Lucilia sericata (common green bottle fly): 119605425
Help
Entry
119605425 CDS
T08270
Name
(RefSeq) nuclear pore complex protein Nup154
KO
K14312
nuclear pore complex protein Nup155
Organism
lsq
Lucilia sericata (common green bottle fly)
Pathway
lsq03013
Nucleocytoplasmic transport
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lsq00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03013 Nucleocytoplasmic transport
119605425
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
lsq03019
]
119605425
Messenger RNA biogenesis [BR:
lsq03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Nuclear pore complex
119605425
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Nucleoporin_C
Nucleoporin_N
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
119605425
NCBI-ProteinID:
XP_037814453
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1405 aa
AA seq
DB search
MNVTQMSGQLDLLDVAGSMLEKHDSKDLCAPGLLEMTGINQHGMATASGLNDYDYQTLSS
LSMGHKQLNQLQTVNKIPIPPEILEHFKHIKCHCMMGLFPEIGRAWLTIDSEIYIWTYEQ
SRDVAYYDGLSHLIISVGLVKPKPGVFINDVKYLLILTTPIEIIVLGVTFGDTTKTISSP
TRNIQSTATFEEMQLMNKPIFILSTDNVSINVVMGSDNGRIFLGGRDGCLYEISYQAESS
WFGKRCKKVNHSQGIVSYIVPSFLKVFSENDPIVRLAVDSSRQLLYVLTEKGSIEAWEMG
HDCNTMRRIAKVTQNEISQSAGNIIKTVDPAVFKNIKSICPLSADDCQNLHLLAITQCGV
RLFFATNPLVGFQNSNNYQNPLNQTQMSINQHSPTKPTPVGNATGPLPTQTSPHSSATEQ
RRQQGLYLLHVRLPPGYTPNTTINKPKQVHSAHYNEGTLLMVSTPQQDQDILWSISSAPF
PHRPYLTESTTVIPLDGIVWSLAEMPDRCKAQLQSILRKAQKPKKVVLLTNQGAHIISLL
KPVDILQQLLIACHGPHHDAVKAFFQAQGDREACATALLLTCSEQYRGTDLAMWAAQAFL
LYGGEPTFSNQMQMMGCLQGQRPYLNNSMGMDQRNTPQMFISTPMPNTGSGGLVNRTLQN
TPIQSPIQHTQYPLSPIYNQNSFIGSGIAPVNDMNAIIYSSKHDGLYIYVARLLRPIWKI
RCVDENLNSKLTQADCTFILEDLYALKNFLDANSVNDLSCTMRAFNNQNTLSNGYGLLMQ
NSTNMHTNDPQMNAAEQAQTEEKRSLTALNYFIKHTCEVIALWKILCEHQFQVLASQLLK
EQQSVLLSCTFRDLILSRSESCALLIVALINSYLKDNASVSTISSKLRDECPNLYRHEDA
VSFKATEILMNSKNCTIVEEKQDKLRTALQLCKDAAPNLPLQNICQQFVLSGFFEGVIEL
TSTCAFKIDPEEFGIHFYQSDEPEEDREGYAAYAARLNCYKEVKLMMDHVYQSVCNANAN
QEFSQQICNKQELSVNAQIMKIVGMSVQIKDPILHVCVYEWLMAHDMLSELLSLTEQTLG
EFLRRNVVRNPDNLNLIDLLWKYYEKNGHHAQAARILDNLASTQSDGIPLIQRIEYLARA
VMCMRNDGVGYSITNGVLLKELEDKLEIARVQKTVLDAVSALAPTNNDANKAVENLNKIL
YDITQLYENFADPFDLWECKLTILNCSHHNDPLLIESVWGQIINKSVEGTGSMQERSTRL
FSKIETLFKEFGESGHCFPLAFIIRELEIKACQLRLSEGIVPDKLVAMNIDVELLMEYYS
RMISINERIWANEGNEWHLVQSSIRVVTLLANNAHAIWSRSKRRIIGKAQDMVSVCLNLC
YQKPGTERMQQSLKELQCRLQRSLT
NT seq
4218 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatgtaacacaaatgagtggtcaactcgacttactggatgtagccggaagcatgttg
gaaaaacatgattctaaagatttgtgtgcaccaggacttttggagatgaccggcataaat
caacatggaatggcaacggccagtggtcttaatgattacgattaccagacactgtcaagt
ttgtctatgggtcataagcagctaaaccaattgcaaaccgtcaataaaattcctatacct
cctgaaattttagagcactttaaacatatcaaatgtcactgtatgatggggctttttcca
gagataggaagagcatggttaactattgattcagaaatatatatttggacatatgaacag
tctcgtgatgttgcatattacgatggattaagtcatctaattataagtgttggtttggtc
aaaccaaaacctggagtttttatcaatgatgttaaatatctcttaattcttactacacca
attgaaataattgttttaggcgttacctttggagacacaacgaaaactatatcttctcca
acacgcaacattcagagcacggcaactttcgaagagatgcagttaatgaacaaaccaatt
ttcatattaagcacagataacgtttcgataaacgttgttatgggaagtgataatggtcga
atttttctcggaggacgtgatggttgtctttacgaaatatcttatcaagcagagtcaagt
tggttcggaaaacggtgtaaaaaagtaaatcattcgcagggcatcgtttcgtacattgtt
ccaagttttttaaaagtattttcggaaaatgatccaattgttcgtttggcagtagatagt
agccgtcaattgctatatgtcttgaccgaaaaaggttcaatagaggcatgggaaatggga
catgattgtaacacgatgcgtcggatagctaaagtaacgcagaatgaaatttctcaaagt
gctggaaacataattaaaaccgtagatccagcagtgtttaagaatattaaatcaatatgc
ccattatctgcggatgattgtcaaaatcttcatttattagcaataactcaatgtggcgtt
cgtttattttttgcaactaatccgttagtaggatttcaaaactctaataattatcaaaat
cctcttaaccaaacgcaaatgtcgataaatcaacattcgcctacaaaaccaacacctgta
ggtaacgcgacgggcccattgccaactcaaacttccccacatagttcagcaactgaacag
agaaggcaacaaggtttatatcttttacatgtgaggctaccgcctggatatactcctaat
acaaccattaataaaccgaaacaagttcattccgcccattataatgaaggcaccttgcta
atggtttcaacgccccaacaagatcaggatattttgtggtctataagttcagcacctttt
ccacatcgtccatatctaactgaatctacaacggttattccattggatggtattgtctgg
agtttagcagagatgcccgatcggtgtaaagcacaactacaatcaatactgcgtaaagcg
caaaagcctaaaaaagtagttttattaactaatcaaggagctcacattatttcacttcta
aaacctgtggatattttgcaacaactacttatagcatgccatggaccccaccatgatgca
gtcaaagcattctttcaggctcaaggtgatcgtgaagcatgtgctacagctttgctttta
acatgttccgaacaatatcgtggaaccgatttagcaatgtgggccgcgcaggcgtttttg
ttatatggaggagagccaacattttctaatcaaatgcaaatgatgggatgtctgcaagga
cagcgtccatacctaaacaactctatgggcatggaccaacgcaacacaccacagatgttc
atatctacaccaatgccaaacactggaagcggtggcttagtaaatcgtacacttcaaaat
acaccaatacaaagccccatacaacatacgcagtatcccctaagtccaatttataatcaa
aattcattcattggatctggtattgctccagttaacgatatgaatgcaattatttattcc
tctaaacatgatggtctttatatatatgtcgcacgtctattacgtcctatatggaaaatt
cgttgtgtggatgagaatctaaatagtaaattaactcaggcggattgtacatttattctg
gaagatttgtatgcgctcaaaaattttttggatgcaaactccgttaatgatttatcatgt
acaatgagagcttttaataatcaaaacacactttctaatggatatggccttttgatgcaa
aatagcacaaatatgcatacaaatgacccacaaatgaatgctgcagaacaagctcaaacc
gaagaaaagcgttcattgactgcattgaattattttataaagcatacttgtgaagttata
gcactgtggaaaattttatgcgaacatcaattccaagttttagccagtcaattattaaaa
gagcaacaatcagttctattatcgtgcacttttcgggatttaattttatctcgttctgag
tcgtgtgcacttttgattgtggccttaataaattcttatttaaaggataacgcatcagtt
agcacaatatcttcaaaactgcgagacgaatgtcccaatttataccgccatgaggacgct
gtctcatttaaggccacggaaatattaatgaattctaaaaattgtaccattgttgaagaa
aagcaggacaagttacgaacagctctacaactatgcaaagatgcagctccgaatttacct
ttacaaaatatttgtcagcagtttgtactcagtggcttttttgaaggtgttatagagttg
acatctacatgtgctttcaaaattgatcctgaagaatttggcatacatttttaccagagc
gatgaaccagaagaggatcgtgaaggatacgctgcatatgctgcacgcctaaattgttat
aaggaagtaaaactgatgatggatcatgtctaccaatctgtttgtaatgccaatgcaaac
caagagttttctcagcaaatatgcaataaacaagagttgagtgtcaatgcccagattatg
aaaattgttggtatgtctgtacaaataaaagatccgattttacatgtctgtgtctatgaa
tggttaatggcgcacgatatgctttctgagctactatcgttaacagaacagactctgggc
gaatttctacgaagaaatgttgtacgaaatccagataatttaaatttaatcgatttatta
tggaagtattatgaaaaaaatggtcatcatgcacaggctgcacgtattctagataattta
gcatctactcagagtgatggcattccattaatacaaagaattgagtatttggctagagca
gtaatgtgcatgcgaaatgatggagttggttactctataacaaacggtgtcctactcaag
gaactagaggataagctagaaattgctcgtgttcaaaaaactgtcttggatgctgtttca
gctttagcaccaactaataacgatgctaataaagctgttgaaaatttaaacaaaatttta
tatgatattacacagttgtacgagaattttgcggatccatttgatttgtgggagtgcaaa
ttaactattcttaactgttcgcatcataacgatcctttgctaattgaatctgtatggggt
caaatcataaataaatcagtcgaaggtacaggttcaatgcaagaaagaagtacacgattg
ttttcaaaaattgaaacacttttcaaggaatttggggaatcgggccactgctttccactt
gctttcattataagagaactggaaataaaggcatgtcagttgcgtttatctgaaggtatt
gtaccagacaaattagtcgccatgaatatcgacgtagaattacttatggaatattattcg
aggatgatttcaattaatgaacgcatatgggcaaatgaaggtaacgaatggcatttagtt
caatcttctatacgagtggttactcttttggcaaataatgcccatgcaatatggtccaga
tcaaaacgtcgcataattggaaaagctcaagatatggtatcggtatgtttaaatttgtgc
tatcagaaaccgggtactgaaagaatgcaacaatctttaaaggaattacaatgtcgcctt
caaaggagcttaacataa
DBGET
integrated database retrieval system