Lutimonas zeaxanthinifaciens: QZH61_01035
Help
Entry
QZH61_01035 CDS
T09226
Name
(GenBank) SusC/RagA family TonB-linked outer membrane protein
KO
K21573
TonB-dependent starch-binding outer membrane protein SusC
Organism
luy
Lutimonas zeaxanthinifaciens
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
luy00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
luy02000
]
QZH61_01035
Transporters [BR:
luy02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
QZH61_01035
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
CarbopepD_reg_2
CarboxypepD_reg
CooC_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WKK66219
LinkDB
All DBs
Position
238179..241115
Genome browser
AA seq
978 aa
AA seq
DB search
MKKIRQLVFAILFLLPMMISAQELINGNVKDDQGIDLPGVSVMIQGTTQGTATDFDGNFQ
LEVEENAILVFSYVGYSNVELPASDSMQVVLMESAESLDEVVLIGYGQTTKKDATGAVEK
VSEKEFNVGVIASPEQLITGKTAGVNVTPPSGRPGETGDVKIRGGISSLSNNSPLYVIDG
VPIDQKGPALNSINPNDIESFNILKDASATAIYGSRATNGVIIITTKSGRMNSDFRVEIG
SYVSAGVKSNTVDVLKPSQFRKAINSLENPDASALLTNESTNWQDNIYQTAFGTDNNITI
SEGFDNSSYRVAVGYMYQEGILKTGKFSRPSIAMNFRQNLFDNSLKMDFNLRGSWVQDTF
ADQGAIGNSVSFDPTKPIYSGQPVYGGYWEWLNNDGSPNNLAPRNPVGQLMQNSDNANTQ
RYLGNAKFDYKFNFLEGLSVVLNLGFDYSEVKGQFIVPAESASGYNSLGSVRDYSELKRN
TLADVYLNYLNTFADKHKVDVMLGHSFQDFYRENSNVTETGLGNVTGRPRIVSLNALESY
FARLNYTFNEKYLVTFTYRRDGSSRFAPENRWANFFSGALAWNISEEAFLQDSETISNLK
LRLGFGQTGQQEIDKDFGYLPIYTPGDNGVRYPFGGSYHYTLRPEGYDKNIKWEESDTYN
IGLDYGFMNDVITGSIEYFKRESSDILSTIAPPAGSNLTNNLYTNIGDLSSQGVEFTLNA
DIFQKENFTWNVNFNATWLSNEIKKLNNVDDPLSPGIAQGGISGGVGNTIQTHKVGHPQF
SYLVFEQVYDESGNPLEGVYVDQLTVDTNDDGIADARDGVINDSDKRIYKNPNPDYLFGF
SSYMNFHNFDLSFTLRATLGNYAYNNVASSRGYEGALYELGTLRNVHSDYLATDFKTQQF
WSDYYIQDASFLKMDNLSLGYTFDDLKDGEVGLRLYTTVQNVFTITGYDGLDPEISGGID
NNFYPRPQTFLLGFNINF
NT seq
2937 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaaattagacaattagtctttgcgattttatttttattgccaatgatgatttcc
gctcaggaacttattaatggtaatgtaaaagatgaccaaggaattgaccttcccggggta
tctgtaatgatacaaggtacaactcagggaacagccacagacttcgatgggaattttcaa
ctcgaggttgaggaaaacgcgattctagtattctcttatgttggatattccaatgtagag
ttacctgcttcggatagcatgcaggttgtgttgatggaatcagcagagagtttagatgaa
gttgtattgattggttatggacaaacaaccaagaaagatgcaaccggtgcggttgaaaaa
gtaagcgaaaaagagtttaatgttggtgttatcgcttcaccagaacaattgatcacgggt
aagacagctggtgtgaatgttacacctccaagtggtagaccaggtgaaaccggggatgtt
aagatcaggggtggtatttcatcgttgagtaataacagtccgctttatgtaattgacggg
gtgccgattgaccagaaaggtcccgcacttaattcgattaaccccaatgatatcgaaagt
tttaacattttgaaagatgcctcagcaacagcgatctatggatcgagagcgacaaacggg
gttatcatcattacgacgaagtcaggaagaatgaattctgactttagagttgagatcgga
agttatgtttcagcgggagtaaaatcaaatactgtagacgtattaaaaccaagtcaattt
agaaaggcgatcaattctcttgaaaatcctgatgcttcggctttacttaccaatgaaagt
acaaactggcaagacaatatttaccagactgcttttggaaccgataataacattacaatt
tcagaaggtttcgacaacagctcttatcgagtagcggttggatatatgtatcaggaaggg
attctgaaaacaggtaaattttcaagacctagtatcgccatgaatttcagacaaaatttg
tttgataattcattgaagatggattttaacctgagaggttcatgggttcaggatacattt
gcagatcaaggcgccattggaaattcagtgagctttgatccaacaaaaccaatttacagc
ggacaacctgtatatggtggatactgggaatggttgaataacgacggaagtcctaacaac
cttgctccaagaaaccccgttggtcagttaatgcaaaattcagataacgcaaatacgcaa
agatatttgggtaatgcaaaatttgattataaattcaacttcttggaaggtcttagtgtg
gttttaaatcttggttttgattactcagaggtaaaaggtcaattcattgttcctgcggaa
tctgcaagtggatataattcactgggatctgtcagagattattcagaattgaaaagaaat
acacttgcggatgtttatttaaattacctgaacacttttgctgacaagcataaagtagac
gtgatgcttggacattccttccaggatttctatcgtgagaactctaatgtaaccgaaact
ggtttaggaaatgttacaggaagaccaagaattgtttcacttaatgcgcttgaatcatat
tttgcacgtctgaattatacattcaacgaaaagtacctggtaacatttacatatcgtcgt
gatggatcttcaagatttgctcctgagaacagatgggcgaacttcttctctggtgcactt
gcatggaatatctcagaagaggcttttcttcaggattctgaaaccatatcaaatttgaaa
ttaagactcggatttggacaaacaggacaacaggaaattgataaagattttggttatttg
cctatttacactccaggagataacggggtgagatatccattcgggggcagctaccattac
acattgcgtccagagggatatgataagaatatcaagtgggaggaatccgatacctacaac
attggtttggattatggattcatgaatgatgttataacgggttcgatagaatactttaaa
agagagtcttctgatattcttagtacgattgcgcctcctgccggatcaaaccttaccaat
aacctctatacgaatattggtgatttatcaagtcagggtgttgaatttacgcttaatgcg
gatattttccagaaagaaaattttacctggaacgtaaactttaatgcaacctggttaagc
aatgaaatcaagaaattgaataatgttgatgatcctttatctcctggtattgctcaggga
ggaataagcggtggtgttggtaacacaattcaaacgcataaagttgggcatcctcaattc
tcatatttggtttttgaacaggtatacgatgaaagtggaaaccctttagaaggagtttat
gtggatcaacttacagttgacaccaatgatgatggtatcgcagatgccagagacggggtg
atcaatgacagcgataaaagaatctacaaaaatccaaatccggattatctgttcggtttt
tcatcttatatgaatttccataactttgatctatcgttcacccttagagcgacacttgga
aactatgcttataataatgtggcatcttccagaggatatgaaggagccttatatgaatta
ggaacacttagaaatgttcactcagattatctggcaacagattttaaaacccaacaattc
tggtctgactattatatccaggatgcctcattcttaaaaatggacaacctttctttagga
tatacattcgatgatcttaaagatggagaagttggattgagattatataccactgtacag
aatgtatttacaattaccggatatgatggtttggatcctgaaatcagtggaggtattgac
aataatttttatccaagacctcaaacattcttacttggatttaacattaacttttaa
DBGET
integrated database retrieval system