Litorilituus sediminis: EMK97_14580
Help
Entry
EMK97_14580 CDS
T05852
Name
(GenBank) DUF3372 domain-containing protein
KO
K01200
pullulanase [EC:
3.2.1.41
]
Organism
lsd
Litorilituus sediminis
Pathway
lsd00500
Starch and sucrose metabolism
lsd01100
Metabolic pathways
lsd01110
Biosynthesis of secondary metabolites
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lsd00001
]
09100 Metabolism
09101 Carbohydrate metabolism
00500 Starch and sucrose metabolism
EMK97_14580
Enzymes [BR:
lsd01000
]
3. Hydrolases
3.2 Glycosylases
3.2.1 Glycosidases, i.e. enzymes that hydrolyse O- and S-glycosyl compounds
3.2.1.41 pullulanase
EMK97_14580
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Pullul_strch_C
PUD
Pullulanase_N2
CBM_48
Pullulanase_Ins
PKD_4
PKD
Alpha-amylase
Big_9
Cadherin_4
GlgB_N
Spc29
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QBG37839
UniProt:
A0A4P6PBY2
LinkDB
All DBs
Position
3278118..3282299
Genome browser
AA seq
1393 aa
AA seq
DB search
MSSALTLTLAACGGGGSGDGGTDPVTPPAPSNNAPTIASFSATADDNSALTVNFTWQVSD
SDNDALSCVLSSGDGQADIEIADCSATTSSSITYPAYGEYTASLTVSDPSNANAKASTNF
ELIDDTALPEPSVVAGDKQLVIFYNRPDANYDGWILHLWNNNECDSYADFASDGGTDWAT
GQAQSGIDTNYGAYWLIDLKADYSDCANFIVHKGDEKDLGGIDHKADLSGDRMIWTLSGI
DELYSQATLYPSGVLIADTAAHWARLETVFWQVNSSDAVSKVRVYSAPTDELGFDGETGI
AGDNFIEFLPQTNNSATALGMPRYSDLSTFTATSAQADKAKQMLTGKLLAIAYDASDKVL
AATYVQTPRVIDDLYTSGSNDADEATLGLVYTDTSITTNVWAPTAQQVSLKVYNSDKTLQ
TTHAMSLDSDTGIWSVSLPKSNDRLFYRYELLAYHPQNQAFETIQTTDPYSLSLSTNGSY
SQFVNLNDADLKPQNWDNHQIPSIANPEDAVIYEGHIRDFSILDDSTSAANRGKYMAFTE
ADSAPVQHLKSLVAAGLTHFQMLPANDIASINEDDSEVVNLTDTVADLCALNSSAGVCTS
ESHSAILHDVLKGYDASSSEAQALVQDMRGLDSFNWGYDPKHFSAPDGSYASNPDGVARI
KEMRAMNQALHEMGLRVVLDVVYNHTNSSGLWDNSVLDKVVPGYYHRRDLTTGQVFNETC
CQDTEPEHRMMDKLMADSLVLWTQHYKFDGFRFDIMSNNSVESILSARDAVQAIDADNYF
YGEGWQRSEQGYQQAHQLNMAGSQVGTFNDRPRDVIRSASLFASSANLNNQDTIRLGLAG
TLADYLLQDRSDTLKKGGDFANHASYGKDPADIINYVSKHDNETLWDQLQYGIESGTSRE
QRVRIQNITGTIPLISQGIPFLQMGGDLIRSKSMDRNSYDAGDWFNKVDFTKQRNNWHVG
LPLAQDNEGKWSTIGSLIADNQTTVFANDIDFSSAIFSEFLAIRADSKLFRLTTAQDVID
RLGFHNTGSKQTPGLIVMSLDDGIGLTDLDNKYDAIVVVINGTDSEQTHSILTAADFELH
SIQQNSADANVQMASFTQGLNDGAFTVPALTTAVFVKKQGASQGAGLAANVTRDAPDVAP
YGDTSLYLRGSMSSWLDNELLPEHSFTYQGNGVYDLAIDLTAGSQSFRITSQDAIALDLG
FDDISLASGSISITNDNGNLTFVAASDASYQFSLDASQDKPVLSLTSVALTVDCAALTDS
NDDIPFAIAGGGQLYVRGDHSGWGADEAYRLHYKGNNTYQAVANFDGDMQFKLASDDGSW
TTQLWAQAQGGSDINTENLELGVNYQVAYNDAGTTNNQTSLAAGSYSFLLTLNEANPARG
ANVGSLIIQQCQP
NT seq
4182 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atttcaagcgcgcttacactcactttagcagcgtgtggcgggggcggctcaggcgatggt
ggtacagacccagttacaccgccagcaccgagtaataatgcgccaaccatagctagtttt
tctgctacggcagatgataattcagccttaacggttaactttacttggcaagttagtgat
agtgataatgatgccttgtcatgcgtattatcttctggagatggccaagcggatattgaa
attgctgattgcagtgcgacaacttctagctcaataacttatcctgcctacggtgaatat
accgctagcttaacggtttctgaccctagtaatgccaatgctaaggcaagcactaacttt
gaactaattgatgataccgctctacctgagccatccgtggttgccggcgataagcaatta
gtgatcttttataatcgacctgatgctaattatgatggttggattctacacttatggaat
aacaacgagtgtgatagctatgctgattttgccagtgatggcggcacagactgggcaaca
ggtcaggcgcaatcgggcattgatactaactacggtgcttactggttgattgacttaaaa
gcagattatagtgattgcgcgaactttattgtgcataaaggtgatgaaaaagacttaggt
ggtattgatcacaaggcggatctcagtggcgatcgtatgatctggacattatcaggtatt
gatgagctctacagccaagcgaccttataccctagtggcgttttaattgccgatactgct
gcacattgggcaagattagagacagtgttttggcaagttaatagctcagatgccgtcagt
aaagtacgtgtttatagcgcgccaacagatgagctaggttttgacggtgaaactggcatt
gccggtgataattttattgaatttttaccacaaactaataacagcgccactgccttaggc
atgccgcgatatagcgatttatctacctttactgcaacaagcgcgcaagctgacaaagca
aagcaaatgctaaccggcaaattattggcaatcgcttatgatgcgagtgataaagtgctc
gctgctacttatgtacaaactccgcgtgttatcgatgatttatatacgtcaggcagcaat
gacgccgatgaagcgaccctaggccttgtttacactgataccagcatcaccaccaatgtt
tgggcgccaaccgctcagcaagtttcattaaaggtgtataactcggataaaacgctacaa
acaacacatgccatgagcctagatagcgacacgggcatctggtctgttagcctgccaaag
agcaatgatagattgttttatcgttacgagttgctagcgtatcacccacaaaatcaagca
tttgaaaccattcaaacaaccgatccttattcgctatctttatcaaccaatggtagctat
tcgcagtttgttaacttaaatgatgccgatttaaagccacaaaattgggataaccatcaa
atacctagtattgctaatcccgaagatgcggtcatttatgaagggcatattcgcgatttt
agtattttagatgacagtaccagcgcggccaatcgcggtaagtatatggcgtttactgaa
gcggactctgcacctgtgcagcaccttaaatctctggtggcagctgggctaacgcatttt
caaatgttaccagcaaatgatattgccagcattaatgaagatgacagcgaagtagttaat
ttaaccgatacagtggctgatttatgcgcattaaatagtagcgctggtgtttgtactagc
gaaagccatagcgccattttgcatgatgtcttaaaaggttacgatgctagctcaagtgag
gcacaagccttagttcaagacatgcgcggcctagatagctttaactggggttatgatcct
aagcatttctctgcccctgatggtagctatgcatcgaaccctgatggtgttgctcgaatt
aaagagatgcgtgccatgaaccaagcgctacatgaaatgggtttacgcgtagtgcttgat
gtggtttacaaccatactaactcatcaggtttatgggataactcggtacttgataaagtg
gtgcccggttattatcaccgtcgcgatttaactacagggcaagtatttaatgagacttgc
tgtcaggatactgagccagagcatcgcatgatggataagctgatggctgactcactggtg
ctgtggactcagcactataagttcgacggcttccgcttcgatatcatgagtaacaactct
gttgaatcaatcttgtcagcacgtgatgcagtacaagcaattgatgctgataactacttt
tatggcgaaggttggcaacgtagtgagcaaggttatcagcaagcgcatcaactgaatatg
gcaggctcacaagtgggtacttttaatgatagaccgcgtgatgtaattcgcagtgcgtca
ctttttgcctcatctgctaatttaaataatcaagacaccatacgtttaggcttagcaggc
acgcttgctgattacttgctacaagatagaagcgatactctcaagaaaggtggtgatttt
gctaaccatgcttcctatggcaaagatcctgctgacattattaattacgtatcaaaacat
gataatgaaaccttatgggatcagctacagtacggcattgaaagcggtacatctcgagag
cagcgagtaagaatacagaatattacgggaaccataccgctaatcagccaaggtattcca
tttttgcaaatgggcggtgatttaattcgctcaaagtcgatggatagaaacagctatgat
gctggcgactggtttaacaaagtcgactttactaagcaaagaaataactggcatgttggc
ttgccgcttgcccaagataacgaaggcaagtggtcaactatcggtagtttaattgccgat
aaccaaacgacagtattcgctaatgatattgacttctcatcggcaatatttagcgagttt
ttagccattcgtgctgatagcaaactgtttagattaaccacagcacaagatgtaatcgat
agacttggctttcacaatacgggtagtaagcaaacgccaggtttaattgttatgagctta
gatgatggtattggtttaactgatttagataacaaatacgatgctattgtggtggtaatt
aacggcacagatagcgaacaaactcacagtatcttaaccgccgctgattttgagctacat
agcattcaacaaaactctgctgatgctaatgtgcaaatggcgagtttcactcaaggttta
aatgatggcgctttcactgtgccagcgttaacaaccgcggtatttgttaaaaaacaaggt
gctagtcaaggggcgggattagcagcaaatgtaacccgagatgcaccagatgttgctcct
tatggtgatactagcttgtacttacgtggcagtatgtcgagctggttagacaatgagtta
ttgccagagcatagttttacttatcaaggtaatggcgtttatgacttagcgattgattta
actgcaggtagccaaagctttagaatcacctcacaagatgccatagcacttgatttaggt
tttgatgatattagcttagcctctggcagcattagcatcactaatgataacggtaattta
acctttgttgcagcaagtgatgctagttatcagtttagcttagatgcatcacaagataag
cctgtgctatcactaaccagtgttgcgctaacagtagattgtgctgcactcactgattca
aatgatgatattccatttgctattgctggcggtggtcaactgtatgtgcggggcgatcat
tctggctggggcgctgatgaagcctatcgacttcactacaaggggaataatacctatcag
gctgtggctaattttgacggcgatatgcagtttaaacttgcctcagatgatggtagttgg
acaacgcaattatgggcacaagcacaagggggcagtgacattaatactgaaaaccttgaa
cttggcgttaattatcaagtggcctataacgacgcaggtaccaccaataatcaaactagt
ttagcagcaggtagttacagtttcttactgacacttaatgaggctaacccagcgcgtggt
gctaatgttggcagtttgattattcagcaatgtcagccctaa
DBGET
integrated database retrieval system
