSDLTLNKPTDDNQNQDVSYSVEDILKAWIDGNNLGFSYEVHGNF
DKQSTSKFDSGSGKDMLSKILELWPNAIVFPNNKNIRVYSEDEFYKDNGRIIDFPHDAKS
VKTTRDSQSIINEIRCVGGKHEVQHTVYTGTGGANASGPTEPVNGDWTPVIQYAASFYGI
KPTDQQLNVLRAQIHLESGGREDAQQPGADPDGDGSGPALGLLQFKQRTFNYYCREPYTN
VKHGFDALIAFFNIPNALGQINGVTGWSPHGAPITKDKLIITPPNPWGWPFPNVGEGHFS
LGQTFGTHPQDGVGRTNGFHDGLDFGSVDHPGSEVHAVHGGKVQDIGYIAGLENYVTVVS
NDYLICYQEAFSSRSNIKVSVGQDIKTGDVIGIRDTSHVHIGITKQKNLMVALRSAWSDD
GTWLDPLQIIRDGIGGKDNNDAVGNDTTTESQEEYYFQPFIVKDQKSIDEWGEHPGPDLV
DERFQDAEAMRKYALTTLKPDPDLNLEVTLNGNEFVPEANEIVRVIAGKKYSGSYKTVGF
TLAPAKGQDNTISLNNTKTTILDYQNQRTKRLEEALDEQRQRMEGLAGSLDQQSKSLTQV
VNDKKETDKSMEAVDQNIYWMQNGQHNLVTTMTGGTASSEKYNDSPVIEVEQGALRSNEF
NLNGVSSISSRLIAKLNATDNSISATTYVEFLKSDGSSAGKSNIVYIVNNGAWQSAGTVN
IKIPAGTTKGRLVFDVSGSGKAYVSRAQVNLGYRVTDWGSLK
NT seq
2469 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgtggccaacttttaagcctagctgggagaaaaactctacctatcaagttaccttttca
gtatttaactacggtgacccgttgtatgacgaactagacgttgaaagctcgttcttctta
gatggccaggagtatattgttaagaattgcgttgagaacttcgatacaaatactaaagat
atcactgcctggcatgtctacaatgagatcaatcgaatctataaacgtagtgacctaaca
cttaataagccgactgatgataatcaaaaccaagatgtctcatactcggtagaagatatt
cttaaagcgtggatagatggtaataacttagggttcagctatgaggttcatggtaacttc
gataagcagtcgacttctaaatttgatagtggtagcggtaaggacatgctgagcaagatt
ctggagctatggccaaacgctattgttttcccgaacaataaaaatatccgtgtttattct
gaggacgaattttataaggataacggtcggataatcgacttcccgcacgatgccaagtcg
gttaagaccactcgtgatagccaatcaattattaatgaaattcgttgtgttggtggtaag
catgaagtgcaacatacggtatataccgggactggtggagcaaatgccagtggaccgact
gaaccagttaatggcgactggacaccggtcattcagtatgctgctagcttctatggaatt
aagccaactgaccagcaactcaacgtattacgtgcacagatccatttagagtctggtggt
cgagaagatgcacaacagcctggtgccgatccagacggcgatggttctgggccggcactg
gggctgttgcaatttaagcaacggacattcaattattattgtcgggaaccgtatacgaat
gtaaaacatggctttgatgccttgattgcttttttcaatattccaaatgctttaggacaa
attaacggggttacggggtggagcccacatggtgctccaattactaaagataaattgatc
attacaccacctaatccgtggggatggccttttccaaacgttggagagggccatttttcg
ttgggacaaacatttggtactcatccacaagatggtgtcggccgaacaaacggttttcat
gatggcctggactttgggagcgtcgatcaccctggctcagaagttcatgccgtccatggt
ggaaaggtacaagatattggctatattgccgggttggaaaactatgtaacagtcgtgtct
aacgattatttgatttgctatcaggaagccttttctagtcggagcaatatcaaggtttcg
gttggccaagatattaagactggagatgtaattggtattcgtgatacttcccatgttcac
attggcattactaagcagaaaaacttaatggtggcattgcggagtgcttggtcagatgat
ggcacttggttggatccactgcagattattcgagatggtattggtggcaaagataacaat
gatgctgtcggtaacgatacgactactgaatcacaggaggaatattattttcagccgttt
attgttaaagaccaaaagtcgatcgatgaatggggtgaacatcctggcccagatttagtt
gatgaaagattccaggatgcggaagcaatgcgaaagtatgctctgacaacattaaagcct
gatccggatctaaatctggaggtaacgcttaatggcaatgagtttgtcccagaagcaaat
gagatcgttcgagttattgccgggaaaaaatattccggcagctacaaaacagttggtttt
accttggctcctgctaaagggcaagataatacgatttcattgaataacacaaaaacgact
attttggactatcagaatcaacggacgaagcgattggaagaagcgcttgatgaacagcgt
cagcgaatggaaggactggctggtagcttagatcagcaatcaaaatcgttaacacaagtt
gtgaatgataagaaagaaacagataaaagtatggaggccgtggatcagaatatttactgg
atgcaaaatggtcagcataatttagtaactacgatgaccggtggaactgcttccagcgaa
aaatataatgacagtccggtaattgaggttgaacaaggcgctctcagaagcaatgaattt
aatctcaacggtgtctcctccatctcaagtcgtctcatagctaagttaaatgcgaccgat
aattcaatttccgctactacgtatgttgaattcttaaagagcgatggcagttcagccggc
aagtcgaatattgtctatatcgtcaataacggtgcctggcaatctgccggcacagtcaac
attaaaatcccagccggcactactaaaggaagattagttttcgatgtttctggatctggt
aaagcatacgtatcacgggcccaggtaaatctaggttatagagtaacggattggggtagt
ttgaagtga
DBGET
integrated database retrieval system