Legionella spiritensis: NCTC12082_00111
Help
Entry
NCTC12082_00111 CDS
T06800
Symbol
rtxA-2
Name
(GenBank) structural toxin protein RtxA
Organism
lss
Legionella spiritensis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DUF5801
DUF4114
VWA_2
MCR_alpha_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
VEG89702
LinkDB
All DBs
Position
1:129626..134806
Genome browser
AA seq
1726 aa
AA seq
DB search
MVGVFMVVPSLSGVVQGLEGILIKNTRDGGNEVAKLGTPVHQGDILTLLSGNAYIHMLEG
FPEALALNRPVQIDGISPLLKAAPQESLVEQIVDEALAKGIDPTIILNVLEETAAGEETI
GEGGRFFVLDPLYGVGAVTAGYPTVGVSVDTKSGEQHVFFYEPNSSEQASDFVSNPAGTE
TTPFAIGVSSVSVDESDGLATVVNRVQSSTAASEITSVELSTPDSNAAVWHSGTQTLTAT
DGSWQIMVVRSGNNEINYEFKQLTPLQHPDASDPNDAITVPITVTATRNDGASATDRFSV
TIYDDGPKIEEALVESPLPLNVDETNISAGNAVATVNYFNTFAGAVHFGMDDTLDHPGEL
VFSLGVTADQVASGLYANDPSAVDGKGVEIQLIEEGGAIRGIAGGIEYFTISIDSNSGEM
TFAQSEAIWHGNPANPDDLASLNTPDINDLFIRVTAIDGDGDKASYQLGLGQGIFSINDD
GPGIDPGLIVAADPLNVDETNLATGNAVATANYADNFQPAIDYGEDGAGQTVYELSLNGQ
PGSGLYAIDPNQANGQGDEIQLVQVDSHTVQGQVNGETYFTVTVDGGTGEVTFAQNRAVW
HSDSANANDLSTLTTANADDFTIRAIVTDADGDSVGQALNLGQDIFSINDDGPLVNGNTD
TAQLVYEDALPAGNADPGQTLNLSGSLSSLVDFGADGPGGFELTTDYLTTLAAFGLTSDG
QALSYSASENNGIQSVVAKDYLGQDVFTFTFDKTTGNYDFTLQSHLDHLPPPIAQDDDTQ
SLPIQLGAIINAIDADGDKVNLGQSFGVHVQDDLPIAQNDSVSVNEPNAQLNIYYVVDVS
GSMGVVDPLIGQSRLELAREALVNLTQEYANYNGEVFVTVVPFASGSGNSGAFATAKFDI
LHGELVDALNVIGNLQVSQNPIPGSGTEYNDALDVTQDNLELDLNPLSQVAGYQNVVYFL
SDGVPVPASAGAPAGWQSFVDTNNIDVIPIGIGDFNPGPLEEVGNTGDTVIQVLDPTDLS
STLIEQLDNVVQGNVLDNDAFGGDGPDMPSIVSVSYQGVEHQYDGVNHSVTIIDDFGGRL
TFDFTSGDYSYIAPGVDQDEQVQFQYTIRDNDGDLSTANLNIVVNHLDPPSVTLLTKTLE
FTRTEQGQQPYGNADVAEYLLLQALGNESQQVTSVPINGVNLSNTFISVATEPTVNFVSE
GAGYRNMVGYYTYDSDGNINDAGFIWVNSSASSSAQNPNGGTNLITNTSGAFGFNQSASF
TLPDVSAGEGLGFFLLADGANDSTNVNLIRNGNYDSIQSLNNNVSIVNNQVLVGGQALNG
SIYFTHDKTLNSDYTTFPEGHALSGVTFSQDPSLTAYSGLLIIGFEDVHDGGDQDYNDVI
FSVDLGANIQNYATDSSPIIESVTDPDSAYLTKAVVTTDGFIEGDTLNFLSNANVQFDTV
NNQVTVTYNGADHVLNYTLTPDGNDPDFIYTFAAADVNNPVPVGAYEMALKSISFTPVAS
EASEGVARDVYVTVTDDTGLSATQATSFNVVINDILPMDLLAFDQQNGFDFGQGNDTVLI
PDQMDGLGQVSGGQGIDTVKFTEEGMNLTAEEIQDHFNGHWEQIDMTEQGSNILNLDLEA
VLKLSSGSELNLQLNNGDNVSVLQIKADGADSPDGSVDTVNIDSAHVTDVSDQLPAAGQT
AAEQLFKLTNADASQTAYVHVVSLTQQLPEVHATSTEGGGGGGGGG
NT seq
5181 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggttggggtatttatggtagtaccgagcttatctggggtggttcagggactggaaggc
attctgattaaaaatacaagggatggaggaaatgaagtagcaaaactgggtacgccagtt
catcaaggtgatatcctgactttattaagtggtaatgcttatatccatatgctggaaggt
ttcccggaagccctggcgctgaaccggcctgttcagattgacggtatttcacctcttctt
aaagccgcaccacaagagtcattagtcgaacagattgttgacgaagcgttggcaaaaggg
attgatcccaccatcattttgaatgttctggaagaaacggcggccggtgaagaaacgatt
ggggaggggggccgtttttttgttcttgatcctctgtatggtgttggggctgtgacggcc
ggatacccaaccgttggtgttagtgtagacactaaaagcggggaacaacacgtatttttc
tacgaaccgaatagttcggaacaagcctctgattttgtttcaaatccagccggtactgaa
acgactccttttgctatcggcgtatcttccgtgtccgttgatgaatcagatgggcttgcc
acggtggtgaaccgcgtgcaatccagtaccgcggcttcggaaatcacatccgtggagctg
agtactccagacagcaacgcggcggtttggcatagcggcactcaaactctgacggctaca
gacggaagctggcaaattatggtagtacgttcgggtaataatgaaataaattatgaattc
aaacagttaactcccctgcagcatcctgatgccagcgatccaaatgatgccataacggtg
ccgataaccgtcaccgctacccgaaacgacggggcttcggcaacggatcggttttcggtc
accatttacgacgatgggccaaaaatagaagaggctctggtggaaagccctctacccttg
aatgtggatgaaaccaatatctctgccggcaatgcggttgcaacggtgaattacttcaat
acgtttgccggcgccgtccattttggcatggacgatacccttgatcatccgggagaactg
gtttttagcctgggcgtcactgcggatcaggtagcgtccggcttgtatgcgaacgatcct
tcggctgtcgatgggaaaggcgttgaaattcagttgattgaagaagggggggctattcga
gggattgctggcggcatagagtattttacgatcagtatcgacagcaatagcggggaaatg
acttttgcccagtcagaggcgatctggcatggaaatccggccaatccggatgatctggcc
tcattaaataccccggacataaatgatttatttatcagggtaacggccatagacggagac
ggtgataaagccagctaccagcttgggttgggtcaaggcattttctccatcaacgacgac
gggccaggcattgatccgggtttgatcgtagccgccgatccgctcaatgtggatgaaacg
aatctggcaacgggcaatgcggtggctacggcgaattacgctgataattttcaaccggcc
attgattacggggaggacggcgcgggtcaaaccgtttatgaactgagcttaaacggccag
ccgggttccggtttgtatgccatcgatcccaatcaggctaacggccagggcgatgaaatt
caactggtgcaggtagatagccatactgtgcaagggcaggtgaatggcgagacgtatttt
accgtcacggtggatggtggcacgggtgaggtgacgttcgcgcaaaaccgggccgtgtgg
catagcgacagcgcgaacgccaacgatttgtccacgcttacgacggccaatgccgatgat
ttcactatcagggccatcgtcaccgacgccgacggtgattcggtagggcaggcattgaat
cttggccaggacattttctccatcaacgacgacgggcctttggtgaatggaaataccgat
acggctcagctggtttatgaagatgcgttaccagcgggtaacgcggatccgggtcaaact
ttaaatctcagtggctccctgtcttctctggtggattttggcgccgatgggccgggtgga
tttgagttaacgacagattaccttacaaccctggctgcgtttggtttgacatcggatgga
caagccttgagttacagcgcttcggaaaataacggcatacagagtgtggttgccaaggat
tatctggggcaggacgtatttaccttcacgttcgataaaaccaccgggaactatgatttt
acgttgcagagccatcttgatcacctcccgccgccgatagcgcaagatgatgatacgcaa
tcgttgccaattcagcttggcgctattatcaacgcgattgacgcggacggagacaaggtc
aatctggggcagtcttttggtgttcatgtccaggatgatttgcccattgcccaaaatgat
tcggtctccgtgaatgaaccgaacgctcagttaaacatttattatgtcgttgacgtgtca
ggcagtatgggtgtggttgatcctttaattggccaaagccgtctggagttagcgagggaa
gcgttagtcaatttaactcaggagtacgccaattataatggtgaagtgtttgtaaccgtg
gtgccttttgcatccggatcaggcaattccggcgcgtttgccaccgcaaaatttgatatt
ttgcacggcgaactggtggatgcgctaaatgttattggcaatctgcaggtgagtcaaaat
cccattcccggatcaggcacggaatacaacgatgcgcttgatgtgacgcaagataatctg
gaattggatctgaaccctctttcgcaagtggccggttatcaaaatgttgtttattttcta
tccgatggtgtgccggttcctgcaagtgccggagcgcctgccggatggcagtcttttgtc
gatacgaataacattgatgtcatacccattggtatcggtgattttaaccccggccctctg
gaagaggtgggcaataccggagatacggttattcaggttcttgatccgacggacttgtca
tcaaccttgattgagcagcttgataacgtagtgcaaggcaatgtcctggacaatgatgcc
tttggcggtgatggacctgacatgccgagtattgtttccgtgagttatcagggtgtggag
caccaatacgacggcgttaatcattcggtaacgattatcgatgattttggtggccgattg
acgtttgattttacaagcggggattactcctatattgctcccggcgttgatcaggatgag
caggtgcaattccagtatactatccgggataacgatggtgatttgagtacggccaatttg
aatattgtggtgaatcaccttgatccgccgtccgtgactttgttaaccaaaacactggag
ttcacccgtaccgagcaaggacaacaaccttacggtaatgccgacgttgcggaatatctg
ctgcttcaggctctgggtaatgaaagccagcaagtcacttccgttcccattaatggtgtt
aatttaagcaataccttcatttccgtggctacggaaccaacggtcaattttgtatcggaa
ggcgccggttatagaaatatggtaggttattacacatatgattccgacggaaatattaat
gatgccggatttatctgggtaaattcctcagcgagttcaagcgcccagaatcccaatggc
ggcaccaatttgatcactaataccagtggtgcgttcgggtttaatcaatcggcttccttt
acgctgcctgatgtttctgcaggagaaggtctcggatttttcctgctcgctgatggggct
aacgacagtaccaatgtcaatcttattagaaacggaaactacgattccattcagtcgctg
aataacaacgtttccattgtcaataatcaggtgctggtgggaggacaggctttaaatggc
agtatttattttactcatgacaaaacgttaaacagtgattatacaacttttccggaaggt
catgctttaagcggcgttacctttagtcaggatccttctctcacggcctattccgggctt
cttattattggttttgaagatgtgcacgatggtggcgatcaggattacaacgacgtcatt
ttcagtgtggatctgggggctaatatccagaactatgcgacggacagttcacccatcatc
gaatccgtgaccgatccggacagtgcctatttaacaaaagcggttgttacgaccgatggt
ttcattgaaggcgatacgctgaattttctatctaatgccaacgtacaatttgatacggtg
aataatcaggttacagtgacttacaacggcgctgatcatgttctgaattacaccttgacg
ccagatggtaatgatcctgattttatatacacctttgctgctgccgatgttaacaatccg
gtgccggtaggcgcttatgagatggctttgaaatccattagtttcactccggtcgccagc
gaagccagtgagggggttgcgcgggatgtctatgtgacagtaacggacgataccggatta
tccgctacgcaggcgacctcatttaatgtcgtcatcaatgatattttaccgatggatttg
cttgcatttgatcagcagaatggatttgatttcggtcagggtaatgatacggtgttgatt
cctgatcagatggatggtctggggcaggtcagtggcggtcagggtattgatacggtgaaa
ttcaccgaggaaggtatgaatttgaccgccgaggaaatccaggatcatttcaatggccat
tgggaacagattgacatgaccgagcaaggcagcaacattttgaatctcgatctggaagcg
gtcttgaaattatcgtccggcagcgaactgaatcttcaattaaataacggcgataatgtt
tccgttttgcagattaaggcggatggtgccgatagtcccgacggcagtgtggatacagta
aatatcgacagtgcgcacgtcacggatgtgagcgatcagttacctgccgccggacaaact
gcagccgagcagttgtttaaacttaccaatgcggacgcaagtcagacagcttacgtgcat
gtggtgagtttaacgcagcaactgcctgaagttcatgccacctctacggaaggaggcggt
ggaggtggtggcggcggataa
DBGET
integrated database retrieval system