KEGG   Lachnoanaerobaculum umeaense: D4A81_06120
Entry
D4A81_06120       CDS       T05639                                 
Name
(GenBank) N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family protein
  KO
K20276  large repetitive protein
Organism
lua  Lachnoanaerobaculum umeaense
Pathway
lua02024  Quorum sensing
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:lua00001]
 09140 Cellular Processes
  09145 Cellular community - prokaryotes
   02024 Quorum sensing
    D4A81_06120
SSDB
Motif
Pfam: Choline_bind_3 Choline_bind_1 Flg_new Flg_new_2
Other DBs
NCBI-ProteinID: AYB00819
UniProt: A0A385Q357
LinkDB
Position
1346042..1352578
AA seq 2178 aa
MLGEWDDVPIFVTKHDNTEGAEGLHFHNKDHANNNSSHAVFDIISKGKGIGGQDVGMQRR
DANDKSENRVWAGSWSSTAGVYHTDWVFSQSRPGYVGAGRYGTGSAGDTAAAFSAYFDLE
PHETKTTIFALAIKPYVIYVDPANGKDDTGTGFMGSPVKSIKKAMEVLSTKPYDIKKAYI
YIQGNIDNQGIIDNQKETIVIPANRDITIQTADYKPLANAATINFNTVPLYTDDAPIPET
NTFTIKRDANFTGALFKVESDSSTLNFSNIILDGNGDNVKAAAPIVELSAGNVKLKDNTT
IQNSNVAKGLNNDISTVSETTPKASAISVEGTGVLTMESSVKPIYINNNTGNSSGSDPKI
PAINVSSTVNPTVASATGIGAVRARAINVSGNVNVVNNEDIHTVVEAYKVDADGTEVAVA
SVPTGATVTTTLVASTTTDPNPKTTITDKTSTTVTKEEHNDSATTPATKYKSTTKVTTSK
ANVNLDKSMLYVPKGKTLTGSIGVTISDVPNTSDDNDGRPVLDFEGRTSGSAAPYSASNI
TTDGDGIDPRMGMATANVTDGTGTVLSIPQVDNLVYLRAQKYNFTVTYIDPDGNTIPIAS
LTSGTNTIPGTLDATNTSSYAFRAASGSAVNIPMPSYTFNGTPTVFDSATGAFGTLTVVT
TDPIAPATTPTKGTVIGTTPNTPLDIVISLKKNVMNYKFDSRGGTAVAEVVSPVGTIPGT
MSTPTKAGYTFTGWVKYTDANNNDVFDTGDTAGANVGTTYPASSTADTFKFYATWTPDGT
LYPISTYHKNVNPALALTLGSEIDPGYVIESVVDKDHAIVPGYIYNSGSATPVSAGEVEP
NPAVTAGVSEGHYHISSMPASAVTLNYKYSVDPNATFTFTVRHIDAMGNLLPGTNVVTSQ
RRAEQSITAMADNSIAGYTYSTYHITSGENDGAAGSYVLGLNHQEIVGGTPKTPYIVRND
TSTGTFVAYMPNQDVSIDYIYTADAGMNLVRRYYDRFTDKIITSQVEASTPSANVAASIP
TSGSTDGDKLYGYLWDTSSNVDIVDISNLTGPVSVVHNPSNGDLSGSMPISGNGVRADYK
LSHDASKWRDINFTVANTPNNNGSVDALPVGAPTSFLANDGSIAGNTYAYTFDKLKSENY
VPGVTPNRYYKFDGWYLDAAATQQVNGTDTFPTDTAPLTLYAKFVEDPSQWFDINLAAGS
NGSISAPATLHIPYDYTWSQITGQLPTATPVANYLFNGWKDSNGAFMQGTSTLTNHATYT
AFFSQDPNVFGGIGSITPTGHIGNDGSGEIVIDGTTPGNVYVISDPDGNIVAVVPGDSVG
NRTVVPNLIPGAHYNVQEGSPDTQATVGQPVSSVTGTSVSTPQDVYIPTVDNNYNIGYDP
DNDGMAQIVINPADPDADYALIDENGNVVQYPGSDNGWMTPVGSNPSTVTFNNLNPNETY
TVVARKKGDSTIPNPLTKLPDGNQIIANPGDMADAPKYVVETKEGSIVSVGTTSVGNDTY
DEAKAGEVVAIHADPINANGKNFLYWQILAGRAVGVSGKITQADYTFTLSNSNIVLKAVY
EPTKVAGDDADLTETIRGGSVGEFGLTPDQIPGLAHELTTPLDRSLIGTNGATVEYKVVF
NKRDAKTNEKTAVKPVSVSGVDHPDAHTVAYGLDIELERYVNGRLVNNGIIATASNAMVD
VIAQLPAEDVDQLDYQLFDVTPDSLGNITPIEVTMTTDVANNAGLIKFTGNLKHSYVLVY
SKTFKVTFVDNKPVLNHLYLNDTSRNFYKKFKVRRKENVEDSYYSTDYDVVTAYAQNDVA
NGLVTPFEDIYGVQYDYVNWSKKEDKLSVYDTTSPVTKKTVVYAFYTDNRKEVAQARVDL
GDTIEEAKLLTGDPYLKVAEVAEINEAIAHALETLRQARDLVSPDGTTYLRQANYAELQQ
AIDALRRLIDKYSNTSTGRAGERNRRTGGASGGGNSSSGRGSKLLTPGEKSTQSTAINEN
SNTRSFVLGMDGNWERNSVTGGWSFVLNGGTPINDMWGMIVFNDEAGNKIYRWYYFDARS
TMATGWVYDSKNGNWYYMNTTEGPELGQMVKGWVKDTNTNKWYYMNDNTGILDTGWHLDK
QDGRWYYLNQNGEMLTGWQNIDGKWYYFNTNTPQDTYTWDANAFKWNYLNNSARPYGSMY
AGEKTPDGYSVDANGIWN
NT seq 6537 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgcttggagaatgggatgatgtacctatttttgttacaaaacatgataatacagaaggg
gcagaaggtctgcatttccacaataaagatcatgctaataataattcgtcacatgctgtc
tttgatataatttcaaaaggcaaaggtataggtggacaggatgtcggaatgcaaagacgt
gatgcaaatgataaaagcgaaaatagagtttgggcaggaagctggtctagtacagcagga
gtatatcatacagattgggtattttcacagagcagacccggatatgtaggtgccggacga
tatggcacaggctctgctggtgatacagcagcggcgttctcagcttattttgacctagaa
ccacatgaaacaaagacaacgatttttgctttggctataaaaccatatgttatatatgtt
gatcctgccaatggaaaagacgatacaggaaccggatttatgggttctccggtgaagtca
ataaaaaaggcaatggaagtattgtcaactaaaccatatgatatcaaaaaagcatatata
tatatacagggaaatatagataatcaaggaattatagataatcaaaaagagactatagtg
attccggcaaatagagatattactatacagaccgcagactataagccactggcaaatgca
gcaactataaactttaatacagttccattgtatactgatgatgctcctataccggagact
aatacatttacaataaaaagagatgctaactttacaggagcattgtttaaggtggagagt
gatagttcaacattgaacttttccaatataattcttgatggaaatggtgacaatgtcaaa
gcggcagcccctatagtagagttatcggcaggtaatgtaaaactgaaagacaatactact
attcaaaacagtaatgtagcaaagggattgaacaatgatatttctactgtatcagagact
acaccaaaggcttctgctataagtgtagagggtacaggtgttcttacaatggagagcagt
gtaaagccaatctatattaataataatacgggcaacagttcaggcagtgatcctaagatt
ccggctataaatgtatcatctacagtaaatccaacagttgcaagtgctacaggaatagga
gcagttagagccagagcaataaatgtttcaggcaatgttaatgtagttaataacgaagat
atacatacagtagtagaagcatataaggttgatgctgatggaacagaggttgcggtggct
tcagtacctacgggtgctactgttactacaacacttgtagcttcaactactacagaccct
aaccctaagactactataacagataaaacatcaacgacagtgactaaggaagagcacaat
gatagcgctactacaccggcaactaaatataagtctacaactaaagttactacatctaaa
gctaatgtaaatcttgataagagtatgttgtatgtgcctaagggcaaaacacttacagga
agtataggagtaacaatttcagatgttcctaatacatcagatgataatgatggtagaccg
gtactagactttgaaggtagaacttccggatcagctgcaccatattctgcaagtaatatt
actactgatggtgatggtattgatcctagaatgggtatggcaactgctaatgtgactgat
ggtactggtacagttttaagtattccacaggtagataatttggtttatttaagagctcag
aagtacaattttacagtgacctatatagatccggatggcaatacgatacctattgcaagc
cttacatcaggtacaaatactattccgggaactttagatgctacaaacacatcttcatat
gcatttagggcggcatccggatcagccgtaaatataccaatgccaagttatacattcaat
ggaacaccaactgtatttgacagtgctacaggtgcttttggaacattgacggtggtaact
actgatccgattgcacctgctactacacctactaagggaactgttattggaacgactcct
aatactcctttagatattgtcatttcattaaagaaaaatgtaatgaattataagtttgat
tcaagaggcggtacagcggtagcagaagttgtatctcctgtaggaacaataccaggtaca
atgtctactcctacaaaagcaggctatacatttacaggatgggtaaagtacacagatgca
aataataatgatgtatttgatacaggtgatacagccggagcaaatgttggtacaacttat
ccggcttcatcaacagcagatacattcaaattttatgctacctggacacctgatggaacg
ctttatccaataagcacatatcacaagaatgtaaaccctgcattagcacttacattaggt
tcagaaatagaccctggatatgttattgaatcagttgtagataaagatcacgcgatagtt
ccgggatatatctataattcaggaagtgctactcctgtttcagcaggtgaagtagagcca
aatccagcagtaacagctggcgtatctgaaggacattatcacatttcaagtatgcctgct
tcagcagttactttgaattacaagtacagtgttgatccaaatgcaacatttacatttact
gtacgacacatagatgcaatgggtaatctccttccaggaactaatgtagtaacttcacaa
agaagagcagagcagagtattactgcaatggcagacaattcaatagccggttatacttat
tcaacataccatataacatcaggtgaaaacgatggtgcagccggaagctacgtacttggt
ctaaatcaccaagagatagtgggaggaactccaaaaacaccatacattgtacgtaatgat
acatcaacaggaacttttgtggcatatatgccaaatcaggatgtatctatagactatata
tatacagccgatgcgggtatgaatttggttagaaggtactatgacagatttactgataag
attataacaagtcaggtagaagcatctacaccttcagctaatgtagcagcatcaattcct
acatcaggaagtacagatggtgataagctgtatggttatttatgggatacttcatcaaat
gtagatatagtagatatttcaaatttaacaggtccggtaagtgtagttcataatccttca
aatggtgatttgagtggtagtatgcctattagtggaaatggtgttagagctgactacaaa
ctaagtcatgatgcttctaaatggagagatatcaactttacagtagcaaatacaccaaat
aataatggtagtgtggatgccctacctgtgggagcaccgacaagcttcttagcaaatgat
ggaagtattgccggaaacacatatgcatatacatttgataagctaaaatctgaaaactat
gttccgggtgttacaccaaacagatactataagtttgatggatggtatctggatgcggca
gcaacacagcaggtaaatggaacagatacattcccaacagatacagcaccacttacactt
tatgctaagtttgtagaggatccaagtcagtggtttgatataaaccttgcagcaggaagc
aatggttcaatatcagctcctgcaacacttcatattccatatgattatacatggagtcag
ataacaggacagttgccaacagccacacctgtagcaaactacttgtttaacggctggaag
gattcaaacggagctttcatgcagggaacaagcacacttacaaaccatgcaacatataca
gcattctttagtcaggatccaaatgtatttggaggtataggttctatcactccaacagga
catataggaaatgacggaagtggcgagatagtaatagacggtacaacacccggtaatgta
tatgttatcagtgatccggatggaaatatcgtagcagtagtacctggggattcagtagga
aacagaacagtagttccaaacctcatccccggagcacattacaatgtacaggaaggaagt
cctgatactcaggctacagtaggacagcctgtttcaagtgttacaggcacatctgtatca
acaccacaggatgtatatattccaacagtagataataactacaatataggatacgatcca
gataatgacggtatggcacagatagttataaatcctgcagatcctgatgcagactatgca
ctcatagatgagaatggaaatgtagtacagtatccgggaagtgacaatggatggatgact
ccggtaggaagcaatccttcaacagttactttcaacaacttaaatccaaatgaaacttac
acagtggtggcaagaaagaagggcgatagcactattccaaatccacttacaaagcttcct
gatggaaatcagataattgcaaatcctggtgatatggcagatgcacctaagtatgtcgta
gaaaccaaggaaggaagcattgtatcagtaggaactacaagtgtaggaaatgacacatat
gatgaagcaaaagcaggagaggtagtggcaattcatgctgatcctataaatgcaaatggc
aagaacttcctatattggcagatacttgcaggaagagcagtaggagttagcggaaagata
acacaggctgactatacatttactctttcaaattcaaatattgttttaaaggctgtatac
gagccaactaaggtggcaggagatgatgcagatcttacagagacaataagaggtggaagt
gttggagagttcggacttactccggatcagatacctggacttgcacatgaactgacaaca
ccacttgacagatcgcttatcggtacaaatggtgcaacagtagaatataaggtagtattc
aataagagagacgcaaagacaaatgagaaaacagctgtaaaaccggtatcagtttcaggt
gtagatcatccggatgcacataccgttgcatatggacttgatatcgaacttgagagatat
gtaaatggaagacttgtaaacaatggcataatagcaacagcatcaaatgcaatggtagat
gtgatagcacagttaccggcagaggatgtagaccagcttgactatcagttatttgatgtg
acacctgacagcttaggtaatatcacaccaatagaagtaacaatgacaactgatgtagca
aacaatgccggacttataaagttcacaggtaacttaaagcattcatatgtacttgtttac
tcaaagacatttaaggtaacatttgtagataataagcctgtacttaatcacttatactta
aatgatacaagtagaaacttctacaagaaattcaaggtgagaagaaaagaaaatgttgag
gacagctattattcaacagactatgatgtagttacagcatatgcacaaaatgatgtagca
aatggacttgtaacaccatttgaagatatctatggtgtacagtatgactatgttaactgg
tcaaaaaaggaagataagctttcagtatatgatacaacaagccctgtaacaaagaagaca
gtagtctatgcattctatactgataacagaaaagaagtagcacaggcaagagtggatctt
ggtgatactatagaagaggcaaagcttcttacaggtgacccatatcttaaggtggctgag
gtagctgaaatcaatgaagctatagcacatgcacttgagacacttagacaggcaagagat
cttgtatctcctgatggaactacatatctcagacaggcaaactatgcagagcttcagcag
gctatagatgcacttagaagacttatcgacaagtattcaaatacatctacaggtagagca
ggtgaaagaaatagaagaaccggtggtgccagtggtggtggtaattcttcaagtggtaga
ggaagtaaacttttgacaccgggagagaagtcaacacagagtacagctatcaatgagaac
agtaacacaagatcattcgtacttggtatggatggtaactgggaaagaaacagcgtgaca
ggtggatggtcattcgtacttaacggaggaacacctatcaatgatatgtggggtatgata
gttttcaatgatgaagccggaaacaaaatataccgttggtattactttgatgctcgctca
actatggcaacaggttgggtatacgactcaaagaatggtaactggtattatatgaatact
acagaaggtcctgagcttggacagatggtaaagggctgggtaaaagatacaaatacaaat
aaatggtattacatgaatgataatacaggtattcttgatacaggatggcatttagataag
caggacggtagatggtattacctcaaccaaaatggtgaaatgcttacaggatggcagaat
attgatggaaagtggtattacttcaataccaatactccacaagatacttatacatgggat
gccaatgctttcaagtggaactatttgaacaatagtgccagaccatatggttctatgtat
gcaggagagaagactccggacggttatagcgtagatgcaaatggtatttggaactaa

DBGET integrated database retrieval system