Lytechinus variegatus (green sea urchin): 121422629
Help
Entry
121422629 CDS
T11173
Name
(RefSeq) LOW QUALITY PROTEIN: neurogenic locus notch homolog protein 1-like
KO
K02599
Notch 1
Organism
lvg Lytechinus variegatus (green sea urchin)
Pathway
lvg04330
Notch signaling pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lvg00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
04330 Notch signaling pathway
121422629
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EGF
hEGF
EGF_TEN
EGF_2
EGF_CA
EGF_Teneurin
CUB
EGF_3
CUB_M02D8_5_2nd
EGF_DL_JAG
CDCP1_CUB_6
GPR128_N
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
121422629
NCBI-ProteinID:
XP_041473725
LinkDB
All DBs
Position
10:complement(19292513..19347973)
Genome browser
AA seq
2065 aa
AA seq
DB search
MGKLNMAVMKLILVISCFMLPLVASQGCTTNFCSFGGTCLERPFEENPLCICPPGTHGPT
CSEFQLGTCDGQTPGEYTINQTSGTLLSPNYPNQYPDSSYCSYFIVFPGAQQIRLSFNVI
DVEEIKDDVIIGAGQTLSFDVSNFSLDGFGGRMXILFANDELFDEPDETIPSDVVWVWLI
TDKTDPGAPYKGFNISFLVDLDECQFNPDICAPGSTCEDLEFSYRCNDIDECQSNPCING
GTCNNLENAFRCDCPSGYSGERCDIVIDPCLSNPCVASQTATCLNQVTRYECVCVPGYTG
VNCQTEIDECGSSPCQNGAICTDLINSYECRCAAGYTGPTCDQNINDCNPNPCLNGGSCT
DLVNGYSCQCAVGFTGTNCETNINDCVPNPCQNGAACSDLVNGFFCICVLGYTGNTCDIN
INDCSPDPCVNGQCTDLINGYRCTCDAGYTGANCDQNINECSPDPCVNGQCTDFINGYQC
TCDPGYTGVDCVININDCLPDPCVNGACTDLVNGYRCTCISGYTGEDCDININECQSAPC
LNGGMCVDLVSMYRCDCLAGFTGVHCGTNIDDCTPNTCSNGGTCVDQINGFICNCPQGFQ
GLRCEINIDDCLPNSCNNQGICNDNVNGFTCTCFAGWTGTFCLISVDDCVPQPCLNGGSC
VDGHVSFTCNCLPGYSGTTCEINDNECASNPCRNNGACTDGINSYTCSCLPGYTGVNCQT
NIDECQPNPCLNGGNCIDEVNGFRCSCTAGWTGVVCNQDIDECASGPCVNGATCQNGQNM
FTCICAPGYTGTICSQDINECVVNNNPCGSFGFCNDGRNIYTCTCIPGYTGVNCDTEIDL
CINDPCSSSSTCVNFRTYYECQCAPGYEGANCDININDCIGEPCNFGVCQDLINDYNCIC
DAGWTGRNCEINIDECASNPCLNGGICRDRVNGFECICTTAYEGVICADEVNPCLSNPCL
NGGACNDLDTYFTCDCVAGYSAYDCSVDINECSSGPCRNGAQCTDLVADYRCACLPGYSG
KQCGEDINECLSRPCQNGGECVDQVNSFVCRCRPGYTDNLCQTNINECASSPCLNGGTCR
DQINKYVCDCPVEWTGDRCETSARFCFSAPCQNGGTCKEGEDDFSCICAQGWTGDICTED
IDECLILDSPCFNGGTCINGPNVNEFTCFCTSAWTGDRCEINVDECLSSPCMNGGSCTDQ
VGGYTCACPPAWTGPRCLIEVQFCISNPCENGGTCTDENNGYRCTCAAGYQGIRCGVEID
ECLTTVQPCSSNGICNDLVNGFSCTCFSGWTGDRCQIDIDECESLPCQNGGQCQDRENFF
ECVCPTGYSGVLCEINDDNCNPVNPCQNGGICTDEVNGFTCQCATGFTGTTCATNIDDCL
LNSGTSNPCLNGGVCIDGINVFTCLCLSGYTGTLCDIVIDTCNPNPCMNGAACTPDINTF
TCTCMPGYRGTLCEIDIDECSSNPCLNGGQCTDGVNMFLCSCPSGWTGPRCEIEGPCSAN
YSLTDLTMAVDIVSPNYPANYPNNEECLWFISAPNGKHIYVEVINFNTERLYDVVTIGNL
LNINDLGSAIIDTSGNMEQTGTERPPPFLSTGEVVWARFVSDGTKTEDGFTIRFSLRDEA
DLMDECQASSTGPCMNGGTCINSINNYTCQCDRYFTGPNCEIEIEINFCASDPCPAGTHC
ESGDGSFVCLCPSDIEDDQCEIIAIDERAPCDSSPCANGGTCMESGSGYTCECTPEWTGV
SCNTDIDECNSSPCVNGGTCINLSGAFECRCCDSLFSGVLCEIVIADTVCDSNPCMNDGV
CIRPEGDTTGQYICQCRSGYIGANCEDEIDECASNPCLNGYECTDLVDGFECNCPENMGR
TCRGSNCLPLPCRNGGTCRELVGDFLCTCADGWTGETCTLVEGTVCNSNEIDSCLNGATC
IQQNGRTRCVCAPGYSGTDCSDVIVINRCDRRTCLNGTCNNEECICDPGFEGDYCEKDID
ECLSNPCENGGSCFDGVNGVTCACEAGFSGELCRQQFLTAPTDPTDASLEQEWVVVFAVL
GTLAFILLVLLLIGCVYFSGKEDRS
NT seq
6198 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggggaaacttaacatggccgtgatgaaattgattttagtgatttcctgcttcatgctg
ccattggtagcatcgcaaggttgtacgactaacttttgttcttttggtggaacatgtctg
gagagaccttttgaggaaaacccgctgtgcatatgcccaccagggacacatggaccaact
tgttctgaattccaactagggacatgtgatggtcaaacccctggggaatataccattaac
cagacaagtggaacgctgctatcaccgaactatccgaaccagtatccagatagttcttac
tgttcatactttatcgtcttccctggagctcaacaaatccgattgagtttcaacgtcatc
gacgtcgaagaaattaaagatgacgtcatcataggtgctggtcaaacgctttcttttgat
gtaagtaattttagccttgacgggtttggtggaaggatgtagatactgtttgctaacgac
gaattgtttgatgaacctgatgagacgattccttctgatgttgtatgggtgtggttaatc
accgacaaaacagaccctggagcgccatataaaggatttaatatttcgttcttggttgat
cttgacgaatgtcaattcaaccctgatatctgcgcacctggatctacctgtgaggatttg
gaattttcttatcgatgtaatgatatcgacgagtgtcaatccaatccctgtataaacggc
ggtacttgcaataatttagaaaatgcattcagatgtgattgcccgtccggctattccggt
gaacgatgtgacatagttattgatccgtgtcttagcaatccttgtgtggccagccaaaca
gctacttgtctcaaccaggttacacgctatgaatgcgtatgtgttcctggttacacgggt
gtaaattgccagactgaaatcgacgagtgcggttctagtccatgccaaaacggcgccatt
tgcacagaccttatcaattcctatgaatgtcggtgcgccgctgggtacaccgggcccacc
tgcgatcaaaatattaatgactgcaacccaaatccttgcctaaatggaggctcatgtacg
gacttagtcaatggttactcttgccaatgtgctgtcggatttacgggaacaaactgtgaa
acaaatatcaacgactgtgtgccgaacccatgtcagaatggagcagcgtgttcggatctt
gttaatgggtttttctgtatctgtgttcttggatacactggaaatacctgtgatataaat
atcaacgactgctcgccagatccttgtgttaacggacaatgtacagacttgattaacggt
taccggtgtacatgcgacgcaggatatactggtgcgaattgcgaccaaaatatcaacgag
tgctccccagatccttgtgttaacggacaatgtacagattttatcaatggttaccagtgc
acatgtgacccaggatatactggtgtggattgcgtcataaatatcaacgactgtttgcct
gatccatgcgttaacggtgcttgtacagacttggtcaacggatacagatgcacatgtatt
tctggttatactggagaggattgtgacatcaacattaatgagtgtcagtctgctccatgt
ttgaatggcggtatgtgtgtagacctggtaagcatgtataggtgtgactgtctggctgga
tttacaggagttcactgtggcacaaatattgatgactgtactcccaacacttgcagtaat
ggaggaacttgtgtagatcaaataaatgggttcatctgcaactgtcctcaaggatttcaa
ggacttcgttgtgaaattaatattgatgactgtctgcctaatagttgcaacaatcaagga
atctgcaatgacaatgtcaacggatttacatgcacctgtttcgctggttggactggaacc
ttttgcctgatatccgtggatgactgcgtcccccaaccctgtctaaatggtggctcatgt
gtagatggtcatgtatcatttacatgcaactgtttgcctggctactctggaactacttgt
gaaataaatgacaacgagtgtgctagtaatccatgccgaaataacggagcctgtacagac
ggcatcaattcatacacgtgttcctgtctccctggatataccggtgttaattgtcaaacc
aacatcgatgagtgccaaccaaatccctgcctcaatggaggaaattgcattgatgaagtc
aatggctttagatgttcttgcacagctggatggacaggggtggtatgtaatcaagatatc
gacgaatgtgcgtccgggccatgcgtgaatggagctacttgtcagaatggacagaatatg
ttcacctgtatttgcgcccctgggtacacaggaactatatgttcgcaagatatcaatgag
tgcgtagtaaataacaatccatgtggctcatttgggttttgtaacgacggcagaaatatc
tacacctgcacctgcattcccggatacactggagtcaattgcgacactgaaatcgacctg
tgtataaacgacccatgttctagtagctcaacatgtgttaacttcaggacttactacgaa
tgccaatgtgctccaggctacgagggtgccaactgcgatataaatatcaatgactgtatt
ggagaaccttgtaattttggtgtatgtcaggatctgattaatgattacaactgtatttgt
gatgctgggtggacaggcagaaactgtgaaataaatatcgacgaatgtgcaagtaatcca
tgcttaaatggaggaatatgcagagatagagttaatgggtttgaatgcatctgcaccact
gcatacgaaggcgtgatctgcgcagacgaggtcaacccgtgtctatctaatccttgctta
aatggaggagcctgcaacgatctggacacttactttacatgtgattgtgttgcgggctat
agtgcatatgactgctcagtggacataaacgaatgttcaagtggtccttgccggaatgga
gctcaatgtactgatcttgttgctgactacaggtgcgcctgcctcccaggatactctgga
aaacagtgtggagaggatatcaatgaatgtttgtctcggccttgtcagaatggtggggaa
tgtgtggatcaagtcaattcttttgtttgccgctgtcgaccaggctatacggataatttg
tgccaaacaaatattaatgaatgtgccagtagcccgtgtctgaatggtggtacctgccgt
gatcagatcaacaagtatgtatgtgactgcccagtggaatggactggagaccgttgtgag
acaagtgcccgattttgtttcagtgcaccctgccaaaatgggggaacgtgtaaggagggc
gaggatgacttcagttgcatttgtgcacagggctggactggcgatatttgtactgaagat
attgacgaatgtctaattttggattcaccatgctttaatggagggacgtgtatcaatgga
cccaatgtgaatgagttcacttgtttttgtacctcggcttggacaggcgacagatgtgaa
atcaacgtcgacgaatgtctgagtagcccttgtatgaatggtggatcttgtacggaccag
gttggtggctatacatgtgcctgcccaccggcatggactggaccacgctgcctgatagag
gtgcagttttgtatcagcaacccttgtgaaaatggtgggacctgtacggatgagaacaat
ggctataggtgcacctgtgctgctggataccaagggattcgttgtggagttgagattgat
gagtgcttaaccactgtgcaaccatgtagctccaatggtatctgcaatgatctggtgaac
ggcttctcctgcacttgtttcagtggatggacaggcgatcgctgccaaatcgatatcgat
gagtgtgaaagtttaccttgccagaatggtggacagtgccaggatagggagaacttcttt
gaatgtgtttgtcctaccggttatagtggtgtcttatgtgaaatcaacgatgacaactgc
aatccagtcaatccttgtcagaatggtgggatttgtacggatgaagtcaacggatttacc
tgccaatgtgctactggattcacaggcactacatgtgcaacaaacattgatgactgtttg
ttgaacagtggaacatccaatccatgtctgaatggcggagtgtgcattgatggcattaat
gtattcacttgcctctgccttagtggctataccggtactctctgtgacatcgtaattgat
acatgcaatccgaacccgtgcatgaatggtgctgcttgcactcctgatattaatactttc
acctgtacgtgcatgcctggatacagaggaacgttatgcgagatagatattgatgaatgc
tcaagcaacccttgtttaaatggaggacaatgtactgacggcgttaacatgttcctctgc
tcctgtccttctggatggactggtccaagatgtgaaattgaaggcccatgtagcgcaaac
tattctctgaccgatcttaccatggccgtcgatattgtctcgcccaattatcccgccaac
taccccaacaatgaggagtgtctctggttcatctccgctcccaacggcaagcatatctat
gttgaggtgatcaatttcaacaccgagcgcctgtacgatgttgtcactatcgggaacctg
ttgaatatcaatgacctggggtcagccataatcgatacatcagggaacatggagcagact
gggactgagaggccacctcctttcctttctacaggagaggttgtctgggccaggtttgtc
tctgatggcacaaagaccgaggatggcttcactatccgcttttctctgagagacgaagca
gatttgatggatgagtgccaggccagcagtacaggaccctgcatgaatgggggtacttgt
atcaattctataaataattacacttgtcagtgtgaccgctactttactggccccaactgt
gaaatcgaaatagaaataaacttttgtgcaagtgacccatgcccagctggtacccactgt
gaaagtggagatggttcttttgtctgtctctgtccatcagacatcgaagatgatcaatgt
gaaattattgctattgatgagagagctccttgtgattcatcaccttgtgcaaacggaggt
acatgcatggaatccggttcgggctatacctgtgaatgcacacctgaatggacaggcgta
tcctgcaacactgatattgatgagtgtaacagttctccttgtgtaaatggaggcacttgt
ataaacctgagcggtgcttttgagtgtaggtgctgtgattcgctcttctctggggttctt
tgtgaaatcgttattgctgacactgtctgtgattccaatccatgcatgaatgatggagtg
tgcatacgccctgagggggatacaacgggtcaatacatctgccagtgtaggtcgggctac
atcggggctaactgtgaagatgagattgacgagtgtgccagtaacccatgtctcaacgga
tatgaatgcactgatctggttgatggctttgaatgtaactgccctgagaacatgggaaga
acatgccgtggaagtaactgcctccctctaccatgccgaaatggaggtacttgccgtgaa
ctcgtgggggatttcttgtgcacatgcgcagatggatggacaggggaaacgtgtaccctc
gttgaaggcactgtctgtaacagcaatgagatcgacagttgtctaaatggtgccacatgc
atccagcagaatggaaggacaagatgtgtgtgcgcgccaggatatagcggaactgattgt
agcgatgttattgtaatcaacagatgtgacagaagaacatgtctaaatggaacatgtaac
aacgaagaatgtatttgtgaccctggatttgagggagactactgtgaaaaggatattgac
gaatgtctcagcaacccttgtgaaaatggaggatcatgttttgatggagtgaacggtgtc
acgtgtgcttgtgaagccgggttttctggtgaactatgccgacaacagtttttaacggcc
ccaaccgaccctactgacgcttcgctcgagcaagaatgggtcgttgtttttgctgtattg
gggactttagctttcattctcctagtccttctccttatcggatgtgtctacttctctggg
aaggaggaccgatcttaa
DBGET
integrated database retrieval system
