Lucilia sericata (common green bottle fly): 119602393
Help
Entry
119602393 CDS
T08270
Name
(RefSeq) low-density lipoprotein receptor isoform X1
KO
K20053
very low-density lipoprotein receptor
Organism
lsq
Lucilia sericata (common green bottle fly)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lsq00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
lsq04131
]
119602393
Membrane trafficking [BR:
lsq04131
]
Endocytosis
Clathrin-mediated endocytosis
Low-density lipoprotein receptor (LDLR) family proteins
119602393
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Ldl_recept_a
Ldl_recept_b
FXa_inhibition
cEGF
EGF_CA
SGL
EGF_3
hEGF
Pox_A14
DUF3105
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
119602393
NCBI-ProteinID:
XP_037809814
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1260 aa
AA seq
DB search
MGLIRYFLYCLLLINGVLHTSRLKTMMYVNAAPGDIEESTCGVEQFRCNNGKCIPNRWRC
DQEKDCSDGSDEFPGLCKSKTCTPDEFTCKSGEGECIPLAWMCDQSKDCSDGSDEASCNE
TCRSDEFTCGNGRCIQKRWMCDHDDDCGDGSDEKNCAKVPCDAHEFTCTNGACIHKKWKC
DGDPDCYDGSDELNCRNVTETHTPCLAHEYQCKDRITCLHPSWLCDGECDCPGCDDEVDQ
NCKNNTCRPDQFQCADRSCIAGHLICNGESDCTDKSDELNCGIRKETVCNNTTQFDCGGG
QCISLAKVCDKHKDCPDGEDEPANKCDINECSTNNGGCMHKCIDQPIGFKCECETGYKLI
NNKSCVDIDECAENPGACSQICINEIGGYKCECMDGYMRDPRNHTRCKATEGHASLLLAR
RHDIRKIALDHMEMTSIVNNTKSATALDFVFRTGMIFWSDVTTQSIYKAPIDEGNDKTIV
LKEHTVTSDGLAVDWIYNHIYFTDTHRCTIELTNFDGNMGKVLIEDELDIPRSIALDPIE
GWMYWSDWGASPRIERAGMDGSHRTTIINYDVKWPNGITLDLVRKRIYWVDGKLNIISSA
NYDGSQRRQILYSTEYLRHPFSITTFEDYIYWTDWDKQTVFKANKFNGEGVEPITAVHML
QHPMVIHVYHPYRQPDGVNHCQAVNGHCSHLCLPAPRINEHSPRISCACPTGLKLMDDRL
MCVEDHKKDVMNNSSPLKGRNVLKTPEIQHNKTPSLPGDVSNGDDDDNDEEQQQQEQSIT
ASFYDSYAAKYLYAVCLELQFHNNDDQRAIEMNYKHNTDSGAGAGDEIEDYERKVKQRMK
RNILPKEQEGKRRRDNKTKQKPIMEMKTMNANDKNNENNIEINNELPVIKDKNNSNSNNE
ALETNDFDTITINDKLSILIKSINYTKTDNDKITKYEIINNTIDSMLPNKTTSENGIING
QSFNTTKENYKEIIETLASTEIPNSSPEQQDNEFVINQDYDTNIYLDETFYDSDYYVEGG
AMDRPQETETEIIIQLINSSPKPITTTAGNRFESTNNISPSLTAFNDDSLNSFKTLLSLY
SSTNLSLSTLSSSSSSSAGQHTFYTNYDVPVGYLRWLCKRLPKTSTNAPPLQGSSDDEKK
TVNEIELNTITVNKHPTGNGTHNNDGSPITTTTQPDSGYIALIVIGSLLGTSLVLGVLLY
SGYRYCSRRSINSMNFENPVYRKTTEDHFSLEKNLPVRMYPSTVDEESKEPLKEVGTECV
NT seq
3783 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggattaatacgttattttctgtattgtttactgctgataaatggtgtattgcataca
tctaggcttaaaacaatgatgtatgttaatgctgcaccgggtgatattgaagaatcaact
tgtggtgtcgaacagtttcgttgcaacaatggcaaatgtatacccaacagatggcgctgt
gatcaagaaaaggattgctctgatggttctgatgaatttcccggattgtgcaaaagtaaa
acttgtacccccgatgagttcacttgtaaatcgggcgagggtgaatgtatacccttggcc
tggatgtgtgatcaaagtaaagattgttcagatggttccgatgaggcttcatgcaacgaa
acttgtcgctctgatgagttcacttgcggcaatggtcgttgcatacaaaaacgttggatg
tgtgatcatgatgatgattgcggtgatggttccgatgagaagaattgtgccaaagtacca
tgtgatgctcatgaattcacatgcacaaatggagcctgtatacacaagaaatggaagtgt
gatggtgatcccgactgttatgatggatccgatgagttgaattgtcgcaatgtcaccgaa
acacatacaccctgtctagcacatgaataccagtgcaaggatcgtataacctgtttacat
cccagctggttatgtgatggtgaatgtgattgtcccggttgtgatgatgaagtagatcaa
aattgtaaaaataacacttgtcgcccggatcaatttcaatgtgctgatcgttcttgtatt
gcggggcatcttatttgcaatggtgaatctgattgtaccgataaaagtgatgaacttaat
tgtggcatacgtaaagaaactgtatgtaataataccacacaatttgattgcggtggcggt
caatgtatatctcttgccaaagtatgtgacaaacataaagactgtccggatggtgaagat
gagccagccaataaatgtgatataaatgagtgttccacaaataatggtggctgtatgcat
aagtgtattgatcagcctataggttttaaatgtgaatgtgaaaccggttataagttaatt
aataataaatcctgtgtggatattgatgaatgtgccgaaaatccaggagcatgttcacaa
atttgtattaatgaaattggtggctataaatgtgaatgcatggatggctatatgcgtgat
ccacgcaatcatacacgctgtaaggcaacagaaggacatgcatccctgctactggcacgt
cgtcatgatatacgtaaaatagctttggatcatatggaaatgacatcgattgttaataat
acaaaatcagcgactgctttagattttgtttttcgcaccggcatgatattctggagtgat
gtgaccacacaaagcatatacaaagcacccattgatgagggcaacgataaaacaattgta
ctgaaagagcatacagtaacctcagatggtttggctgtcgattggatttacaatcatata
tactttacggatacccacagatgtaccattgaattgacaaactttgacggcaatatgggt
aaagtgctcatagaagatgaattggatataccacgttcaatagcattggatcccattgaa
ggctggatgtattggtccgattggggtgcttcgcctcgtatcgaacgtgctggcatggat
ggttcacatcgtaccacaattatcaactatgatgtcaagtggccaaatggtattacattg
gatttggtacgcaaacgtatctattgggttgatggtaaattaaacatcatatcatctgca
aattatgatggttcacagcgacgtcagattttatattcaacggaatatttacgtcatccc
ttctctattacgacatttgaagattatatttactggacagattgggataaacagaccgtt
ttcaaggcgaataaattcaatggagaaggtgttgaacccataacagctgtacatatgcta
caacatcccatggtcatacacgtctatcatccatatcgtcaaccggacggtgtcaatcat
tgtcaagctgtcaatggacactgttcacatttatgtctgccagcgccgcgcattaatgaa
cacagtccacgtatatcgtgtgcctgtcccaccggtctcaaattaatggacgacagactg
atgtgtgttgaagatcataaaaaggatgttatgaacaattcatcaccactaaagggaagg
aatgtattaaaaacacctgaaatacagcacaacaaaacaccatctctacccggagatgtt
agtaatggtgatgatgatgacaatgatgaagagcaacagcaacaggagcaatcaattaca
gcatcattttatgatagttatgctgcaaaatatctctatgcagtctgtctagaattacaa
ttccataataatgatgaccagagagccatagagatgaattataaacataatactgatagt
ggtgctggtgccggtgatgaaattgaagattatgaacgtaaagtgaagcagagaatgaaa
cgtaatattttaccaaaggaacaggaaggcaaacgacgacgagacaataaaactaaacaa
aaaccaataatggaaatgaaaaccatgaatgcaaatgacaaaaataatgaaaacaatatt
gaaataaataatgaattaccagtgattaaagacaaaaacaacagcaatagcaataatgaa
gctttagaaaccaatgatttcgatacaattacaatcaatgataaattatcgatattaata
aaatccataaattatactaaaactgataatgataaaataacaaaatatgaaataattaat
aatacaatagattcaatgctgccaaataaaactacctcagaaaatggcatcatcaatggg
caaagttttaacacaactaaggaaaattataaagaaattatagaaactttagcttccaca
gaaattcctaacagttcaccagaacaacaggacaatgagtttgttattaatcaggactat
gatacaaacatctatttagatgaaacattctatgatagtgattattatgtagaaggaggt
gccatggacaggccacaagaaactgaaacggaaataattattcaattaataaattcatca
cctaaacccataacaaccaccgctggcaatcgttttgaatctacaaataatatttctcct
tcactaactgcattcaacgatgatagtttaaattcctttaaaactcttttgtctttatat
tcatcaacaaacttatcattatccacattatcatcatcatcatcctcatcagcaggtcag
cacacattctatactaattatgatgtacctgtgggttatttacgttggttgtgcaaacgt
ttgcccaaaaccagcactaatgccccaccattacaaggttcatctgatgatgaaaagaaa
acggtcaatgaaattgaattgaatacaatcacagttaataaacatcccaccggaaatggt
acacataataatgatggcagtcctataacaacaactacacaacctgattcgggttatatt
gctttaatagtgataggtagcttactgggcacctcactagtattgggagtgctactttat
agcggttatcgctactgcagcaggcgctctattaattcgatgaatttcgaaaatccagtt
tatcgcaaaacaaccgaagatcattttagtttggagaaaaatctacccgtgcgcatgtat
cccagtacggtcgatgaagagtccaaagaacctttaaaggaagtgggcactgagtgtgtt
taa
DBGET
integrated database retrieval system