Lytechinus variegatus (green sea urchin): 121415895
Help
Entry
121415895 CDS
T11173
Name
(RefSeq) fibrillin-2-like
KO
K23342
fibrillin 2/3
Organism
lvg Lytechinus variegatus (green sea urchin)
Pathway
lvg04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lvg00001
]
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
121415895
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
lvg00536
]
121415895
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
lvg00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
121415895
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_CA
cEGF
FXa_inhibition
EGF
hEGF
TB
EGF_3
Plasmod_Pvs28
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
121415895
NCBI-ProteinID:
XP_041465209
LinkDB
All DBs
Position
5:complement(29522038..29614235)
Genome browser
AA seq
2844 aa
AA seq
DB search
MLRSSLLAVLACLSTVVFAQSNVINGPNVCGMRFYSYCCPGWRLHPRTKQCVVPICNRPC
GSGYCQRPNSCSCPGGQISVSGCDGYTGGNPCTVQCLNGGSCQGNSCNCPNGFSGTNCGT
PLCNPPCQNGGECSGGNRCSCPPGFGGSQCQTDYRTGVCYLQSPRNGICSDGVEGLHCTK
ALCCATIGQGWGDQCEHCDTFDNPCDRGYILNGRSGQCKDADECLMIPGLCEGGQCTNTP
GSYACQCPPGFELSMTTLACVDIDECQTGYLCQNGRCINTQGSFRCDCNPGYFLSQDGRQ
CTDIDIPRTPVTPEEIGYCYMRFRNRNSRTTCSQELAVRMSFLECCCSVDYAQGWGLSRS
DCSPCRTQTEELHRRLCEGFEPTTSLPRRTPVRQTKTDRPDPTGDPGVVTLSPPTVTPPR
KVTPRPEGICAMVPNICRNGLCVSLGGVMEYRCDCFEGYENAGRYTCQDINECRDRSLCR
YGTCENTDGSFRCVCPSGYKLTLDQRSCEDVDECRTNPNVCHHGTCMNIIGSHTCDCFEG
YQKSIDGRYCIDIDECTLGTHRCRNAECENLAGTYECICTEGYEAIGSSGVCIDVNECAQ
EINPCPLGFCINTLGGYQCQCPVGYATGQDGTCVENRRGFCFQDGDLGRCTHQSMGQMTI
SSCCCSAVLLNEALSWGPNCESCPPQGTLQFEQLCRHGIGFTSQRININECTLFNNLCDN
GVCEDLTGNYKCRCNSGFQPQADGKECIDENECSYNRLLCHNGACRNTPGSFVCECPDGY
ELDARSSICQDINECENPSLCNNGRCINTRGSYRCECIYPGTELDPTGTICVDNRIATCW
TRISNGQCEADIMGPMRRDECCSTFGRAWGSPCEACPLAVGDCPRGFSEISGECVDLNEC
DLNPMVCNNGLCENTMGSYRCVCEEGLTLDTSGRNCIDLRSYECFLDYSEGECSSPIPGL
YRNSVCCCSLGYSYGDQGRCYECPQEGSVEFDVLCPRGRGFADTRPRPDLLDGTVYINDI
NECSVYDGICKYGECTNIIGSYDCICDIGFAMDEFGYQCVDIDECRITFGACGNGSCENT
PGDFRCNCYEGFEAHPVMRTCMDIDECETIPGLCRGGSCTNLPGTFRCDCPLGQELTPDG
RACQDINECSISHGICSNGECHNIVGTYRCMCNPGFRPTANYRACEDMNECDMNNGGCDH
ICVNSQGSYECQCQSGYTLRMNGRSCVDVDECADIPDICGGGQCENQEGGYLCDCFTGFR
PSDDFRSCLDIDECSTDAAICISGVCKNTLGSYTCQCFEGYSMKPGIPGCSDIDECMLQM
HQCAMNSQCENTIGSFQCRCNPGFIVDENANICIDVDECESSNHDCHEYARCVNIPGSYQ
CQCNQGFVGDGLSCMDVDECMQNQALCVNGQCINNPGGYVCECEMGFYPTENRDSCEDID
ECSNFPDICVFGQCINVPGTFRCECNPGYMLDIGGGNCTDVNECEEPATYCVNGLCTNSM
GSYTCECPPNWVLSRDGTACTDVRTGLCYAHGPDTESRLDVNECSLLLGTNIQRTTCCCS
ELGTGWGDPCELCPLVNTTEFFLLCPYGIGRRVDVNSTRPVNEINQCRDFPNFCQGGECQ
QVEGSYRCVCPRGYEYDQEQMMCVDIDECQLSAYICGAGTCMNMEGSYTCMCPQGFMFMN
MPTGKNCMDIRELTCYLSYNTSVFPLPECGSPLMGSLTKKVCCCSALMAAAWGTRQECSP
CPAQMTEDYYRMCGATSPGHVVNPETGLPEDVDECSLIEGICANGICVNTPGSFRCDCRP
GYRANVAMHICEDIDECQEGMHRCVGNSICNNLEGNHECLCPRGYQRSVSGLSCDDINEC
LTIPDACINGQCTNQIGSYVCVCNQGFQLSADGTQCNDIDECFRFPDRCGNGTCQNVVGA
YACSCNRGFELTINGDCADINECATMAGTCPNGRCVNTPGSFFCDCVEGYVLSLSGLRCE
DENECITRFGVCENGRCDNTIGSFRCSCFDGFQLSPSGQECIDTNECAIIPDMCRNGVCQ
NTPGSFQCTCPDGFLLSSDGLICIDMRRSYCYNDFVGGQCTDARAGNATRKECCCSLGAG
WDSPCNLCPRVSDPNFIELCPDGPGYAPSVTPDLYEDINECKVFPGICENGICINTDGSY
RCQCQPGFILDTTGRICVDRDECQENYNVCGFNSTCYNTLGSFECNCGEGYQVGRRGTCE
DINECRRRRGQCAFRCQNLPGSFRCLCPKGYTLTDNGRHCRDLDECQTDLNTCRYRCKNL
IGKFMCLCDEGYTPIGGDGNNCRDINECMLNHGVCQNGRCRNTDGGYTCICNQGYTLGPS
GKECMDRRTGFCYAYVPPSGCEASLGGMQPVTMESCCCSGGRAWGPTCQICPVYGTIEYN
RLCTDATPVDPCRVVQGLCENGHCLGGSGGYLCQCNPGYILSPDGTRCEDENECNRVPPP
CSYQCKNTPGSFKCGCPQGYLLSEDGLTCREKDECSMGIHECQFECRNTLGGFRCVCPEG
YVQHGSTCIDVNECIQTPDICGTYGTCQNTQGGHRCECQRNFRPDPVTNTCVDINECEEQ
PDICQYGCQNTIGGYRCVCPDGFEENFYGRCIDYNECRQPGRCGQATCYNTQGSYQCGCN
NGYAFDQQNLACNDINECQGSYGNVNSPCQYSCQNTEGSFSCGCPPGYTSVVQGACVTDR
DSVQPCYHCNRNPRQRRSATETKDTDSASIISNNTALLYHVPLSQAIPKHQIAKFKTGYT
RQVARYEYVILKGNEDNIFMMKRKAEGMSLLRFSKNVKTTGLYELEIEGVLKRKNDTILA
EVQTLVEEPVAMQIQIQIVADEEG
NT seq
8535 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgctgcggtcatctttgcttgcggtcctggcgtgcctgtcgacggtggtattcgctcag
tcaaatgtcatcaatggcccaaatgtgtgtggtatgagattctattcgtattgttgtcct
ggatggcgtcttcatccgagaacaaaacagtgtgtggtccctatttgcaatcgtccgtgt
gggtcgggttactgtcagcgtccaaactcttgctcgtgtcccggtggacagatctcagtc
agtggatgtgatgggtacacaggtggaaacccatgtacagtacagtgtttgaatggaggc
tcttgtcaagggaactcctgcaactgtcctaatggcttctcaggaactaattgtggcacg
cccttgtgcaatccaccctgccagaatgggggtgagtgcagtggaggaaacaggtgctcg
tgccctcccggttttggtgggagtcaatgccagacagactacaggacaggcgtgtgctac
ctccaatcaccgaggaacggcatctgctcagatggagtggaaggactgcactgtaccaag
gcattgtgttgtgctaccattggacagggatggggagaccagtgtgaacactgtgatacc
tttgataatccatgcgacaggggatatattcttaatggaaggtctggccagtgcaaagat
gctgatgaatgcttgatgatcccaggtttgtgtgagggaggtcaatgcactaatacccca
ggatcatatgcctgccagtgtcctccgggctttgaactgagtatgactaccctagcatgt
gttgacattgatgaatgtcagacaggttacttgtgtcagaatggaagatgtataaacaca
caaggaagtttcagatgtgattgtaatccgggctacttcttgagtcaagatggccgccaa
tgcacggatattgacattcctcgcacccctgtcactcctgaagaaattggctattgttac
atgaggttccgtaacaggaactcccgtaccacatgtagtcaggagttggccgtgcgtatg
agcttcctagaatgctgttgctccgtggactacgctcagggctggggactgtccaggagt
gactgcagcccctgccgaacacagaccgaagaacttcaccgaagactgtgtgaaggtttt
gaacctaccacgtctctgccaaggagaacgcccgttaggcaaaccaagaccgacagaccc
gatccaacaggagatcctggagtggttaccctgagccctcccactgtcacccctccacgc
aaggtcacaccccgccctgaaggaatatgtgccatggtgcctaacatttgccgaaacggt
ctgtgcgtgtccttggggggagtcatggaatatcgttgtgattgttttgaagggtatgag
aatgctggcaggtatacttgccaagatatcaatgagtgtcgagacaggtcactttgtagg
tatggtacatgtgagaacacggatggcagcttccgctgtgtatgcccaagtggatacaag
ttgactctcgatcagaggtcgtgtgaagatgtggatgaatgccgtaccaatcccaatgta
tgtcaccatgggacatgtatgaatatcattggctctcacacatgcgattgctttgaaggc
tatcaaaaatcgatagacggacgttactgcattgatattgatgaatgcacattgggtact
catagatgtaggaacgctgaatgcgagaatcttgcaggtacttatgaatgcatctgcaca
gaaggctatgaagctattggatcatctggagtctgtattgacgtgaatgaatgcgcccag
gagatcaatccatgtccactcggtttctgtatcaacacactgggaggctaccaatgccag
tgccctgtagggtacgcaacaggacaagatggcacttgcgttgagaaccgccgtggtttc
tgcttccaggatggggaccttggccgatgcacccaccagtccatgggccagatgaccatc
tcatcctgctgctgcagcgctgtccttctcaacgaggccctgagctggggacccaactgt
gaatcctgcccgcctcagggtacccttcagtttgagcagctctgcagacatggcattggc
ttcaccagccagaggatcaatatcaacgagtgtacactgttcaacaatctatgtgacaat
ggtgtatgtgaggacctgactggtaactacaagtgtaggtgcaactctggattccagccc
caagcggatggcaaggagtgtattgatgagaacgagtgttcatacaacagactactctgc
cacaatggtgcttgccgtaatacccctggaagctttgtgtgtgaatgccctgatggttat
gaattggatgcaaggagctcaatttgtcaagatatcaatgagtgtgagaatcctagtctc
tgcaacaatggtcgctgtatcaacactagagggagctatcgttgtgaatgcatctatcca
ggcactgagctagaccctactggaaccatttgtgttgataatcgcatcgcaacttgctgg
acccgcatcagcaacggtcagtgcgaggcggacatcatgggacccatgaggagagatgaa
tgctgctctacctttggccgtgcatggggtagtccttgcgaagcctgccctcttgctgtt
ggggactgtcctcgtggcttttctgagatcagtggtgaatgtgttgatctgaatgaatgt
gatctgaatccaatggtgtgcaacaatgggctttgtgagaataccatgggatcctaccgc
tgcgtgtgtgaggagggtctcacccttgatacatcaggcagaaactgtattgaccttcgt
tcttatgaatgtttcctggactactctgagggtgaatgctccagccctatcccaggccta
tacagaaactcggtatgctgttgctcactgggatattcctacggtgaccagggaaggtgc
tatgagtgcccacaggagggaagtgttgaatttgatgtcctttgtccaagaggacgtggc
tttgctgacactcgaccacgccctgatcttttggatggcactgtttacattaatgacatc
aacgaatgcagtgtttacgatggaatctgtaaatacggagagtgcaccaacatcattgga
tcatatgactgcatatgtgatattggattcgctatggatgagtttggttatcaatgtgtt
gatattgatgagtgtagaatcacattcggtgcctgtggtaatggatcgtgtgagaatact
ccaggtgacttcagatgtaactgctatgagggatttgaagcccatcctgtcatgcgcacc
tgtatggatattgatgagtgtgaaacgataccaggactctgccgtggcggttcctgcacc
aacttaccaggaaccttcagatgcgattgtcccctgggacaggagctgacaccagatggt
cgcgcttgccaagatatcaatgaatgctccataagccatgggatatgctccaacggtgaa
tgtcacaatattgttggtacctaccgatgtatgtgcaacccgggtttcagaccaactgct
aattacagagcatgtgaagatatgaatgaatgcgacatgaacaacggcggttgcgatcac
atctgtgtcaactcacaaggaagctacgaatgccagtgccagtctgggtatacactgaga
atgaatggcagatcgtgtgttgatgttgacgagtgtgctgatattcctgatatctgcggc
ggtggacaatgtgagaatcaagaaggagggtacctctgtgattgcttcacaggattcaga
ccatctgatgacttcaggagctgtctagatattgacgaatgtagcacggatgctgccatc
tgtatttctggtgtgtgtaagaatacccttggatcctacacatgtcagtgctttgaagga
tactccatgaaaccaggcattcctggatgctcagacattgatgaatgtatgcttcagatg
caccagtgtgccatgaactcccagtgtgaaaataccattggctccttccagtgtcgctgt
aatccaggattcattgttgacgagaatgccaatatatgtatagatgtggatgagtgtgaa
agctccaaccatgattgtcacgaatatgctcgctgtgtgaacatccccggctcctaccag
tgccagtgtaatcaagggtttgtaggagatggtctgtcatgtatggatgtggatgaatgc
atgcagaaccaggctctgtgtgtcaacgggcagtgtatcaacaatcctgggggctatgtg
tgtgaatgtgaaatgggtttctatccaactgaaaacagagacagctgtgaagacattgat
gaatgctccaacttccctgatatctgtgtgtttggtcagtgcatcaatgttccaggtacc
ttccgctgtgagtgtaacccaggctacatgcttgacatcggaggaggcaactgcacagat
gtgaatgaatgtgaggagcctgcaacatactgtgtaaatggtctctgcacaaactctatg
ggatcctacacttgcgagtgtcctccaaactgggtgctttctcgtgatggaacagcatgt
actgacgtgaggactggtctgtgctatgcccatggcccggatacagagtctcgacttgat
gtgaacgaatgcagtctactcctgggtactaacatccaaaggaccacgtgctgctgctcc
gagcttggcacaggctggggtgacccatgtgagctgtgtcctctcgtcaataccactgag
ttcttcttgctctgcccctatggaattggtagaagggttgatgtcaactctacccgccca
gtcaatgaaatcaatcaatgccgagactttcccaacttctgccaaggtggggaatgccag
caggtagaaggatcctatagatgtgtgtgtcccagaggatacgagtacgaccaggaacag
atgatgtgtgttgatattgatgaatgccagctgagcgcgtatatatgtggtgccggaaca
tgtatgaatatggaaggcagttacacctgtatgtgtccacaagggttcatgtttatgaac
atgcctactggaaagaactgcatggacatccgagagctgacgtgttacctgtcctacaac
acttccgtattccccttgccggagtgtgggagtcctctgatgggtagtcttaccaagaaa
gtgtgttgctgtagtgcactgatggccgccgcatggggtaccaggcaggagtgctctcct
tgtccagctcaaatgacagaggactactacaggatgtgtggtgccacctcacctggccat
gtcgtcaacccagagactggactccctgaagatgttgatgagtgctccctcatcgagggc
atctgtgccaatggtatttgtgtgaacacgcccggaagtttccgctgtgattgtcgacca
ggctaccgggcaaacgttgccatgcatatatgtgaagacattgacgagtgccaggaaggc
atgcaccgatgtgtaggaaactctatttgtaataacctggaaggcaaccatgaatgcctg
tgtcctcgcggctaccaacgctctgtatctggactgtcctgtgatgatatcaacgaatgc
ttgaccataccggatgcctgtataaacggccagtgcaccaaccaaattggttcctatgtg
tgtgtctgtaatcaaggatttcaactgtctgcagatgggactcaatgcaatgatattgat
gagtgtttccgcttcccggaccgttgtggaaacggcacctgtcagaacgtggtgggagcc
tatgcctgcagctgcaaccgagggtttgagctcaccatcaatggagactgcgcagatatc
aatgagtgtgccacaatggctggaacatgccccaacggtcgctgtgtcaataccccggga
agcttcttctgtgattgcgtcgagggatatgttctttcactatccggactccgatgtgaa
gatgagaacgaatgcatcacaaggtttggtgtgtgcgagaacggtcgctgtgataacacc
attggtagcttcaggtgttcttgctttgacggattccagctctcaccttccggtcaggag
tgtattgatacaaatgagtgtgccattatacctgacatgtgccgtaatggagtgtgccaa
aatacaccaggaagtttccaatgcacctgcccagatggcttccttcttagcagtgatggt
ctcatatgtattgatatgcgtaggagttactgttacaatgatttcgttggaggtcagtgt
actgatgccagggcaggcaatgctacccgtaaggaatgctgttgctctctgggtgccggc
tgggattcaccatgtaatctctgcccaagggtctcagatcctaacttcattgaactttgc
ccggacggtcctggttatgcccctagtgtgaccccagatctctatgaagacatcaacgag
tgcaaggtgttcccaggaatctgtgaaaacggtatttgtatcaacacagacggttcttat
cgctgccagtgtcaacctggattcatcctcgataccaccggtcgcatctgtgtcgatcgt
gatgagtgtcaagagaattacaatgtgtgtggtttcaattcgacgtgttacaacactctt
ggatcgtttgaatgtaactgtggagagggataccaagtaggaaggagaggtacctgtgaa
gatatcaacgaatgtcgtcgaaggagagggcagtgcgcattccgctgtcagaacctccct
ggttccttccgatgcctttgccccaaagggtacacacttactgataatggcaggcattgt
agagatttggacgagtgtcagacagaccttaacacctgccgctaccgctgcaagaatctc
attggcaagttcatgtgcttgtgtgatgaaggctacactcctattggaggagacggaaac
aactgcagagatatcaatgagtgtatgttaaatcatggcgtgtgtcaaaatggccggtgc
aggaataccgatggtggctacacatgtatctgcaatcaaggatacaccctcggtccctct
ggcaaagaatgcatggaccgtcgcactggtttctgctatgcctacgtgccacccagtgga
tgtgaggctagcctaggaggtatgcagccggtcaccatggaatcatgttgctgcagcggt
ggaagggcctggggtcccacctgccagatatgccctgtatatggaacaatcgagtacaac
cgtctttgcactgatgccacgcctgtagatccatgtcgggttgttcagggattgtgtgaa
aacgggcactgtctcggaggatcaggcggatacttgtgccagtgtaatccaggctacatt
ctcagcccagatggcacaagatgtgaagatgagaatgagtgtaaccgagtaccccctcca
tgcagctaccagtgtaagaatacaccaggaagctttaaatgcggttgcccacagggatat
ctactcagtgaagatgggctcacatgtagagagaaagatgaatgctcaatgggaatccat
gaatgccagtttgaatgtaggaatactctaggagggttccgatgtgtctgccctgaagga
tacgtgcaacatggatccacgtgtatagatgtgaacgagtgcattcagactccagatatc
tgcggtacgtacggtacttgtcagaacacacaaggtgggcataggtgtgaatgccagaga
aacttcagaccagatccagtcactaatacctgcgttgatatcaatgaatgtgaagagcag
ccagacatctgtcagtatggctgtcagaataccattggaggctacaggtgcgtctgtcca
gacggctttgaagaaaacttctacggaagatgtattgattacaacgaatgcagacagcca
ggtcgatgtggtcaagctacctgttataacactcagggcagctaccaatgtggatgtaac
aatggatatgcatttgatcaacagaacctcgcttgcaatgatatcaatgagtgtcaagga
tcatatggtaatgtgaacagtccctgtcagtatagctgccagaacacagagggtagtttc
tcatgtggttgtcctcctggatacaccagtgtagtacaaggagcctgtgtgacagatcga
gattctgtccaaccttgctaccattgcaacaggaaccccaggcagcgcagaagtgccaca
gagaccaaagacactgactcagcatcgatcatatccaacaacactgcccttctttaccac
gtcccgctttcacaagccattcccaaacatcaaattgccaaattcaagaccgggtacacc
aggcaggttgctcgttatgagtatgtaatcttgaagggcaacgaagacaacatcttcatg
atgaagaggaaagcagagggcatgtccctgctacgattcagcaaaaacgtgaagaccaca
ggtctctacgaactcgagattgaaggtgtgctgaagaggaaaaatgatacaatattagcg
gaagttcaaactctagtggaagagcccgtagccatgcagattcaaattcaaatagttgct
gatgaagaaggatag
DBGET
integrated database retrieval system
