Urechidicola croceus: LPB138_12775
Help
Entry
LPB138_12775 CDS
T04497
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
lul
Urechidicola croceus
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lul00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
lul02000
]
LPB138_12775
Transporters [BR:
lul02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
LPB138_12775
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AOW21499
UniProt:
A0A1D8PA92
LinkDB
All DBs
Position
complement(2866104..2868239)
Genome browser
AA seq
711 aa
AA seq
DB search
MKKILSIFLMLVTVVSYSQTETKKDSIKIDNFLDEVVVTAVRVNSESPVTHSNLSKKEIS
KRNLGQDIPILMNFMPSVVTTSDAGAGVGYTGIRVRGSDATRVNVTINGVPYNDAESMGT
YWVDLPDFSSSTESLQLQRGVGTSTNGAGAFGASLNLLTDAIEEEASGEISNSFGSYNTR
KHTIKFSTGKLNEHFEIAGRLSRIKSDGYVDRATSDLTSYFLQASYVDENTLIKALAFGG
FEETYQAWYGVTADDLKNNRTVNYYTYDNEVDHYNQDHYQFLWSEKYNENWSSNIALHYT
WGRGYYEQYKAESDFSDYGFTPITIGGETINTTDLIQRKWLDNDFYGTTFSIDYNNLSNF
SLIFGGAWNKYEGDHFGEVIWAQYASDSEIRDRFYDDFGNKTDFNLFAKGKYSVNDNFNL
FADLQIRKVNYEATGEFSPVDDSFSFFNPKGGMTYRVNDKNNLYLSFATAHREPNRTDYE
NGNPKPETLNDLELGWRVKNEDFNINSNVYMMFYQDQLVLSGAIDDVGAPIRENVGDSYR
IGIEIDANIKINNQLYIQPNIAISSNKNKDFITSRDGEIVNLKNTNIAFSPNVVAGNIFN
YLPTDNLQISLLSKYVGEQYMANLDSKNSKLDSYFVNDLNINYEIKPKKIFKSIVLSALV
NNILNEKYVSNGYYYTYDDTWSVEGETTTLDGAGYFPQATTNFLVGATLRF
NT seq
2136 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaaatattatctatttttttaatgcttgttactgttgtgagttattctcaaaca
gaaacaaaaaaagattctattaaaattgacaattttctagatgaagtagttgttacagct
gttcgtgtaaattcagaatcaccagtaactcattctaacttgtcaaaaaaagaaatttct
aaacgaaatttaggtcaagacattcctattctaatgaacttcatgccaagtgtagttact
acctctgatgctggtgctggagttggatatacaggaattagagtacgtggtagtgatgct
actcgcgtaaatgtaactatcaatggtgttccttataatgatgcagaatcaatgggaact
tattgggttgatttacctgatttttcatcttcaactgaaagtttacaattgcaacgtggt
gttggtacatctacaaatggtgcaggagcatttggagctagtttaaatttattaaccgat
gctatagaagaagaagcatcaggagaaataagtaattcatttggttcatataacacaaga
aagcacaccataaaatttagtacaggaaaattaaatgagcactttgaaattgcaggtcgt
ttatctagaattaaatctgacggatatgtagatagagcaacttcagacttaacttcttat
tttttacaagcatcatacgttgatgaaaacacattaatcaaagctttagcttttggtgga
tttgaagaaacttatcaagcatggtatggtgttactgctgatgatttaaaaaataataga
acggtaaactattatacatatgataatgaggttgatcactataatcaagatcactatcaa
ttcttatggagtgaaaaatataatgaaaattggtcttctaatatagcgttacattatact
tggggtcgtggatattacgaacaatataaagcagaaagtgacttttcagattatggtttt
acacctattactattggtggagaaacaatcaacactaccgatttaattcaaagaaaatgg
ctggacaatgatttttatggaacaacattttctatagattataacaatttatcaaacttt
agtttaatatttggtggtgcttggaataaatatgaaggtgatcactttggagaagtaata
tgggctcaatatgctagtgatagtgaaattagagatcgtttttatgatgattttggaaac
aaaaccgatttcaatttatttgcaaaaggaaaatatagtgtaaatgataacttcaattta
tttgctgatttacaaatcagaaaagtaaactatgaagcaactggtgaattttcacctgtt
gatgattcattctcattctttaatccaaaaggaggtatgacatatcgagtaaatgataaa
aacaatttgtatttatcgtttgcaactgctcaccgtgaaccaaatagaacagattatgaa
aacggaaatcctaaaccagaaactttaaatgatttagaattgggttggagagtaaaaaat
gaagattttaatatcaactcaaacgtttatatgatgttttatcaagatcaattggtatta
tctggtgctattgatgatgttggtgctccaattagagaaaatgttggtgatagttatcgt
ataggaattgaaattgatgctaatattaaaattaacaatcaattatatattcaaccaaat
attgctatcagtagtaataaaaataaagattttattacatcaagagatggtgaaattgtg
aatttaaaaaacacaaatattgctttttctccgaatgttgttgctggtaatatttttaat
tatttacctacggataatcttcaaatttcacttttatcaaaatatgtaggagaacagtat
atggcaaatcttgattcaaaaaactcaaaattggatagttactttgttaacgatttgaat
atcaattatgaaattaaaccaaagaaaatatttaaatcaatagtattaagtgcattggtt
aacaatattttaaacgaaaaatatgtgtctaatggatactattatacttatgatgatact
tggtctgttgaaggagaaactacaactttagatggagcaggatattttccacaagcaact
actaatttcttagttggagccacattaagattttaa
DBGET
integrated database retrieval system