Ligilactobacillus salivarius JCM1046: LSJ_1541c
Help
Entry
LSJ_1541c CDS
T03340
Name
(GenBank) putative membrane spanning protein
KO
K01421
putative membrane protein
Organism
lsj
Ligilactobacillus salivarius JCM1046
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lsj00001
]
09190 Not Included in Pathway or Brite
09194 Poorly characterized
99996 General function prediction only
LSJ_1541c
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
ABC2_membrane_3
BLOC1_2
T4SS_LegC2C7
COG6_N
DUF3533
CCDC39
Helical_needle
CCDC18_2nd
CCDC110
Rod_CreS
Nuf2_DHR10-like
FKBP15
Sec3_CC
Sec8_N
SBP_bac_4HB
Snapin_Pallidin
DUF7210
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AIR11191
UniProt:
A0A089QJP2
LinkDB
All DBs
Position
complement(1564112..1567138)
Genome browser
AA seq
1008 aa
AA seq
DB search
MKMVAEEFNNIRKHKILTATIIAIMIIPFLYSLFFLKSVWDPYGNTKYLPVAVVNNDKPV
KYQGKTFKVGEDLEKELRENKDLGWHFVNAKEAKYGLSHKKYYMVITIPKNFSKNATTVL
DKHPKKMQLTYDTNDALNYIGKVIGEEGAKQVNSSVRDSVSEAYATTMFGIVKKVGKGFD
KAAKGATQLSDGAYTLSDGLKVYTAGVDQVNDGVIQLKNGVAPLSAGVLKLTTGASVLAN
GLNQLQSKTGTLASGVNQLATGSQTLSSGLNELQGKTAALPVGVKKLFDGSNELNSGIKT
YTGGVTKLATGVNTLAGSTDSLSAGATKLNDGSKQLNDGVNKYTAGVSQLQQGLTELNGN
SKSLKDGAAQVAAGNKALAVEVAKIDVSQFNSGNTTQLINGLQQLQVVKQQLQPAMQAIT
TLQSSMGGMKDELAAVQSSSTELSNKLGSDLKTAGSSVQGSSANIQAVLGSSNLTDADKQ
KLQAALQQNQAAGNAISDAGTTAGQIKAQMDGVNAKLSGLQGQLSNLSAMSDKLTNAASV
LNGINIDPNELKGNADKLQELAKNVTTLQEATKALAKGSSDLNDGVNKYTAGVTSALNGA
NQLTDQNGALTSGASQLYAGTSELKNKLPELVTGVTKLNNGAVALVANNGKILYGSAQLA
GGIGQMNAQIPALTSGVNQLANGGNQLASGLGQMNAQIPALTSGVNQLANGGNQLAGGLG
QLNAQVPTLTNGVNQLANGTQQLATNSGQLIDGANKISEGNGTLAKSLSAGAKEVNGQNL
NSANANMFAAPTTLKHKNYSYVPNYGYALAPYMLSVALYVGALVFNLVYPIRRLSTPDGS
ATEWFFSKVAIGAVVAIGNAVVEVGLMMLAGLHPDHPAATFMNAISFSLAAMFIVMLLAI
LFSNPGRFIGMIFLVIQLGACGGSFPIQITKGMNGFFQVINPYLPMTYSVYGFRESLSSG
LGSSQMTISLTVQLIFIVASLLLLWISMSYLRTSGKVSYSEEPTSIED
NT seq
3027 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgaagatggtagctgaagaatttaataacattcgtaaacataaaattttgacggcaacg
attattgctattatgattattcccttcctatatagtttattcttcttaaaatcagtatgg
gatccttatggtaataccaagtatttacccgttgcggtagtaaataatgataagccagtt
aagtatcaaggaaagacatttaaagtcggtgaagacttagaaaaagaattaagagagaat
aaagatttaggttggcattttgttaacgcaaaagaagctaaatatggattgagccataaa
aagtattatatggtaatcacaattcctaagaacttctctaaaaatgctacaactgtgttg
gataagcatcctaagaagatgcaactgacatatgacactaatgacgcattgaattatatt
ggtaaagttattggagaagaaggagctaagcaagtaaattcttctgttcgtgattctgtt
tctgaagcatatgccacaacaatgtttggtatagttaagaaagttggtaaaggtttcgat
aaggctgctaaaggtgctacacaactttcagatggtgcatatacattatctgatggtttg
aaagtttatacagcaggtgttgaccaagttaatgatggtgttatccaacttaagaacggg
gttgctccattgagtgccggtgtattgaagttaacaactggtgctagtgtgttggcaaat
ggattaaaccaattgcaaagtaagacaggaacacttgcttcaggtgtaaatcaattagca
acaggttctcagactttatcatctggattgaatgaattgcaaggtaagacagctgcatta
ccagtaggtgtaaaaaaattatttgatggtagtaatgaattaaattctggtatcaagaca
tatacaggtggtgtgactaaattagcaacaggcgttaatactctggcaggaagtacagat
agtttaagcgctggtgctactaaattaaatgacggtagtaagcaactaaatgatggagtt
aataaatatacagcaggtgtatctcaacttcaacaaggcttgactgaacttaatggtaat
tctaaatcattgaaagatggtgcagcacaagttgccgctggtaataaagcattagctgtt
gaagttgctaaaattgatgtcagccaatttaatagtggaaatactacacaattgattaat
ggcttacaacaattacaagttgtaaagcaacaattacaaccagcaatgcaagctataaca
actctacaaagtagtatgggtggaatgaaggatgaattagctgctgttcaaagttcatct
acagaattatctaataaattaggtagtgacttgaagactgctggaagtagtgttcaaggc
tcatctgcaaatatccaagcagttttaggttctagcaacttaacagatgctgataaacaa
aaattacaagcagctttacaacaaaaccaagcagccggtaatgcaatttcagatgcaggt
acaacagcaggtcaaattaaagctcagatggatggtgtaaatgctaagctatcaggactt
caaggacaactatctaatttgtcagcaatgtctgataaattaactaatgcagctagtgta
ttgaatggaattaatatcgatcctaatgaattgaaaggtaatgctgacaaattgcaagaa
ttagcaaagaatgtaactactttacaagaagcaactaaagcattagctaaaggctcatct
gacttgaatgatggtgtgaataaatatactgctggtgtaacaagtgccttaaatggtgca
aatcaattgactgatcaaaatggtgcattgacttctggtgcaagtcaattatatgcagga
acatcagaattgaagaataaattgccggaattagtaacaggtgttacaaaattgaataat
ggtgcagtagcattagttgctaataacggtaagattttatatggttccgcacaattagct
ggtggaataggtcaaatgaatgcacaaattccagcattaacaagtggtgtaaatcaatta
gcaaatggtggtaaccaattagctagtggtttaggtcaaatgaatgcacaaattccagca
ttaacaagtggtgtaaatcaattagcaaacggtggtaaccaattagcaggcggacttgga
caacttaatgctcaagtaccaacattaacaaatggtgtaaaccaattagcaaatggtact
caacaactagctactaactcaggacaattaattgatggtgccaataagattagcgaaggc
aatggtactctagctaagagcttaagtgctggtgctaaggaagttaatggtcaaaactta
aatagtgcaaatgctaatatgtttgctgcacctacaacattgaaacacaagaattattct
tatgttcctaactatggctatgcattagctccatacatgctatcagtcgctttatatgtt
ggtgcattggtatttaacctagtttatccaattcgtcgactatcaacgcctgatggttct
gcaacagaatggttctttagtaaggtagctataggtgctgtagtagcaatcggaaatgcg
gttgttgaagtaggattgatgatgttggctggattgcatccagatcatcctgctgctacg
tttatgaatgctatttcattctcattagcagcgatgtttatagtcatgctattagcgata
ttgttcagtaaccctggacgattcattggtatgattttcttagtaattcaattaggtgcc
tgtggtggttccttcccaattcaaattactaagggtatgaatggtttcttccaagtaatt
aacccatacttaccaatgacttactctgtttacggattccgtgaatcattatccagtggt
ttaggaagcagccaaatgacaatttcattgacagttcaattaatctttatcgtagcaagc
ttattgctattatggatttctatgagttacttacgtacaagcggaaaggtaagttattca
gaagaaccaacaagcattgaagattag
DBGET
integrated database retrieval system
