Lucilia sericata (common green bottle fly): 119602470
Help
Entry
119602470 CDS
T08270
Name
(RefSeq) LOW QUALITY PROTEIN: DNA polymerase zeta catalytic subunit
KO
K02350
DNA polymerase zeta [EC:
2.7.7.7
]
Organism
lsq
Lucilia sericata (common green bottle fly)
Pathway
lsq03460
Fanconi anemia pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lsq00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03460 Fanconi anemia pathway
119602470
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
lsq03400
]
119602470
Enzymes [BR:
lsq01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.7 DNA-directed DNA polymerase
119602470
DNA repair and recombination proteins [BR:
lsq03400
]
Eukaryotic type
TLS (translesion DNA synthesis) factors
B-family DNA polymerases
119602470
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_pol_B
POL3_N
REV3_N
DNA_pol_B_exo1
zf-C4pol
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
119602470
NCBI-ProteinID:
XP_037809941
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
2342 aa
AA seq
DB search
MSGAEGIFSLRLVIADFYMEKPVPGLDACYSEFRGKEIKRVPVIRIFGPNAQGQKTCLHV
HGVFPYFYIPYDQKDFESLNKAIYQIAINLDKAINISLSQGSSSAQHVFKIQLVKGIPFY
GYHRSDHQFLKIYMFNPRFIRRAANLLQNGAILNKNFHPHESHVPYILQFMIDYNLYGMS
FLHIPLEIVKFRRSDNAELIPFRNLQETQMLDVNIVKKISCSTLEIDIGSNFILNRFQLI
TKTNTTHTNPGIESIWNDERLRRQKLAKSVEDDEEKLNAIPRLEIPATQERPDVQPTESE
IFYRTALLSKLLAMETSILESTQISNQTLNSSLISNITLNPSNTSLNSKQQKRTFNLTKI
LQNSVYPEECTQNDNLINASVIPNHLSNSSIFEQSLMVKSNETKEQEIIKIPEDESVFLE
DTIVDEELVLSLTQQQNQAAEEEHVPMNVTLREEDMELLDILQQLEENNEDKIDLDSSLA
PMSQMHKNFALSPQELDKETTNAALHKPSAYTDSEDDQENDDNIHDFSIALENLDDLILK
LTQSQKQPHAPNEKSSLDVPQVDGADDLLRTPTKAAKTVAANNRGTPPHTPTTPKXRRLT
MGSPCRSPRTPKTGHKYAALPLVSIDRSTGKTKAVNDTTPLKQSSGERNSLPMLSLRKKL
ALSDMRRKSISVDTDVEDQVTAVAESTSSNRRRSKRLVNLDKTHVTCALTPRRTNAKLLK
VYSLDNKDNEIGDDAQDTPEESENIQDDIKKKEIKAKQPISLEGENPTKTVNKRCLKVTR
KFTKKPDLAVDVPNNLEDELKETVANNLEIVKEIDSNKETDEEIVDSGNEGEVAMKNLRK
TPNLKRLRRSFIAANSAKRRKIRSSTSSLVNSSKFDCATDERKPNEIEEENHLKLKKCKV
RLKKLTESEEQESKNRTVNTKSGESYVETLGNVNDGLKCDMELKENSNQVVKPKALESVE
SREDNSKSSDLTNDQQISTKLEDLSSALKLHFQSICNFKSCTGNHHPKPSSIEIKYKSQK
EDKDDTTNRNIETRNSTISPNLETFSLNPKSKKVQMKKSSKLLYLIFFLSLQINNVQMRK
SLKPPPQETDKDPKFKRLGSKSISLQSPVIFTQNSSPVLQAQSKTTSRSNSLQLESYITI
SSSSSNHSLITSETNIVLTPLDLPPSREEVLKGCRKFQLPEYDFQQPFYSNPDDITKHKE
LGFTVLQIPGNKLNDVEEFQSILGTDVKGLTSWRRQQLIKLGGVEMLXKYRNPQRIREYF
ANQKSVIITPQXNAPTRQEVKLWLKARELLKTKGEEWDMKVKNLEEDSPIKVRRQKVTMM
LNAGDAGEADSDDGDNSLDCSSRSLTLTPLTPGTPTGNEHYSKADVKKSFTPVTXEFGKV
PLKLDSSLRKRKNYRIFRRVALNKQLKEAFEKEASKESSQELEAIKDSQGSVIANSQNSE
TSVSSETALAELERSSFMQQLKEADVTIGGFSENSTLNNTFGFKVALENLQQAKADVEFN
YLTIVTLEVFVATRDDLFPNPEMDEIRCLFYAIENSIPNDHIDVDKKLPRKACGYIMVHD
SRDIVAKEGRIHGIDNDIEVTIVQTEVEALEALLGLCSRWDPDIYAGYEIEMSSWGFVIE
RAKYLCLNIAPLLSRVPTQKVREFVDEDRESFTDLDVEMKLCGRILLDVWRLLRSEIALT
SYTFENVMYHIMHKRCPWHSYRNLTEWFSSPCSRWIVIEYYLERVRGTLALLDQLDLIGR
TSEMAKLIGIQFYEVLSRGSQFRVESMMLRIAKPKNLVPLSPSVQQRAHMRAPEYLALIM
EPQSRFYADPLIVLDFQSLYPSMIIAYNYCFSTCLGRVEHLGQSTPFEFGASQLRVSPAM
LRKLVDRDLITISPCGVVFVKSAVREGILPRMLTEILDTRQMVKQSMKLHKSNSALQRIL
HSRQLGLKLMANVTYGYTAANFSGRMPAVEVGDSVVSKGRETLERAIKMVEVNDKWNVRV
VYGDTDSMFVLVPGRNRDEAFRIGEEIAEAVTKQNPHPVKLKLEKVYQPCILQTKKRYVG
YMYETPDQKEPVYEAKGIETVRRDGCPMVAKMLEKVLRILFETADVSQVKHYVCRQFTKL
LSGRANLQDLIFAKEFRGLNGYRPTACVPALELTRKWMQSDPRRIPRRGERVPFIITNGP
PGVPLIRLVRHPHEVLSDEGLKINAVYYITKAIIPPLNRCLLLIGADVSEWFANLPRKIL
LTPALSTASEIISCPNPKSKKSTISQFFSTTNCIVDCGRQTKQGICMECSQNSTRSMIIL
QSKISKIERSYLATQHICEACCGRVGDIKCGSLDCPVLYVLEVKRRDLQQIMHFRNIVEE
RF
NT seq
7029 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtctggagcagaaggaatattttccttgcgtttagttatagcagatttttatatggaa
aagccggtaccaggattggatgcttgttattcggaatttcgtggtaaagaaataaaaagg
gtaccagttatacgcatatttggtccaaatgctcagggacaaaaaacctgcctgcatgtg
catggtgtatttccttatttctatataccctatgatcaaaaggattttgagtcgctaaat
aaggctatctatcaaattgctatcaatttggataaggccataaatatatcgctcagccaa
ggtagttcctctgctcagcatgtttttaaaatacaactggttaagggcataccattttat
ggttaccatcgttctgatcatcaatttcttaaaatttacatgttcaatcctcgctttata
cgaagagcggcaaatcttctacaaaatggtgctattttaaataaaaactttcatcctcat
gagtctcatgttccatatattttacaatttatgattgattataatttatatggcatgagt
tttttacatattcctttggaaattgtgaaatttcgtcgcagtgataatgctgagttgatt
ccatttcggaatcttcaggaaacacaaatgctagatgtaaatattgttaaaaaaatatcc
tgcagtacgttggaaattgatattggttctaattttattttgaatcgtttccaattgatt
actaaaacgaatacaacacatacaaatccgggtattgaatctatctggaatgatgaacgt
ttaagaagacaaaaactagcgaaaagtgtagaggatgatgaagagaaattgaatgcgata
cctcgacttgaaataccagccacacaagaacgacccgatgtccaaccaaccgaaagtgaa
attttctatcgtacagcattattaagtaaactattagctatggaaacctccatactagag
tcaacgcaaatttcaaatcaaactcttaattcaagtcttatttcaaatataactcttaat
cccagcaatacaagtttaaatagcaaacagcagaagagaacatttaatttaacaaagata
ttacaaaactccgtctatcctgaagaatgtacacaaaatgataatttaattaatgcctca
gtgataccaaatcatttaagcaatagcagtatatttgagcagagtcttatggtaaaatca
aatgagacaaaagagcaggaaataataaaaatacccgaagatgaaagtgtttttctggaa
gatactatagtcgatgaagaattggtcttaagtttaacacaacaacaaaatcaagcagct
gaggaggagcatgtacccatgaatgttactttacgtgaggaagacatggaattattagat
atcttacaacaattggaagagaataatgaagataaaattgatttagatagtagtttagcg
cctatgtctcaaatgcataaaaattttgctttatcacctcaagaattggataaagaaacc
acaaatgctgctttgcataaaccctctgcctacactgattctgaagatgatcaagaaaat
gatgataatatacatgatttttctatagctttagaaaatctagatgatttaatactaaaa
ctaacacaatcacaaaaacaaccacatgcgcctaatgaaaaatcttcattggatgttcca
caagtagatggagctgatgatttgctaagaactcctacaaaggcagcaaaaaccgtggca
gctaacaataggggtacgccgccacatacccccactactcctaaanatagacgtttaact
atgggttctccctgtcgttctcccagaacacctaaaactggacataaatatgctgcttta
cctttagtttctattgatcgttctacgggtaaaaccaaagctgttaatgacactacacct
ttgaaacagtcctcgggagaacgaaacagtttgccaatgttatctttacgcaaaaaatta
gctttgtctgatatgcgccgcaaaagcatatcggtcgatacagatgtggaggatcaggtt
actgctgtagccgaaagtaccagttccaatcgaagacgttccaaaagattagttaattta
gataaaactcatgtcacatgtgccttaacaccccgacgaacaaatgcaaaattacttaaa
gtttatagtttggataataaggataatgaaattggggacgacgcacaagatacccccgag
gaaagtgaaaatatccaagatgatataaagaaaaaggaaattaaagccaaacaaccaatt
agtttagaaggggaaaacccgacaaaaactgtaaacaaaagatgtttgaaagtaactagg
aaattcaccaaaaagccggacttggcggtggatgtaccaaataacttagaagatgaatta
aaagaaactgttgcaaataacttggaaatagtgaaagaaattgactctaataaggaaaca
gatgaagaaattgttgactctggtaatgagggtgaagtagccatgaaaaatttacgtaaa
acaccaaatttaaagagattaaggcgtagttttatagcagccaattcggcaaaacgtaga
aaaataagatctagtactagctcattagttaattcatcaaaatttgattgtgcaacagat
gaacgcaaacctaatgaaattgaggaggaaaatcatttaaaattgaaaaaatgtaaagtg
agactcaagaaactaacagaatcagaagagcaggaaagtaaaaatagaacagttaatacg
aaatccggagaaagctatgtcgaaactttaggaaatgtaaacgatggcttaaagtgtgat
atggaattaaaagaaaattccaaccaagtggtaaaacctaaagctttagaaagtgtagaa
tctagagaagataattcaaaaagttctgatctaacaaatgatcagcaaatttctactaaa
ttagaagatttaagcagtgctctaaagttgcatttccaatcaatctgcaacttcaaaagc
tgtaccggaaaccaccatccaaaaccgtcatcaattgaaattaagtataaatctcaaaag
gaagataaagatgacacaaccaatcgcaatatagaaactcggaacagcacgatttcacca
aatctagaaacattttccctgaatcccaaatcaaagaaagttcagatgaagaaatcttcg
aaactcctttatttgatattctttctaagtctccaaataaacaatgttcagatgaggaaa
tcactgaaacctccaccacaagaaactgataaagatcccaaatttaaaaggttgggtagt
aaatcaataagtctacaaagtccagtaatatttacccagaattctagtccagtattacaa
gcccaatcaaaaacaacctctagatccaattccttacaattggaaagctatataactata
tcgtcttcttcgagtaatcattccctaataacatcagaaacgaatatagttttaactccc
ctagatttacctcccagccgggaagaagtgctgaaaggttgtcgtaagtttcaactacca
gaatatgatttccaacaaccgttctacagtaatcccgatgatatcaccaagcataaggaa
cttggtttcaccgtactccaaataccgggtaataaactaaatgatgtagaagaattccaa
agtatattgggtacagacgtcaaaggtttaacctcctggagacgtcaacaactaataaaa
ctagggggagtagaaatgttanataaatatcgtaatccacaacgtatacgtgaatatttt
gccaatcaaaaatcggttattataactccccaanataatgctcccactagacaagaagtt
aaactatggctgaaagctagggagttgttaaaaactaaaggagaagagtgggacatgaaa
gtgaaaaacctggaagaagacagtccaattaaagtacgacgacaaaaagtaactatgatg
ttgaatgctggcgatgcaggcgaagcagacagtgatgatggtgataatagtttggactgt
tcttccagaagtctaacgctaacgcctctaacaccaggaacaccaaccggaaatgaacat
tacagcaaagcagatgttaagaaaagttttacacctgttactnaggaatttggaaaagta
cccttaaaactggatagttccctaagaaaacgtaaaaattatagaatttttcggcgtgtt
gctctaaataaacaacttaaggaggctttcgaaaaggaagcatctaaagaaagctcacag
gagttagaagctataaaggatagtcaaggcagtgttatagccaattctcaaaatagtgaa
actagtgttagtagtgaaactgctctggcggaattggaacgttcctcttttatgcagcag
ttaaaggaagccgatgttaccattggtggcttttcagagaattccactttgaataatact
tttggttttaaagtggctttggagaacctgcaacaggccaaggcagatgtagagttcaat
tatcttaccattgtcaccttggaagtgtttgtggccacacgtgatgatttatttcccaat
cctgaaatggacgaaatacgttgcctattttatgccatagaaaatagtatacccaacgat
catattgatgtcgataaaaaattaccccgcaaagcttgtggctatataatggtacatgat
tctcgtgatattgttgctaaggagggtcgtattcatggcattgataatgatattgaagtg
accattgttcaaactgaagttgaggctttggaagctctattgggtttatgttcacgttgg
gatcctgacatttatgctggctatgaaatagaaatgtcttcttggggttttgttattgaa
cgtgccaagtatttgtgtttgaatattgcacctttattgtcaagagttccaacacagaaa
gttagagaatttgtggatgaagatcgagagtcgtttacggatttggatgtagagatgaaa
ctttgtggtcgcattttactagatgtctggcgtctgttacgttcggaaattgccttgacc
tcctacaccttcgaaaatgttatgtatcatatcatgcacaaacgttgtccctggcatagt
tatcgcaatttaaccgaatggttttcttcaccctgttcacgttggattgtcatagaatat
tatttggaaagagtacgaggtacattggccctattagatcagcttgatttaataggacgt
acaagtgaaatggctaaactgataggtatacaattctatgaagttctgtcgagaggatca
caatttcgggtggaaagtatgatgttaagaattgctaaacctaaaaatttggtaccatta
tcgcctagcgtccagcagcgtgcccatatgagagctcccgaatatttggctttaattatg
gaacctcaatctcgcttttatgctgatcctttaatagttttagattttcaaagtttatat
cctagcatgataatagcctacaactattgtttctccacctgtctaggaagggtagaacat
ttgggacaatcgacaccatttgagtttggtgcctcacaattgcgtgtttctccggctatg
ttgcgtaaattagtggatcgtgatctcatcaccatttcaccttgtggcgtggtgtttgtc
aaatcagcggtgcgtgaaggtatattaccgcgtatgctaacagaaatcctcgatacccgt
caaatggttaaacaatccatgaaactacataaatctaattcagccttacaacgtatttta
cactcacgtcaattgggtctgaaactaatggctaatgttacttatggttatacagctgcc
aattttagtggtcgtatgccagctgtagaagtaggtgatagtgtagtttcgaagggccgt
gaaactctagagcgtgccattaaaatggtggaagtcaatgataaatggaatgttagagta
gtttacggtgacaccgattccatgtttgttttagtgccgggacgtaatcgtgatgaagca
tttcgcattggcgaggaaattgctgaggctgtaacaaaacaaaatcctcatccggttaaa
ttgaaactggaaaaagtctaccagccctgcatattacagaccaaaaaacgttatgtcggt
tatatgtatgagacccccgatcaaaaggaacccgtttatgaagctaaaggtattgaaact
gttagaagagatggctgtccaatggtagctaagatgttagaaaaggttttgcgtattctc
tttgaaaccgcagatgtaagtcaagtgaaacattatgtttgtcgacaatttactaaacta
ttgtcggggcgcgcgaatttacaagatttaatatttgctaaagagtttagaggtctcaat
ggttatcgtcctacggcctgtgtgcccgctttagaattaactagaaaatggatgcaatca
gatccacgtcgtatacctcgtcgcggtgaaagagtgccgtttattataactaatggacca
ccaggtgtaccattaatacgtttggtacgtcatccccatgaggtgttaagcgatgaaggt
cttaaaatcaatgctgtctattatataaccaaagccataatacctcccttaaatcgttgt
cttttacttatcggagccgatgtcagtgagtggtttgcgaatttacctcgaaaaattctt
ctaacacctgctctctccactgccagcgaaattatttcctgtcctaatcctaaatctaag
aagagtactatatcacaatttttctccactactaattgtattgttgattgcggtcgccaa
acgaaacagggtatttgcatggaatgcagtcagaattcaacacgttccatgattatttta
caatcgaaaatttctaaaattgaacgttcatatctggcaacgcaacacatatgtgaggca
tgttgcggtcgagtgggagatataaaatgtggctctttggattgtcccgttttgtatgtt
ttagaagttaagcgtcgcgatttgcaacagattatgcattttagaaatattgtagaagaa
cgattttag
DBGET
integrated database retrieval system
