Lepeophtheirus salmonis (salmon louse): 121126716
Help
Entry
121126716 CDS
T08214
Name
(RefSeq) uncharacterized protein isoform X2
KO
K06277
Rap guanine nucleotide exchange factor 1
Organism
lsm
Lepeophtheirus salmonis (salmon louse)
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
RasGEF
RasGEF_N
TLP-20
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
121126716
NCBI-ProteinID:
XP_040577956
LinkDB
All DBs
Position
12:2395264..2456185
Genome browser
AA seq
932 aa
AA seq
DB search
MMRGRFTSRAHSFKENLLEVLENKGVKKKRIICGGSSDNILEYERDILCPDIKKGYLMHE
MELALDYFEEAVIKRRFELLPGCANVVLETLLSIQKLVGNEKLVRVFKELASLTLWADSI
LLGYRSIESWEKVENTVKAIKNGVRRSLESFSSECHVSKMVELKKSSSFHNSLPDMLSEV
PPPLPPKLKHRSFTPQIDWFSNPLFQSPQIISNQFIGCDRLNLIQNETSIDINSFGIEDR
LSLPFMLGTSTCIASNCNINFYPSLNVFKSKSVLRAAQEHTHPDNIILCSRKKSMSKNQN
DDSVHEELNSITTLPPPLPPKKTNIMTYMEIFGKSVFPSGEFIRHGLSRTEDILQKVWQE
NYHDYSIDYSSSSISSGIFLNFPTYNVVLFSKLAHNDCPPILPPKKNQRSNIKTVVCDNF
QYYINSSLPNFVGSTNNLTQQSSITKSNFPLSRDHSYLSELSSDKSENNRSSTSPETMSS
LSNGTIGFASGSFKVKKKSIGVHINSVADTNESSYMENNSLLDILDVTQSDYLIYYNGNE
VRAGIVDALVVLATQSYKNDFLFQEAFLATYRTFLTANELLHKLMLRFRKFNKGNVTNHQ
RAAKSAFSLMVRVVDCLADCDFQDVEVMELLTKFMSELVSDGELMLSRALRSKFIQRYDK
HRAKVTPELDVLPSIRSKSKTFNILNFKSTDLAEQMTYLDYQLFIRLDTVELILWVQEQN
EDKSYNLTKFTEHFNNMSFWCRTQILQQDDSKEREKYMTKFIKIMKFLRKYNNFNSYLAI
LSALDSAPIRRLEWHKNIIDNLKEYCSLIDSSSSFRAYRQALNESGSPCIPYVGLILQDL
TFVHIGNSDIYHGKINFAKRWQQFNILDNLRRFRKENYHFKRREDIISFFDGFSLYLSED
ELWQLSESIKPRCSNYPKTCIIKDRPFLYNGI
NT seq
2799 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatgagagggcggtttacatctcgagctcatagttttaaagagaacctattggaagtg
ttggagaacaagggggtgaagaagaagaggatcatttgtggcggctcttccgataatatc
ttagagtatgaaagagatattctttgtcctgatataaagaaaggttacttaatgcatgag
atggaactggctttagattattttgaagaagcagtaattaagaggaggttcgaacttcta
cccggatgtgctaatgttgttctggaaactttattatccattcagaaattagttggaaat
gagaagcttgttcgtgttttcaaggaacttgcttctctcaccctttgggcggacagtatc
ttacttggatatagaagcattgaatcttgggaaaaggtggagaatactgtgaaggcaatc
aaaaatggagtccgtcgatctttagagagtttctcatccgaatgtcatgtctcaaaaatg
gtcgagcttaaaaaaagctcatcatttcataactctcttcctgatatgctatcagaagtt
cctcccccattaccaccaaagttgaagcatcgctcctttactcctcaaattgattggttt
tcaaatcccttgttccaaagtccgcaaataatatctaatcaatttattgggtgtgataga
ttaaatcttattcaaaatgaaacttcaatcgacattaactcttttggcatagaagataga
ctatctttaccttttatgcttggtacatctacttgtattgcttcaaattgcaatatcaat
ttttatcccagtttaaatgtctttaaatccaagagtgttttaagggctgctcaagaacac
acgcaccccgataatattatattgtgttcacgtaaaaaaagtatgtctaaaaatcagaat
gatgacagcgtacatgaagaattaaactcaattaccacgctacctccacctctgcctcca
aaaaaaaccaacattatgacatatatggaaatatttggcaaatcagtttttccgtctggt
gagtttatcaggcatggtttaagtcgaactgaagatattttacagaaagtttggcaggaa
aattaccatgattactctatcgattattcatcaagttctattagttctggcattttttta
aactttcctacatataacgtagtgctattttcgaaattagcgcataatgattgtccaccg
atcttaccgccaaaaaaaaatcaacgttctaatattaagactgtagtttgtgacaatttt
caatattatatcaattctagtctacctaattttgttggttcaactaataatttaactcaa
cagtcttcaattaccaagagtaattttccacttagtcgagatcattcatatttatctgaa
ctatctagtgataaaagtgagaataacaggtcatcaacatcacccgaaactatgtcgtcc
ttatctaatgggacaattggctttgcttctggttcttttaaagtgaaaaaaaaaagtatt
ggtgttcacattaattctgttgctgacacaaacgaaagttcttacatggaaaataattct
ttacttgatattcttgatgtcactcagtcagattatttaatctattacaatggcaatgaa
gttcgtgctggaatagtagatgctctggtcgttttagctacacaaagttataagaacgac
tttctgtttcaggaagctttcttggcaacctatagaacttttcttacggcaaatgaatta
ttgcataagttaatgctaagatttagaaaatttaataaaggaaatgttacaaatcatcaa
agagcagcaaaaagtgccttttcgttaatggttagagttgtagattgccttgctgactgc
gattttcaggacgttgaagttatggaactgttaactaaatttatgtctgaattagtctca
gatggagaacttatgctatctagagctcttcgttccaagtttatccaaagatacgataaa
catagggcaaaagttacaccagaattagatgtcctaccttcaattagatcaaagagtaaa
actttcaatattttgaatttcaaatcaacggatttggctgaacaaatgacttatttggat
tatcaactttttattagactggatacagttgaactcatactttgggttcaagagcagaac
gaagataaatcttataatttaacaaaatttactgaacatttcaataatatgagtttttgg
tgtcgaactcaaatattgcaacaggacgactccaaagaaagagaaaaatatatgacaaaa
tttatcaaaataatgaagtttttgcgaaaatacaataatttcaactcttatttggctatt
ctttcagctttggattcagctcctattagaagattagagtggcataagaatatcattgat
aatttaaaggaatattgctcattaatcgattcatcatcttcattccgggcttacagacaa
gcattaaatgaatctgggtcaccatgcataccttatgttggtttgattttacaagactta
acatttgttcacattggaaatagcgatatatatcacggaaaaatcaactttgctaagcga
tggcaacagtttaatattttggataatttacgaagattccggaaggaaaactatcatttt
aagcggcgtgaagatattatttccttttttgatggcttttcattgtatttatccgaagat
gagctatggcaactatcagaaagtattaaaccaagatgctcaaattatcctaaaacctgt
atcatcaaggatcgaccttttctctacaacggtatctga
DBGET
integrated database retrieval system
