KEGG   Lactuca sativa (garden lettuce): 111889051
Entry
111889051         CDS       T05352                                 
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1
  KO
K12741  heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1/A3
Organism
lsv  Lactuca sativa (garden lettuce)
Pathway
lsv03040  Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:lsv00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03040 Spliceosome
    111889051
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis [BR:lsv03019]
    111889051
   03041 Spliceosome [BR:lsv03041]
    111889051
Messenger RNA biogenesis [BR:lsv03019]
 Eukaryotic type
  mRNA surveillance and transport factors
   Transport factors
    Other transport factors
     111889051
   mRNA cycle factors
    Common to processing body (P body) and stress granule
     111889051
Spliceosome [BR:lsv03041]
 Common components
  Common spliceosomal components
   hnRNP proteins
    111889051
SSDB
Motif
Pfam: RRM_1 RRM_7 RRM_PARP14_3 Nup35_RRM_2
Other DBs
NCBI-GeneID: 111889051
NCBI-ProteinID: XP_023740954
LinkDB
Position
4:complement(167833145..167837405)
AA seq 394 aa
MDGGHPFVNGDDEQLQFDNLNQNHEDYDDNVDDSGGGNEIRHSINDSSRDSSAGKLFVGG
IAWETSEESFSSYFSHYGELTDSVIMMDKISGRPRGFGFVTFADPADADKVLEQDHVIDG
RPVEVKRTVPREDMQGSRGVSRTKKIFVGGIPLTLTEDEMREYFLSYGEIVEHQIMLDHV
TGRSRGFGFVTFDSEEAVDKIFADGQLHELQGKQVEIKRAEPKRAGAGAGGDFSYDSRSR
GRGGGSKSYGGGFGRGAAGYGGKADRGYDDYGGGYAGYDGYGGGYGGGTAGFYAGYGGYG
YGYGFGGPMYGGAGYAGYGGYGGAAGYAGGRGYGSGSGSGGGGGGYGGKGFGRGGGGYGY
GYGYDGSKGYDSSNGGGGGSSGGSGGGRFHPYRK
NT seq 1185 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggatggagggcaccctttcgttaatggtgacgatgagcaactacaatttgacaacctt
aatcaaaatcatgaagattatgatgataatgtagatgatagtggtggaggcaatgagata
aggcattcaatcaatgacagtagtcgtgactcttccgcaggaaaactttttgttggaggc
attgcttgggagacttcagaagaatccttcagcagttacttcagccattatggggaactt
acagattctgtgataatgatggataaaatttctgggagaccacgtggatttgggtttgta
acatttgctgatcctgctgatgcggataaagtcttggagcaagatcatgtcatagatggc
agaccagttgaagtgaagaggacagttccaagggaggatatgcagggtagtagaggtgta
tcaagaacaaagaaaatctttgttggtggcataccattaactttaacagaagatgagatg
agggaatatttcttgtcttatggtgagattgtagaacatcaaataatgctagatcatgtc
actggtcgatcaagaggctttggttttgttacatttgatagtgaagaggctgtggataag
atttttgctgatggtcaactacatgaacttcaaggcaaacaagtggaaataaagcgggcc
gagcctaaaagggctggggctggggctggcggtgatttctcatatgacagccggtcacgt
ggtcgtggtggtggttccaagtcctatggtggtggcttcggtaggggtgcagccgggtat
ggcggaaaagccgacagagggtatgatgattatggtggtggttatgctggttatgatggt
tatggtggagggtatggaggcggcactgctggtttttatgctggttatggtggatatggg
tatgggtacgggtttggtgggcccatgtatggtggtgctggctatgccggttatggtggt
tatggaggggctgccggttatgctggaggtcggggttatggaagtggtagtggtagtgga
ggtggtggtggtggttatggtggtaaagggtttggtaggggaggcggtggatatggatat
ggatacggatatgatggtagtaaagggtatgatagcagcaacggtggtggtggcggcagt
agtggcggcagtggtggtggaaggttccatccatataggaagtga

DBGET integrated database retrieval system