Lutibacter profundi: Lupro_03360
Help
Entry
Lupro_03360 CDS
T04235
Name
(GenBank) valine--tRNA ligase
KO
K01873
valyl-tRNA synthetase [EC:
6.1.1.9
]
Organism
lut
Lutibacter profundi
Pathway
lut00970
Aminoacyl-tRNA biosynthesis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lut00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
00970 Aminoacyl-tRNA biosynthesis
Lupro_03360
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01007 Amino acid related enzymes [BR:
lut01007
]
Lupro_03360
09182 Protein families: genetic information processing
03016 Transfer RNA biogenesis [BR:
lut03016
]
Lupro_03360
Enzymes [BR:
lut01000
]
6. Ligases
6.1 Forming carbon-oxygen bonds
6.1.1 Ligases forming aminoacyl-tRNA and related compounds
6.1.1.9 valine---tRNA ligase
Lupro_03360
Amino acid related enzymes [BR:
lut01007
]
Aminoacyl-tRNA synthetase
Class I (U)
Lupro_03360
Transfer RNA biogenesis [BR:
lut03016
]
Eukaryotic type
Aminoacyl-tRNA synthetases (AARSs)
Other AARSs
Lupro_03360
Prokaryotic type
Lupro_03360
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
tRNA-synt_1
Anticodon_1
tRNA-synt_1g
Val_tRNA-synt_C
tRNA-synt_1_2
tRNA-synt_1e
DUF5915
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AMC10347
UniProt:
A0A109RN26
LinkDB
All DBs
Position
complement(772593..775220)
Genome browser
AA seq
875 aa
AA seq
DB search
MSLATKYNPKDIENKWYDYWMKNNYFHSIPNEKEPYTIVIPPPNVTGVLHMGHMLNNTIQ
DVLIRRARLKGFNACWVPGTDHASIATEAKIVAKLKEEGINKSDLTRDEFLKHAWEWTAE
HGGIILEQLKKLGASCDWERTKFTMDAELSEAVTKVFIDLYNKGLIYRGYRMVNWDPAAK
TTLSDEEVIFEEKQGNLYYVNYKIEGSDDVLTIATTRPETILGDSAICINPNDERFTHLK
GKKAIVPIANRIVPIIEDEYVDIEFGTGCLKVTPAHDQNDKILGEKHNLDVIDIFNDDAT
LNSFGLHYEGKDRFVVRKEITKELERLGCLLKIEQYMHKVGTSERTKEVIEPKISAQWFL
KMDTIVKPALKAVLEDEEIHFFPKHYINTYRHWLENIRDWNISRQLWWGHQIPAYFYGDG
VNDFVIASTLEEAVKLASEKVGKELTIEDVTQDPDALDTWFSSWLWPISVFDGIRNPTNK
EIAYYYPTNDLVTGPDIIFFWVARMIFAGYEFRNEKPFTNVYFTGIVRDSKGRKMSKSLG
NSPDPIELMEKYGADGVRVGMLLCSAAGNDLLFDEELCAQGRNFSNKIWNAFRLIKGWEI
SETLEQPQSSKIAIEWYQAKFQQTLQDIEKSFEQYRISEALMTIYKLIWDDFSSWFLEMI
KPAYQQPIDLKTYNAVIGFFENNLKILHPYMPFISEEIWQEIKDRTPEEALIIAEYPTKE
NVDQSLINDFKLASEIISNIRTIRKDKNIAFKDTIEFFAFNNKNSNRKFDAIIKKLGNLS
SIAYVSKKIDGALSFRVKSNEYFIPITSDINVEEEKTKLEDELKYTEGFLKSVQKKLSNE
RFVNNAPEQVIKNERKKEADALAKIATLKASLASL
NT seq
2628 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtttagctacaaaatacaaccctaaagatattgagaataaatggtacgattactgg
atgaaaaacaactattttcattcaatacctaatgaaaaagaaccttatacaattgtaata
ccacctccaaatgttacaggtgttttacatatgggacatatgctaaataataccattcaa
gatgtattaattagaagagcaagattaaaaggatttaatgcttgctgggttccagggacg
gaccatgcttctattgcaacagaagctaaaattgtagctaaattgaaagaagaaggtatt
aataaatcggatttaacacgtgatgaatttttaaaacatgcttgggaatggacggctgaa
catggagggataattttagaacaattgaaaaaattaggagcatcttgtgattgggaacgt
accaagtttaccatggatgccgagttaagtgaagcagtaaccaaagtttttattgatttg
tataataaaggattgatttatcgtggttatagaatggtaaattgggatcctgcggctaaa
acaaccttgtctgacgaagaagtgatttttgaagaaaaacaaggaaatttatattatgta
aattataaaatagaaggaagtgatgatgtacttaccatagcaacaacacgcccagaaact
attttaggagattctgcaatttgtatcaatccaaatgatgaacgctttactcatttgaaa
ggtaaaaaggccattgtacctattgcaaatagaattgtacccattattgaagatgaatat
gttgatattgaatttggtaccggttgtttaaaagtaactcctgcccacgatcaaaatgat
aaaatattaggtgaaaaacataatttagatgtaatagatatttttaatgatgatgccacg
ctaaattcttttggattgcattatgaagggaaagataggtttgtggttcgtaaagaaatt
actaaggaattagaaaggttagggtgtttattgaaaattgagcaatatatgcacaaggtt
ggtacttctgaaagaacaaaagaagttattgaaccaaaaatatctgcacaatggttttta
aaaatggatactattgttaagccagcactaaaggcagttttagaagatgaggaaattcat
ttttttccaaaacattatattaacacctaccgtcattggttagaaaatattagagattgg
aatatatctcgtcaactttggtggggacaccaaattcctgcatatttttatggagatggt
gtaaacgattttgtaattgcttcaacacttgaagaagcggttaaattggcctcagaaaaa
gtaggtaaagaattgacaattgaagatgtaacacaagatccagatgccttagatacgtgg
ttttcatcttggttatggccaatttctgtttttgatggaattagaaatcctacaaataaa
gaaatagcatactactacccaacaaatgatttagttacaggacccgatattattttcttt
tgggtagctcgtatgatttttgcaggctatgagtttagaaatgaaaaaccatttacaaat
gtttattttacaggaattgtaagagatagtaagggaagaaaaatgtcgaaatcattaggg
aattctccagacccaattgaattgatggaaaaatatggagccgatggtgtacgtgttggt
atgttattgtgttcagcggctggaaatgatttgctatttgatgaggaattgtgtgcgcaa
ggtcgtaatttttcaaataaaatatggaatgcgtttcgtttaattaaaggttgggaaatt
tcagaaactttagagcaacctcaatcgtccaaaatagctattgagtggtatcaagctaaa
tttcaacaaacattacaagatatagaaaaatcatttgagcaatatcgtataagtgaagca
ttaatgacgatttataaacttatttgggacgatttttcttcttggttcttagaaatgatt
aagcctgcatatcaacagccaattgatttaaaaacatacaatgctgtaataggttttttt
gaaaataatttaaaaattttacacccatatatgccttttatttctgaagaaatttggcaa
gaaattaaagatagaactccagaagaagcattgataatagccgaatatccaactaaagaa
aatgttgaccaatctttaatcaacgattttaaattagcttcagaaattatctctaatatt
agaactattagaaaagataagaatatagcatttaaagataccattgaattttttgctttc
aataataaaaattctaatagaaaatttgatgctattattaaaaagcttggaaatttatcc
tcaatagcatatgtatcgaaaaaaattgatggagcgttgagtttcagagtgaaatctaac
gaatattttattccaataacttcagatattaatgttgaggaagaaaaaacaaagttagaa
gatgagcttaaatataccgaggggtttctaaaatctgttcaaaaaaaattaagcaatgaa
cgatttgttaataatgctccagagcaggtgattaaaaatgaacgaaaaaaggaagccgat
gctttggctaaaatagcaactctaaaagcaagtttagcttcactttag
DBGET
integrated database retrieval system
