Litorilituus sediminis: EMK97_12290
Help
Entry
EMK97_12290 CDS
T05852
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
lsd
Litorilituus sediminis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lsd00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
lsd02000
]
EMK97_12290
Transporters [BR:
lsd02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
EMK97_12290
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
Ail_Lom
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QBG36440
UniProt:
A0A4V0ZG87
LinkDB
All DBs
Position
2759655..2762375
Genome browser
AA seq
906 aa
AA seq
DB search
MNNKKHFKLGYLSSLVMLNLGLSTASLAADSAVAEENKDEVEVIVVSGIRDSLIKSKDIK
LEADTIVDAITSEDIGKFPDQNVAESLQRITGVAIDRKGGEGQLITVRGMGPEFTSVLLN
GRTLATTSGGRAFSFDIFASELISGAEVFKTQAAHLQEGAIGATVNVTTFKPFDIPGFKA
VGTAKAQYDEMTGEVAPQFSGLISNTTEDDKFGVLFSFAHNERKSRYDSANTAYYWHTDL
TMDDGSYYDDIYFPQNYDQIAQSEERTRTNANLVLQYKPSDNLEFTADALYSQYDVEYRQ
DILAHWFTKDQLTDVEVDDNGTLVKLSMGKGSNSDVLVRQSDTRNELLALGFNAAWDVNS
DLNLSFDVAYSEAKSDPKRGTTDTVASRPGDYTYDRSSGAQLPQLTFDRNNSASGLKAGW
GERFGYIREDDVLEAKIDAELMVEAGPLYKIGFGTMTSDRTLASTRLRTTRPLPWTWGDN
SAAIWLPENMFSVYDADGFLSGGSGAPEQSWLTFNSEDFFDYITSADVVAQLDDPAGVQQ
LLDDNDGFTMHAVPWNYEINEKLFALYTDAYLEGEIGNMLWSVTAGLRYVKTDSTSNGFA
VPLLDLIPSEGKPGFVNAVEGDDYTPVTVKHDYDNWLPSINAKLEVMENLITRFAYSKSI
TRPELDEMSPESGYGGGDVTQLTGWGSNPKLMPFESKNLDLGIEWYYDEGSYAAIAMFQK
DVDGYLSTEEVEEQVTVPSGTYNYRISRPVNSDQADIEGYELAIQHMFTSLPAPFDGLGI
IANKTFVDSESTADEADNPLPLIGLGDSANLILFYEKDAIQLRVAWNQRDRFMQSKPESW
RDGHYVDDYAQVDISGSYDINEHLTVFFEGINVTNELYITTAKYSNQYLDITETGPRYSV
GIRGTF
NT seq
2721 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataataagaaacactttaaactaggatatctatcttcgttagttatgcttaacctt
ggcttatcaacagcatctttagccgccgactcggcggtagcagaagaaaataaagatgaa
gtggaagttattgtcgtctcgggtatacgagatagcttgattaaatccaaagatattaag
ctagaagcagacacaatagttgatgcaatcacgtcagaggatattggtaaattccctgat
caaaatgtggccgaatcattacagcgtattactggtgttgccatagatcgcaaaggtgga
gaagggcaattgataacggttaggggaatggggccagagtttacttctgttctacttaac
ggccgaaccttagcgactaccagtggtggcagagcctttagttttgatatttttgcttct
gaacttatcagcggtgctgaagtgtttaaaactcaggcggcacatttacaagaaggggct
attggcgcaacggtcaatgtaactacattcaaaccttttgatattccaggctttaaagct
gttggtactgctaaagcacagtacgatgagatgacaggagaagtggcgccgcaattttcc
ggattgatcagcaataccacagaagatgataaatttggcgtactgttttctttcgcgcac
aatgaacgtaaaagccgttacgatagtgccaatacggcttattactggcatacagatctg
accatggatgatggcagttattacgacgatatttattttccacaaaattatgaccaaatt
gcgcaatcagaagaaagaacacgcactaatgcaaatttagttttgcaatataaacctagt
gataatctggagtttactgctgatgcactctactcacagtatgatgttgagtaccgtcaa
gatattcttgctcactggtttaccaaagatcaacttaccgatgttgaagtggatgataac
ggtactttggtgaaattatctatgggcaagggcagcaacagtgacgtactagtacgtcag
tctgatactcgtaatgaattgctcgccttaggatttaatgccgcatgggatgttaactca
gatttaaacctaagctttgatgtagcctactcagaagctaaatcagatcctaaacgtggt
acaacagacacggtagcctctcgcccaggtgattatacctatgatcgtagctctggtgcg
caactaccacaattaacctttgatagaaacaactcggcatctggcttaaaagctggctgg
ggtgagcgctttggttatattcgtgaagatgatgttttagaagcaaaaattgatgctgag
ttaatggttgaagccggaccattatataaaattggctttggtactatgacatcggataga
accttagcgagcacccgactaagaaccactcgcccattgccgtggacttggggtgataat
agtgcagctatttggctgcctgagaatatgttctcagtgtatgatgccgatggattctta
tcgggcggctcaggtgcacctgaacaatcatggttaacatttaattctgaagactttttt
gactatatcacctctgcggatgtggttgcccaattggatgatccagcaggggttcagcag
ttacttgatgataatgatggttttaccatgcatgctgtaccatggaactatgaaatcaat
gaaaagctgtttgctctttatactgatgcctatttagagggtgaaattggcaatatgctt
tggtcagttaccgcaggcttacgttatgttaaaactgatagcacctcgaatggttttgcc
gtacctttacttgatcttattccatcagaaggtaagccaggtttcgttaatgccgttgaa
ggggatgattatacacctgtaacggttaagcatgattatgataattggctacctagcatt
aacgctaaattggaagtgatggagaacttaatcactcgttttgcctattctaaaagcatt
actcgtcctgaactggatgaaatgtcgcctgagtcaggttatggtggtggtgatgtcact
cagctaacgggctggggttcgaacccgaaattgatgccatttgagtcgaagaacttagat
ttaggtattgaatggtattacgatgaaggtagttatgccgcaatcgctatgtttcaaaaa
gatgttgatggttacttatcaacagaagaagttgaagaacaagtgactgtgccaagcggt
acttataactatagaatttcacgaccagttaattcagatcaagcggatattgaaggctat
gagcttgctattcagcatatgtttactagcttgccagcaccttttgatggcttaggcatc
attgccaataaaacttttgttgatagtgaatcaacggctgatgaggcagataacccgtta
ccgttaattggtttaggcgattcagccaatttaattttattttatgaaaaagacgccatt
cagttacgtgtcgcttggaaccagcgtgatcgctttatgcagtctaaaccagagtcatgg
cgagatggtcactatgttgatgattatgcgcaagtcgatatcagcggtagttatgatatt
aatgaacacctcacggtattttttgagggcattaatgtgaccaacgagctttatataacg
acagcaaaatatagcaatcaatatttagacatcactgagactggccctagatattctgtt
ggtattcgaggtactttctaa
DBGET
integrated database retrieval system