Lutibacter profundi: Lupro_06390
Help
Entry
Lupro_06390 CDS
T04235
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K16053
miniconductance mechanosensitive channel
Organism
lut
Lutibacter profundi
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lut00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
lut02000
]
Lupro_06390
Transporters [BR:
lut02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
Lupro_06390
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MS_channel_2nd
MSSS
UPF0154
DUF5334
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AMC10895
UniProt:
A0A0X8G6F4
LinkDB
All DBs
Position
1450362..1451609
Genome browser
AA seq
415 aa
AA seq
DB search
MSFDFTNWVDNLLVNVLNMNANTIYIPRTIILFLLLIVLCLFVWWLSKKILNYIIPKVTL
KTKTLWDDIIFNKKVINSVSNLLPAILFNNYAPIIFADFQFIVPFLTGITTIFIIFVTVD
IFNSLLNSATEILSNIERFKDKPLYSFSQLGKIVVYSIAAILIISIIIDKNPLFLLSGIG
AMAAIILLIFKDSILGFVASIQLSGNNMVRVGDWVTVSNYGADGDVIEINLTTIKVQNFD
KTITTIPTYAFISDSFTNWRGMEESGGRRIKRAINIKIDSIKFCSNEMLERYKKYHLIRN
YIQKKQKEIDDYNSKNSIDKVELINGRHLTNIGVFRAYVEAYLKSNPNINNNMTCMVRQL
PPTEYGVPIEIYAFSKNKDWTKYEAIMADIFDHLFAATKNFDLKIFERPSTGDFK
NT seq
1248 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagttttgattttacaaattgggtagacaacctattggttaacgttttaaatatgaat
gctaacactatttatattccaagaacaatcattttatttttattactcattgtgctgtgc
ttatttgtatggtggttaagtaaaaaaatacttaattatatcatccctaaagtaacctta
aaaacgaaaaccctttgggatgatataatttttaataaaaaagtaataaactcggtatca
aatcttttacctgcaattttattcaataattatgcgcccataatatttgccgattttcag
tttatagtaccctttttaacaggtataactactatttttattatttttgtaactgttgat
atattcaattctcttttgaattctgcaactgaaattctttctaatattgaacgatttaaa
gacaaacctctttatagttttagtcaattaggtaaaatagtagtgtactcaattgctgct
atcctaataatttcgattataattgacaaaaatcctttgtttttacttagtggtattggt
gccatggcagcaattatactattaatttttaaagatagtatattagggtttgtagctagt
attcagctttcaggaaataatatggtgcgtgttggtgactgggttaccgtatcaaattat
ggggcagatggtgatgttattgaaattaatttaaccactattaaagtacaaaattttgat
aaaaccattactactatacctacttatgcatttatttctgattcatttacaaattggaga
ggtatggaagaatcaggaggtaggcgtattaaaagagccataaatattaaaattgatagt
attaaattttgctcaaatgaaatgttagagcgatataaaaaataccatctaatacgtaat
tacatccaaaaaaaacaaaaagaaattgatgattacaattctaaaaattctatcgacaaa
gttgaattaataaatggtagacatttaacaaatataggagtgtttagagcttatgttgaa
gcttacttaaaaagcaatccaaacataaataacaatatgacttgtatggttaggcaatta
cctccaactgaatacggcgttccaattgaaatttatgcctttagtaaaaataaagattgg
acaaaatacgaagctattatggctgatatttttgatcatttgtttgctgcaactaaaaac
tttgatcttaaaatttttgaaaggccttcaacaggtgattttaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
