Lucilia sericata (common green bottle fly): 119607092
Help
Entry
119607092 CDS
T08270
Name
(RefSeq) RRP12-like protein
KO
K14794
ribosomal RNA-processing protein 12
Organism
lsq
Lucilia sericata (common green bottle fly)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lsq00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03009 Ribosome biogenesis [BR:
lsq03009
]
119607092
Ribosome biogenesis [BR:
lsq03009
]
Eukaryotic type
90S particles
Other 90S particles
119607092
Pre-60S particles
Other pre-60S particles
119607092
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
RRP12_HEAT
ARMC9_ARM
AsnRS_N
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
119607092
NCBI-ProteinID:
XP_037816797
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1386 aa
AA seq
DB search
MGKFRSKLKRDRKGKTWSKGHSSTSNPEQMKHRNKAKSRFFQPNISLAPPEAERNPNTLT
LEAVMKHEQRQAFNAETTTVNDVAGSLKSFSLHDDDELMSESQGGTFKTFKTFASNYSTC
SNMSFKKLLVGFRASSDFHKEMLAILTALTEIIKERGGTESSTEYFILLMEQIEASTEDN
DIIAGVSLLSMGIKSVPTAVLRKRFSETAGTLMSCLQRFMDSNNQSIIKYVIGCLSVLLR
AQDYMTWTYSSTWQYMDALLSFTIHSKPKIRKAAQHAVVSIIHGSSFMLPPKLTDNEEEN
ETPVDTNSQQPQIKFHPAGSRVTKFCLNQFKPEVLAQQQTTVLHTLALLKETISGFKTDD
IRTVCEHLLSIMTAANVLVRTNCLQTMHQLFVSRTTNLNGLLCAKLLTAIHEYRPDRTDY
RQTLAWLTVLKEGHIHLSQLELNLCLNALPSFVEICCSDLWLSDRTDIIVGVSNAIKELL
YECVKPACATQELANVYRVPITKILSSVHKVLSAPFGEVAKYVVLTFSIIFEVCGTYFSK
ELSASLLELAKRYDTQSALRIQIEHAIISAIKSMGPEIVLKSIPLTNAKGEVLLEKSWLL
PLLREGAAGASFKFFKEVILALALDCNKKWHKFADEKQVSMSHTYELLCCQLWGLFPGFC
RAPKDPDNFKLIAPTLGNALDNNPEFRAPIFDGLIELIQNEEQTVIHEALGKYAKNFLPR
LFNIYTQKPNGTYEQDLRKKSLEVIKLYLTKTPNDMLKELFDTAHKQLEGTAVGTFEYDS
IFDITAALVLFQTCEVIRSFFETYIVPVLMKSEKSKLVTKDEQKLKKQQRKTYELLRDIL
TSEAASCKKFTRTNLIALQKLLLEAFSTSCAVCQAARLRCLKILIENRKNNSINDKIIIK
TLPEAVINYKEFSTRKENISEELLKLILDLYQEAEKLNDFVDILTAGFAGDESLITNTIL
AFRTVVQSQGKNLTVSTLEFIMEQIAVFLVQKSRSQAEASVAFLITFIKVMPTPLVANHL
ETIMKSLSAMVKDTKRFCRIQIGYLLKKLCKRFTAEELIRFVPGDDEVTHRRLKKIRKQL
RRENRKKQSEDNAKDSDEEGSDEEFVPGLEKKSVTIDDILADSDSDLPEDMDDDDDNNAA
DKSKTKKQRNTFIREDPEDIVDLADIKSIGNVLTNRPNLDAAKSGGKTKSSDPNRGFKTA
DDGRLIISDKALRGIDDDEGDSSSDDDDDEGVEMNEKKAVKRGMEDDSSDDEDVAMAPNR
KRKAADALSMRSGKTSASRYTTGGKGIHRNVGAASDAISMKSGKSGYSTKSGKSNHTGGE
YTTKKAKGDMKKKGKLDPYAYIPLSRNTLNKRKRAKHAGAFKNIVNGARKGALKGVKSKM
AKAYKK
NT seq
4161 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggtaaatttcgttcgaaactaaagcgggatagaaaggggaaaacctggagcaaagga
cattcctctacctctaatcccgaacagatgaaacatcgcaacaaagcaaaatcgagattt
tttcagccgaatataagtttagctcctcctgaagctgaacgaaatcccaatacccttacc
ctggaggcggtaatgaaacatgaacaaagacaggcttttaatgctgaaaccacaaccgta
aatgatgtggctggtagtttaaaatcctttagccttcatgatgacgatgagttaatgtcc
gaatcacaaggcggcacctttaaaactttcaaaacgttcgcttccaactacagcacctgc
agtaatatgagtttcaaaaaacttctggtaggctttcgtgcctcttcggactttcacaag
gaaatgttggctattcttacagctctaacagaaattattaaagaaagaggtggcactgaa
tcatccacagaatattttattttgttaatggaacaaattgaggccagtactgaggataat
gatatcattgctggtgtgtcacttttgtctatgggtattaagtcggtccctacagcagtg
ttgagaaagcgttttagcgaaacagcaggtactttaatgtcgtgtctgcagagatttatg
gattccaataatcagtcgataattaaatacgttattggctgcttatcggttctgttaaga
gctcaagattatatgacctggacttattcgtcaacatggcaatatatggatgcgttatta
tcctttaccatacactcaaaacccaagatacgtaaagctgctcagcatgctgtagtttct
attattcacggcagttcctttatgttgcctccaaaactaactgataacgaagaggagaat
gagactccagtagacaccaacagtcaacaaccacaaattaagttccatcctgccggcagc
cgtgtcaccaaattctgtttaaatcaattcaagcccgaagttctggcgcaacaacaaact
actgtgctgcacacattagctttgctaaaagaaaccattagtggttttaagactgacgac
ataaggaccgtatgcgaacatttgttgtccataatgaccgccgccaatgtcttggtaaga
acaaactgtttgcaaaccatgcatcagctttttgtatcacgcaccacaaacttgaatggt
ctgctatgcgctaaactgttgacagccatacatgaatatcgtccagatcgcacagattat
cgccaaacattggcctggttgactgtactcaaggagggtcacatacatttgagtcaatta
gaattgaatttatgcttaaatgctttaccaagttttgtagaaatatgctgcagtgattta
tggctttcggatagaaccgatattatagtgggtgtatccaatgccattaaagaattgtta
tatgagtgtgttaagcccgcctgtgccacacaagaattggctaatgtatatcgcgtacca
attaccaaaatattgtcgtcagtgcacaaagttttaagtgctccctttggagaggtggcc
aaatatgtggtcttaacattctccataatctttgaagtatgcggtacttacttcagcaag
gagttgtcggcttctttgttggaactggccaaacggtacgatactcaatcagctttgcgc
atacaaattgaacatgccattatatcagctattaaatccatgggacccgaaattgtcttg
aaatccatacctttaactaatgctaaaggtgaagtcttattggagaaatcctggttgctg
cctttgcttagagaaggcgcggctggagctagcttcaaattctttaaagaggtgatttta
gccttagctttggactgcaataaaaaatggcataaatttgctgatgagaaacaagtatcc
atgtcccacacttacgaactgctgtgctgtcaattgtggggcctattcccaggtttctgt
agagctccaaaagatcccgataactttaaactaatagcaccaactttgggtaatgctttg
gataataatcctgaatttagggctcccatcttcgatggtttaattgaattgatacaaaat
gaagaacagactgttattcacgaagctttgggcaaatatgctaaaaactttttacccaga
ttgtttaacatttacacacaaaaacccaatggcacttatgaacaagatttacgtaaaaaa
tctttggaagttataaagttgtatttaacaaaaacacccaatgacatgttaaaagaactc
tttgataccgctcacaaacaattggaaggcactgctgtgggcacctttgaatatgattcc
atttttgatatcactgcggctttagtattattccagacttgtgaggttatacgcagcttt
ttcgaaacctacatagtaccagttttaatgaagagtgaaaaatcaaaattagtgaccaag
gatgaacagaaattgaagaagcaacagcgcaaaacttatgaattattgcgcgatatttta
acatctgaggccgcctcatgcaaaaagttcacacgcaccaatttgatagctttgcaaaag
ttactactagaagccttctccactagttgtgccgtttgtcaagcagctcgtttaagatgt
ctgaaaattcttattgagaatcgcaaaaacaattctatcaacgataagattatcataaaa
actttgccagaggctgttataaattacaaagaattttccacacgcaaagaaaatatttcc
gaggaattattaaaattgattttggatttgtatcaggaggctgaaaaattaaatgatttt
gtagacattctaactgctggatttgctggcgacgaatctttaattaccaatacaattcta
gccttccgtacagttgtacagagccagggcaagaacttaactgtcagcactttggaattc
ataatggagcaaattgcggtatttttagtgcaaaaatccagatcacaagctgaagcttct
gtggcatttttaatcacattcattaaagtaatgcctacacctttggtagccaatcatttg
gaaactataatgaaatctctttcggccatggttaaagataccaaacgtttctgtcgcata
caaattggttatttattaaagaaactttgcaaacgttttacggccgaggaattgataaga
tttgttcccggtgatgatgaagtaactcatcgtagacttaaaaagatacgcaaacaactg
agacgcgaaaatcgcaagaaacaatcggaagataatgctaaggacagtgatgaagagggc
tccgatgaagaatttgtgccgggcttggaaaagaaaagtgttacaattgatgatattttg
gctgattctgactccgatttaccggaagacatggacgatgatgatgacaataatgcagct
gataaatctaaaaccaaaaaacaacgtaatactttcatacgtgaagatcctgaagatatt
gttgatttagctgatattaaatcaataggaaatgttttaactaaccgtcctaacttggat
gctgctaaatcgggtggtaaaacaaaatctagtgatccaaatcgtggcttcaaaaccgcc
gatgatggtcgtcttattattagtgataaggccttgcgtggcatagatgatgatgagggc
gatagcagtagtgatgatgacgatgatgagggtgttgaaatgaatgagaaaaaggctgtt
aaacgtggaatggaagatgattccagtgatgatgaagatgttgccatggctcctaaccgt
aaacgtaaagcagctgatgccttaagcatgcgttcgggtaaaacttcagcttcacgttat
accaccggcggcaaaggtattcatagaaatgttggtgctgcttcagatgcaatctctatg
aaatcgggtaaatctggctattcgactaaatcgggcaaatcaaatcatacaggtggagaa
tatactaccaagaaagctaagggtgatatgaaaaagaagggaaaattagatccatatgct
tacataccattaagtagaaatactttaaataaaagaaaacgtgctaaacatgccggagcc
tttaagaatatagttaatggtgcacgtaaaggagctttaaagggagttaaaagtaaaatg
gccaaagcctataaaaagtaa
DBGET
integrated database retrieval system