Lonchura striata (white-rumped munia): 110482547
Help
Entry
110482547 CDS
T05897
Symbol
FBN2
Name
(RefSeq) fibrillin-2
KO
K23342
fibrillin 2/3
Organism
lsr
Lonchura striata (white-rumped munia)
Pathway
lsr04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lsr00001
]
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
110482547 (FBN2)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
lsr00536
]
110482547 (FBN2)
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
lsr00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
110482547 (FBN2)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_CA
cEGF
EGF
FXa_inhibition
hEGF
TB
EGF_3
Fibrillin_U_N
Plasmod_Pvs28
EGF_FBN_1st
EGF_MSP1_1
EGF_2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
110482547
NCBI-ProteinID:
XP_021407547
LinkDB
All DBs
Position
Z:3158281..3272076
Genome browser
AA seq
2883 aa
AA seq
DB search
MGRRRLCWARRCCLLSLCLGCLALCAQGAAGRQHRPPPLRPHPRAPPAHREDGTGSAAGR
VRRRGQQDALRGPNICGSRFRSYCCPGWKTLSGGNQCIVPICRNSCGDGFCSRPNMCTCA
NGQISPTCAARPAQQCSISCRNGGTCVDEQCQCQKGFSGAHCEQPVCESGCQNGGRCVGP
NRCACVYGFTGPQCQRDYRTGPCFTQVSKQMCQGQLTGIVCTKSLCCATVGRAWGHPCEM
CPAQPQPCRRGFIPNIRTGACQDVDECQAIPGVCQGGNCVNSVGSYECKCPVGHKQNEAT
QKCDDIDECSVIPGICEGGVCSNTVGSYFCICPQGFVTSVDGSCTPDQRAGSCFSSSASG
RCVQELPGRLTRRQCCCESGYCWASGSAPELCPARGSDDHRRLCVDGVPARGGARRGGAG
GNGFHPGGNGNGFGPRGAGFIPVPGSNGFSPAAGGAGVGAGGHSSTGSGPIITGLTILNQ
TIDNCKHHPNLCLNGRCIPTPSSYRCECNMGYKQDANGDCIDVDECTSNPCSNGDCVNTP
GSYYCKCHAGFQRTPTKQACIDIDECVQNGVLCKNGRCVNTEGSFQCICNAGFELTTNGK
NCVDHDECATTNMCLNGMCINEDGSFKCICKPGFVLAPDGRFCTDIDECQTSGICMNGHC
INTEGSFRCDCPPGLVVGVDGRVCVDTHVRSTCYGGIRKGLCVRPFPGAVTKSECCCASP
DYGFGEPCHPCPAKNSAEFHGLCSSGIGITVDGRDINECALDPDICSNGICENLRGSYRC
NCNSGYQPDPAGTNCVDVDECSVNGLLCDNGLCRNTPGSYSCSCPRGYLFSSETDTCEDI
NECESSPCVNGACRNNLGSFHCECSSGSKLDPTGLICIDSLKGTCWLNIRDSRCEVNING
ATLKSECCATLGAAWGSPCERCELDTACPRGFARVKGVTCEDVNECEVFPGVCPNGRCIN
SRGSFHCECPEGLTLDGTGRVCLDIRMEPCYLRWEEEECVQAVPGRLRMDSCCCAVGAAW
GSSGCQRCPAPGSQEHQDLCPRGPGFSNRGDVLTGRPFYKDINECKVFPGMCMNGKCRNT
IGSFKCRCNSGFTLDMEERNCTDIDECRISPDLCGSGTCVNTPGSFECECFDGYESGFMM
MKNCMDIDECERNPLLCRGGTCVNTEGSFHCDCPLGHELSPSQEECLDVNECSLSDSLCR
NGRCVNMVGTYQCFCDSGYQPTPDRQACTDIDECMIMNGGCDTHCTNSEGSYECSCSDGY
ALMPDVRTCADIDECENNPDICDGGQCSNIPGEYRCLCYDGFMVSIDMKSCVDVNECDLN
SNICMFGECENTKGSFICHCQAGYSVKKGTTGCTDVNECEIGAHNCDMHASCVNVPGSFK
CSCREGWVGNGIKCIDLDECSNGTQRCSANAQCVNSLGSYHCACAEGFTGDGFTCSDVDE
CAENVNLCENGQCLNAPGTFRCECEMGFTPASDSKSCQDTDECSFQNICLFGTCNNLPGM
FRCICDDGYELDRTGGNCTDIDECADPINCVNGLCVNTPGRYECNCPPDFQLNPTGVGCV
DNRVGSCYLKFGPRGDGGLSCNTEIGVGVTRSSCCCSLGKAWGNPCETCPPVNSTEYNTL
CPGGEGFRPNPITIILEDIDECQELPGLCQGGNCINTFGSFQCECPKGYYLSEETRICED
IDECVAHPGVCGPGTCYNTLGNYTCICPPEYMQVNGGHNCMDMRKSFCYRSYNGTSCENE
LPFNVTKRMCCCTYNIGKAWNKPCEPCPTPGTVEFKSLCGNIPGFTFDIHTGKAVDIDEC
KEIPGICANGVCINQIGSFRCECPTGFSYNDLLLVCEDIDECSNGDNLCQRNADCINSPG
SYRCECAAGFKLSPNGACIDRNECLEIPNVCSHGLCVDMQGSYQCICHNGFKASQDQTMC
MDVDECEQYPCGNGTCKNTVGSYNCLCYPGFELTRNNDCVDIDECSSFGQVCRNGRCFNE
IGSFKCLCNEGYELTLDGKNCVDTNECVALPGSCFPGTCQNLEGSFRCICPPGYEVKSES
CIDINECNEDPNICLFGSCTNTQGGFQCICPTGFVLSENGRRCFDTRQSFCFTNFENGKC
SVPKAFNTTKAKCCCSKMPGEGWGDPCELCPKEEEVAFQDLCPYGHGTIPGIDDTREDVN
ECLESPGICSSGHCINTDGSFRCECPMGYNLDFTGVHCIDTDECSIGNPCGNGTCTNVVG
SFECSCHEGFEPGPMMNCEDINECAQNPLLCAFRCINTYGFYECTCPVGYELREDQKMCK
DLDECAEGLHDCESRGMICKNLIGTFVCICPPGMTQRPDGEGCTDENECRSKLGVCENGR
CVNVVGSYRCECNEGFLSSPSGTECLDNRRGFCFAEVLQTMCQMGSSSQNLVTRSECCCD
GGRGWGNQCRLCPLPGTSQYKKLCPHGSGYTTDGRDIDECKVLPNLCRNGQCINTMGSFR
CFCKAGYTTDITGTSCNDLDECSQSPRPCNFICKNSEGSYQCSCPRGYVLQEDGKTCKDL
DECQTKQHNCQFLCVNTLGGFTCKCPPGFTQHHTACIDNNECGSHPTLCGSKGICQNTPG
SFTCECQRGFSLDSTGLNCEDVDECDGNHRCQHGCQNILGGYRCGCPQGFVQHYQWNQCV
DENECSNPHMCGSASCYNTLGSYRCVCPSGFSYDQFSHACHDVNECSSAKNPCSYGCSNT
EGGYLCGCPPGYYRVGQGHCVSGMGFNKGQYLPLDGDADKENALSPEVCYECKINGYSKK
DSRKKRSANTERVSWGSLESPLKVRVAMSRLGGREPILELRPALGRRVRYAIARGSRRGT
FWMLLRDGAGRLHAARGRAARGLHALDITSTAVPEEDGRPQGGHGGGGARGEALRVRLWL
HLY
NT seq
8652 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggccggcggcggctctgctgggctcggcgctgctgcctcctgtctttgtgcctgggc
tgcctggctctgtgcgctcagggggcggccggcaggcagcaccgaccgccgccgctccgg
ccgcatccccgcgctccgcccgcgcaccgggaggacggcaccgggagcgccgccggccgg
gtccgccggcgaggacagcaggatgcgcttcgagggccaaatatctgtggttccagattc
cgctcctactgttgccctgggtggaaaacactttctggaggaaatcagtgcattgttcca
atttgcaggaatagctgtggtgatggattttgttcccgtcccaacatgtgcacttgtgcc
aatgggcagatatcacccacgtgtgcagcaagacctgcccagcagtgcagcatcagctgc
aggaacggcgggacgtgcgtggatgagcagtgccagtgccagaagggcttctctggtgct
cactgtgagcagcctgtctgtgagagtggctgtcagaacggaggacgctgtgttggaccc
aatcgttgtgcttgtgtctatggcttcactggccctcagtgccaaagagattacaggaca
ggcccgtgcttcacccaggtgagcaagcagatgtgccagggccagctgacggggattgtg
tgcaccaagtccctgtgctgtgccaccgtggggcgagcctggggccacccctgcgagatg
tgccctgcccagccccagccctgccgccgcggcttcatccccaacatccgcaccggcgcc
tgccaagatgttgatgagtgccaggctatccctggggtctgccaaggaggaaactgtgtt
aattcagtaggttcatacgagtgcaagtgtcctgtgggccacaaacagaatgaagcaact
caaaaatgtgatgatattgatgaatgcagtgtcatcccagggatttgtgagggtggtgtt
tgctccaacactgtggggagttatttctgcatctgccctcagggttttgtcacatctgtg
gatggatcctgcacccctgatcagagagcaggcagctgcttctccagctctgcgagtggc
cgctgcgtgcaggagctgcccgggaggctcacccgaaggcagtgctgctgtgagtctggc
tactgctgggccagtggctctgccccagagctgtgtcctgccagaggatctgatgaccac
cgcaggctgtgtgtggacggtgtccctgcccgaggcggcgcccggcgcggcggagcagga
gggaatgggttccatcccgggggaaatggaaatggattcggaccaagaggagctggcttc
atcccagtcccaggaagcaatgggttctccccggctgcgggtggagcaggggtaggagca
ggtggtcacagctccactggaagtggcccgatcattacggggctgacaatactcaatcag
acaattgacaactgcaagcaccatcccaacctttgcctgaatggacgctgtataccaacc
ccctctagttacagatgtgaatgcaacatgggatataagcaggatgcaaatggggattgt
atagatgttgatgagtgcacatcaaacccctgctccaacggggactgtgtcaacacacct
ggttcctattactgcaagtgccacgcaggtttccagagaactcccaccaagcaagcctgc
attgatatcgacgagtgtgttcagaatggtgttctttgtaaaaatgggcgttgtgtgaac
actgagggaagcttccagtgcatttgcaatgctgggtttgaactgactacaaatggaaaa
aactgtgtggaccatgatgagtgtgccacaacaaacatgtgcttgaatgggatgtgcata
aacgaggatgggagttttaaatgcatctgtaaaccaggatttgtcctggctccagatgga
cgtttctgtactgatattgatgaatgccagacatcaggaatttgcatgaatggtcattgc
ataaatactgaaggctcatttaggtgtgactgtccacctggcttggttgttggagttgat
ggtcgtgtgtgtgtagatactcacgtgcgtagcacatgctatggaggcatcaggaaaggg
ctgtgtgtccgtcccttccctggtgctgtgacaaagtctgaatgctgctgtgccagccct
gactatggctttggagagccgtgccatccctgccccgctaaaaactcagctgagttccat
ggcctgtgtagcagtggaataggtattactgttgatggaagagacattaacgagtgtgct
ctggatcctgatatttgctccaatgggatttgtgaaaacctgcgaggcagctatcgctgt
aactgcaacagtggctaccagcctgatcctgctggaaccaattgcgtggatgttgacgag
tgctctgtgaacgggctgctgtgtgacaacgggctctgccggaacaccccgggcagctac
agctgctcctgccccaggggttacctgttcagctcggagactgacacctgtgaagatata
aatgaatgtgaaagcagcccatgtgtcaatggtgcctgcaggaacaaccttgggtcgttc
cactgtgaatgttcatctggcagcaagttggaccctacaggactgatttgtattgacagc
ctgaaggggacttgttggcttaatatccgagacagccgctgtgaagtcaacatcaatggt
gccacgctgaaatctgagtgctgtgctactttaggagcagcctggggcagcccatgtgaa
cggtgtgaattggacacagcttgcccaagaggatttgccagagtgaagggtgttacctgt
gaagacgtgaacgagtgcgaggttttccctggggtttgtcccaatgggcgttgcatcaac
agcagaggctccttccactgcgagtgtcccgaggggctgaccctggatggaacagggcga
gtgtgtttagatattcgcatggagccgtgctacctgcggtgggaggaggaggagtgtgtg
caggcagtgcccggcaggctgaggatggattcctgctgctgtgccgtgggagctgcctgg
ggctcctccggctgccagcgctgccccgcgcccggctcccaggaacaccaggacctgtgc
cccaggggccccggcttctccaaccggggcgatgttctcactggaaggccgttctacaaa
gatatcaatgaatgtaaagtgttccctggcatgtgcatgaatggtaaatgtagaaacaca
attggaagtttcaaatgcagatgcaacagtgggttcactttagatatggaggaaagaaac
tgtacagacattgatgagtgcaggatctccccagacttgtgtggaagtggcacttgtgtc
aacactcctggcagctttgagtgtgagtgctttgatggttatgaaagtggatttatgatg
atgaagaactgcatggatatagatgagtgtgaacgcaaccctctgctgtgcagaggtggc
acctgtgtgaacactgagggcagctttcactgtgactgtcccctggggcatgagctgtca
ccatcccaggaggaatgcttggatgtaaacgagtgctcgttgagcgacagcctctgcagg
aatgggaggtgtgtgaacatggttgggacctaccagtgcttctgtgactctgggtaccag
cccactcccgacagacaggcatgcacagatattgatgagtgtatgataatgaatggaggc
tgtgacacccactgcactaactcagaaggcagctatgagtgcagctgcagtgatggctat
gctctgatgccagatgtcaggacatgtgcagatattgatgaatgtgaaaacaatccagat
atctgtgatggtgggcaatgtagcaatatcccaggggaatatcgctgtctctgttatgat
ggatttatggtttctatagacatgaaaagttgtgttgatgtgaatgaatgtgatttgaat
tctaacatctgcatgtttggggagtgtgaaaacaccaaaggctccttcatttgtcactgt
caagctgggtattcagtcaagaaaggaaccacagggtgcacagatgtgaatgagtgtgaa
attggagctcacaactgtgacatgcatgcctcttgtgtcaacgtgccaggaagttttaaa
tgcagctgcagagaaggttgggttggaaatggcattaagtgtattgatcttgatgaatgc
tccaacgggacccagcggtgcagcgccaatgcccagtgtgtgaacagcctgggctcctac
cactgtgcctgtgcagagggattcactggagatggctttacgtgctctgatgttgatgag
tgtgcagagaatgtcaacctgtgtgaaaacgggcagtgcctgaacgcccccggcaccttc
cgctgcgagtgtgagatggggttcactcctgcctccgacagcaagtcctgccaagacacg
gatgaatgctccttccagaatatttgtctgtttggcacctgcaataatctcccaggaatg
tttcgttgcatctgtgatgatggctatgaactcgatcgaactgggggaaattgcacagat
attgacgaatgtgctgatcccattaattgtgttaatggtctttgtgtaaacactcctgga
agatatgagtgcaattgtcctccagacttccagctgaatcctactggagtgggttgtgtg
gataaccgtgtgggcagctgctacctgaagtttggaccaagaggggacgggggcctgtcc
tgcaacactgagattggggttggggtcactcgttcctcgtgctgctgctcgctgggaaag
gcttgggggaacccctgtgagacctgtccccctgtcaacagcactgaatacaatactctg
tgtccagggggagaaggattcagaccaaatcccatcactattattttagaagacattgat
gaatgtcaggagctgccaggtctctgccaagggggaaattgcatcaatacttttggcagc
ttccagtgtgaatgcccaaaaggttactacctcagtgaagagacaagaatctgtgaagat
attgatgagtgtgttgcacaccctggtgtctgtggtcctggcacctgctacaacaccttg
gggaactacacctgcatttgtccacctgaatatatgcaggtgaacggaggacacaactgc
atggacatgaggaaaagcttttgctacagaagctataatggaacttcctgtgagaatgaa
ctgcccttcaatgtgaccaaaaggatgtgctgctgcacatacaatattgggaaagcctgg
aacaaaccctgtgagccgtgtccaactccaggaacagttgaattcaagagcctatgcgga
aatattcctggcttcacttttgacatccatactggaaaagctgttgacattgatgagtgt
aaggaaatcccaggaatctgtgccaatggagtttgcatcaatcagattggcagcttccgc
tgtgagtgccccactggattcagttacaatgacctgcttctggtctgtgaagatattgat
gagtgcagcaacggggacaacctctgccagagaaatgctgactgcatcaacagccctggg
agctaccgctgtgaatgtgctgctggctttaaactgtcccccaacggtgcctgcattgat
cgcaatgaatgtctggaaattcctaacgtttgcagtcatggtttgtgtgtggacatgcag
ggaagctaccagtgcatatgtcacaatggcttcaaggcatcccaagatcagactatgtgc
atggatgttgatgagtgtgaacagtatccatgtggaaatggaacctgcaagaacacagtt
ggatcatacaactgcctgtgttatccaggatttgaattaactcgtaataatgattgtgtg
gatattgatgagtgcagttcctttggtcaggtgtgcagaaatggacggtgcttcaatgaa
attggttctttcaaatgtttgtgtaatgaaggatatgagctgactctggatggcaagaat
tgtgttgacaccaacgagtgtgtggcgctgcctggttcgtgctttcctggtacctgccaa
aatttggaaggatcattcaggtgcatctgtccaccaggatacgaagtaaaaagtgaaagt
tgcattgatattaacgagtgtaacgaggatcccaacatctgcctcttcgggtcctgtacc
aacacccagggaggtttccagtgcatctgtcccacgggttttgtgctgtctgaaaatggg
cggaggtgctttgatactcgtcagagcttctgcttcaccaactttgagaatgggaagtgc
tcagtgccaaaggctttcaacaccacaaaggccaagtgttgctgcagtaaaatgccagga
gaaggatggggtgatccttgtgagctctgtccaaaggaagaggaagttgcttttcaggac
ctgtgcccatatggtcatggaactattcctggaattgatgacacacgtgaagatgtcaat
gaatgtcttgaaagcccaggaatttgctccagtggtcactgcatcaacactgatggatcg
tttcgctgcgagtgccccatgggctacaacctggatttcacaggagtgcattgcatagat
acagatgaatgttccattggcaacccctgtggaaatggaacgtgcactaacgtggttggc
agctttgagtgcagctgtcacgaagggtttgagccaggcccaatgatgaattgtgaagat
atcaacgagtgtgctcagaaccccctgctctgtgccttccgctgtatcaacacttatggt
ttctatgaatgcacctgcccagtgggatatgagctaagggaagaccaaaagatgtgcaaa
gatctggatgagtgtgctgaaggtctccatgactgtgaatcaagaggcatgatctgcaaa
aatctgattggtaccttcgtgtgcatttgtcctcctgggatgacccagaggcctgatgga
gaaggatgcacagatgaaaacgagtgccgctccaagctgggtgtctgtgaaaacgggcgt
tgtgtgaatgttgttggcagctacagatgtgaatgtaacgaaggattcctgtcaagtcca
tcaggcactgagtgtcttgataaccgccgggggttttgctttgctgaggttctgcagacc
atgtgccagatgggctcgagcagccagaaccttgtcaccaggtccgagtgctgctgtgac
gggggccggggctgggggaaccagtgcaggctctgccccctccccggaacctcccagtac
aagaaactctgtccacatggatcaggctacaccacagatggaagagatattgatgagtgt
aaggtcctgccaaacctgtgcaggaatgggcagtgcattaacaccatgggctccttccgg
tgcttttgcaaagctggctataccactgacataactggcacatcttgtaatgatcttgat
gagtgctcccagtcccccagaccatgcaattttatctgcaagaactcagaagggagctat
caatgctcatgtccccggggctatgtgcttcaggaagatggaaagacatgtaaagatctt
gatgaatgtcaaaccaaacaacacaattgtcagtttctctgtgtcaacacccttggaggc
ttcacatgcaaatgtccacctggttttacacaacatcacacagcttgtattgataacaat
gaatgtggttctcatccaacactgtgtggatcaaaaggaatttgtcaaaacactcctgga
agttttacctgtgaatgtcaaaggggattttcactggattctactggattaaactgtgaa
gatgtggatgagtgtgatggaaaccacaggtgccagcacggctgtcagaacatcctgggt
ggatacagatgtgggtgcccacaaggatttgtccagcactaccagtggaatcagtgtgtt
gatgaaaacgaatgctccaatcctcacatgtgtggctctgcttcttgctacaacaccctg
ggaagttacaggtgtgtctgcccatcggggttctcctatgaccagttctcccatgcctgc
cacgatgtgaacgagtgctcttctgccaagaacccctgcagttatggctgctccaacacc
gagggtggttacctctgtggctgcccacctggctattacagagttggacaaggacactgt
gtctcggggatgggatttaacaaaggccagtacctgccactggatggagatgctgataaa
gaaaatgctttgtcccctgaagtgtgttatgagtgcaaaatcaatggctactccaaaaaa
gacagcaggaagaagagaagtgctaacactgagcgggtgagctggggaagcctggagagt
cccctgaaggtgcgagtggccatgtccaggctgggcggccgggagcccatcctggagctg
cggccggccctggggcgccgcgtgcgctacgccatcgcccgcggcagccggcgcggaacc
ttctggatgctcctgagggacggcgccggccgcctgcacgccgccaggggccgggcggca
cgcgggctgcacgccctggacatcaccagcacggccgtgcctgaggaggacggaaggccg
cagggcggccatgggggcggcggcgcccgaggagaagccctcagggtgcggctgtggctg
cacctctactag
DBGET
integrated database retrieval system