KEGG   Lytechinus variegatus (green sea urchin): 121422786
Entry
121422786         CDS       T11173                                 
Name
(RefSeq) fibropellin-1-like isoform X1
  KO
K02599  Notch 1
Organism
lvg  Lytechinus variegatus (green sea urchin)
Pathway
lvg04330  Notch signaling pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:lvg00001]
 09130 Environmental Information Processing
  09132 Signal transduction
   04330 Notch signaling pathway
    121422786
SSDB
Motif
Pfam: EGF hEGF EGF_TEN EGF_CA EGF_3 Avidin FXa_inhibition CUB EGF_2 cEGF EGF_Epiregulin Gurken_M EGF_TGFA-like
Other DBs
NCBI-GeneID: 121422786
NCBI-ProteinID: XP_041473909
LinkDB
Position
10:complement(18690614..18740153)
AA seq 1526 aa
MASDNVLNTACGLCIFLFLFSAVTAQDPCDSGPCVSPSTCVSGGGRFLCLCTFVTRGDTT
TFYHGTTCNETYQSSCGQTFSSATGEILSPSYPADYPPNQECYYLIRILGALGITFYVND
IATENTDTVTIGKGPSVLLEGTRLNSSGEFVTVNSDQAWISFISDRDTTFRGFNITYEAD
TDDCQDDPCNNNGTCTDLVYDYECSCADGWTDRNCTTDIDDCAGVSCNLVGICQDMVNGF
ICNCTTGFTGTFCETNIDECTPNPCQHGSTCHDGIGGYSCSCAPGYTGTECEVDIDECAS
NPCTPGGRCRDLVNQFKCICDLGLTGTRCDTDIPECASEPCRNGGTCTEGNLNTYMCTCA
PGFTGPTCREDINECASNPCRNGGACSNEINRFTCDCPSGFNGTTCQSNINECSSNPCQN
GGTCIDEINGYRCDCLNGFNGSDCQSNIDECAQDPCFNGATCTDGIGGFTCSCAPGFTGT
TCSVDINECASTPCQNGGTCRDGVNGYTCDCVAGYTGSHCTSNINECASTPCRNGATCVD
GVNGFTCVCVAGYTGLQCLSNINECASTPCQNGATCVDGVDGFTCVCVAGYTGLQCLSNI
DECGSNPCQNGATCMDEVNGYICNCVAGYTGSHCASNINECGSNPCQNGGICIDEINGYR
CDCLNGFNGTNCQSNINECGSNPCQNGGICIDEINGYRCDCLNGFNGTNCQSNIDECAQD
PCFNGATCTDGIGGFTCICLSGFTGATCSIDINECGNNPCQNGGLCTDEVNGYQCDCPIG
FNGSNCQSNIDECAQDPCFNGATCTDGIGEFTCTCAPGFTGTTCSTDINECGSNPCQNGG
LCTDEVNGYQCDCPIGFNGSNCQSNIDECAQGPCLNGATCTDGIGGFTCSCAPGFTGITC
AVDINECGSTPCQNGATCQDGINGYTCDCAAGYTGSQCASNINECASTPCQNGATCMDEV
NGYSCDCIAGYTGSHCASNINECGSNPCQNGGICIDLINEYRCDCLNGFNGSNCQFNIDE
CSSTPCQNGATCMDEVNGYSCDCVAGYTGSHCASNINECGSNPCQNGGICTDLINGYRCD
CPIGFNGSNCQSNIDECAQDPCSNGASCTDGIGGFTCTCALGFTGITCAEDINECGSNPC
HNGATCQDEINGYSCDCLPGYTGSQCASNIDECASNPCENGACTDEINGYRCDCLNGFGG
PNCESNIDECSHNPCLNGATCTDGIGGFTCTCALGFTGTTCEEDVDECASNPCQNGGTCF
DEINRYSCECPSGYTGMECNSDLNECESNPCLNGGTCEDGVNGFQCRCLQGYYGNNCASV
SNVCTSWSCLNGGTCLGLVPGSMEYICTCPAGYVGNRCEFEINECSSLPCQNGGTCVDGV
NSYHCDCRPGYTGINCRIVGYCNISGIWYNECNDYVNITQTTSGLLLGEYVADIEGSINS
WPNGILIGYSSIQCQLPSFGFTVDHAGGERTTAWTGQCRLCEEEILYTTWTSVKKADSCR
GIKKSFKTGLDRWTRYKQSLAPARQP
NT seq 4581 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggcctctgacaatgttttgaatactgcttgtggattatgtatatttctgttcctgttt
tctgccgtaacagcacaagatccttgtgatagcggtccttgtgtttctccttctacatgc
gtgtctggagggggtcggttcctttgtctatgtaccttcgttaccagaggagacactact
accttctatcacggaactacatgcaacgagacatatcaatcgtcttgtggtcaaacgttt
tcctcggctaccggcgaaatcttgagcccgtcgtatcccgctgactacccaccgaatcaa
gagtgctattatctaatcaggatccttggtgctcttggcatcacgttctacgtaaatgac
attgccactgaaaatacagacacggtcaccattggaaaagggccaagtgttcttttagaa
ggaactcgtttaaattcgtctggagaatttgtcaccgtaaactctgatcaagcatggatc
tcatttatatcggatcgagatacaacgttcaggggattcaacatcacatatgaagcagat
acagacgattgtcaagacgacccatgtaacaataatggaacgtgcaccgatttagtttat
gactatgaatgttcatgtgcagatggttggaccgacagaaactgtactacagatatcgac
gattgtgcaggagtatcttgtaaccttgttgggatctgtcaggacatggtcaatggattt
atctgtaattgtacaactggattcactggcaccttctgcgaaacaaatatagatgaatgt
acaccgaacccctgtcaacatggttctacgtgtcatgacgggattggtggatattcttgc
tcatgcgcaccaggctacaccgggacggagtgcgaagtagatatcgatgaatgcgcgtcc
aatccgtgtacgcccggtggtcgatgcagagatttggttaaccaatttaaatgcatatgt
gatcttggtttgacgggaaccagatgtgacactgatatcccagaatgtgcgagcgaacct
tgtagaaatggaggaacgtgcacggaaggcaatctgaacacctacatgtgtacctgtgct
cctggttttaccggaccaacctgtcgggaagatatcaatgaatgcgcaagcaacccttgt
cgaaacggaggagcatgttcgaatgagatcaacagatttacatgtgattgcccatcgggt
ttcaacggaacaacttgtcaatcaaacattaacgagtgtagcagtaacccttgtcaaaat
ggtggcacttgcatagatgaaatcaatggatatcgatgtgactgcctcaatggcttcaac
ggatctgattgtcaatcaaatatagacgaatgtgctcaggacccttgttttaatggagct
acgtgtacggatgggattggaggattcacttgctcgtgtgcaccaggatttacaggaaca
acatgttcagtagatattaacgaatgtgcaagtaccccctgtcaaaatggagggacctgt
agggatggagtcaatggttacacctgtgattgtgtagctggttacactggatcacattgc
acatcaaatatcaacgaatgtgcgagtaccccctgtcgaaacggagcgacctgtgtggat
ggagttaatggtttcacctgtgtttgtgtagctggttataccggattacaatgtctatca
aatatcaacgaatgtgcaagtaccccctgtcaaaacggagcgacctgtgtggatggagtc
gatggtttcacctgtgtttgtgtagctggttataccggattacaatgcctatcaaatatc
gacgagtgtgggagtaacccctgtcaaaatggtgcgacctgtatggatgaagtcaatggt
tacatctgtaattgtgtagctggttacactggatcacattgcgcatcaaacatcaatgaa
tgcggcagtaacccttgtcaaaatggtggcatttgcatagatgaaatcaatggatatcga
tgtgactgcctcaatggattcaacggaactaattgtcaatcaaacatcaatgaatgcggc
agtaacccttgtcaaaatggtggcatttgcatagatgaaatcaatggatatcgatgtgac
tgcctcaatggattcaacggaactaattgtcaatcaaatatagacgaatgtgcccaagac
ccgtgtttcaatggagctacgtgtacggacgggattggaggattcacttgtatttgttta
tcagggtttacaggagcaacatgttcaatagacattaatgagtgtggcaacaacccttgt
caaaatggcggcttatgcacagatgaagtcaatggatatcaatgtgactgccccattggc
ttcaacggatctaattgtcaatcaaatatagacgaatgtgctcaggacccttgttttaat
ggagctacgtgtacggatgggattggagaatttacttgcacatgcgcaccagggtttaca
ggaacaacatgttcaacagacattaatgagtgtggcagcaacccttgtcaaaatggcggc
ttatgcacagatgaagtcaatggatatcaatgtgactgccccattggcttcaacggatct
aattgtcaatcaaatatagacgaatgtgctcagggcccttgtttaaatggagctacgtgt
acggatgggattggaggattcacctgctcgtgcgctccaggatttacgggaataacatgt
gcagtagatataaacgagtgtgggagtaccccctgtcaaaacggagctacctgtcaggat
ggaatcaatggatacacctgtgattgtgcagcaggctataccggatcacaatgcgcatca
aatatcaacgaatgtgcaagtaccccctgtcaaaacggagcgacctgtatggatgaagtc
aatggttacagctgtgattgtatagctggttatactggttcacattgcgcatcaaatatc
aatgaatgcggcagcaacccttgtcaaaatggtggcatttgcatagacttaatcaatgaa
tatcgatgtgactgccttaatggcttcaacggatctaattgccaatttaatatcgacgag
tgttcaagtactccttgtcaaaacggagcgacctgtatggatgaagtcaatggttacagc
tgtgattgtgtagctggttacactggatcgcattgtgcatcaaacatcaatgaatgcggc
agtaacccttgtcaaaatggaggcatttgcacagacttaatcaatggatatcgatgtgac
tgccccattggcttcaacggatctaattgtcaatcaaatatagatgaatgtgctcaggac
ccctgttctaatggagcttcgtgtacggatggaataggaggatttacttgcacatgcgca
ttagggtttacaggaataacatgtgcagaagatataaacgagtgtgggagtaacccctgt
cataacggagcaacctgccaggatgaaatcaacggttacagctgtgattgcttaccagga
tataccggatcacaatgcgcttcaaatattgacgaatgcgccagtaatccttgtgagaat
ggagcttgcactgatgaaatcaatggatatcgatgtgattgcctgaatggcttcggtggg
ccgaattgtgaatcaaatatagacgaatgttctcacaacccgtgcttgaatggagctacg
tgtacggatgggattggaggatttacttgcacatgcgcactaggatttacaggaacaacg
tgtgaagaagatgtcgatgagtgtgcatccaacccatgtcaaaatggcggaacctgcttt
gatgaaatcaatagatatagctgtgaatgtccgtctggttatactggaatggaatgcaat
tcagatttaaatgaatgcgaaagtaatccgtgtcttaatgggggtacatgcgaggacgga
gtcaatggcttccagtgtagatgcttgcagggatactacggcaacaattgtgcttcagtt
tctaatgtctgtacgtcatggtcatgcttgaatggaggaacctgtctgggcctggtaccg
ggatctatggaatacatctgcacttgccctgcgggatatgttggaaatcgatgtgaattt
gaaatcaacgaatgtagtagtttaccctgtcaaaatggaggcacttgcgtggatggtgtt
aattcataccactgtgattgcagaccggggtacaccggtatcaactgcagaatagttggg
tattgtaacatctcaggcatctggtacaatgagtgtaacgattatgtcaacataacccag
acaacatccgggttactccttggtgaatacgttgcagatatcgagggttctatcaacagt
tggcccaatggaatactcatagggtactcatctatccaatgtcagctgccttccttcggt
tttacggtagaccatgcaggaggtgagaggaccacggcctggactggccagtgtcgactg
tgtgaggaggagatactttatacgacctggacctcggttaagaaagcagatagttgcaga
gggattaaaaaatcattcaaaactgggcttgatagatggacgagatataaacagagtttg
gcaccggcgaggcaaccttaa

DBGET integrated database retrieval system