Lytechinus variegatus (green sea urchin): 121409915
Help
Entry
121409915 CDS
T11173
Name
(RefSeq) fibrillin-1-like
KO
K02599
Notch 1
Organism
lvg Lytechinus variegatus (green sea urchin)
Pathway
lvg04330
Notch signaling pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lvg00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
04330 Notch signaling pathway
121409915
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EGF
hEGF
EGF_TEN
EGF_CA
EGF_3
EGF_Teneurin
EGF_2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
121409915
NCBI-ProteinID:
XP_041457631
LinkDB
All DBs
Position
3:659515..689812
Genome browser
AA seq
3206 aa
AA seq
DB search
MWCFGITLFLILQGIISTRATVIVSYHLSTYLNPSSKQLDGVCCDGISTDLCQTRCDNKF
EICFGPLGNDNSTDDCPYGKYKTNKVHEDRDLFLFPTPLPGGVPNPINIRIEEWKKGFRV
KMKVFDTNSYYNPEILVDVYGDNFHMQPGRTPSRARKHRRTLSGEGSSQIIVNIKLYCDS
HFYGPECSVYCKPRGDGIDHFYCDPLTGDIICHAGYTGDRCAEEIDECASLPCQNNGTCH
DVVNGFWCTCQEGIAGNVCQTNPDDCQENECRNGASCIDGYATYTCKCPPGFSGTYCEFN
INECASYPCQNNAVCSDGINGYVCLCIPGFTGTHCETNIDECASDPCYNGASCIDRVNKY
KCRCIKGYEGEYCEVNINECVSDPCQNGAICIDAVNGFECICKPGYQGKFCQVNTDECKS
NPCLNRGECVDGVNGYNCSCTPGYTGIHCEFNIDECASNPCLHGSTCNDLVNRYRCNCLP
GYEGAECHIEIDECQSNPCQNEAPCVDVVAGYQCVCLPGYEGSECETDINECNSYPCEND
GMCLDGINGYACQCRDGFEGIHCEINIDECESSPCLNQGTCDDGINSYTCICKPGFTGIE
CETDIDECVSAPCQNDAACIDGINSYICKCTPGYEGDYCEINIDECASLPCLNGATCIDG
VDGYVCSCSPGYTDVNCNLEINECISIVCHNGGECVDHINKYECVCLPGYSGLQCEININ
ECESRPCQNGATCKDRINGYQCNCLPGYEGWNCEIETDECSSSPCVNEASCVDEVNGYTC
ICLSGYDGVHCQTDIDECSSSPCQNDALCVDKVNQYRCKCKAGYKGANCENDIDECLSNP
CENGGLCVDNINGYHCQCIPGYTGTNCEINIDECESSPCENGGSCNDGINRFECSCLPGY
NGQMCATDINECASGPCLNNGTCEDGVNGYFCLCIPGFEGTQCEINVDECHSDPCDNGGF
CMDGINGYICTCSPGYEGTQCEINIDECGSAPCFNGAECIDRIDRYKCRCRPGFEGTHCE
VDINECDSNPCLNGASCLDQINRFECVCILGFKGVTCEADIDECSSSPCQNNATCEDHIN
HYTCHCLPGFDSIQCQTDIDECSSSPCEHGSKCEDLINGYLCHCPSGYEGIHCEIEIDEC
QSNPCLNGATCNDKINKYRCNCLPGYVGVHCEENVNECESIPCQNEGSCEDLVNHFTCNC
QPGFNGRVCEMNIQECDSSPCFNNATCVDDIDGYHCDCQQGFEGVHCEVNIDECGSDPCR
NGGVCSDKTNHYICNCTPGYVGSQCELEANECDSSPCQNGASCIDRVNKYKCRCLDGFDG
AHCEINIDECESNPCYNSGTCVDGINEFHCSCVIGFAGVTCETNINECASDPCFNDGTCV
DQVAGYVCECLDGFNGRHCNNDIDECESNPCLNNATCIDQVDGYECQCLQGFEGMHCGID
IDECTSSPCRNGAACEDMINGYRCECLSGYEGIHCGINIDECESNPCQNEATCVDRVNKY
KCTCQQGFRGNQCEIDINECSSDPCSNGATCKDRINAYFCECNPGFAGINCETDINECES
RPCENGATCVDKVNGYSCSCDLGYDGILCENNIDECGSTPCLNGARCHDEINGFMCQCTD
GYHGVFCETNIDECASLPCKNNGKCKDKINGYICKCQEGFEGLHCENDIDECSSSPCMNS
ATCVDLTAGYECECSPGYIDFHCETDIDECVSSPCENGATCRDDVNGYTCLCMPGYQGVD
CEEDINECGSEPCKNNATCVDKVDRYKCICIPGFRGKECQTNFDECTSNPCSNGGQCEDG
VNDYICHCTPGYTGDLCEINIDECQSIPCQNDARCIDQINGFTCDCKDGYDDTLCSTDID
ECSSQPCLNNGSCTDMINRFKCICIPGFDGALCGQNINECRSNPCLNNGECVDDINMYFC
RCTPGFEGMQCELEVDECSSNPCRNDARCHDNINRYSCECVPGYEGTHCEINVDECLSDP
CVHGGTCRDMTNEYQCLCRAGYNGENCENNIDECYSEPCFNNGNCLDKVNRYRCLCMDGF
DGVHCEVNIDECASDPCMNAASCFDQIDSYHCLCQPGFTGVQCEIEINECSSYPCQNKAG
CIDFINRYECQCKPGYEGVHCEIEINECISSPCLNDASCIDKVNRFRCSCLPGYEGVLCE
TNTDECQSSPCQNEARCQDRINGYICICPYGFDGGQCQVDINECESFPCHNGGLCLDRVN
GYECQCAAGFRGVECKTDINECSSSPCQHNSECVDRINGYSCSCNKGTEGVHCEIDIDEC
ASQPCQNGAECKDGMNGYQCQCQIGYQGVYCDVNIDECMSSPCQNLASCIDLVNGYSCDC
IPGFSGPHCEINIDECVSEPCANGGACRDQINGYICGCLPGYDGNHCGHEIDECASSPCQ
NGANCLDHIDQYICQCLDGFMGTNCQVDINECASYPCVNDGTCFDKVNGYRCSCAAGFEG
FQCQVNTNECESSPCLNGGNCVDQIDAFFCRCEAGYAGAICEINIDECASNPCKFASTCQ
DKIDGYGCECLSGYYGVHCQFEEDECESRPCGHGGQCIDEVNGFTCECAAGYQGVTCEFD
IDECNNHPCQNGGTCIDRINEYDCQCVDGFGGSECQTDIDECASIPCHHNGACHDHTNGY
RCTCMVGFEGDHCQTNINECESNPCSSYGRCIDRIDGYRCRCRPGFMGAHCEIDIDECQS
DPCYHGSRCVDGLNGYSCQCRSGYQGPRCRDEIDECISNPCINGICLDRLNGYRCHCIKG
FYGKNCAINHDECISNPCLNGATCQDAINDYNCECPLGYEGKHCEIITDECRSNPCQNGA
TCVDGFKEYTCECVLGFEGINCEVNINDCAGAPCQNRATCLDGISSYECQCVLGYKGEHC
EFEINECDSHPCKNDGTCLNGVNSFYCYCPPGFEGWLCEVQIDECESSPCLHGGSCVDGT
AEFSCQCKEGFSGIRCETVLDQCKLHPCYGNATCIKIHDDFRCLCPPGYSGLGCDDYDEE
GCGSTKCFNGQCFIDGVTNNDIKYKCKCNNGFIGTECQTYLLNVTASVLIEEKHSQLSGL
EHKMKEVLMEAMEKTDDIHNCSNVDIAIIDTTTGNGALSGMEFTNVTIYAMLDDKPADRD
SLSHMLRALPPAHVNKLIHPYRLFVDRQMPPVLQTDITVNDEKKKKKSWGHRHWYVFLIS
IVILIGIASAVAYIVRRQRKAEIPPD
NT seq
9621 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtggtgttttgggattacgttatttctaattctccagggcattatttctactagagcg
acagttattgtctcttatcatctctcaacgtacctgaacccttcgagtaagcagttggat
ggtgtctgttgcgacggcatctctacagacttgtgtcagaccagatgcgacaacaaattt
gaaatatgcttcgggcctcttggaaatgacaatagcacagatgactgtccttatggaaag
tacaaaacaaataaggtacatgaagatcgggatctgtttctctttcctactccactccct
ggaggtgtacccaacccgatcaacatcaggattgaagaatggaagaaaggttttcgagtg
aagatgaaggtatttgataccaattcctactacaacccggaaatattggtcgatgtctac
ggggacaactttcatatgcagccaggcaggactccatcgcgagctcgtaagcacagaagg
acccttagtggggaaggatcttcacagatcatcgttaacattaaactatattgcgattct
catttctatggtcccgaatgctctgtctattgcaaacctcgaggagatggaattgaccac
ttctactgcgacccactaacaggcgatataatttgccatgctggttatactggggatagg
tgtgcagaggaaatcgacgagtgtgcttcgttgccgtgtcaaaataatggtacatgccac
gacgtagtgaacggattttggtgtacatgtcaagagggtatagcgggtaatgtgtgtcaa
acaaaccccgatgactgccaagaaaacgaatgcaggaacggagcgtcctgtattgatgga
tatgccacttatacttgcaagtgtcctccaggattcagtgggacttactgtgagttcaac
atcaacgaatgtgccagctatccctgtcagaacaacgctgtatgttccgacggtataaat
ggatatgtttgtctgtgtatacctggatttactggcactcactgtgagacgaacatcgac
gaatgtgcaagtgatccttgttacaatggtgcgtcttgcatagacagagttaacaaatat
aagtgtagatgcatcaaaggctacgaaggagaatattgcgaagttaatatcaacgaatgt
gtcagtgatccgtgtcaaaatggagcaatttgtatcgatgcagtcaatggttttgaatgt
atctgtaagcctggataccaaggaaaattttgtcaagtaaacacagatgaatgtaaaagc
aatccatgtttgaatagaggtgaatgcgttgatggtgtcaatggttacaactgcagttgt
actcctggatacactggaattcactgcgagtttaacattgacgaatgtgcaagtaaccct
tgtcttcatggcagcacttgcaacgacctggtcaatagatatcgctgtaattgtctccct
ggatacgaaggtgcagaatgtcatattgaaatcgatgaatgtcagagtaacccttgccaa
aatgaagcaccatgtgtcgatgttgttgctggttatcagtgcgtatgcctgcctggttac
gaaggttctgaatgtgagacagatatcaacgaatgtaacagttatccatgcgaaaatgac
ggcatgtgtcttgatggaatcaatggatacgcctgtcaatgcagagatggattcgaagga
attcattgtgaaataaatatcgatgaatgtgaaagttcaccatgtctgaaccaaggaaca
tgcgacgatggcataaacagttacacctgtatctgtaagccaggatttacagggattgaa
tgtgaaacagatattgacgaatgtgtgagtgctccttgccaaaacgatgctgcatgtatt
gacggaataaatagttatatctgtaagtgtacacctggatatgaaggtgactactgtgaa
atcaatattgatgagtgtgcttcacttccttgtctgaatggagcgacatgcatagatgga
gtggatggatatgtatgcagttgtagtccaggatacactgatgttaactgcaatttggaa
ataaacgaatgcataagtatagtttgtcataatggcggagaatgcgttgatcatatcaac
aagtatgaatgcgtttgcttgcctggatatagtggcttacaatgtgagataaacataaac
gaatgtgaaagtagaccatgtcaaaatggagcaacttgcaaagaccgcatcaatggatat
caatgtaactgcttaccaggatacgaagggtggaactgtgaaattgaaaccgacgaatgt
tctagttcaccatgtgtaaatgaagcttcgtgtgttgatgaagtaaatggatatacatgt
atttgtctcagtggatacgatggtgtccattgtcaaactgatattgatgagtgttcgagc
agcccctgtcaaaatgatgcgctctgtgttgataaagtcaaccaatatcgttgcaaatgt
aaagcagggtacaaaggggcaaattgtgaaaatgacatagatgaatgcttaagtaaccca
tgtgagaacggtggtctctgtgttgacaacattaatgggtaccattgccaatgtatccca
ggttacacggggacaaactgtgaaatcaacattgacgagtgtgaaagttccccttgtgaa
aatggaggatcttgtaatgatggtatcaatcgatttgaatgcagttgcttaccaggatac
aatgggcaaatgtgtgcaactgatattaatgaatgcgcaagtggtccatgtttgaacaat
ggcacatgtgaggatggggttaatggttatttctgcttatgcattcctggatttgagggt
acacaatgtgaaataaacgttgatgaatgccattctgatccatgcgataatggtggattt
tgtatggatggcatcaatggttatatatgtacatgctctcctggatacgaagggacacag
tgtgaaattaatattgacgaatgtggaagcgctccttgcttcaatggggccgaatgtatt
gatcgtattgatagatacaaatgtaggtgtcggccgggatttgagggtacacattgcgaa
gtggatataaatgaatgtgatagcaatccatgtttgaatggagcatcgtgtctagatcaa
atcaatcgatttgaatgcgtatgtatccttgggtttaagggagtaacatgtgaagcagac
atagatgaatgtagtagctcaccctgtcagaataacgctacgtgcgaggaccacatcaat
cactacacctgtcactgtctgcctggttttgacagtatacaatgccagacagacattgac
gaatgttcgagtagcccttgcgaacatggatcaaagtgtgaggatctcataaacggttat
ctttgtcactgcccttccggatatgaaggaatccactgcgaaattgaaatagacgagtgc
caaagtaatccttgtctgaatggagcaacctgcaatgacaaaatcaacaagtataggtgt
aattgcctgccaggctacgtaggtgttcattgtgaagaaaacgttaacgaatgtgaaagt
attccttgccagaatgaaggatcgtgtgaagacctcgttaatcatttcacttgtaactgc
caaccaggattcaacgggagagtttgtgagatgaatattcaagaatgcgacagcagtcca
tgttttaacaatgccacatgtgttgatgatatcgatggatatcattgtgattgtcaacag
ggttttgaaggagtccattgtgaggtaaacattgacgaatgtggatctgatccttgtcgg
aatggaggcgtctgttctgacaagacaaaccattacatctgcaactgtactccaggatac
gttggaagtcaatgtgaactcgaagctaatgaatgtgacagctctccttgccaaaatggt
gctagctgcattgatcgagtgaataaatataaatgtagatgtttagatggatttgatggt
gctcactgtgaaattaacattgacgaatgtgagagtaatccatgttataatagcggcacg
tgcgttgatggaataaatgaatttcactgctcttgtgtgataggatttgctggagtaact
tgtgaaacgaatatcaacgaatgtgcaagcgacccatgttttaatgacggaacatgtgta
gaccaagttgctggatacgtatgcgaatgccttgatggatttaatggacgtcactgtaat
aatgacatagacgaatgtgagagtaatccatgtttaaacaatgcaacatgcatcgatcaa
gtggatgggtatgagtgtcaatgtttgcaaggttttgagggcatgcactgcgggatagac
atcgacgagtgtacctcatcaccatgtagaaatggagctgcctgtgaagatatgataaat
ggttacagatgtgaatgcctatctggatatgaaggaattcattgtgggataaatatagac
gagtgtgaaagcaatccttgtcaaaatgaggcaacctgtgttgatagagtgaacaaatac
aagtgtacatgtcaacaaggctttcgaggaaatcaatgtgaaattgatatcaacgaatgt
agtagtgatccttgtagcaatggtgcaacttgcaaggacagaatcaatgcatacttctgc
gagtgcaatcctggatttgcaggaattaattgtgaaacagacatcaacgaatgcgaaagc
agaccttgtgaaaacggtgcgacatgtgtggacaaagtgaatggatattcgtgtagttgt
gaccttggttatgatggcattctttgtgaaaataatattgatgaatgtggaagtaccccg
tgtttgaatggtgctagatgtcacgacgagataaatggatttatgtgccaatgtacagat
gggtatcatggcgtcttttgtgagaccaacatagatgagtgtgcaagtctaccgtgtaaa
aataatggaaaatgcaaagacaaaataaatggttatatctgcaaatgccaagaagggttt
gaaggattgcactgtgagaatgacattgacgagtgctccagctccccgtgcatgaattca
gcaacttgtgtagacctgactgctggatacgaatgtgaatgcagccctggatacatagat
ttccactgtgaaacagacattgatgaatgcgtcagttctccttgtgaaaatggagctacc
tgcagggatgatgttaatggatacacctgtttatgtatgcccggttaccaaggagtcgat
tgtgaagaagatattaatgaatgtggcagtgaaccttgtaagaacaatgctacatgcgtg
gataaagttgacagatataaatgtatttgcattcccggttttcgtggaaaagagtgccaa
acaaacttcgacgaatgtaccagcaatccctgttcaaatggcggccagtgcgaagatggt
gtgaacgattatatatgccattgcacaccaggatatactggtgacttgtgtgaaattaat
attgatgaatgtcaatcaataccgtgtcaaaatgacgctcgctgtatcgaccaaataaac
ggatttacatgtgattgcaaagatggctacgacgatactttatgctcaacagatatcgat
gaatgttccagtcagccttgtttgaacaatggaagttgcactgacatgataaatagattc
aaatgcatttgtataccaggattcgatggggcactttgtggacaaaacataaatgaatgt
agaagtaacccatgtttgaataatggagagtgtgttgacgatataaatatgtatttctgt
cgatgcactcctggatttgaaggaatgcaatgcgaacttgaagttgatgaatgctcaagc
aatccttgtcgaaatgatgcccgctgccacgacaatattaacagatacagctgtgaatgt
gtaccaggttatgaaggaacccactgtgaaattaacgtagatgaatgcttgagtgacccg
tgtgtgcatggagggacttgcagagacatgacaaacgaataccagtgtctgtgccgagca
ggatacaatggggaaaactgtgagaataacattgatgaatgttacagtgagccttgtttt
aataacggcaactgcttggacaaagtcaacagatacagatgcttatgcatggacggattt
gacggtgttcactgtgaagtaaatatcgacgagtgtgccagcgatccctgtatgaatgct
gcttcatgttttgaccagattgatagttatcactgcctttgtcaacccggatttacgggc
gttcagtgcgaaattgaaatcaacgaatgcagtagctacccatgtcaaaacaaagcagga
tgcatagatttcataaacagatatgaatgccaatgtaaaccaggatatgaaggagttcac
tgcgaaatagaaattaatgaatgcatcagcagtccgtgtttgaatgatgcttcatgtatt
gataaagttaatcgcttcaggtgttcctgtcttcctggatatgaaggtgtgctgtgtgag
actaatacagatgaatgtcagagctctccttgccaaaatgaagcgagatgtcaagaccga
attaacggatatatatgcatatgcccgtatggatttgatggtggccagtgccaagttgat
attaacgaatgtgaaagtttcccctgtcacaatggtggactttgcctggacagagtcaat
ggatacgagtgccagtgcgctgctggttttaggggagtggaatgtaaaacagatatcaat
gaatgttctagtagcccttgccaacataattctgaatgcgtagatcgaatcaatggatat
agttgctcatgtaataaaggaacggaaggtgtacattgtgagattgacatcgatgaatgt
gcaagtcagccgtgtcaaaatggagccgagtgtaaggatggaatgaatggctatcaatgt
caatgtcaaattggataccaaggtgtttactgcgatgttaacatagacgaatgcatgagc
tccccttgtcaaaatttggcatcatgtattgacttagtgaatggatactcctgtgattgc
ataccaggattttccggaccacattgtgagataaatatcgacgaatgtgtaagtgagccg
tgtgctaatgggggcgcttgcagggatcaaatcaatggatatatctgtggctgccttccg
ggttatgatggtaaccactgtggacatgaaatcgatgaatgtgcaagctcaccttgtcag
aacggggcaaactgcttagaccacatcgatcaatacatatgccagtgtttggacggattc
atgggaaccaactgccaagttgatatcaacgaatgtgctagctacccttgtgttaatgat
gggacgtgttttgacaaagtgaatggataccgttgttcctgtgctgcagggtttgaggga
ttccagtgtcaggtgaatactaatgaatgtgaaagttctccttgtcttaatggaggaaac
tgcgtcgaccaaattgatgcattcttttgccgatgtgaagcaggatatgcaggagcaatc
tgtgaaatcaatatcgacgaatgtgctagtaacccatgtaaatttgcatctacctgtcaa
gacaaaattgatggatatggatgcgaatgtctttcgggctattatggtgtgcactgccaa
tttgaggaagatgagtgtgagagtagaccttgcggtcatggtggacaatgcattgacgag
gtaaatggattcacttgtgaatgtgctgctggataccaaggcgttacttgtgaatttgat
attgatgaatgcaacaatcatccatgtcaaaatggcggaacttgtattgataggattaat
gagtatgattgccaatgtgtcgatgggtttggtggttccgaatgtcagacagacatcgac
gaatgtgctagtattccctgtcatcataatggtgcatgtcacgaccatacaaatggctat
agatgtacttgcatggtgggttttgagggagatcattgtcaaacgaatatcaacgaatgt
gaaagcaacccttgctcgagctatggaaggtgcatagatagaatagatggctatcgctgc
agatgtcgtccgggttttatgggtgctcattgtgaaattgatattgacgaatgtcagagt
gacccttgctaccacggtagcagatgtgttgatggcttaaacggatactcttgtcaatgc
agatccggttaccaaggaccacgctgtcgagatgaaattgatgaatgtatcagtaatcca
tgcataaacggtatttgcctcgacagattaaatgggtaccgttgtcattgcattaaagga
ttttatggaaaaaattgtgcgataaatcatgacgaatgcatcagtaacccctgtctgaat
ggtgcgacttgccaagatgcaatcaatgactataactgcgaatgtcccttgggatatgaa
ggaaaacactgcgaaatcattaccgatgaatgtcgaagtaatccttgtcaaaatggtgca
acctgtgtggatggatttaaggaatatacgtgtgaatgcgttcttggttttgaaggaatc
aactgcgaagtgaatattaatgattgcgctggtgccccttgtcaaaatcgagctacttgc
ctggatggaatcagcagttacgaatgccaatgtgttcttggctataaaggagaacactgt
gaattcgaaatcaacgaatgcgacagccatccttgcaaaaatgatggaacttgcctgaac
ggagtgaacagtttctattgctattgcccacccggctttgaaggttggttatgtgaggta
cagatagacgaatgcgaaagtagtccgtgtctacatggtggaagttgtgttgatggcact
gcagaattcagctgtcaatgtaaagagggattctctggtatcagatgtgagactgtcctt
gatcaatgcaagcttcatccatgctatggcaacgctacctgcatcaaaatacatgacgat
ttcaggtgtctttgcccacctggatattctggtctgggttgtgacgattatgatgaggaa
ggttgtggatcgacaaagtgcttcaacggccaatgttttatcgatggagtaaccaataat
gacatcaaatacaaatgcaaatgcaacaacgggttcatcggaactgaatgtcagacgtat
ttactgaacgtcacagctagcgtgctaattgaggaaaagcactcacaactgagcggtctt
gagcacaagatgaaggaagtgctaatggaagccatggagaagacagatgacatccataat
tgttccaatgtggacatcgccattatagatactacgacgggcaatggagccttatcgggc
atggaatttacgaacgtaacaatctacgcaatgctggatgataagcctgccgatcgcgat
tctctatcacatatgttaagagctctccctccagcccatgtcaacaaactcatccatcca
tatcgactcttcgtcgacaggcaaatgccacctgtattacagacagatatcactgtaaat
gacgaaaagaagaagaagaagtcctggggacatcggcattggtacgttttcttaatttcc
atcgtcatcctcattggaattgcatcagcagtggcgtacatcgttaggaggcagcggaaa
gctgaaattccacccgactaa
DBGET
integrated database retrieval system
