Lachnoanaerobaculum umeaense: D4A81_01005
Help
Entry
D4A81_01005 CDS
T05639
Name
(GenBank) N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family protein
KO
K20276
large repetitive protein
Organism
lua
Lachnoanaerobaculum umeaense
Pathway
lua02024
Quorum sensing
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lua00001
]
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
D4A81_01005
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Choline_bind_3
Flg_new
Choline_bind_1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AYB00771
UniProt:
A0A385Q332
LinkDB
All DBs
Position
251963..258343
Genome browser
AA seq
2126 aa
AA seq
DB search
MNIGQNNISRANATASPFYPAYDGEVKNGEVIKVFDGHTDMKLEIRLSVKPTTDGKYILT
EYTVKNTNMNPAETNAKIVDAGRTDGGRTVWFAAGTDIMIAQDDYAAVWSTPKTNTGNKN
EGIHGQADNGATYTLGSFDMLTYSPQYPNLGMQKRNSSDPSAITTWVGHYGSFTSNYGTD
LVDTSYMPGGTYGATDSGLAYSLKFDLLPGEEKTGVIAWSMRGPTYYVDPVNGNDSNNGF
MSKPFKTIEAAVAKIGSRTPKKTYVYIMNDTEIDSTITIPTGKSITFGTTDYVLDPTTNS
KVAAYPITVGADGQRTNQKVIKRANNFTGPLFKVEHANSSISFTDIKVDGRGDAVNNITG
SLVLAKAGTVNTLTGAVLTNNKITPVEHEQFTDTNGNGTWDPTEEFIDANGNGVWDGPEA
FVDANGNGKYDIGETFTDANRNGIYDKSANATVASAIHLLSGSKLNMNYGTITGNKSYMG
GAITKNTGSEVSLSGAINITGNVSGAGGASNLMIDTTGSKAKVTSNLTSASRIGLSSLQS
VPLAGVTVLEADNGTGAPLPYNLNNFSADKQGQGSLYGDAAGELVNLNASAVTYVVSHVM
MDGSTVPGTSTSSVLTTAGAPVAIAPINNSAYLHTVSYTVPGSSPAQTLTSPEVTPTGHG
LSVDADGVSGYLPGNDISVIFRYVRNESVAKFDPAGGAPTTVPDIVSPAGGAPTASLPLV
SRTGYDFVGWFKYTDANNNNKYDTGDTVLTASATGETGLDNPVVTGTVNYFAKWTPSTTP
YNFDVVHKNSSTTVPISFATSTTPHPYLDPISASPLTIPGYVLYTAVQTPASPNYFDPVN
NYNGTMSIGGASVKYTYRVDPSVRKAFKVEHIDTSTGAVMQTTQVYRAAEAAISAAPLTT
LGYSLTNAQITTGNTSTGAHVLTVADMQTAAGGTVGFNADQSFTGYMPNQDVTIRYEYAN
TTGYFAVQKFVDSTTNERIGNLNPISFTNAAAMNIPYTGVYGYLYGSATATPAAGTFDGA
GNFTGVMPSANVNLDYMLNRDPAYWKTMSFAVANAPYNYGVVPSTTFSFLKDDHTTAASG
NAYTFQKITDLGGVPTPAANPTPYYKFEGWYLDAAATTPVTPGMTFDNDVTLYAKFVEDP
AYWIDINFAAGEHGSISAPSSLHTYYDNKWGNILGSIPTPTPELNYLFLGWKNGTNVITN
GSSLTNGATYTAHFGKDPNTWGTNMGSISPVGRIGSNGSGEIVIEGTTPGNVYVISDPDG
NIIAVVPGDANGNRTTVPNLTPGAHYNVQEGTPDTQATVGQPVSSITGTSVSTPQDVYIP
TVDNNYNIGYDPENDGMAQIVVNPADPDADYALIDENGNVVQYPGSDNGWMTPVGSNPST
VTFNNLNPNATYTVVARKKGNTAIPDPLTKLPDGNQIIANPGDMAEAAKYVVETRDGDIV
SVGTTNVGSDTYTDAKAGESVVIHADPINSNGKNFLYWKVLAGRAVGVSGKITQADYTFN
LSNSNIVLKAVYEPTKIAGDDANVEEDLRGKAGVGEFGLEPSQIPALANQLTTPADRALN
TVNGATVDYKVIFDKRDTTSAESNLVKPVSYSGSTHPGAYTAAYSLDIKLERYVDGRRVD
AGIMATASNATVDVIAQLPASDVDQLDYQLFDVTSGTPVEATITTDVANNAGLVKFTGNL
LHTYVMVYSKAFKVTFVDNKPVLDNLHLNDTSRNFYKQFKVRKKDSVEDSAYTTDYTVVT
DYAQNDVANALVTPFEDIYGVQYDYVNWSKKEDKLSVFDTTDELTKKTTVYAFYTNNKKE
VAEARVDLDKTIDEARILTGDPYLKVAEIAEINEAIANAVETLRQARDLVSPDGNTYLRQ
ANYAELQQAIDALRRLIDKYSKIAADRAGDRNRRTGGASGGGNSSSGRGSRLLTPGEKSQ
QSTAINENSNVRAFVLGVDGKWQTNPVTGGWSFVLNGGTPLNDMWGMITFNDETGKKVYR
WYYFDARSTMATGWVYDSKNGNWYYMNTTAGPDLGQMVKGWVKDTNTNKWYYMNDNTGIL
NTGWHLDKQDGKWYYLNQNGEMLVGWHNIDGKWYYFNTNTPQNTYTWDANAFKWNYLNNS
ARPYGSMYAGEKTPDGYSVDANGAWN
NT seq
6381 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatattggtcaaaataatattagtagagcaaatgccacagcaagtccgttttatccc
gcctatgatggagaggtgaaaaacggtgaggttataaaggtatttgatgggcatactgat
atgaagcttgagattagactttctgtcaagcctactactgacggtaaatatatcttaaca
gagtatactgttaagaatacaaatatgaatccggcagaaacaaatgctaagatagtagat
gctggtagaacagatggtggtagaacagtatggtttgcagcaggtactgatataatgatt
gcacaggatgactatgcggcagtttggtcaacaccaaagaccaatacaggaaataaaaat
gagggtatacatggccaggctgataatggtgctacatatactcttggttcatttgatatg
cttacatatagtccacaatatccaaatcttggtatgcaaaagagaaattcatctgaccca
agtgccattactacatgggtaggacattatggaagctttacgtcaaactatggaacagat
ttggtagatacctcatacatgccgggaggtacatatggagcgaccgactcaggtcttgcg
tattcattgaaattcgaccttcttccgggtgaagagaagacaggtgttatagcttggtct
atgagaggacctacatactatgtagacccggtaaatggtaatgactccaataatggattt
atgtctaaaccgtttaagaccattgaggcagcggtagccaagattggaagtagaactcct
aaaaagacatatgtctatatcatgaatgatacagagattgactctactattactattccg
acaggaaagtcaataacctttggtactactgactatgtacttgatccaactaccaactca
aaagtagcggcatatccgataacagttggtgctgacggtcaaagaaccaatcaaaaggtt
ataaagagagcaaataactttacaggtccactatttaaggtggaacatgcaaactcatct
atttcatttacagatataaaagtagatggtagaggggatgcagtaaataatataacaggc
tctttagtacttgcaaaagccggtacggtaaatactcttacaggtgcagtacttacaaat
aataagataacaccggtagaacatgagcagtttacagatactaatggaaatggaacatgg
gatccaactgaggagtttatagatgccaatggaaatggtgtttgggatggtccggaggca
tttgtagatgctaatggaaatggcaagtatgatatcggtgaaacatttacagatgctaat
agaaatggtatctatgataagtcagcgaatgctactgtagcaagtgctatacatttgtta
agtggttctaagttaaatatgaattatggtactattacaggtaataaatcttatatgggt
ggtgctattacaaagaatacaggctcagaagtaagtttgtcaggtgccataaatattaca
ggaaatgtttcaggtgccggtggagcatctaacttgatgattgatactaccggaagcaag
gctaaggttacttcaaatcttacatctgcttcaagaatcggtctttcatcacttcagtct
gtacctcttgcaggtgtaacagtacttgaggctgataatggaaccggagctccactgcca
tataacttaaataactttagtgctgataagcaaggtcagggttcactttatggagatgca
gccggagagttagtaaatcttaatgcaagtgcagttacatatgtagtaagtcatgttatg
atggatggttctacagtaccaggtacatctacaagcagcgtacttacaacagcgggtgca
cctgtagctatagcacctataaataatagtgcatacttacatacagtttcatacacagta
ccgggaagtagtccggcacagacacttacaagccctgaggttacaccgacaggacatggt
ctttcagtagatgctgatggagtttcaggatatcttcctggaaatgatatatcagttatc
tttagatatgtgagaaatgaatcagtagcaaagtttgatccggcaggaggagcacctact
accgtacctgatatagtttcaccggcaggaggagcaccaacagcttcattgccattagtt
tcaagaacaggttatgattttgttggatggttcaaatatacagatgcaaataataataat
aaatatgatacaggtgatacagtgcttacagcaagtgctacaggagagacaggattagat
aatccggtagtgacaggaactgtcaactactttgctaagtggacaccgtcaactacacct
tataactttgatgtagttcataagaattcatcaactacagttcctattagttttgcgact
agtacaacaccgcatccatacttagatcctatatcagcttcaccgctgactatacctgga
tatgtattgtacacagcggttcagacaccggcttcaccaaactattttgatccggtaaat
aactacaatggtactatgtcaataggtggtgcatctgtaaaatatacatatagagttgat
ccaagtgtaagaaaggctttcaaagttgagcatatagatacatcaacaggtgctgtaatg
cagacaactcaggtctatagagcggcagaggctgctatatcagcggcaccacttacaact
ctaggatacagtttgacaaatgcacagatcacaacaggaaatacatcaacaggtgcacat
gtacttacagtagcggatatgcagacagcggctggaggaacagttggctttaatgcagat
cagagcttcacaggctatatgccaaaccaggatgtaacaatccgttatgaatatgcaaat
acaacaggatattttgcagttcaaaagtttgtagattctactacaaatgaaagaatagga
aatttaaatcctatatcatttacaaatgcagcagcaatgaatattccatacacaggtgtt
tacggatacctttatggttcagctacagcaacaccggctgcaggaacatttgacggggca
ggaaactttacaggagtaatgccatcagcaaatgtaaaccttgattatatgttgaataga
gatccggcttattggaagacaatgagttttgcagttgcaaatgcaccatataactatggt
gtggtaccatcaactacattcagcttcttgaaggatgatcatacaacagcagcaagtgga
aatgcttacacattccaaaagattacagaccttggtggagttccaactccggcagcaaat
ccaacaccatactataagtttgaaggatggtatttggatgcagcagcaacaacacctgta
acaccgggaatgacatttgataatgatgttacattatatgctaagtttgttgaagatccg
gcatattggatagatataaactttgcggcaggagaacatggaagcatatcagcaccatca
agtcttcatacatattatgataataaatggggtaatatattaggatctatcccaacacca
acacctgagcttaactatttgttcttaggctggaagaatggtacaaatgtaataacaaat
ggttcatcacttacaaatggagctacatatacagctcactttggtaaagaccctaacaca
tggggaacaaacatgggttcaatctcacctgtaggaagaattggatcaaacggtagtggt
gaaatagtaatagaaggtactacacctggaaatgtatatgtaataagtgatccggatgga
aatattattgcagtagttcctggagatgcaaatggaaacagaacaactgttccaaatctt
acaccgggagcacattataatgtacaggagggaacacctgatactcaggctacagtagga
cagcctgtttcaagtattacaggtacatctgtatcaactccacaggatgtatatattcca
acagtagataacaactacaatattggatatgatcctgaaaatgatggaatggcacagata
gttgtaaatccggcagatccggatgcagactatgcacttatagatgagaatggaaatgta
gtacaatatcctggaagtgacaatggatggatgactccggtaggaagcaatccttcaaca
gtaactttcaacaacttgaatccaaatgcaacatacacagtagtggcaagaaagaagggc
aacacagctattcctgatccacttacaaagcttcctgatggaaatcagatcattgcaaat
cctggtgatatggcagaagctgcaaagtatgttgtagaaaccagagacggagatatagta
tcagtaggtactacaaatgtgggaagtgatacatatacagatgctaaggcaggagaaagc
gttgttatacatgcagatcctataaactcaaatggtaagaacttcctatattggaaggta
ttagcaggtagagctgtaggagttagcggaaagataactcaggctgactatacatttaac
ctttctaattcaaatattgttcttaaggctgtatatgagcctacaaagatagcaggagat
gatgctaatgtagaggaagatttgagaggaaaagcaggagtaggagagtttggtcttgag
ccatctcaaataccggcacttgcaaatcaacttacaactccggctgacagagcactcaat
acagttaatggagcaacagtagattataaagttatctttgataagagagatacaacaagt
gcagagtcaaatcttgtaaaacctgtttcatactcaggttcaactcatccgggtgcgtat
acagcggcgtactcacttgatattaagcttgagagatatgtagatggaagaagagttgat
gcaggaataatggctacagcatcaaatgcaactgtagatgtgattgcacagttgccggca
tcagatgtagatcagttagactatcagttatttgatgttacatcaggaacacctgttgag
gcaacaattacaacagatgtagcaaacaatgccggacttgtgaagttcacaggaaaccta
ttacatacttatgttatggtttactcaaaggcattcaaggttacatttgtggataataag
ccggtacttgataatttacacttaaatgatacaagtagaaacttctacaaacagtttaaa
gttagaaagaaagactcagtcgaggatagtgcttacacaacagattatactgtagtaact
gactatgctcaaaatgatgtagcaaatgcacttgtaacaccatttgaagatatttatggt
gtacagtatgactatgtaaattggtcaaagaaggaagataaactttctgtatttgatact
acagatgagttgacaaagaagactactgtttatgcattctatactaacaataagaaggaa
gtagcagaggcaagagtagatcttgataagacaattgacgaagcaagaatacttacaggt
gatccttatcttaaggttgctgagattgctgaaatcaacgaggctattgcaaatgcagtt
gagacacttagacaggctagagatcttgtatctcctgatggtaatacatatctcagacag
gcaaactatgcagaacttcagcaggcaatagatgcacttagaagacttattgacaagtat
tcaaagatcgctgctgacagagccggggatagaaatagaagaaccggtggtgccagtggt
ggtggtaactcttcaagtggtagaggaagtagacttctgacaccgggagagaagtcacag
cagagtacagctatcaatgaaaacagtaatgtaagagcattcgtacttggagtagacgga
aaatggcagacaaaccctgtaacaggtggatggtcattcgtacttaacggaggaacacct
cttaatgatatgtggggtatgattactttcaatgatgaaaccggaaagaaagtataccgc
tggtattactttgatgctcgctcaactatggcaacaggttgggtatatgactcaaagaat
ggtaactggtattatatgaatactacagcaggtcctgatcttggacagatggtaaagggc
tgggtaaaagataccaatacaaataaatggtattacatgaatgataacacaggtattttg
aatacaggatggcatttagacaagcaggacggtaaatggtattatctcaaccagaatggt
gaaatgcttgttggatggcataatattgatggaaagtggtattacttcaataccaacact
ccacaaaatacctatacatgggatgccaatgctttcaagtggaactacttgaacaatagt
gccagaccatatggatctatgtatgccggagagaagactccggatggctatagtgtagat
gcaaatggtgcttggaactaa
DBGET
integrated database retrieval system
