Litorilituus sediminis: EMK97_09485
Help
Entry
EMK97_09485 CDS
T05852
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
lsd
Litorilituus sediminis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lsd00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
lsd02000
]
EMK97_09485
Transporters [BR:
lsd02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
EMK97_09485
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QBG35929
UniProt:
A0A4P6P6V2
LinkDB
All DBs
Position
complement(2122589..2125279)
Genome browser
AA seq
896 aa
AA seq
DB search
MSKANSRIPRAMNKKPLAVAVSSALLSMMTLPVIAADEAEEKTDRNTLEVIEVTATKHVT
NLMETPIAVTAMNPETLTRQNVKQLGDLSGMVPNLQLGLSNSDSGVKASIRGVSSNNFTE
IADPAVGIHIDGIYSPRPQGSLALMFDLEQVEVLRGAQGTLFGRNSTAGVINVIPAKPEF
DENYGWTTLQLGNYNAQQIRTVYNFGISDNFALRAALMIDKRDGYINQKQDLTDRGMKLP
DPDGEWGDSIWSGPDGKPDVDMRLNKKLDASDYYSNSDQWGGRLTGLWQITDDLAWTMGF
EHYQNNGAGHVNLKDCWAAEGTDYACDTESHFDQEVLINVPGKIDMSIDTVRSLLTYDIN
GNTVLEHRFAYANQKRVQHHDDDAGQHSLMSEVDIMYSWGNWGRQTVDDRATYTIDSEYK
SYVNELQLKQTFNNWQYVLGAFWMYENNKMEFGQDMLVQAPWGMPYSQYYDQPKREIDSK
AIFFQADVELSEKWTATAGIRYTQDERIDNEGETWGSWSADTPWYYNGADGLPVNELGMG
LPHNGTDLTMNMGPFAGKPAYGDTKVVNTYAKDWDQTTWRLGLNYQLANKQFMFASVATG
YRAGGFGDRTDACGGGTCADGSTEQWTYLDYDPETTINYELGYKATLLDDSLNLSAVFFF
TQYEDMQYTNMHPIGQKIVDRECPDWDPACDIVQAWKTENIGDSEIYGIELEFDYIPWEN
GHLNGFYAYLGTEITSYDSYNDDWMCGYREENGAEACAELFIEPGNPLSGRQLYDVTGNQ
LPNSPEHSMGLNYSHYIEMGEYQLVPWVGLRWQDKMYFTPRNLDNRAVGDYQEAYANVDA
SLKFSPVDEDWYIELYGNNLTDEVVINWMGQGANGGWKSNSYNPPRMYGIRFNISY
NT seq
2691 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtctaaagcaaattcaagaatacccagagcaatgaacaaaaagccgctcgcagttgct
gtatcgtcagcacttttgagtatgatgactttacctgtaatcgctgcagatgaagctgag
gaaaaaactgatagaaacacgttagaagtgattgaagttaccgcgactaaacatgttact
aacctaatggaaacgcctatcgcagttaccgcgatgaacccagaaacgttaacacgccaa
aatgtaaaacaattaggtgatttaagcggtatggtgcccaacttacaattgggattatca
aattcagactcaggtgtgaaagcgtctattcgtggtgtttcatcaaataactttactgaa
attgctgatcccgctgtaggtattcatatcgatggcatttactcaccacgcccacaaggt
tcattagcgttaatgttcgatttagagcaagtcgaagtgttacgtggtgctcaaggtacg
ctttttggtcgaaactctaccgctggtgtgattaatgttattccagctaagcctgagttt
gatgaaaactatggttggacaacattacagctaggtaactataacgctcagcaaattcgc
actgtatataattttggcattagcgataactttgccttacgtgcagcactaatgatagat
aaacgcgatggttatattaatcaaaagcaagatttaaccgaccgtggcatgaagctacct
gatcctgatggtgagtggggtgattcaatttggagtggtccagatggtaagccagatgtt
gatatgcgtttaaataaaaaacttgatgcctcagattattattcaaattcagatcaatgg
ggcggtcgtttaaccggtttatggcaaattaccgatgatttggcttggactatgggtttt
gaacattatcaaaataatggtgcaggtcatgttaacttaaaagactgttgggcggcagaa
ggtactgattatgcttgtgatactgaaagtcattttgaccaagaggtgctgattaatgta
ccgggcaaaattgatatgagcatagatacagttcgcagtttacttacctatgatattaat
ggaaataccgtattagagcatagatttgcctacgccaatcaaaaaagggttcaacatcac
gatgatgatgccggtcaacactctttaatgtctgaagtagatattatgtactcttggggt
aactggggacgtcaaaccgttgatgatagagcaacctacacaatagattcagaatataaa
tcttatgttaatgaactgcaattaaagcaaacttttaacaattggcagtatgtgcttggc
gcattttggatgtatgaaaacaacaagatggaatttggtcaagatatgctagtgcaagcg
ccttggggtatgccatatagccaatactatgatcaaccaaagcgtgaaattgattcaaaa
gcgattttcttccaagcagatgtagagttaagtgaaaaatggacagcaactgccggtatt
cgctacacccaagatgagcgaattgataacgaaggtgaaacctggggtagttggagcgcc
gacactccttggtactacaatggtgcagacggtttgccggttaatgagttaggcatgggc
ttacctcataatggtactgatttaaccatgaatatggggccttttgccggtaaaccagct
tatggcgatactaaagtggttaacacctatgcaaaagattgggatcaaaccacttggcgc
ttgggcttaaactaccaattggctaataagcaatttatgtttgccagcgtggcaaccggt
tatcgtgctggtggctttggtgatagaaccgatgcctgtggcggcggtacttgtgcagat
ggcagtactgagcagtggacgtacttagattatgatcctgaaactaccattaactatgaa
ttaggctataaagcgaccttactagatgacagcttaaatttatcagcagtattcttcttc
acccaatatgaagatatgcaatacaccaatatgcaccctatcggtcagaaaattgttgat
cgtgaatgtcctgattgggatccagcctgtgacatagtacaagcgtggaaaactgaaaat
attggcgactcagagatttatggtatcgagttagagtttgactatattccttgggaaaat
ggccacctaaatggtttctatgcttatttaggtacggaaattacctcgtatgattcttac
aatgatgactggatgtgtggctatcgtgaagagaatggcgcagaggcttgtgccgagtta
ttcattgagccgggtaatccgttaagtggtcgtcaattatatgatgttaccggtaatcag
ttacctaattctccagagcactctatgggtctgaattattcgcactatatcgaaatgggt
gagtatcaattggtgccttgggttggcttacgctggcaggataaaatgtactttaccccg
cgtaacttagataaccgcgcagtgggtgattaccaagaagcgtatgctaacgttgatgcc
tcgttaaaattctcacctgttgatgaagattggtatatagagttatacggcaataactta
actgatgaagtggtgattaactggatgggccaaggcgcaaatggcggttggaagtctaat
tcgtataatccaccgcgtatgtacggtattcgttttaatatttcctactaa
DBGET
integrated database retrieval system