Litorilituus sediminis: EMK97_11175
Help
Entry
EMK97_11175 CDS
T05852
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
lsd
Litorilituus sediminis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lsd00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
lsd02000
]
EMK97_11175
Transporters [BR:
lsd02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
EMK97_11175
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
OMP_b-brl_3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QBG36236
UniProt:
A0A4P6P3T6
LinkDB
All DBs
Position
complement(2496898..2499375)
Genome browser
AA seq
825 aa
AA seq
DB search
MKTYNNSKTIISKTIVLAIASSTTIATQVNAQAQDADKIERIAVTGSRINRTDVETSSPV
TVISSDFITKSGYTSVQEILSTQPAAAGMSLGATSNNGSGGSATVNLRGMGVQRTLVLLN
GRRMVASGTGADSSVDLNTIPVSIIQSIEILKDGASAVYGSDAIAGVVNIITKKDFTGTE
VNVEGSITDKGDGESGGFSVLHGTELANGNLVAGLQYSNRGEVIQADRDFVPPGESSYIP
EGSLGGFVPDGEGGWKERDSSYDYTEDSYAQTPNELISVFGSYNTELASDTELSVDLMYT
HRDSNQQMAPQPASIDLAVCQTNAQDPSSCIEMGDVLIPELDELLYKRRMTDAGPRIYKQ
QTDTYRGSIALSGILDNDAQWDISATYGRNDSKDQVENSIHAGNMQQSIYNHQDIWFSGD
PIDKDFLVSEGIIYTEENEGGNEQFILAAGYNGVTENDIGYAFGAESRFESGFYTPDEVT
QAGESTAAQQDPTSGDYSVQSVYGEISLPVTDAFTVEAATRYDNYSTFGGAATWKLGATY
RFTDTLMVRSVAATGFRAPSVSELYGGNSGSFDYLDDPWGNAEDSQILVNYTGDENLKPE
ESESFTAGVVWEIADGLSTTIDYWRFDITNAISRVNVQNEMNKCYNGDLAACDTINITPD
GDLSAMTSTLTNIGQQNTSGVDWNISYSVDIFKVMLDTTYLIEFEEDGISYEGTIDGNMG
GYSQLKSNLTVSADVTEDLNLLYTANYIQGMQGNAWGEAYKTDDVIYHNISAAYHINDAW
QLTGGIKNLFDTEPEEVPDGNDMNTVPNIYDVVGRTFFISTSIKF
NT seq
2478 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaacctataacaatagtaaaacaataatcagtaaaactatcgtcttggcaatagca
tcaagtacgacaattgcaacgcaagtgaatgctcaagcgcaagacgctgataaaatagag
cgcattgcagtaacaggctctcgcattaatcgcaccgatgtggaaacctcaagcccagtc
actgttatatcttcagattttatcactaaaagtggttacacctcagtacaagaaatttta
tcaactcagccagcagctgccggtatgagcttaggagcaacatcaaacaatggctcaggc
ggctcagcgacggttaatttacgtggtatgggggtacaacgtacgctggtattacttaat
ggccgtagaatggtggcatcgggtactggtgcggactcatcagtagatttaaacactatt
cccgtttctatcattcaatcaatagaaatattaaaagatggtgcatcagcagtatatggc
tcagatgccattgctggcgtagttaatattatcaccaaaaaagacttcactggtacagag
gtcaatgtcgagggcagtattaccgataaaggtgatggcgaaagtggtggctttagcgtt
ctgcatggtactgaactagccaatggtaatttagttgccggtttacagtactcaaatcgc
ggtgaagtaattcaagcagatcgcgatttcgttccaccaggtgaatcctcatatattcca
gaaggctctttaggtggttttgttcctgatggtgaaggcggctggaaagaacgtgattct
tcttatgactacaccgaagatagttacgcgcaaacacctaatgagctgattagtgttttt
ggtagttacaatacagagctagcatcagatacagaacttagtgttgatttaatgtacacc
catagagattcaaatcaacaaatggcaccgcaacctgccagcattgatttagctgtttgt
cagacaaatgcgcaagatccaagtagctgtattgaaatgggcgatgtgctaattcctgaa
ttagatgaactgttatataagcgtcgtatgactgatgctggcccgcgtatttacaagcaa
caaactgatacgtatcgcggctcaattgctttaagcggtatacttgataatgacgcgcaa
tgggacatctcagctacttatggtcgtaatgactcgaaagatcaggtagaaaactctatc
catgctggcaatatgcagcaaagtatttataaccaccaagacatctggtttagtggcgac
ccaatagataaagattttttagtcagtgaaggcattatttacacggaagagaatgaaggc
ggtaatgaacagtttatactagctgcgggttataacggcgtaactgaaaatgatattggc
tatgcttttggtgctgaaagtcgttttgaaagtggtttttacacgccagatgaagtaaca
caagcaggtgaaagtaccgccgctcaacaagatccaacctcgggtgattactcggtgcaa
tctgtttatggtgaaatttcgctacctgttactgatgcctttaccgtagaagcggcgacg
cgttacgacaactattcaacctttggtggtgcagcaacgtggaagttaggtgctacttat
cgttttaccgataccttaatggttcgctcggttgcggcaacaggctttagagcgccaagt
gtcagtgaattatatggtggtaactcaggctcttttgattatttagatgatccttggggc
aatgccgaagattcacaaattttagtgaattacacaggtgatgaaaacttaaagccagag
gaaagtgagtctttcacggccggtgtggtttgggaaatagctgatggcttatcgactacc
atagattactggcgctttgatattaccaatgccattagtcgcgttaatgtgcaaaacgaa
atgaacaagtgctacaacggagacttagctgcctgtgacaccattaatattaccccagac
ggtgatttatcagcaatgacctcaacactaaccaatattggtcagcaaaatacctcaggt
gtagattggaatattagttactccgtcgacatcttcaaagtgatgcttgataccacttat
ttaattgaatttgaagaagacggtattagttatgaaggtactattgacggcaatatgggc
ggttactcgcagttaaagtctaatttaacagtaagtgctgatgtaacagaagatttaaac
cttttatatacagctaattatattcaaggcatgcaaggtaatgcttggggtgaggcttat
aaaacagatgatgttatttatcataatatttcagcagcctatcatatcaatgatgcatgg
cagttaacgggcggtattaaaaacttatttgatactgaaccagaagaagtgcctgatggt
aatgatatgaatactgtacctaacatttatgatgttgttggccgtaccttctttattagt
acctcgattaagttttag
DBGET
integrated database retrieval system
