Ligilactobacillus salivarius JCM1046: LSJ_2067
Help
Entry
LSJ_2067 CDS
T03340
Name
(GenBank) PrtP proteinase
Organism
lsj
Ligilactobacillus salivarius JCM1046
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Peptidase_S8
fn3_5
KxYKxGKxW_sig
Gram_pos_anchor
HpsJ
CHU_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AIR11481
UniProt:
A0A089QKL1
LinkDB
All DBs
Position
pMP1046A:74529..79121
Genome browser
AA seq
1530 aa
AA seq
DB search
MEKLLGEKRRYKLYKAKSKWVVSAIITISGVTFLVTSPVSNAQADTVNGSESVKTEATQA
SGSSVQDNATAKTTVTTNSNSSNNVSNVQTDTVKEAATSNVDSVASQNQATTAQQAKTTA
DTADQTVPPTTYKDHVKGNVQTAWDNGYKGQGMVVAVIDSGADTNHKDFSKAPESPAISK
EDADKKISELGYGKYASEKFPFVYNYASRDNNWVKDDGPDASEHGQHVAGIIGADGQPNG
NERYAVGVAPETQLMMMRVFNDQFADENTDDIAQAIYDAVKLGANVIQMSLGQGVAAANL
NDVEQKAVEYATQHGVFVSISASNNGNSASVTGEEVPYKPGGADGNFEPFSSSTVANPGA
SRNAMTVAAENSVVGAGDDMADFSSWGPLQDFTLKPDVSAPGVSVTSTGNDNRYNTMSGT
SMAGPFNAGVAALVMQRLKATTNLNGADLVQATKALIMNTAKPMTQQGYDTPVSPRRQGA
GEIDAGAATESPVYVVAADGTSSVSLRKVGDSTQFALTFKNLSDKDQTYTFDDFGGGLTE
VRDADTGTFHDVYLAGAHVYGNKTVTVKAGQSATYNFTLSLTGLKENQLVEGWLRFVGND
GQNQLVVPYLAYYGDMTSEDVFDKAANQEGTVYGGNYFVNEDNYPRGVADEDSLKALVNL
EGNYNWQQVAKLYQDGKVAFSPNADGKSDLLKPYAFVKQNLKDLKVEVLDKSGKVVRVVA
DEQGLDKSYYESGVNKDVTLSVSMRNNPNTLAWDGKVYDDKAGEMVNAADGEYTYRYVAT
LYNDGVNKVQTADYPVVIDTTAPVLSNVKYDAATHTLSFDYKDTGSGFTDYSYAVVKVND
KTFGYKLNDGKNSKFLDAAKTSGTFKAVLGSDTLAALTAAKNALSVAVSDVADNTSTVTL
LVNGNNDATTKVSVWNATNGLELDQSSPDYQAATSTYNLRGNATSDFYYNGALVQVDNSG
NFVVPVSTSDTAVVFTSDAAGKNVVYKLNTATPKAVFAWQVNNTVKENFGIVLDTVVSNN
KDDVVVQAAVTKGDNVEAYARDYFTGAVYKADVKDGLATFHVKVTNNSGRTVLLGWTEVV
GPTFNDVQRTSANGVYLGVDTDTENPTPAPAFTSADQLGTNVVQEKADSATIGNPGDLPG
HSLKDLTTRADANPDIHFDYLKDNDYNWVGAQAVKDGVYNPSTQVFTLTGKVDPNVKSLV
VLGDSYNEDDPVNKVNLNSDGTFSFQFHTAPTSQRPVAYIYTKDDGSTTRGTMELILDTV
LPTLSLNNVANLQLDSNGDYQVYTNNKDFSVSGEATDNLDGYRFFFNGDNDYREFHNSGV
NFVAEAHQDGSTVTNPYPAYKFSKTFNLADATGETTHVYTLSVVDLTGNTVTRKFYVHYQ
PASDTVKTVTTDKDGATKVLVDYNNNTLQVKDNTGNWVNATAGVEAAKNYRVVNEYGNVV
LLLNVLADKEQDNNKVQVNEVTNNKVEQTVVTKTVSNKSVAKVGKKAAEPVKVLPQTGEN
NSKSTSVLGAVLASIAGFLGALGLRRVKKD
NT seq
4593 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaaaagttgctaggtgaaaaacgccgctacaagctttataaagctaaatctaagtgg
gtggtgtcagcgattattactatttctggagttacatttttagtgacaagtccagtttct
aacgctcaagccgataccgttaatggtagtgaaagtgtaaaaacagaagctactcaggca
tcaggttcgagtgtgcaggataatgcgacagctaaaacaactgttacaaccaatagtaat
agttctaacaatgtttctaatgttcaaactgataccgtaaaagaagcagcaacgagcaat
gttgattcagtagctagtcaaaatcaagctacaacagctcaacaggctaaaactactgct
gatactgctgatcagacagtaccaccaacaacctataaagatcatgtcaaaggaaatgtt
caaactgcatgggataatggctataaaggacaaggtatggtggttgctgttattgattct
ggtgctgatacaaaccataaagatttctctaaagctcctgaatctccagcaatttctaag
gaagatgctgacaagaagattagcgagctaggctacgggaaatatgcttcagagaaattc
ccattcgtatataattatgcgagtcgtgacaacaactgggttaaagatgatggcccagat
gcatcagaacacggtcaacacgttgctggtatcattggtgctgacggccaaccaaatggc
aatgaacgctatgcagtaggggtagcacctgaaacacagttaatgatgatgcgagtattt
aatgatcaatttgctgatgaaaatactgatgatattgctcaagcaatttatgacgcagtt
aaattaggtgctaatgtaattcaaatgtccttaggtcaaggcgtcgcagctgctaatttg
aatgatgtagagcagaaagcggttgaatatgcaactcaacatggtgtgttcgtctccatt
tcagcttctaacaatggtaattcggcaagtgttactggtgaagaagttccttataaacca
ggtggagcagatggaaactttgaaccattctctagtagtacggtagctaatccaggtgca
tcgcgcaatgcaatgacagttgcagctgaaaactcggttgtaggtgctggtgatgacatg
gcagacttctcttcttggggtcctttacaagatttcactttgaaaccagatgtatcagct
cctggggttagtgtaacttcaacagggaacgataatcgttacaatactatgagtggaact
tctatggctggtccatttaacgctggggttgcagctttagtaatgcaaagattaaaagct
actactaacttaaatggagcagatttagttcaagctactaaagctttaatcatgaataca
gctaaaccaatgacgcaacaaggatatgacactccagtttctcctagacgtcaaggtgct
ggtgaaattgatgcaggtgctgcaacagaatctccagtatatgttgtggcagcagacggc
acaagttctgtatctttgagaaaagttggagattcaactcaattcgcactaacgtttaag
aacttatccgataaagatcaaacatatacttttgatgattttggtggtggattaactgaa
gtgcgcgatgccgatacaggaactttccacgatgtttatctggcaggagcacatgtctat
ggaaataagacagtaaccgttaaagctggacaaagcgcaacttataatttcacattatct
ttaacaggtttgaaagaaaatcaattagttgaaggttggttgagatttgtaggaaatgat
ggtcaaaatcaattagtagttccatatctcgcatattatggtgatatgacaagtgaagat
gtatttgacaaagctgctaatcaagaaggcacagtctatggtggtaactactttgttaat
gaagataactatccaagaggggtagctgatgaagattccttaaaggctttagtaaatctt
gaaggtaattataattggcaacaagttgctaaattataccaagatggaaaagttgcattc
tcaccaaatgctgacggtaagagtgacttattaaaaccatatgcctttgttaaacaaaat
ctaaaggatcttaaagttgaagtattagataagagtggaaaagttgttcgtgtagttgca
gatgaacaaggtctggataagtcttactatgaaagtggagttaataaagacgtaacttta
tcagtttcaatgcgtaataatccaaatactttggcttgggatggaaaagtatacgatgat
aaggccggtgaaatggtaaatgcagcagatggtgaatatacatatcgttatgttgctact
ttgtataatgatggtgtaaataaggttcaaacagctgattatccagtagttatcgacaca
acagctccagtattatcaaatgttaagtatgatgctgcaacacatactttaagctttgat
tataaagatacaggatctggctttacagattattcttatgcagtagttaaagttaatgat
aagacatttggctataagttaaatgatggcaagaattcgaagttcttagatgcagctaaa
acatcaggaacatttaaagccgtattaggtagtgatactttagcagcacttactgcagct
aagaatgctttatcagttgcagttagcgatgtagctgataatacttcaacagtaacctta
ctggtaaatggaaataatgatgcaacaactaaagtatctgtttggaatgcaactaatgga
ttagaactcgatcaaagttccccagattatcaagcagcaacttcaacttataacttacgt
gggaatgcaacatctgatttctattacaatggtgcattagttcaagttgataacagtggt
aattttgtggttcctgtaagtacaagtgatactgcggttgtcttcacatcagatgcagct
ggtaagaatgtagtatataaattgaatacagcaactccaaaggctgtttttgcatggcaa
gtaaataatactgttaaggaaaactttggtattgttttagatacagtcgtaagcaacaac
aaggatgatgtagtcgtacaagcagcggttactaagggggataatgttgaagcttatgca
cgcgactacttcacaggtgcagtatataaagcagatgtaaaagatggattagcaactttc
cacgtaaaagtaactaataatagtggtagaactgtattattaggatggacagaagttgta
ggaccaacatttaatgatgttcaaagaacttctgcaaatggtgtttatttgggtgttgat
acagatacagagaatcctacgccagcaccagcctttacaagtgctgaccaattaggaaca
aatgttgttcaagaaaaagctgattctgctacaattggtaatccaggagatttgccagga
cacagtctaaaggacctaacaacacgtgcagatgctaacccagatatccactttgactac
ttgaaagataatgattacaactgggtaggagcgcaagctgttaaagatggtgtatataat
ccatcaacacaagtatttactttaacaggtaaggttgatccaaatgttaaatcattggtg
gtattgggagatagttacaatgaagatgatcctgtaaataaggttaacttaaatagtgat
ggaacatttagtttccaattccatacagcaccaacttcacaaagacctgttgcttacatc
tatacaaaagatgatggttcaacaactagaggtacaatggagttaatcttagatacagtt
cttccaacacttagcttaaataatgtggctaatttacaactggatagtaatggtgattac
caagtctacactaataataaagactttagtgtatctggagaagctactgataatttggac
ggatatcgtttcttcttcaatggagataatgattatcgtgaattccacaattctggtgtg
aactttgttgctgaagctcatcaagatggaagtacagtgactaatccatatccagcatac
aagtttagtaagacatttaacttagctgatgcaactggcgaaacaacacatgtatataca
ttgagtgtagttgacttgacaggtaatactgtaactaggaagttctatgttcactatcaa
ccagctagtgatacagttaagactgtaacaactgataaagatggtgcaaccaaagttcta
gtagattacaataacaatacactacaagtaaaagataatactggtaactgggtaaatgct
actgctggagttgaagctgctaagaattatcgagtagttaatgaatatggtaatgtggta
ttgttactaaatgttcttgcagataaagaacaagacaataataaagtacaagttaatgaa
gttacaaataataaagtagaacaaacagtagtaactaagactgtttcaaataaatctgta
gctaaagtgggcaaaaaagctgcagaaccagtaaaagtattaccacaaactggtgaaaat
aacagtaaatctacttctgttctaggtgcagtcttagcctcaatcgcaggattcttaggt
gcattaggcttaagacgtgttaaaaaagattaa
DBGET
integrated database retrieval system