Lepeophtheirus salmonis (salmon louse): 121120720
Help
Entry
121120720 CDS
T08214
Name
(RefSeq) uncharacterized protein isoform X2
Organism
lsm
Lepeophtheirus salmonis (salmon louse)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Apolipoprotein
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
121120720
NCBI-ProteinID:
XP_040571510
LinkDB
All DBs
Position
6:53792069..53891651
Genome browser
AA seq
1465 aa
AA seq
DB search
MSTPADNLWYHSIRYLEKYRLDYNRHGIQEFYDFPDETGILSRHEQLFRKEYEKGAIELK
HMYFELVKLFFERERKLYPKAHEHLRDVYKIQGYQDLTNRLQSTMNNNIFMNIEELSDKV
DGLVKSDKNAILAEKVVFLEKENEFLRDEYTRIEKSYQLLSDRLDAKDETDSTNILLITQ
QMRELQEAVEIMRKDTKLEREMTDRFEALEKADDFLRENQTQHAIKLEGINGDCKRVTTE
VNEVIKFTNTEFSKVNTNFENLMETELPKLAQNCNNNIQIIRNEAEIMNNEIKSMKPKID
LNTENIQGISRVLSPMEDEVSVLSKGLNINVLPNLSSINTGLDKVIHTVNAHEGQLEKME
IETKSSLKNTTTKIEEIMTEFNYGNRINALEMEVNRNHAEKLDRIENEIAPRITKLDNEL
RPKIQNVEIMIKDIDSKLRSNIDEIQVKVNNQLESERIEGVKRMEPKFNDMTKIVNDNFA
KLELEIHEKLWPYIKEMDHDYKAELKEKVWPSVEGIIADINLKMSKMEENHINLSKEFNI
QLVDLQNRTQKDVADNLINKLNDVQDKIYKDMNDITKQTNEFQLKYANELNDSMWPRIEK
LDKRIFELGGDVQQQINLQISNYQSETTTNIMNEVMIIINEFKNEINPKHKDLEKRVANN
EVELFEKLWPFVKDLDREMSTKVSPFMKTTVENVESLHTNLNKCNEEIFNNVWPFIKNIN
KESSEQLSISINNLEKKYDNEIFDNLWPFVKEMDKDFKIELGEKMWPQINSLENKITELN
PKIENQNEIVQTILPKLETINSEVDRKISHSINLFKTENNTEIQNKIQLNLTQYSEKQNS
EVNDKLWDKINEVESKTLNSEVEIFEKLWPFIQSMDSDVKEELADKIWPEINNCKELQIK
ISEVENKTSLYQQDANKEFDSKLLKMENEMKDQINININNFRLENNIEIDKKIEINLENY
NRDQSSNVTDKIWERLEELQISSHDNNIELHEKLWPYILEMDKDIKIEMGEKLWPEVNKI
KDVEPKIERINSKIQSIEPRIDEVDSKANHTEKEVYNQLLPKMNNIDSEIDRKISVNINN
FKTENNTDITNKILLSLKEYKKEQESEVNNKIWEKITEIQAELYEKLWPYVQEMDKDNKV
EMTERLWPELNKVKKIEAQLQEITPKIKDVEDRALTSQNEIVERVIPKLNTIDSEIDRKI
SVNINNFKTENNTDITNKILLSLNDYKKEQDSEVNEKIWERLTEIQAELYDKLWPYVQEM
DKDHKIEITERLWPELNKVKDIEVQLKEITPKIKDVEDRALTSQNEIVERVIPKLNTIDS
EIDKKISVNINNFKTENNTDITNKILLSLNDYKKEQDSEVNEKIWERLTEIQAELYDKLW
PYVQEMDKDNKIEITERLWPELNKVKNIEVQLREMTPKIKDVEDRALTSQNDIVDKLLPQ
LNKLKDIEAQLQKSHPRSRMWKTEL
NT seq
4398 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtccacgccggccgataatttgtggtatcattccatacgatatttagaaaaatatcgt
ctggattacaatcgccatggaattcaggagttctacgactttcccgatgagacggggata
ctttctcgacatgagcagttatttcgtaaagaatatgaaaaaggagctatcgagctcaaa
catatgtattttgaattagtgaagctgttttttgaacgtgaaagaaagttatatcccaaa
gctcatgaacatctcagagatgtttacaaaatccaaggatatcaggatcttacaaatcga
ctccaaagcaccatgaataacaatatttttatgaatattgaggaattgagtgataaagtc
gacggtttagtaaagagcgataaaaacgctattctcgcagagaaagtggtgtttttggag
aaagagaatgagttcttgagagatgagtacactcgaatcgaaaaatcatatcaactcctg
agtgatcggttggatgccaaggatgaaacggattcaactaacatcctccttattacccaa
caaatgcgcgaattacaagaggctgtggagatcatgagaaaagatacgaaacttgagaga
gaaatgaccgatagatttgaagccctagaaaaagctgatgactttctacgagaaaatcaa
actcaacatgccattaaattagaaggaatcaatggggattgcaaacgagttaccactgaa
gtgaatgaggttatcaaatttacaaatactgagttctcaaaagttaatacaaattttgaa
aatttaatggagactgaactccctaaattggcacaaaattgcaacaacaacatccaaatt
atccgaaatgaagctgaaataatgaataatgaaattaagtctatgaaacccaaaattgat
ctgaacacggaaaatattcaaggaatttctcgagtattgagccctatggaagatgaagta
tctgtattgtctaaaggattaaatatcaatgttcttcctaacctttcttcaataaatacc
ggcctggataaagtaattcatacagtaaacgcccatgaaggacaattggaaaagatggaa
attgaaaccaaaagctctttgaagaatacgactactaagattgaggaaattatgacggaa
tttaactacggaaatagaattaatgctcttgaaatggaagttaacagaaatcatgctgaa
aaattggaccgaattgaaaatgaaattgctcctagaataacgaagttggacaatgagtta
cgaccaaagattcagaatgttgaaattatgattaaggatattgattcaaaattaaggagt
aatattgatgaaatacaagttaaggttaacaatcagcttgaaagtgaaagaattgaagga
gttaagcgcatggaacctaagtttaatgacatgaccaagattgtaaacgataactttgct
aaattagaacttgaaattcatgaaaagctatggccctacattaaggaaatggatcatgat
tacaaagcagaattaaaagaaaaggtttggccatcagttgaaggaataattgctgacata
aacctaaagatgagtaaaatggaagaaaatcatattaatttgtccaaggaattcaatatt
caattggtggatttgcaaaacaggactcaaaaagatgttgctgataatttaattaacaag
ttaaacgacgttcaggataagatttataaggacatgaacgacattactaagcaaacaaat
gaatttcaattaaaatatgcgaatgagctaaatgattctatgtggccaagaattgaaaaa
ctggataaaagaatctttgaactaggtggtgatgttcaacagcaaattaatcttcaaatc
agcaactaccaaagcgaaactactactaatataatgaatgaagtaatgataataataaat
gaattcaagaatgaaattaatcccaaacataaagatctcgaaaaaagagttgcaaataat
gaagttgagctttttgaaaaactatggccttttgtaaaagacttggatcgtgagatgagc
acaaaggtatcaccttttatgaaaacaactgttgagaatgttgagagcttacatactaac
ctaaataaatgtaatgaagaaatttttaataatgtatggccttttattaaaaacattaac
aaagaatcctcagagcagctttctattagcattaataatttagagaaaaaatatgataac
gaaatatttgataacttatggcctttcgtaaaagaaatggacaaggacttcaaaattgaa
cttggggaaaaaatgtggcctcaaataaattcacttgaaaacaaaataactgaattgaat
cctaagatcgaaaatcaaaatgaaatagttcaaacaattcttcctaaacttgaaactata
aactctgaagttgatagaaaaataagccatagtatcaatctatttaaaacagaaaataat
acggagattcaaaataaaatacagcttaatctaactcaatatagtgagaaacaaaactca
gaggtgaatgataagctatgggacaaaatcaatgaagtagagtctaaaacgcttaattca
gaagtcgaaatctttgaaaaattatggcctttcattcaatctatggatagtgacgtcaaa
gaagagcttgctgataaaatatggcccgaaataaataattgcaaagaacttcaaattaag
atatctgaagttgaaaataaaacatctttatatcagcaagatgcaaacaaagagtttgat
tcaaaattattaaaaatggaaaatgagatgaaagatcaaatcaatataaatattaataat
ttcagactggaaaataatattgaaatcgataaaaagattgaaatcaatttggaaaattat
aacagggatcaaagctcaaacgtaacagataagatatgggaaagactggaagaattgcaa
atatcctctcatgacaataatattgaattgcatgaaaaattatggccttatatattagaa
atggataaggatataaaaatagaaatgggagagaagctatggcctgaagttaacaaaata
aaagacgttgagccaaaaattgaaagaataaattcaaaaatacaaagtattgaaccacga
atagatgaagttgattcaaaagcaaatcatactgaaaaagaagtctataatcagcttttg
ccaaagatgaataacatcgattcagaaatagacagaaaaatcagtgttaatataaacaat
ttcaaaacagaaaacaacacagacatcaccaacaaaatattgttaagtctaaaggaatac
aaaaaggaacaagaaagtgaagtaaataataaaatttgggaaaaaataaccgaaatacaa
gcagaattatacgaaaaactttggccatatgtccaggaaatggataaggacaataaagtg
gaaatgacagaaaggttatggcctgaactcaacaaagtaaagaaaattgaagctcaactg
caagaaatcacacccaagatcaaggatgtggaagacagagctttaacatcacaaaatgaa
attgtggaacgagtaattcctaaattgaatacaattgactctgaaattgataggaaaatc
agtgtcaatattaacaatttcaaaacagaaaacaacacggacatcacaaacaaaatactt
ttgagtctgaatgattacaagaaagaacaagatagtgaagtcaatgagaaaatttgggaa
agactaacagaaattcaagcagaactctacgataaactctggccctatgttcaggaaatg
gacaaagatcataaaattgaaatcacggagagattatggccagaactcaacaaagtcaag
gatattgaagttcagctgaaagaaatcacacccaagatcaaggatgtggaagacagagct
ttaacatcacaaaatgaaattgtggaacgagtaattcctaaattgaatacaattgactct
gaaattgataagaaaatcagtgtcaatattaacaatttcaaaaccgaaaacaatacggac
atcacaaacaaaatacttttgagtctgaatgactacaagaaagaacaagatagtgaagtc
aacgagaaaatttgggaaagactaacagaaattcaagcagaactctacgataaactctgg
ccctatgttcaggaaatggacaaagataacaagattgaaatcacggaaaggttatggcca
gaactcaacaaagttaagaatatcgaagttcaactaagggaaatgacaccaaagatcaag
gatgtcgaagatagagctttaacatctcaaaatgatattgtagacaagcttttacctcaa
cttaataaattaaaagatattgaagctcaactgcaaaaatcacacccaagatcaaggatg
tggaagacagagctttaa
DBGET
integrated database retrieval system
