Lutibacter profundi: Lupro_12180
Help
Entry
Lupro_12180 CDS
T04235
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
lut
Lutibacter profundi
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Alpha-amylase
Por_Secre_tail
CBM_48
TSP_3
Big_7
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AMC11972
UniProt:
A0A0X8G8D2
LinkDB
All DBs
Position
complement(2765566..2768838)
Genome browser
AA seq
1090 aa
AA seq
DB search
MKIKLILFLLVLPIFTFSQITTNPTIPIVNSEITIIFDATGTGLDGYTGDIYAHTGATVN
GNQWQNVIGSWGDNTTQPQLTRDGSNPNLYTLLISPDVFTFYGVSTSDTVTELSFVFRSS
DGTKQTNPDIFIAIYAEGLNVAFTNPSNQSVYNLNEVITISAVSSIDANLELFVNNISQQ
TATATTTISVTYNLDSSGSQTIKVIATANGETKETSITVYVKTPTINSTKPTGLKYGLNK
NTDNSVTFLLQAPQKTDVLLLGDFNNWTLDNSFQMAKDGDDFWITLTGLDINTEFAYQYL
VDYTIKVADPYSEKILDPNNDQYIPSTTYPNLKSYPAGLTTGIVSTFIINEPIYTWNVTN
FEKPAKDNLIIYELHIRDFTESDSYNEALTRLDYLESLGINAIELMPISEFEGNDSWGYN
PSFHGALDKAYGTKNDFKKFVDECHARGISIILDVVYNQAFGQSPLAQMYWDSANNKPAA
DNPWLNTDATHPFSVGNDFNHESIYTKNYVKQTMKHWINEFKIDGFRIDLSKGFTQTNNP
TDVAAWGNYDASRIAILENYATDIWTNTSSDIYLILEHFADNSEETVLANYGFLLWGNSN
HNYSQNTMGYASDSDISSMSYQERGWNNPNLVGYMESHDEERLMFKNLNFGNSNENYNVK
NLNTALAREELAGMFLFTIPGPKMIWQFGELGYEISIDENGRTGRKPIHWEYFDDVNRKN
IYNVWSTLIAFKKKQPVFNSVDFSLNVGNLTKSIVLRDASMDVVIVGNFDIVTKTITPQF
TQTGTWYEYFTGVQKEISNTSESVTLNPGEYRLYSTVRLLDPRGGTAIDDSDGDGIVDTQ
DLCPNTPTGIAVNTTGCPIFSLPEDNFNVQVISETCPDKNNGQLVITAQTVQNYAVTING
TAYTFTDSLTVDSLAPGMYNFCITVTGETYEQCFVVEVIAGVTVSGKSSVSSNRATIEIA
EGTAPFIIYVNGQEVLETNSPVFNVEVKHGDLLEVKTSKSCEGVYSKTIALLEGIVAYPN
PTSGVLEIALPVSQKEVTISLYSIHSQLISRKVYPIINGKVQLNIANKPIGLYIVKVQLD
KPVTLKIIKQ
NT seq
3273 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaataaaactaatcctatttcttcttgttctacctatatttactttctcgcaaata
acaaccaacccaactatacctatagtaaatagtgaaattactattatatttgatgctact
ggaactggattagatggctataccggtgatatttatgcacacacaggtgccacagtaaac
ggtaatcaatggcaaaatgtaattggttcttggggtgataatactacgcaaccacaactt
acaagagatggttcaaaccctaatttatatacgcttcttatctctcctgatgtttttaca
ttttatggagtttcaacttctgatactgtaacagaattgagctttgtttttagatcttct
gatggaacaaaacaaacaaatcctgatatttttatagctatttatgccgaaggattaaac
gttgcatttacaaatccatcaaatcaaagtgtctataatttgaatgaagttattacaatc
tccgctgtatcttctattgatgctaatctagaactttttgtaaataatatttcacaacaa
accgctactgcaacaactacaatatcagtaacttataatttagattcttcagggtctcaa
actataaaagtaatagcaactgccaatggagaaacaaaagaaactagcattactgtatat
gtaaaaacgccaacaataaatagtacaaaaccaactggtttaaaatatggcttaaataaa
aatactgataattcggttacttttttattgcaagctcctcaaaaaacagatgttctcctt
ttgggtgattttaataactggactttagataattccttccaaatggccaaagatggtgat
gacttttggataactttaactggtttagatattaatacagaatttgcttatcaatatttg
gtagactataccattaaagtggctgatccttattcagaaaaaatattagatccaaataac
gaccaatacataccttccacaacatatcctaatttaaaaagctaccctgctggtttaacc
acaggaatagtatctacttttataattaatgaacctatatatacttggaatgttactaat
tttgagaaaccagcaaaagataacttaatcatttatgaattacacataagagattttacc
gaatctgactcctataatgaagccttaactcgcctagattatttagaatcattaggtata
aatgctatagaattaatgcctataagcgaatttgaaggaaatgatagttggggttacaat
ccttcttttcatggagcattagataaagcttatggaacaaaaaatgatttcaagaaattt
gtagatgagtgccatgcaagaggtatttccataatacttgatgttgtatataatcaggca
tttggacaaagcccattagctcaaatgtattgggatagtgcaaataataaacccgcagca
gataatccttggttaaatactgatgcaacacatccttttagtgttggtaacgattttaat
catgaaagtatttatacaaaaaattatgtaaaacaaacaatgaagcattggataaacgaa
tttaaaattgatggttttagaattgatttatctaaaggatttacccaaacaaataaccct
actgatgttgctgcttggggtaattatgatgcgtccagaattgcgattttagaaaattat
gcaactgatatttggacaaatacttcctctgacatttatttaattttagaacattttgca
gataattctgaagaaactgttttagcaaattacggatttctattatggggcaatagcaac
cataattacagccaaaatactatgggttatgcatctgactcagatattagttcaatgtct
tatcaagaaagagggtggaataatccaaatcttgtaggatatatggaaagtcatgatgaa
gaacgattgatgttcaaaaacctgaactttggtaatagtaatgaaaactataatgtcaaa
aatttaaatactgccttagctagagaagaattagctggaatgttcctttttactattcct
ggaccaaaaatgatatggcaatttggtgaactcggctacgaaattagtatagatgaaaat
gggcgaactggaagaaaaccaatacactgggaatattttgatgatgttaatagaaaaaat
atatataatgtttggtcaacacttattgcattcaaaaagaaacaaccagtatttaattca
gttgattttagcttaaacgttgggaatttaacaaaatctattgtattaagagatgcttca
atggatgtagttattgtggggaattttgatattgttactaaaactataaccccgcaattt
actcaaacaggcacttggtatgaatattttacaggagttcaaaaagagatatctaatact
tctgaatcagtaacattaaaccctggagaatacaggttatattctacagtaagattgtta
gacccaagagggggaacagctattgatgatagtgatggagatggtattgttgatacacaa
gatctatgtcctaataccccaacaggaatagctgtaaatacaacgggatgtcctattttt
agtttacccgaggacaattttaatgttcaagtaattagtgaaacctgtccagataaaaac
aacggccagttagttatcacagctcaaacagttcaaaattatgccgtaacaattaatggt
acagcttatacttttaccgatagtttaaccgttgatagtttagctccgggaatgtataat
ttttgtattaccgttacaggagaaacctatgagcagtgttttgttgtggaagttatagca
ggggttaccgtatcgggaaaatcaagcgtaagttcaaatagagccaccatagagatagca
gaaggcacggcaccatttattatttatgtaaatgggcaagaggtattggaaacaaactca
ccggtatttaatgttgaagtaaaacacggagatttattagaggtaaaaacgtcaaaatct
tgtgagggggtttacagtaaaacaatagcattattagaaggtattgttgcatatccaaat
ccaacaagtggtgttttagagatagccttaccagtttcacagaaagaggtaacaataagt
ttgtacagtatccattcacaattaatatcaagaaaggtatatccaataataaatggaaaa
gtacagttaaatatcgcaaacaaaccaatagggttgtatatagtaaaagtacaattagat
aaacctgtaacccttaaaattataaaacaatag
DBGET
integrated database retrieval system
