Lactobacillus ultunensis: H4B44_04450
Help
Entry
H4B44_04450 CDS
T07197
Symbol
smc
Name
(GenBank) chromosome segregation protein SMC
KO
K03529
chromosome segregation protein
Organism
luu
Lactobacillus ultunensis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
luu00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03036 Chromosome and associated proteins [BR:
luu03036
]
H4B44_04450 (smc)
Chromosome and associated proteins [BR:
luu03036
]
Prokaryotic type
Chromosome partitioning proteins
Condensin-like complex
H4B44_04450 (smc)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SMC_N
SMC_hinge
AAA_21
AAA_23
AAA_15
AAA_13
AAA_29
ABC_tran
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QQP29308
LinkDB
All DBs
Position
877336..880905
Genome browser
AA seq
1189 aa
AA seq
DB search
MPLTELVLDGFKSFADKTIIHFNDGITGIVGPNGSGKSNITEAIRWVMGESSAKSLRGTN
MKDVIFAGSQYRKPLNKAEVTLIFDNKKRELAFDADQVSITRRILRSGDSEFLINNQQVR
MRDVRSLFLDSGISQNSLAIISQGRVDQILNSRPEQRRVIFEEAAGVLHFKQQKEEAQTQ
LKKTQDNLIRINDLVKELESRIEPLHEQSSLAKEYQFQKAGLDKKLKSLLAFEIEDINHH
KEAVQKSAEKNKVLLSKLDNEVKDSQNAVAKKRAEYKKIQADRDQTQDRLLKLSKQLSDL
DANLQMAKQSKQFDDATKVEYQNQVKALKQNLVKLNADLEELQKSGEKLKNEQDVLQKQR
DQLTAELNENPEELSRQLESCRNDYIQLLQDQATTNNQIVNLNTDLKRSQADTSYQSNDV
TKQLADAKAELEKLRSEGKSLTEKRKQTKEKFTKINKQNSDLANEINRLRETVASERNKL
EKIEARHEALVNIQKRHEGYYYGVRNVLNHLSAFPGVIGAVGELITFPIELEAAMTTALG
GGVQDLITDNRISARNAINQLKRNRGGRATFLPLDGLRQYGIPQSTVTTLKSYEGFKGIA
SDLVESKTNHNINAAINYLLGSVIIVDTIDTALEVSRRINRYRIVTLDGDVISPGGSMTG
GQRNQRNNSPLQTATEINQLEEQITALTKTLKEDQDQLEKLVEQGQSVSGELQKLQKLLQ
EINQAINEAAISFQNQEKEVKRLTDANDLYESRIKERDSRIKSLKKQIEEAQEKQKFLTK
QGTEHKDKMNNLQERIRDFNSLSQRVQDKLSKLDPKIAVYTNKLENLAGQAKEKENQIEN
NKKQTTNLSQKLQDLSQSGQLTVKKNADLRQQKVEIKQKTDDLQKKLNDLSSQLGQFDAQ
INQLDQVASRNYDLRKDAAIEQEDYSVQLAKFNSSINQRLETLRDDYSLSYEAAIAQAEG
DNNQETRQELAKSVKLHRMSIEDIGPVNLDSIKEYEDVKKRYDFLSNQQNDLLKARDDLE
KSMSELDEEVKTRFKNTFDTVAESFKHIFPIVFGGGKAKLELTEPNNLLETGIEIIAQPP
GKKLQRLSLLSGGERALTAITLLFAMLQVNPVPFCVLDEVEAALDDANVARFAQFLLKYD
LKTQFIVITHRRGTMRQADQLYGVVMQESGVSQVLSVSLKEMKDRHEVK
NT seq
3570 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgccattaacagaattagtgctcgatggttttaaatcattcgctgacaagacaattatt
cattttaacgatggaattactggaatcgttggtcctaacggaagtggtaagagtaacatc
actgaagccattcgttgggtgatgggggaatctagtgctaagtctcttcgtggaacgaac
atgaaggacgtcatttttgctggaagccagtatcgcaaacctttgaataaagctgaagtt
actttgatttttgataataaaaaacgtgaattggcttttgatgcggatcaagtctcaatt
acaagaagaattttgcgttcaggcgatagtgaatttttaattaataatcagcaagtgcgc
atgcgagatgtgcgttcgctgttccttgattccggtatttcccaaaatagcttagcgatt
atttctcagggacgggttgaccaaattttaaactctcgtccagagcaacgccgagtgatt
tttgaagaagctgctggtgtcttgcattttaaacaacaaaaagaagaggcacagactcaa
ttaaagaaaactcaagacaatctgatccggattaatgatctggttaaagaacttgagagt
agaattgaaccactgcatgaacaaagttctttggctaaggaatatcaatttcagaaggcg
ggtttagataagaagcttaagagtttattggcttttgaaattgaagatatcaatcatcat
aaagaagcagttcaaaagtcagctgaaaaaaataaagttctcttatctaaactggacaat
gaagttaaggattcacagaatgcagttgctaaaaagcgagctgagtataaaaagattcag
gcagatcgtgatcaaactcaagatcgattgcttaagctgagtaaacaattatctgatcta
gatgcaaatcttcaaatggctaagcaatccaagcaatttgatgatgctactaaagttgaa
taccaaaatcaggttaaagcacttaaacagaatttggttaagttgaatgctgatttagaa
gaattgcaaaagagtggagaaaagcttaagaacgagcaggatgttttacaaaaacagcgt
gatcagttgactgcagaattgaatgaaaaccctgaagaactgagtcgccaacttgaaagt
tgccgtaatgattacatccaattgttacaagatcaagcaaccacgaataatcaaattgta
aatttaaatacagacctaaaacgtagccaggccgatactagttatcagagtaatgacgtg
actaagcagttagctgatgccaaggctgagttagaaaaactcagaagtgaaggtaagagt
ttaactgaaaaacgtaaacaaactaaagaaaaatttactaagattaataagcaaaatagt
gatttagctaatgaaattaatcgtttgcgtgaaacggtagctagtgaacgtaataaattg
gaaaaaattgaagcacgccatgaggctctagttaatattcaaaagcgacacgagggctat
tactatggtgttcgtaatgttttgaatcacttaagtgcttttccaggtgtgattggcgct
gttggtgaattgattaccttcccaattgaacttgaagcggcaatgacaactgctttaggc
ggtggagttcaagacttgattactgataaccggattagtgctcgaaatgctattaatcag
ttgaagcgtaatcgtggtggacgtgctacttttttgccattagatggattaagacagtat
ggtattcctcaatcgacagtaactactttaaagtcatatgaaggctttaaaggaatagca
agtgatttggtagaaagtaaaacaaatcataatattaatgcggctattaattacttgcta
ggtagtgtaattattgttgatacaattgatactgctttggaagtttcaaggagaattaat
cgttatcgaatcgttactttagatggggatgtaatctcacctggtggttcaatgactggt
ggacaaagaaatcaacgtaataattctcctttgcaaactgctactgaaattaatcagttg
gaggaacaaattacagctttgaccaaaaccctaaaagaggatcaagatcagcttgagaaa
ttggttgagcaaggtcagtcagtaagtggtgagctccaaaaattgcagaaattgttgcaa
gaaattaatcaagcaattaacgaagctgcaatctccttccaaaatcaggaaaaagaggtt
aagcgtttaactgatgccaatgatttgtatgaatcacgaatcaaggaacgtgattctcga
attaagtctttaaagaagcaaattgaagaagctcaagaaaaacaaaagtttttaactaag
cagggtactgagcataaagataaaatgaataatttgcaagaaaggattagagactttaat
agtttgagtcaacgagtccaagacaagctatctaagttagatcctaagattgcggtttat
actaataaattggagaatttggctggtcaagctaaagaaaaagaaaatcaaatagaaaat
aataagaaacaaaccacaaacctaagtcaaaagttacaggatctctctcaaagtggtcaa
ttaactgttaaaaagaatgcagatctgaggcaacagaaagttgaaattaagcaaaaaaca
gatgatttgcaaaaaaagttaaatgatctaagttcacaacttggacaatttgatgctcag
attaatcaattagatcaggttgccagtcgtaattatgatttgcgtaaggatgctgcaatt
gagcaagaagattattcagttcagttggctaagttcaacagttcaatcaatcaacgactt
gaaactctgcgtgatgattattcattaagctatgaagcagcaattgcacaagctgaaggt
gataataatcaagaaacccgtcaagaactggctaaaagtgttaaacttcatcgcatgtca
attgaagatattggtccagttaacctggattccattaaggaatatgaggatgttaagaaa
cgttatgatttcttaagtaaccaacaaaatgatttgctcaaggctcgcgatgatctagaa
aagtcaatgagtgaactagatgaagaagtaaagacacgttttaagaatacttttgataca
gtggcagaaagctttaagcatattttcccaattgtctttggtgggggtaaggctaagttg
gaattgactgaaccaaataatttgttagaaacgggaattgaaataattgctcaaccacct
ggtaaaaaattgcaacgtttaagcttgctttcaggtggagaaagagctttgactgcaata
acattgctttttgctatgttacaggtaaatcctgttcctttctgtgtacttgatgaagta
gaggctgccttagatgatgcaaacgttgctcgttttgctcagttcttgcttaaatatgat
ttgaagacacagtttatcgttattactcacagacggggtacaatgagacaagctgatcaa
ttgtatggcgtagtcatgcaagaatctggtgtttctcaagtattgtcagtatcattgaaa
gaaatgaaagataggcatgaggtgaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
