Lactuca sativa (garden lettuce): 111908090
Help
Entry
111908090 CDS
T05352
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1
KO
K14411
RNA-binding protein Musashi
Organism
lsv
Lactuca sativa (garden lettuce)
Pathway
lsv03015
mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lsv00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
111908090
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
lsv03019
]
111908090
Messenger RNA biogenesis [BR:
lsv03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Other transport factors
111908090
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
RRM_7
RRM_PARP14_3
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
111908090
NCBI-ProteinID:
XP_023759701
LinkDB
All DBs
Position
6:103513691..103517065
Genome browser
AA seq
466 aa
AA seq
DB search
MDSDQGKLFIGGISWETSEEKLKEYFGNYGEILQTVVMRDKISGRPRGFGFVVFSDPSVL
DTVLQEKHTIDGRTVEAKRALSREEQQVSKAGNPSGGRSFGGGGGGGGGGGTRTKKIFVG
GLPPTLSEEGFRQYFEAYGQVTDVVVMYDQQTNRPRGFGFISFDSEDAVDRVLHKTFHDL
NGKQVEVKRALPKDANPGGGAGGGRSMGGGGGGSYGASGGNSGSYESRMDSNRYMQSQSG
GGGGGGGGGGGFPPYGTPGYGYGPSNGMGYNGYGSYGGGTPGYGGAPYGNPNVAGAGYGS
APSGAARSSWNAQPSSGYGGAGAYGAAPWGGSVAGGGGSQAAPPPTGQSPSGGAGYGSQG
YGYGGGYGGGSDGSYGNAAGYGAVGGRIGGAPAANSGGAGGEIQSSGGVGGYMGSGGYGD
ANGYGNSGWRGDPSQASAGNYGVQGNGGQGGGGGYGGYGGGPVRQG
NT seq
1401 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattcagatcaggggaagctgttcatcggtgggatttcatgggaaacttcggaggag
aagctgaaagagtatttcggtaattatggagagattctgcagacggtcgtaatgagagac
aagatctccggcaggccacgcggttttggtttcgtcgtcttttcagatccttccgtactc
gacactgttcttcaagaaaaacacaccattgatggccgaacggtggaggctaagagggcc
ctatcaagagaggaacaacaggtgtcaaaagctggaaacccgagtggtggtagaagtttt
ggtggtggtggtggtggtggtggtgggggaggtacaaggacaaagaaaatatttgtgggg
ggtttgccacccactttgagtgaagaaggatttcgtcagtattttgaagcgtatggacag
gtaactgatgtagtagtaatgtatgatcagcagactaacaggcctcgtggatttggattt
atttcattcgattctgaagatgctgttgatagggttttgcacaagactttccatgatttg
aatggtaagcaagtagaagttaaaagggctcttcctaaggacgctaaccctggtggtggt
gctggtggtggtcggtctatgggcggtggtggtggtggaagttatggtgcatctggtgga
aattcaggttcttatgagagtagaatggattctaacaggtacatgcaatctcaaagtggt
ggaggtggtggtggtggtggtggtggtggagggtttccaccatatgggacacctggatat
ggatatggtcctagtaatggaatgggttacaatgggtatggcagctatggtggtgggacc
ccagggtacggtggtgcaccatatggaaacccaaatgttgcaggtgcagggtacggaagc
gctccatctggtgcagcaaggagttcatggaatgctcagccttcctccggatatggtggt
gctggagcttacggggctgccccatggggtggttctgttgctggaggtggtggttcacag
gcggcaccaccacctacgggccaatctccaagtggaggtgctgggtatgggagtcaaggg
tatggttatggtggtggatatggtggtggtagcgacggttcttatgggaatgctgctgga
tatggtgctgttggcggccgtatcggtggtgctccggctgccaattctggtggtgctggt
ggagaaattcagtcctctggtggtgttggtggctacatgggaagtggtggttatggggat
gctaatggatatgggaattcagggtggagaggtgatccttcacaagcttccgccgggaac
tatggtgttcaggggaatggcgggcaaggtggtggtggtgggtatggtggttatggtggt
ggtccggtgaggcagggttag
DBGET
integrated database retrieval system
