Lacinutrix venerupis: BWR22_00355
Help
Entry
BWR22_00355 CDS
T04680
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K16899
ATP-dependent helicase/nuclease subunit B [EC:
5.6.2.4
3.1.-.-]
Organism
lvn
Lacinutrix venerupis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lvn00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
lvn03400
]
BWR22_00355
Enzymes [BR:
lvn01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.4 DNA 3'-5' helicase
BWR22_00355
DNA repair and recombination proteins [BR:
lvn03400
]
Prokaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
HR (homologous recombination)
AddAB pathway proteins
BWR22_00355
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PDDEXK_1
DUF2800
DP
Retrotran_gag_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
APX98818
UniProt:
A0AAC9LI64
LinkDB
All DBs
Position
81028..83769
Genome browser
AA seq
913 aa
AA seq
DB search
MKSFIFDVLESLKDKGEDLSTLYFILPSKRAGVFLRQELSAVVKKTIFSPTIISIEEFVE
ELAELTTINNTELLFEFYNTYLALTPKQEQESFEVFSKWAQILLQDFNEIDRYLIPQNQI
FDYLAAVKELDHWSVGNDKTEVIKNYLKFWNKLKLYYKHYTQNLIAKKTGYQGLIYREAV
ENIQNYCTLTKRKHIFLGFNALNTAEETIIQELLKNNLAEIFWDIDETFIENKIHDAGLF
TRAHKTKWKHFEKHPFNWVTKHYKNDKNIEVLGVPKNIGQAKAIGSILKKLETKNPNLKS
TAVVLGDENLLIPILNSVPESISKLNITMGFPLSSIPLASLFEQLFSVHKKASEKYYYKD
IIGLLSHQFINPLFLNGTINTASIVIDTIKKNNLVYLTVSEIRQYAKNNASLIELIFNPW
KDDANKAIENCFKIINKVKEYLSTNKEDNLISLEYLFRFNKLFNELFRLNNTYKHIQDIS
ALFSIYTELLSSETLDFKGEPLQGLQVMGMLESRVLDFETVIISSVNEGVLPSGKTNNSF
IPFDIKIENKLPTYKEKDAVYTYHFYRLLQRAKNIFILYNTEVDVLTGGEKSRFINQLEL
ENIHKINHKIITPKVPGFNNKLKEIVKTKTVINQLKEVAQRGFSPSSLTNYIRNPLDFYY
QSLLGIKNIEEVEETVAANTMGTVVHDTLEALYKPYINMELKIEDIKDMMPKIESNIEMF
FKKTYAEGDMSKGKNLIIFEIAKRYVQNFLNLEIEDLKAGNTIKILALEQKTEVPLNIPE
LNFNVKLKGTVDRVDLYNGITRIIDYKTGKVNNNQVSITNWEDINLDYKKYSKSFQILAY
AYMMNALKPLDFPVEAGIISFKNLNSGFIKFTQKGGKKNSLITQENLNSYFNELKKLIIE
ICNPEINFVEKEV
NT seq
2742 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagagttttattttcgatgtattagaaagtcttaaagataaaggagaagatttatct
accctttactttattttacccagtaaacgtgcaggagtttttttaaggcaagaactatct
gctgttgtaaaaaaaacaattttctctcctactattattagtattgaagagtttgttgaa
gaattagcagaacttacaactattaacaatacagagttattatttgagttttacaatact
tatttagctttaactccaaaacaagagcaagaaagctttgaagtattttctaaatgggcg
caaatactacttcaagactttaatgaaattgaccgttatcttataccacaaaaccaaata
ttcgattacttagctgcagtaaaagaattggatcattggtctgtaggaaacgacaaaaca
gaagttataaaaaactatttaaaattttggaacaaattaaaactctactataaacattac
acccaaaatttaattgctaaaaaaactggctaccaaggcttaatatacagagaagccgtt
gaaaatattcaaaattactgcaccttaacaaagcgtaagcatatatttttaggttttaat
gctttaaatactgcggaagaaactataattcaagaacttttaaaaaataatttagcagag
atattttgggatatagatgaaacctttatagaaaacaaaattcatgatgcaggattattt
actagagcgcacaagaccaaatggaaacattttgaaaaacatccttttaattgggttact
aaacactacaaaaacgataaaaatatagaggtattaggtgttccaaaaaacataggacaa
gcaaaagccattggctctattttaaaaaaattagaaactaaaaatccaaatttaaaaagt
actgctgtagtacttggtgatgaaaatttattaattccaatactaaattctgttccagaa
tctatttctaaattaaatattaccatgggctttccattaagttccataccattagcatcg
ctattcgaacaattatttagtgtacacaaaaaagcatcagaaaaatattattataaagac
attattggtctgctatctcatcaatttattaatcccttatttttaaacggaacaataaat
acagcctcaatagtaatagatactataaaaaaaaataacctcgtatacttaactgtttca
gaaattagacaatatgctaaaaacaacgctagccttatagagcttatttttaatccttgg
aaagatgatgcaaacaaagcaattgaaaattgttttaaaataattaacaaggtaaaagaa
tacctatctactaataaggaagacaacttaatatctttagaatatttatttcgttttaac
aaactctttaacgagctttttaggctaaataatacctataaacatatacaagatatttct
gctctatttagtatctataccgaacttttaagcagcgaaacattagactttaaaggtgag
cctttacaaggattacaagtaatgggaatgttagaatctcgtgttcttgattttgaaacc
gtaattatttcgagtgtaaatgagggcgtgttaccatcaggtaaaacaaataactctttt
attccttttgatattaaaattgaaaataaactaccaacatataaagagaaagatgctgta
tacacctatcatttttacaggttattacaacgtgcaaaaaatatatttattctctacaac
actgaagttgatgtattaaccggtggagaaaaaagtagatttattaaccaattagaactt
gaaaatattcataaaattaatcataaaattattactcctaaagttccaggatttaataat
aaactaaaggaaatagttaaaacaaaaactgtaataaatcaacttaaagaagttgcacaa
agagggttttcaccttcatctttaacaaattatatacgaaacccattagacttttattac
cagagtttattaggtataaaaaatatagaagaagtagaagaaaccgtagccgcaaatacc
atgggtacagttgttcatgatacattagaagcactttacaagccatatattaatatggaa
ctaaagattgaagacattaaagatatgatgcctaaaatagagtctaatattgaaatgttc
tttaaaaaaacttatgctgaaggcgatatgagcaaaggtaaaaacctaattatattcgaa
attgccaaacgctatgttcaaaattttttaaatttagaaatagaagatttaaaagcagga
aataccattaaaattctagctttagaacaaaaaacagaggtcccattaaatattccggaa
ttaaattttaatgttaaattaaaaggaacagtagaccgtgtagatttatataatggtatt
acaagaattatagattataaaactggtaaagtaaacaacaatcaagtatctataacaaat
tgggaagacataaatttagactataaaaaatacagtaaaagttttcaaattttagcttat
gcttatatgatgaacgctttaaagcctttagattttcctgttgaagcaggaataatttct
tttaaaaaccttaattctggttttataaaatttacacaaaaaggtggcaaaaaaaactca
ctaattactcaagaaaacttaaatagctactttaatgaattaaaaaaattaataatagag
atatgtaatccagaaattaattttgttgaaaaagaagtataa
DBGET
integrated database retrieval system