Lepeophtheirus salmonis (salmon louse): 121128748
Help
Entry
121128748 CDS
T08214
Name
(RefSeq) voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2 isoform X1
KO
K04859
voltage-dependent calcium channel alpha-2/delta-2
Organism
lsm
Lepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lsm00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
04040 Ion channels [BR:
lsm04040
]
121128748
Ion channels [BR:
lsm04040
]
Voltage-gated cation channels
Calcium channel, voltage-gated (Cav)
121128748
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
VWA_N
VGCC_alpha2
VWA_3
VWA
dCache_1
VWA_2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
121128748
NCBI-ProteinID:
XP_040580276
LinkDB
All DBs
Position
13:6560900..6579656
Genome browser
AA seq
1171 aa
AA seq
DB search
MATSVEKSRLANYSKSIGIQRSVSFFIMFYYVLILFCLHSVESQTFPSAETAKSWSLRID
EAFKKISSGDGDLTGAETFQKKFQDNIGESVIVSTDGKKIAETVSKEITRIFDYNIKALK
NLVSNIEGLVKNYKYNDDLSIGNLSNYLNMAKSHETNSADFAYDPKFKQDVNLKQSGVHI
PLEIYEGYNSNQMSRICIDCISVCDLCDNGMFWQDHSSNLGVVQDPDILNGIEWSGALDD
VLKDNYKKYPGVYWQSFGSQTGFLRVYPAARWQSSIEHPDLFDVRRRPWYIHGSVTPKDM
IILLDTSGSMHGQSFDIMKLAAKMLINTLGEDDYFNVASFDRNVSWVTPCLDTLVQANSR
NKRLIFDGIDQLEARYIASYTDGLNFAYDNFEQFERTKEEEEGAECHKLVMVFSDGGTIY
PEKVINYYRNQTLTENVRIFSYAVGPHPLPTVALKTMACRTGGAFTTITAMGAIRTKVQD
SYLNVIARPQVLNKIHTLQFTSVYADALDYARVLSKPLILTNSKTYYQSTHYSRDYLGLG
LITTVTYPVFNTSDGSDNQTLAGVVGIDIPVNDLEALIPRRQLGALGYGFALNQNGFLVF
HPKLWSFMNYFEDPSHVDFADVVGESEPLRTVRKQMIDEIQGSSTIEIDHEVLEFNYFHV
PNSSFSVGIVNPENWSYIKPGAEDINIISDMLSLIENADIAPWIYCNENGIIKNQNLTWL
IKQIKKGKCESKESLHHLSWDVKNALPVFKSLMAQNLSPHDFPSRFVQTEGGFTIHTGFD
ELSNDPYNSTIYKVITKYSRKNFDQPFLYLDKKQNQIKNRILPKYKIDHDEFIFNDAIEI
VTRPELVKNNPVEDFEERAQLHLVKPFFVKQGNNQFMAGISGIELSYEYLAKIFSDATSE
IKTDEYNCFNNTELRCEIIDISGSILHSNREDVALGDFLGSVDPNLMRHMVEKLEIFVDE
NPIINYQALCPDSFECTASGVKVLPFSLDQAVKVWYSFLGVFQALQIVITSFLTTIYSFS
EGSFGLSQFNHKVQEGIHRCTTKTSVWTINPNLKKSEFHDRMTSTCRSETECKRDLHMFK
LKNINGLFVVSNPECAHCNAPPFPKGPVEIMATENCLLPHRYRKRQSGCFAQSDMETSEC
SKGSINLPGLWKTLILMYLSLLSPIFLRKLL
NT seq
3516 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcaacatcagtagagaaaagtaggcttgctaattacagcaaaagtatcgggatacaa
cgttccgtctcattctttatcatgttttactatgtattgatactattttgtctccattcc
gtcgaatctcaaacatttccaagtgctgaaacggccaagtcatggagcttacgaattgat
gaagctttcaaaaagatatcaagtggagacggagacttgactggagcagagacttttcaa
aagaaatttcaagataatatcggagaaagtgtaattgtttcaacagacgggaaaaaaatt
gccgaaactgtttccaaagaaatcacgcggatttttgactataacatcaaagcgttaaaa
aatttagtctccaatattgagggcttggtaaaaaactacaaatataatgatgacttaagt
ataggcaatctcagcaattacctcaatatggccaaatctcatgaaacaaactctgctgac
tttgcttatgaccctaaatttaagcaagacgttaatttaaaacaatcgggagttcacatt
ccattagaaatctatgaaggatacaattctaatcaaatgagtagaatttgcatagactgt
ataagcgtttgtgatctatgcgataatggaatgttctggcaagatcattcatccaatctt
ggtgttgtacaagatccagacatattaaatggaatagaatggtcaggtgcattagatgat
gtgcttaaggataattataaaaaatatccaggtgtgtattggcaaagttttggatcacaa
acaggatttttgagagtatatccggctgcaaggtggcaatcgagtattgaacacccggat
ttatttgatgttcgacgacgtccctggtatattcatggctctgttactcctaaagacatg
atcatattgcttgatacgagtggaagtatgcatggtcagtcctttgacattatgaaattg
gctgccaaaatgctgatcaatactcttggggaggacgactatttcaatgtagcatctttt
gaccgaaatgtatcatgggtgacgccgtgtttagataccttagtgcaggccaattcccgt
aataaacgacttatatttgatggaattgatcaattggaggctcgatacattgcctcttat
acggatggtttgaattttgcttatgacaattttgaacaatttgaaagaacaaaagaagag
gaggaaggtgcagagtgtcataaattagttatggtttttagtgatggaggtactatttac
cccgaaaaggttattaattattatagaaaccaaaccttgactgaaaatgtaaggatattt
agctatgcagttggacctcatcccttgcccacagttgctcttaaaaccatggcatgtcga
actggaggggcttttactacaattacagcaatgggagctattcgtaccaaagttcaagat
tcctatttaaatgttatcgcaaggcctcaagtactcaacaagatccatactcttcaattt
acatcggtgtacgccgatgccttggattatgctcgtgtcctgagtaagcctcttattcta
actaacagcaaaacctattatcaatcaacgcattacagtagggactatttgggccttgga
ctcataacaaccgtgacgtatcctgttttcaatacatcagatggatcggataatcaaaca
cttgctggagttgtagggattgatattcctgtgaatgatttagaagctcttattccaaga
cgtcaattgggtgcattgggatatggatttgctctgaatcaaaatggatttttagtattc
catcctaaactatggtctttcatgaactatttcgaagatccatcgcatgtagattttgcg
gatgttgtgggcgaatcggagccattaaggactgttaggaagcagatgatagatgaaatt
caaggaagttcaaccattgaaattgatcatgaagtcctcgagtttaactatttccatgtt
cctaattctagctttagtgtggggattgtaaatccggaaaattggagttacattaaaccg
ggagcagaggatataaacattatatctgatatgctcagtcttatagaaaatgcagatatt
gctccatggatttattgcaacgaaaatggtataataaaaaaccagaatttgacatggcta
ataaaacaaatcaagaaaggaaagtgtgagtctaaagaatccttgcatcatttatcatgg
gatgtaaaaaatgcacttcctgtctttaaatcattaatggctcagaatctatcacctcat
gatttcccttcaagatttgttcaaactgaaggggggttcaccattcatactggatttgat
gaattatctaatgatccatataattcaacaatttacaaagttatcacgaagtattcaagg
aaaaatttcgatcagcctttcttatatcttgataaaaaacaaaaccaaattaaaaatcga
attttgcctaagtacaaaattgatcacgatgaatttattttcaatgatgctattgaaatt
gtgactcgcccagaattggttaaaaacaatcctgtcgaagattttgaagagcgtgcccaa
ttacatttggtgaaaccattttttgttaagcaaggaaacaatcagtttatggctggtata
tctggaatagaattaagttatgagtatttagcaaagattttttcggatgcaaccagcgaa
ataaaaacagatgaatataattgtttcaataacactgaactacgatgtgaaatcattgac
atctctggatcaatattacactccaatagagaggatgttgctttaggagattttttgggt
tctgtagatcctaatttaatgaggcatatggtggaaaagctcgaaatatttgtggatgaa
aatcctataattaattatcaagcactctgtcctgattcatttgaatgtactgcatcgggt
gttaaagttttgccattttctttggaccaagcagtgaaagtttggtattcatttttagga
gtttttcaagcacttcagattgtaattaccagttttctcacgaccatttattcgttctct
gagggatcgtttggactgtcacaattcaatcacaaagtacaggaaggtattcatcgttgt
acaacgaagacttcagtttggacaattaatcccaatttaaagaaaagtgagtttcacgat
aggatgacttcaacttgtaggtcagaaactgaatgtaaaagggacttgcatatgttcaaa
cttaaaaatataaatggtctctttgttgtctcaaatccagaatgcgctcattgtaatgca
ccgccttttccgaagggcccagtcgaaattatggcaacagaaaattgtcttcttccgcat
cgatatcgaaagagacaatcaggctgttttgctcaaagtgatatggaaacatcagaatgt
agcaaaggttccataaatttaccggggctttggaaaactctaattctgatgtatttgtca
ttattgtcacctattttcctgcgaaaactattgtaa
DBGET
integrated database retrieval system
