Lutibacter profundi: Lupro_01265
Help
Entry
Lupro_01265 CDS
T04235
Name
(GenBank) RND transporter
Organism
lut
Lutibacter profundi
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ACR_tran
MMPL
SecD_SecF_C
HFX_2341_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AMC09968
UniProt:
A0A0X8G5C6
LinkDB
All DBs
Position
complement(275178..278357)
Genome browser
AA seq
1059 aa
AA seq
DB search
MKKIISYFIKFPVAVNIFILAFIGFGLAGALSMKSSFFPLTDSQRISINLTYPGASPEEI
EEGIVLKIEDNLKGIVGIDRVTSVSRENSATINIETLKGKNIDVVLSDVKNAVDRVPSFP
SGMEPPIIAKIETMRPTISFTISGDNISLATLKQYARTIENDIRSIDGISQINLSGFPDQ
EIEIAVRENDLQAYNLSFSEVAEAVSKTNLLISGGNIKTDSEDYLIRARNKNYYGNELLN
LVVRATPDGNIIRLKDIASVSDTWSENPDRLFFNGKKSIEITINNTNSEDLISSADKVKK
YIEKFNQQQENIQINISSDNSITLKQRSDLLLKNAAMGVLLVLFFLALFLNIRLAFWVAA
GIPIAFFGMFIFAAQLGVTINVLSLFGMIIVIGILVDDGIVIGENIYHHYEKGKTPIRAA
IDGTLEVIPPIVSAILTTIIAFSTFFFLDGRMGDFFSEVSTIVILTLAVSLIEALIILPA
HIAHSKALERKEKKRNKINAFFFNINQFAEKWLFYFRDTIYAPYLRFFLKHKALGFSIPI
TMLILSIGALGGGIVKTSFFPSVASDKISITLKMPQGTNERVTDSIISKIEKAAWEINKE
FSKKQTDNQQVIQNIIRRIGPGSANGSLTVNLLPGEARDFSSPKITNAIRNKVGKVYGIE
SLTFGSGGNFGGSPIAVALLGNNIKELKAAKNELKEILSKNSLLKDISDNDPAGIKEIQI
KLKNNAYLLGLNLQTVMSQVRSGFFGLQTQRFQRGQDEIKVWVRFKKEDRSSIKNLNDMW
ITTPTNKRVPFSEIAKYTIKRGDVVINHLSSKREIQITADMKSPDGSATDILDDIKSNIM
PEISSKYPTVSAVYEGQNREMKKTTRSVKKVGLIILALIYIVIAFTFRSYDQPILLIILI
PFSLIGIIWGHWIHGFSINILSWLGIIALIGIMVNDGLVLIEKFNGYLKEGMKYDEALIQ
AATSRFRAILLTSLTTVAGLAPLLLEKSRQAQFLKPMAISISYGIAIATVLTLVMLPLLL
AVSNNIKVFIKWLRTGKKVTKEEVERAIVEQKSDNDELY
NT seq
3180 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagaaaattatatcttactttataaaatttcctgttgctgtaaatatttttattctt
gcatttataggttttggtttagccggtgccttgtctatgaagtcttcattttttccttta
actgattctcaaagaatatcaataaatttaacatatcctggagcctcacctgaagaaata
gaagaaggaattgtattaaaaattgaagataatttaaaaggaattgttggtattgatcgt
gttacatctgtttcaagagaaaattctgcaactattaatattgaaacgttgaaaggtaaa
aatattgacgtagttttatctgatgttaaaaatgctgtagatagggttccctcattccct
tctggtatggaacctccaattattgctaaaattgaaactatgagacccaccataagtttt
acaattagtggtgataatatttccttagcaacattaaagcaatatgctagaacaattgaa
aatgacattagaagtattgatggcatttcgcaaattaatctttcaggatttcctgaccaa
gaaattgaaattgctgtacgtgaaaatgatttacaagcttataacttatccttttcagaa
gtagctgaagctgttagtaaaactaacttactcatttctggaggaaatataaaaacagac
agtgaagattatttaattagagctagaaataaaaattattacggcaatgagttattaaac
ttagttgttagagctactcctgacggaaatattatacgtttgaaagacattgccagtgtt
tctgatacttggtctgaaaatccagatagattattttttaacggaaaaaaatcaattgaa
ataaccataaacaacaccaatagtgaagatttaatttcttcggctgataaggttaagaaa
tacatagaaaaatttaatcaacaacaagaaaatattcagataaatatttccagtgataat
tctattaccttaaaacaacgttcagatttattattgaaaaatgctgcaatgggtgtattg
ttggttttgtttttcttagctttatttttaaatattcgattagctttttgggttgctgct
ggtattccaatagccttttttggaatgtttatttttgcagctcaattaggcgttactatt
aatgtactttctttatttgggatgattattgtaataggaattctagttgatgatggtatt
gttataggagaaaatatttatcaccattatgaaaaaggaaagacccctataagagcggct
attgatggtactttagaagtaattcctcctattgtttcagctattttaacaacaattata
gctttttctacattcttctttttagatggtagaatgggtgatttttttagtgaggtttca
actatagtaatattaactttagctgtgtcattaattgaggcattaattattttacctgca
cacattgcacattcaaaggctttagaacgaaaagagaaaaaaagaaataaaataaatgcc
ttcttttttaacataaatcaatttgccgaaaaatggctcttttattttagagataccatt
tacgcaccctatttaaggtttttcttaaaacacaaagctctaggtttttcaattccaata
accatgcttattcttagcataggtgctttaggaggaggcattgtaaaaacttcttttttt
ccttctgtggctagtgataaaatatctataaccttaaaaatgccacaaggaacaaacgaa
agagttacagattctattatttctaaaatagaaaaagctgcttgggagataaataaagaa
ttctctaaaaaacaaactgataaccaacaagtaattcaaaatattattaggcgtattgga
cctggttctgccaatggaagtttaactgttaacctattacctggcgaagctcgtgatttt
tcatctcctaaaataacaaacgctattcgtaataaagttggtaaagtgtatggtatagaa
agtttaacttttggttctggaggaaattttgggggtagccctattgctgttgccttatta
ggtaataacataaaagaattgaaagcagcaaaaaatgaactcaaagaaatattaagtaaa
aattcattattaaaagatatttctgacaatgatcctgcaggaattaaggaaatccaaatt
aaattaaaaaacaacgcttacttacttggcttaaatttacaaaccgttatgagccaagta
agatctggatttttcggattacaaacacagcgatttcaacgagggcaagatgaaataaaa
gtttgggtacgttttaaaaaagaagataggtcttcaataaaaaacttaaatgatatgtgg
attaccactcctactaataaacgtgtccctttttctgaaatagccaaatacactattaaa
agaggtgatgtagttatcaatcatttaagtagtaagcgtgaaatacagattactgcagat
atgaaatctcctgatggaagtgctacagatattttagatgatattaaaagtaatattatg
cctgaaatttcttctaaatacccaacagtaagtgcagtatacgaaggtcaaaatagagaa
atgaaaaaaacaacgcgctctgtaaaaaaagtcggtcttattattcttgcattgatttat
attgttatagcctttacttttagatcttatgatcaaccaattttattaattatactaatt
cctttcagtttaattgggattatttgggggcactggattcatggattctcaataaatatt
ttatcgtggttaggaatcattgctttaattggtattatggtaaatgatggattagtactt
attgagaaatttaacggctatttaaaagaaggaatgaaatatgatgaagccttaatacaa
gcagctacttcaagatttagagctattcttttaacttctttaactacagtagccggatta
gccccattacttttggaaaaaagtagacaagctcaatttttaaaacctatggcaatttct
atttcgtatggtatagcaattgcaactgtattaacactggtaatgctacccttgctattg
gctgtatcaaataatataaaagtctttattaaatggttgagaacgggtaaaaaagttaca
aaagaagaagttgaaagagctattgttgaacaaaaaagtgataacgatgaattgtattaa
DBGET
integrated database retrieval system