Lactobacillus ultunensis: H4B44_05570
Help
Entry
H4B44_05570 CDS
T07197
Name
(GenBank) SNF2 helicase associated domain-containing protein
Organism
luu
Lactobacillus ultunensis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SNF2-rel_dom
SNF2_assoc
Helicase_C
ResIII
ERCC3_RAD25_C
DEAD
SWIM
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QQP27612
LinkDB
All DBs
Position
complement(1116680..1120222)
Genome browser
AA seq
1180 aa
AA seq
DB search
MANWTRLFPQRILDRGEIYYENQMVQDVRLGNDGEHFAAHVQGGIGRYYNVSGRLRPNGR
ASELKCDCPWAKKGHRCKHQVASLFATEKLQKQEKHSMPLDSQQIELRDLVSRNVKQAIA
EAKPALDPFKIIGKQSFTQESYDLALQLINKYSEIHCRHIDDKMRAYEYIWNLEKEDGTW
LVISVKFTRWQVLTIDFQPNMPTDDQDAATIFALLKFIKEYIKEDPFDITNKAATELLNF
YSDPTTQNKTDQIILQAQIDNYGRLPRLSFKLGKEKHLYQIRDLNALVDAIRQQSIVKLG
KFFNEPIDPNKMSKDSKRWINLIEKIIDARNLSVYYGNSRDFGAIEIENSIADEVDELLY
SGIKLFSGTHLVGYTSDQLDLNIQITEDKGAADVSVEDFPAGTLITGSKKYYGYYKGVWI
RYEGITPTYLQELKLHPGDQFRFSKKTVQQFARQILPRFEKSKYVSVTGAKELRASLPPE
ATFVFSLDYRGGNLLCTARVKYGEKEYELNHNYSANNQRESDLERSTEEVINQYFVDFKE
GKYILPNENTDIVADFLDHGIKKLKHIGEVRITANFRSLLRGLKSNMEFGVSVNLTNELL
NIDLTDQKFSWEDIQAALKAYQEKQHYFILKNEMLQRTNQPTIEQLAQTLHDMGISFKDF
IHGKLQIPAYRAFYFAKQMRDANALHFSSNSAFKQLIADLSKNHLKKNKLPVSLQTVLRP
YQKEGFNWLSTIVNYNFGGLLADEMGLGKTLQIIALLLSRKEQISSNLPSLVVAPASVIY
NWQAELQKFAPHLSVCILDGNKNKREKMLMESPKYDLYISSYQSLNHDLESYDNLTFDLQ
IIDEAQNIKNHEAITAKSVKVIKAHHKLALTGTPIENKLSELWSIFDYLMPGFLGSYLDF
KKKFEIPIVKKKDEDAEALLSNMIMPFTLRRLKKNVLLDLPAKDEQVILVKMNKKQEGLY
QLQTQKLIAQLNGQEETDFKKSRFEIFAQIIKLREICCDPRLLYENYHGKSNKLITTVDL
IKTNLENGHKILLFSQFTSMLEILQSKLKKAKIPLFMLTGSTPKEKRQEYIREFNTMEQP
GVFLISLKAGGTGINLTSADVVIHYDPWWNLAAENQATDRAHRIGQKHSVKVYKMVTKNT
IEERIIKLQQKKAELAQAILGNSNISNAAISKADLLRILD
NT seq
3543 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttggctaattggacaaggctatttcctcaacgtatcttggaccgaggagaaatttattat
gaaaatcaaatggttcaggacgtgcggttaggaaatgatggagaacactttgctgcccat
gttcaaggtggaatcggtcgttattacaatgtttcgggccgacttcgcccaaatggacga
gcttctgaattaaaatgtgattgtccttgggctaaaaagggacatcgttgcaaacaccaa
gttgcatctctatttgcaacagaaaaattacaaaaacaggaaaaacacagcatgcctctt
gatagtcaacaaattgaattacgtgatttggtttcaagaaacgtcaaacaagcgattgca
gaagctaaacccgcattagatccttttaaaatcattggtaaacaatcttttacccaagaa
tcatatgaccttgcactacaattaatcaataaatattctgagattcattgtcgtcatatt
gatgataagatgcgagcatatgaatatatttggaatctagaaaaagaagatggaacatgg
cttgtaatttccgttaagtttacacgttggcaggttttaacaattgattttcaaccaaat
atgcctacagatgatcaagatgctgcaacaatttttgcattattgaaattcatcaaggaa
tatattaaagaagatccttttgatatcactaacaaggcagctactgaattattaaacttt
tattctgatccaacaactcaaaacaaaactgatcaaattattcttcaagcacaaattgat
aattatggacgtctaccgcgactttcgttcaagttaggcaaggaaaagcatttatatcaa
attcgtgacttaaatgctttggttgatgccattagacagcagtcaattgtgaaactaggt
aagttcttcaatgagcctattgatccaaataaaatgtctaaagatagcaaacgttggatt
aatctaattgaaaagattatcgatgctcgcaatttaagtgtttattatggtaattcaaga
gactttggtgcaattgaaattgagaattcgattgctgatgaagttgatgaattactttat
agtggaattaaacttttttcaggtacgcatttggttggctatacttctgatcaattagac
ttaaatattcagattaccgaagacaaaggcgcagctgatgtaagcgtggaagatttcccc
gcaggtactttaattactggtagcaaaaaatactatggttactacaaaggtgtatggatt
cggtatgaaggaattacaccgacatatttacaagaattaaaacttcatcctggagatcaa
tttcgttttagcaaaaagacagtacagcagtttgctcgtcaaatcttacctaggtttgaa
aaatcaaaatacgtttctgttaccggtgctaaagaattacgggcttcattaccgccagag
gctacgttcgtatttagtctagattatcggggtggtaatttactttgtacagccagagtc
aaatatggtgagaaagaatatgagcttaatcataattactctgcaaacaatcagcgagaa
tctgatttagagagatcgacagaagaagtcatcaatcaatactttgttgattttaaagaa
ggcaaatatattttgccaaatgaaaatactgatattgttgctgattttctggaccacgga
atcaaaaaactgaagcatattggcgaagttcgaattacagccaattttagatctctgtta
aggggtttaaaaagtaatatggaatttggggttagtgtcaatttaactaatgagttacta
aacattgatttaaccgatcaaaaattcagttgggaagatattcaagctgcattaaaagca
tatcaggagaagcaacattatttcattctaaaaaatgaaatgctccaaagaactaatcag
cccacaattgaacagttagctcaaactttacatgatatgggtatcagttttaaggacttt
atccacggtaaactgcagatacctgcctatcgtgccttttactttgctaaacaaatgagg
gatgccaatgcattacatttttccagtaattcagcatttaagcagctaattgctgattta
tctaaaaatcacttaaagaagaataagttgcctgtcagtttgcaaactgttcttcgtccg
tatcaaaaagaggggttcaattggttaagtacaattgttaattataattttggtggattg
cttgctgatgagatggggctaggtaaaacattacaaattattgctttgcttttatcaaga
aaggaacaaataagctctaacttacctagcttagtagttgcacctgcttcggttatttac
aattggcaagccgagttacagaaattcgctccccacctttctgtttgtatcttagatggc
aataagaacaaacgtgaaaaaatgttaatggaatccccaaaatatgatttatacattagt
tcatatcaatcccttaatcatgaccttgagtcatatgataatttaacctttgacctgcaa
ataattgatgaagcccaaaatattaaaaaccatgaggctattactgcaaaatcagttaag
gtaatcaaggctcatcataaactagctttgactggaacaccgatagaaaataaattaagt
gaactttggagtatctttgactatttaatgccaggctttttaggttcttatcttgatttt
aagaaaaagtttgaaattccaattgttaaaaagaaggatgaagatgcagaagccttacta
agtaatatgattatgccgttcactttacgtcgacttaaaaagaatgttttattagacttg
ccagctaaagatgaacaagtaattttagttaaaatgaacaaaaagcaagaaggactttat
caattgcaaactcaaaaattaattgcccagttaaacggacaagaggaaacagattttaag
aaatctcgtttcgaaatttttgcacaaattattaaattgcgtgaaatttgttgtgatcca
cgtcttctatacgagaactatcatggtaaatccaataaacttataaccacagttgattta
attaaaactaatctagaaaacggtcataaaattttattattctcacaatttacttcgatg
ttggagattttacagagtaaacttaaaaaggctaagatacctttgtttatgcttactggc
tcgactcctaaagaaaaaagacaagaatacattagagaattcaatactatggaacaacct
ggagtatttcttatttcactcaaagcaggcggtacaggtattaatttaacaagtgctgat
gttgtaattcactatgatccttggtggaatcttgcagcggaaaaccaagctactgatcga
gcacataggataggacaaaaacattctgtgaaagtttataagatggtgactaaaaataca
atagaagaacggataataaagcttcaacaaaagaaggctgaacttgctcaagctatttta
ggaaatagtaatatatctaacgcagcaataagcaaagcagatttattaagaattctagat
taa
DBGET
integrated database retrieval system
