KEGG   Lucilia sericata (common green bottle fly): 119614816
Entry
119614816         CDS       T08270                                 
Name
(RefSeq) LOW QUALITY PROTEIN: activating signal cointegrator 1 complex subunit 3-like
  KO
K18663  activating signal cointegrator complex subunit 3 [EC:5.6.2.4]
Organism
lsq  Lucilia sericata (common green bottle fly)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:lsq00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:lsq03400]
    119614816
Enzymes [BR:lsq01000]
 5. Isomerases
  5.6  Isomerases altering macromolecular conformation
   5.6.2  Enzymes altering nucleic acid conformation
    5.6.2.4  DNA 3'-5' helicase
     119614816
DNA repair and recombination proteins [BR:lsq03400]
 Eukaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   Direct repair
    119614816
SSDB
Motif
Pfam: Sec63 DEAD WHD_SNRNP200 ResIII ASCC3_N Helicase_C Helicase_PWI AAA_19 DUF1995 AAA_22 CdiI_2
Other DBs
NCBI-GeneID: 119614816
NCBI-ProteinID: XP_037826850
LinkDB
Position
Unknown
AA seq 1879 aa
MAERFKDLPRFSGSLRANTDLEAKLPVINDKEELDELRQERNTFLKIKTEEQQTIHEVLQ
HMPADRRDQIKIHFQKLRNLVQECMGYDEQPQVVEHAALFLFWLMLEQKVIMVATTMRVR
SIFGTIFGNKLAIIHQTVWSIRELMEDYEVEDLKEWNKGMGKKSKNQKLWGDHIKVKFKQ
VSEEEIGNLLDLAPTTISKNATSLGFSMQWNQEAATSSNKTKYHKVVDTFIEMSQKDEHA
HLINSLTELLNSKKSNNELQNDLIELLGFEHFDLVQEVLNERTKIGNQLQELEQKEKRSK
RSKQLQQKQMKNGAAGATEHRPTVAHQVLVQSALEKELTKQQRKEEKKMQRLMQSIGRNE
KDEDEVAQVINPMQLRLQQQRKLLEHAQHQPILKCNQQLKEFRSTLAAPQRYPYVFDSQL
EAKQHAGFIGGNRISLPETAERIDCKQYEEVKIPATEPPPLSVGNNRINIADLDDIGKIA
FANCKQLNRIQSVVYPVAYHSNENMLVCAPTGAGKTNVAMLTIVHTIRSHLENGLINRDQ
FKIVYIAPMKALASEMVDNFSKRLKELNIVVKELTGDMQLSKAEMTQTQILVTTPEKWDV
VTRKGAGDVALISLVKLLIIDEVHLLHGERGPVVEALVARTLRLVESSQSMIRIVGLSAT
LPNYIDVSNFLRVNPMKGLFYFDARFRPVPLDTVFIGVKSVKPLQQLADMDQVCYQKCVE
QVQLGHQVMVFVHARNATVRTASTLRELAQQNNTSALFLPDTNNSNYGLALRAIQKSRNK
QLVELFSAGFAMHHAGMLRTDRQLVEKYFSEGHVKVLVCTATLAWGVNLPAHAVIIKGTD
IYDSKHGSFVDLGILDVLQIFGRAGRPQFDKSGVGTIITTYDKLNHYLSLLTNQFPIESN
FVQFLADNLNAEIALGTISNVEEAVEWLSYTYLFVRMRINPHVYGIEYAEVLQDPQLEAK
RQALIVGAAMSLDKARMIRFNQRTLDFNVTDLGRTASHFYIKYDTVEIFNDLLKPFMNES
EIFAMISQAQEFQQLKVRDDELEELDELRHNYCKVKAFGGAENVCGKVNILMQTFLSHGY
VKSFSLVSDMSYIVQNIARIARALFSIVLRNNNAILSGRMLQICKMFERQQWDFETPMRQ
FGNINAETIDKLESRGISLYTLREMEQNELKEILRNARYAENVLRAAKELPMLEIEATLQ
PITRTVLRIKIDIWPNFNWNDRVHGKVSESFWLWIEDPETNFIYHSELFQATRKFVFSGK
PQQLVMTIPLKEPLPPQYYIRVASDIWLGSNNWIPLTFKHLVLPEHHPPLTELLPLHPIP
VTCLKNPLYESLYPFSHFNPIQTQIFHCLYHTDNNVLLGAPTGSGKTIVAEIAIFRAFNK
TPKAKVVYIAPLKALVKERISDWKKRFEAXSLTXKVVELTGDTTPDIQAIRESQIIVTTP
EKWDGISRSWQTREYVQDVALIVIDEIHLLGEDRGPVIEVIVSRTNFITSHTGRSIRIVG
LSTALANAQDLANWLGIKQMGLYNFKPSVRPVPLQVHINGFSGKHYCPRMATMNRPTFQA
IRTYSPADPAIVFVSSRRQTRLTALDSHTYVAGDENPKQFLHMEEYEMQQILQSIKDSNL
KFCLAFGIGLHHAGLQEQDRKLFEDYFLXRKIQVLIATATLAWGVNMPAHLVVIKGTEYF
DGKVKKYVDMPITDVLQMMGRAVVPQFDNEGVAVVLVHDVKKNFYKKFLYDPFPVESSLL
EVLPEHINAEIVAGTGKQNKAALDYLTWTYFFRRFDEKSYYYNLEGLEPTQLNAFLSSLV
EKVVYELEAAACLVQKEHILIPTFLGRISSFYYLSYRTMKHFLDDLEPQMSTSDLLLAIA
DSYEFDQQPVRHNEDKHNE
NT seq 5640 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggctgaacgttttaaggacttaccacgtttcagtggatctttaagagccaataccgat
ttggaggccaaattaccagtgataaatgacaaagaagaattggatgaattgagacaggag
agaaatacttttctcaaaataaaaacagaagaacaacagaccatccatgaagtgctgcag
catatgccggccgatagaagagaccagataaaaatacattttcagaaattacgaaatctg
gtacaagaatgcatgggttacgatgaacagccacaggtggttgaacatgccgccctcttt
cttttctggctgatgttggaacaaaaagttataatggtggccaccaccatgcgtgtacgt
tccatatttggcactatatttggtaataaattagctataatccatcagacagtatggtcc
ataagagaattaatggaagactatgaagtggaggatttaaaagaatggaacaaaggaatg
ggcaagaaatcgaaaaatcaaaaactttggggagatcatataaaagttaaatttaagcaa
gtttcggaggaagaaataggtaatcttttagatttggctcctactaccattagtaaaaat
gccacttctttgggtttttccatgcaatggaaccaagaagctgccacctctagcaataaa
acgaaatatcacaaagtggtggatacatttatagaaatgtcacaaaaagatgaacatgcc
catttgataaacagcctaacagaattgttgaattccaaaaagtccaataacgaattacaa
aatgatcttatagagttattgggttttgaacatttcgatttagtgcaggaagttttaaat
gaacgcacaaaaattggcaaccaattgcaagaattagaacaaaaagaaaaacgctctaaa
cgcagcaaacaattgcaacagaaacaaatgaaaaatggcgcagcaggcgcaacagaacac
agaccaactgtggcgcatcaagtgctggtgcaatcagccctggagaaggagctaactaaa
caacagcgtaaagaggaaaagaaaatgcagcgtttaatgcagtcgataggacgcaatgaa
aaagacgaagatgaggtggcccaagtaataaatcccatgcaattgcgcttgcaacaacag
cgtaagctactcgaacatgcccaacatcagcctattctaaaatgcaaccaacaattaaaa
gagttccgttctacacttgctgctccgcaacgttatccttatgttttcgatagtcaattg
gaagctaaacaacatgctggttttataggcggtaatcgtatatctctgccggaaacagca
gaacgtatagattgcaaacaatatgaggaggtgaaaattcctgccactgaaccaccacct
ttatcggtgggtaataatcgcattaacatagccgatttagatgatataggcaaaatagct
tttgcaaattgtaaacaacttaatcgtatacaatctgtggtctatccggtggcctatcat
agcaatgaaaatatgttggtgtgtgcacctaccggtgcgggtaaaactaatgtggccatg
ttgactattgtacataccatacgttcacatttagagaatggcctgataaatcgtgatcaa
tttaaaattgtctatattgctcccatgaaagccttagcctctgaaatggtggataacttt
tcgaaacgtttgaaggagttaaatattgtggttaaagaactgactggtgatatgcagttg
tcaaaggcggaaatgacacagacacagatattggtaactactccagagaaatgggatgtg
gtgacaagaaagggtgctggtgatgtggccttaataagtttagtgaaactactcattatc
gatgaagtacatttattgcatggtgaacgtggtcccgttgtagaggcactagtagctcgt
actctgcgtctggtagaatcttctcaaagtatgattcgtattgttggtctctctgctaca
ctgcccaattacatagatgtttcgaatttcctaagagtcaatcctatgaaaggtcttttc
tactttgatgcccgctttagaccagtaccacttgacacggtttttataggagtaaaatct
gtaaaacctttacaacaattagccgatatggatcaagtttgttatcagaaatgtgtagag
caagtacagttgggtcatcaggtcatggtgtttgtacatgctcgtaatgctaccgtacgt
acggccagtactttaagagaattggctcaacagaacaataccagtgctctctttttaccc
gataccaataatagtaattatggtttggccttaagggccatacaaaaatcgagaaacaaa
caattggtggaattgttttcggctggttttgctatgcatcatgcgggtatgttgagaacc
gataggcagctggtggagaaatacttttccgagggtcatgttaaagttttagtttgtacc
gccaccttggcttggggtgtcaatttgcctgctcatgctgttatcataaagggtactgat
atttatgattccaaacatggttcatttgttgatttgggcatattggatgttttacaaatt
ttcggtcgtgctggtcgtcctcaattcgacaaaagtggggtgggtactattataaccacc
tacgataaactgaatcactatctctccctactcaccaatcaatttcctattgaatctaat
tttgtacaatttttggcggataatcttaatgctgaaattgctttgggcaccatttccaat
gttgaagaggcagtcgaatggcttagttatacttatctatttgtacgcatgcgcataaat
cctcatgtttatggcatagaatatgccgaggtattgcaagatcctcaattggaggcgaaa
agacaagctttaatagtgggtgctgccatgagtctggacaaggctcgtatgatacgtttc
aatcagagaactttggatttcaatgttaccgatttgggtagaactgcttctcatttctat
ataaaatacgatactgtggaaatattcaatgatttacttaagccttttatgaatgaatcg
gaaatctttgccatgatttcacaggcacaagaattccaacagctaaaagtacgggatgat
gaactggaggaattggatgaattgcgtcacaattattgtaaagttaaagcttttggcgga
gctgagaatgtttgcggtaaagttaatattttaatgcaaactttcctctcccatggctat
gtcaaatccttctctctggtctccgacatgtcttatattgtacaaaatatagcccgtata
gccagagccttattttccatagtactacgcaataataatgctatactatcgggtcgtatg
ttgcaaatttgtaaaatgtttgaacgtcaacagtgggactttgaaactcctatgcgacaa
tttggtaatattaatgctgaaactatagataaacttgaaagtagaggcattagtttatat
acactaagagaaatggaacaaaatgaattaaaagaaattttacgaaatgctcgttacgct
gagaatgtattgagagcagctaaagaattgcccatgttggaaattgaggccactttacaa
cccattacacgtacagtgttgagaattaaaatagatatatggccaaatttcaattggaat
gatcgtgtgcatggtaaagtgagtgaaagtttttggctgtggattgaggatcccgaaact
aattttatttatcattcagaattgtttcaggctacacgcaaatttgtgtttagtggtaaa
ccgcaacaacttgtgatgaccataccgcttaaggaacctttaccaccccaatactatata
cgtgtagctagtgatatatggctgggtagcaataactggataccacttacctttaaacat
cttgtattgcccgaacatcatccaccactaacggaactattacctttacatcctataccc
gttacttgtctaaaaaatcctctctacgaatcactataccctttctctcatttcaatccc
atacaaacacaaatcttccattgtctctatcataccgacaacaatgttctgctgggtgct
ccaaccggttcgggtaaaactattgtggcggaaattgccatatttagagcattcaataaa
acccctaaagccaaagtggtatatatagctccgctaaaagctttagtcaaagaacgtata
agtgattggaaaaaacgttttgaggctnggtcccttacgtaaaaggtagttgaattaact
ggtgataccacacccgatatacaagcgattagggaatctcaaataattgtcaccacaccc
gagaaatgggatggtatcagtcgttcgtggcagactagagaatacgtacaagatgtggcc
ttaattgttatagatgaaattcatttgttgggtgaagatcgtggtcctgtgatagaagtt
attgtttcgcgtacaaatttcataacctcccacacgggtcgcagtattcgtattgtaggt
ttgtccacagctttggctaatgctcaagatttggccaattggttgggtatcaaacaaatg
ggtttatataattttaaaccctcggtgagaccggtaccgctgcaagtgcatattaacgga
ttttcaggcaaacactattgtccccgcatggctaccatgaatcgtcccacattccaagct
atacgcacttactcaccagccgatcccgccatagtgttcgtctcgtccagaagacaaact
agactaacagctttggattctcatacatatgtggcaggcgatgaaaatcccaaacaattc
ttacacatggaagaatatgaaatgcaacagatattgcaaagcattaaagattcaaattta
aaattctgtttagcttttggcattggtctacatcatgctggtctgcaggaacaagatcgt
aaactgtttgaagactatttcttanntcgtaaaatacaagttcttattgccactgccacc
ttggcttggggtgttaatatgcccgcgcatttggtggttatcaagggtacagagtatttt
gatggtaaagtaaagaaatatgtagatatgcctattacggatgttttgcaaatgatgggt
cgagctgtcgtcccccagttcgataatgagggagttgctgttgttttggtacatgatgtt
aagaagaatttctataagaaatttttgtatgatcccttccccgtggaatcaagtttacta
gaagtgttgccagaacatattaacgctgagattgtggccggtacaggcaaacaaaacaag
gctgccttggattacctaacatggacgtatttctttagacgttttgatgagaaatcctac
tattacaatttggaaggtttagagccgacacaattgaatgctttcctttcttcgctggtg
gagaaggtggtatatgaacttgaagctgccgcttgtttggtacaaaaggaacacatttta
atacccacatttttgggtcgcatttcatcattctattatttgtcttatcgtacaatgaaa
catttcctagacgatttagagccacaaatgtccacaagtgatctattgttggctatagcc
gattcatatgagtttgatcaacagccagtgcgtcataatgaagataaacataatgagtag

DBGET integrated database retrieval system