Lytechinus variegatus (green sea urchin): 121411550
Help
Entry
121411550 CDS
T11173
Name
(RefSeq) multiple epidermal growth factor-like domains protein 11
KO
K24333
multiple epidermal growth factor-like domains protein 6
Organism
lvg Lytechinus variegatus (green sea urchin)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lvg00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
04990 Domain-containing proteins not elsewhere classified [BR:
lvg04990
]
121411550
Domain-containing proteins not elsewhere classified [BR:
lvg04990
]
Laminin domain-containing proteins
Laminin EGF-like domain-containing proteins
121411550
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_laminin
EGF_Teneurin
EGF_TEN
hEGF
EGF_PEAR1L
EGF_2
DSL
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
121411550
NCBI-ProteinID:
XP_041460276
LinkDB
All DBs
Position
3:complement(60802309..60824043)
Genome browser
AA seq
1457 aa
AA seq
DB search
MEYRFLLLLLISRLPHLVFSLQEGGTNVCQNENPDGTTDLFCCAGWLEKSGRCTRKCPKN
RWGVGCTNTCTCQKKNGKCNRVTGKCSCNKGWSGATCEEMCDSTHYGRNCLMDCSCENGA
TCNRFSGACTCTAGWTGKSCDQRCPRERYGVGCLQRCRCQNNAACDPADGSCTCRSGFTG
RLCEQDCLCSDGSPCQPDGSCPCGPGWTGPTCEQPCPQGTFGSGCSQECQCQNGGQCNQT
DGTCTCTAGWTGEICDESCQNGYYGPNCREECACLNGGSCSAMNGSCSCAPGWIGETCSE
TCPGNFFGEGCQQVCLCENGAECNPVDGRCNCSSGWIGEICNEMCSQGSYGVNCGNRCMC
ENGAECNHVDGTCSCLAGWQGQFCSDSCADGTFGLNCENECQCLNGGMCHHVHGSCTCSN
GFTGDTCEQQCPEGSYGRDCLEQCQCHNGATCNHVHGTCICTAGWEGQQCTSPCGAGYFG
LQCREICDCKNNATCNHVDGSCLCHPGWVGDLCEKECPEGLYGNQCSLLCDCTSGGSCHH
IDGTCNCYPGWTGVTCSSPCEGGFYGQDCQEPCQCQNGGICDHIDGICTCESGWTGIVCS
EKCPVGSFGGECLQQCQCVNGGTCHHVSGACSCPPGWQGLTCGEPCSNNFYGHDCQERCQ
CHNGASCDNIDGSCACGPGWIGEFCEHACSHGHFGSECLEECQCTNGGSCSHIDGSCSCS
PGWTGQFCDERCREGLFGHECQEICQCQNNAECNHISGVCSCGPGWIGSVCDEKCAQGFY
GEGCRERCACQNNALCSNVDGSCTCSPGWVGESCSQKCPEGFFGSACLGQCQCENGGTCH
HVDSSCTCTPGWDGPTCGDQCGEGLYGQNCQEVCLCQNNGSCHHVNGICTCQAGYIGAMC
EETCPSGYYGHNCMDSCTCQNNAQCDPMDGSCTCSPGWMGLRCNETCQNGYFGNMCQEPC
GCQNDAECNHIDGSCTCQPGWNGDLCDERCSPGNYGYQCSLVCQCQNGATCHHVDGSCTC
SAGWMGEICTMPCQEGRFGPNCTELCLCDINGRCNAADGSCSCNPGWEGRYCERQCTQKF
FGHNCAEQCLCQHGGSCDPVDGSCLCTAGWRGTICSENCPDGTYGIGCSEVCSCNQRGTC
DPEVGCMCRGGWLGKNCSLSCPDGTFGVNCSSTCNCSVNSICDNELGCFCNPGFTGPTCE
KPCANDTFGQNCAHTCGCMNGGTCDPILGCIDCLPGYTGQGCKDECHDGTFGKNCQSTCP
ACQNGGMCHHITGSCVCTAGYTGKSCQDTCEDGFFGLNCSSMCDCPLIDFCDHETGYCPD
INVAAVQTEDPTFRQDRLGVIAGITVGSAIVILVVTAGVIYILRRSKDRPPQAVYSVPKA
TAARSHRIDSNGDKPDEINHNLLGVPRSQSDWKSTMSSQSSSNGDTIETRQQFLKGSVEV
ISVRMPEDDIVERESSL
NT seq
4374 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaatatcgttttctcctgctacttctgatctctcgtctgccacatcttgtgttttca
cttcaggaaggaggaaccaatgtttgtcaaaatgagaatccagacgggactacagatctc
ttctgctgtgctggttggctggaaaagagcggcaggtgcacccgcaaatgccctaagaac
agatggggtgtaggttgtactaacacgtgtacctgccagaagaaaaatggcaagtgcaac
cgggtgactggaaaatgttcgtgcaacaagggatggtcaggggcaacgtgcgaggagatg
tgcgattctacacattatggcagaaactgtctaatggactgtagctgtgagaacggagcc
acctgtaatcggttctcaggtgcatgtacctgtaccgctggttggactggaaagtcgtgt
gatcaaagatgtcccagggaacgatacggagtgggatgcctacaaagatgccgttgccag
aacaatgctgcttgcgatcctgctgatggatcttgtacttgtcgcagcggttttaccggt
agactatgtgagcaagattgtctctgttcagacggatcaccatgtcaacctgacggctct
tgcccatgtggaccaggttggactggacctacatgtgagcaaccatgtccgcagggtacc
ttcggaagcggctgttcgcaggaatgccaatgtcaaaacggaggacaatgtaatcaaaca
gatggaacatgtacttgtacagcaggttggacaggagaaatttgtgatgaaagctgccag
aatgggtattacggacctaactgcagagaggagtgcgcttgcttgaacggcgggagttgc
agtgctatgaatggttcatgctcttgcgcaccaggttggataggagagacttgttctgag
acgtgtccaggaaacttctttggcgaaggttgtcagcaggtttgcctttgcgagaatgga
gcagagtgcaatcctgtggacggtcgctgcaattgcagttctgggtggattggggaaatc
tgcaatgaaatgtgttcgcagggttcatacggagttaactgcggaaatagatgtatgtgt
gaaaatggggcagagtgcaatcatgtcgacggcacttgttcgtgcttagcaggctggcaa
gggcaattctgttctgattcctgcgctgatggcacatttggattaaactgtgagaatgaa
tgtcagtgcctcaacggtggcatgtgccatcatgtacatgggtcatgcacctgcagtaat
ggctttactggggacacctgtgaacagcaatgtcccgaaggaagttatggacgtgattgc
ttagagcagtgtcagtgtcataatggggcaacatgtaaccacgtacatggcacctgcatt
tgcactgctggctgggaagggcaacaatgtacctccccttgcggagccggatattttggc
ttacaatgtcgagagatttgcgactgtaaaaacaacgctacatgcaaccatgtcgatgga
agttgcttgtgccaccctggatgggtgggcgatctgtgtgaaaaagaatgtccagaaggc
ctttatggcaaccagtgctcgcttctttgtgactgtacaagtggtggatcttgccaccat
attgacggcacatgtaattgctatccaggttggactggcgtgacatgcagttcaccttgt
gaaggtggattttatggccaagactgccaagaaccgtgtcagtgccaaaatggtggcata
tgcgatcacattgatggaatatgtacttgtgaatctggatggacagggatagtttgttca
gagaagtgcccagtaggatcattcggtggcgaatgcttgcaacagtgccagtgtgttaat
ggaggaacatgtcaccacgtgagcggtgcttgttcctgtcctccgggatggcagggtttg
acctgtggtgagccctgcagcaataacttctatggacacgattgccaggagcgctgtcaa
tgccacaatggagcttcatgtgataatatagacgggtcgtgtgcatgcggacctggttgg
attggagaattttgcgaacatgcgtgctcgcatggacatttcgggtctgaatgtttagaa
gaatgtcagtgtacaaatggtggatcctgcagtcacattgatgggtcatgttcttgttct
ccgggttggactggccagttttgcgatgaaagatgccgagaaggattgtttggtcacgaa
tgccaagaaatttgtcagtgtcagaataatgcagaatgcaatcatatcagcggcgtgtgt
agttgtggaccaggatggattggatccgtatgcgatgaaaagtgtgctcaaggtttctat
ggagaaggttgtcgagagcgttgcgcatgtcagaataacgcattatgcagtaacgtcgat
gggtcatgtacctgttcgccagggtgggttggtgaaagctgtagtcaaaagtgtccagaa
ggattctttggaagtgcatgtttaggacagtgtcagtgtgaaaacggtggaacgtgccat
cacgttgacagttcttgtacctgtacaccaggatgggatgggcctacatgtggagaccag
tgtggagagggcctctatggccaaaattgtcaagaggtatgcttgtgtcagaataatggt
tcttgtcaccatgttaatggaatctgtacttgccaggctggatatataggggctatgtgt
gaagaaacgtgcccttctggatattatggacacaactgtatggactcatgcacttgtcaa
aacaatgcacagtgtgacccaatggatggttcttgtacttgttctcctggatggatgggc
ttgcgatgtaatgaaacatgtcagaacggctactttggaaatatgtgtcaggaaccctgt
ggctgtcaaaacgacgcagaatgcaatcatatagatgggtcttgtacttgtcaaccagga
tggaatggggatctctgtgatgaaagatgttctcctggaaactatggttaccaatgttct
ctagtctgccaatgtcaaaatggtgccacatgtcaccatgtagacggttcttgcacatgt
tcagctggctggatgggggagatctgcaccatgccttgtcaagaaggcagatttggacct
aattgcaccgaactctgtctctgtgatattaatggtcgttgtaatgctgctgatgggtcg
tgttcttgtaatcctggttgggaaggaagatactgtgaacgtcaatgcactcagaagttc
ttcggacataattgtgctgagcaatgtttgtgccagcatggcggttcatgtgatccagta
gatggctcatgtctttgcactgccggatggagaggtactatctgcagtgaaaactgccca
gatgggacatacggaatcggctgttccgaggtatgctcatgcaaccaacgcggtacctgt
gatcctgaagtcggatgcatgtgtcgtggaggatggttaggaaagaattgctcactctcc
tgtcctgatggcacctttggtgtgaactgttcttcgacatgcaactgcagtgtgaacagc
atatgtgacaatgaacttggctgcttctgtaaccctgggtttactggccctacctgtgag
aagccatgcgcaaatgacacctttggccaaaattgcgcccatacctgcggatgtatgaac
ggtggaacctgcgatcccatccttggatgcattgattgtcttccaggatatacaggtcaa
gggtgtaaagatgaatgccatgatggtacctttggaaagaactgtcaatccacctgtcct
gcttgtcaaaatggcggaatgtgtcaccacatcaccggttcatgcgtctgcactgctggt
tatacaggaaaaagctgtcaggacacatgcgaagatggattctttggcctcaactgcagc
tcgatgtgtgactgtccactgatagacttctgtgatcacgagacagggtattgtccagat
atcaatgttgctgctgtgcagaccgaagatccaacattcaggcaggaccgactgggggta
atagctggtataaccgtcgggtctgctatagtcatattagttgttacagcaggagtaatc
tacatccttcgacgatcgaaggatcgaccaccccaagcagtatacagtgttccaaaggcc
acagcagcacgttctcatagaatagacagtaatggtgataaaccagatgaaataaatcat
aacttattaggtgtgccgagatcgcagtcggattggaaatcgaccatgtcctcgcagtcg
tcatcgaatggagatacgatagagactcggcaacagttcttgaaaggaagtgttgaggtc
atcagcgttcggatgccagaggatgacatcgtcgaacgggaatcaagcttataa
DBGET
integrated database retrieval system
