Lacinutrix venerupis: BWR22_04910
Help
Entry
BWR22_04910 CDS
T04680
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K20276
large repetitive protein
Organism
lvn
Lacinutrix venerupis
Pathway
lvn02024
Quorum sensing
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lvn00001
]
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
BWR22_04910
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CHU_C
Ig_J
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
APX99677
UniProt:
A0AAC9PWE7
LinkDB
All DBs
Position
complement(1084720..1090257)
Genome browser
AA seq
1845 aa
AA seq
DB search
MLKNTLKITFILFLLIQSTFSYAQQPNDCVNAVVVCGDSDIVLDVNGAGNNSNEFPTSCS
SGENNSLWLEVTVTTSGSLAFTLTPNSTAITEDYDFFIFGPNTTCGNLGPTIRCSTTNPQ
ASGQGNNLTGLSTVETDNFEGPGAAGNSFVSAINATAGDSYFIVIDRPVGNSPFSLQWTG
TAQFSDAPTSETDPTGDALDITICNTGNSSAFNLEQNTPLIIGSQTDIDVAYYENESDAN
IGTNALSSPYPNLNNGQTIYATITNTITNCFTIQEFNLFLEDSPQITSLTSNTSVCSGQD
AIFTITGDAGNVVDYNINGGGTMQVTLDAAGQGVVTVAGATADQTITLEAVTNPSTTCTT
TLTDTETVTIGANPTITSLTTNTDICSGADAIFTIDATADDVIDYTINGGATQQVVVDAT
GQAIVTITAATVDQTIVLEAITNPITMCSSILTDTDTVTVIANPTVALASNDQVCIGEDA
VFTITGTPGDIVDYNINGGGTVQVTLDAAGESVITIAAPAVDQEMTLEAVNNPTTTCTSL
LTTSNTVVVNSLPTVITPTTLEACDDETLDGFTEINLNIKNNEITGSNPAYAVTYYLNQN
DAINESNPLVSPYTNISNPQIISVRVENVNTGCFDITTLELEVVEPPVSFPVTSLSYCDP
DSDGFGEFFLNNTATQASGGDTNLSVTFHETMADAQNNVNAITNEPYNNIVANTQTLYIR
VQSSTASTNCASYETLQLIVNPEPQIITPANLTPLEVCDDDADGFASFDLTVKEPEVLNL
LDGDATNDLDPTLYTITYYQTQANAEAPNNAIATPNAYVNTTADMDSVWIRVEDNATGCY
KTIELELIVNPLPVLAQAASLNLCDVNNPGDEVEAFTLEDANADILAGQTGITLTYFSTQ
TGAETNDPADQIFSPYTNTANAQTIYVLGTNNVTGCSSITTFDIRVNPLPSPVAMPAVVE
ECDDDNDGFALFDLDAQTVIIENGEPDVTTTYYETQDDAMNGINPLSSPYANIVQFNQTV
YTFVQNDLTSCYTIVELPLSVIPSPVVPIAIEDYVICDADNDGTAQFDFDAVINPQIFAN
GQTPADFTLTYHTTQAGADSGNNPIVNTSNYTNVTNPQTIYIRLVSNANGCVTTGSFVIR
VEFPPVIDANYDNLLSQCDDLDADYMEANNGFTFFDLTVEDIEITGPMNVSWIVTYYETM
ADAQADTNAIPDPTAYQNTMTGPQTLYVRVTDNDTGCFSFTTVTIRVLNNPSPTPDPEDL
ELCDDVDIVGPNDMLETFDLTQNEATIINGELGVTASYYLSQDDAIMGNNAIADPSMHIN
EDPANPGVAVTPQTIYVRLTNGTDPTGLGGTGCYSLVSFNIIVNPLPVVTPVEDYVICEL
NTDNVADFDLTTMTAAILNGQDPAIFTVTYHETQAEADAGINDLAISGDYTNTSDPQTIY
VNITNTVTGCDTTALTFNLVVDEAAQANPVGGPIVYEACDDTMEFDGDTTNDTTVFDLTT
QNADVLDGQDPADYTVTYYETQADADAGINPLPFTYTNTVNPQVIIVRVDNDLMINDPAN
PGTMIDSSSCYETAEITLQVNPMPSFMLDSAYLLCINTNGSEVINSPVIDTGLDPSQYTF
EWTLDGAVLPNETSEFIEPTQGGTYGVVATDNATGCSNDEVTTLVTVSEPPVLEAEVTTL
AFAEQHDILVTATGTTSTSIAEYEFSLDGGDWELGTQNTAGAYVYTFSDVAAGEHTITVR
DTQGCGESTTTITVMDYPLYFTPNDDGYHDTWNIYDIGRQADAVIYIFDRYGKLLKQLSP
LGEGWNGTYNGNPMPTSDYWFTVEYREPNNPTVKKQFKAHFTLKR
NT seq
5538 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcttaagaatactttaaaaataacatttatactttttttattaatacaatctactttt
tcttatgcacaacaacctaacgattgtgttaatgccgttgtagtttgtggcgattccgat
attgttttagatgttaatggcgctggaaataacagtaacgaatttccaacatcatgtagt
agtggagaaaacaatagtttatggcttgaagtaaccgttacaacttctggttctttagct
tttacacttactccaaatagtacagctattacagaagattatgacttttttatttttgga
ccaaatacaacctgtggaaatttaggaccaacaataagatgctctacaacaaacccacaa
gcctctggtcaaggcaataacttaacaggtttaagtacagtagagacagataattttgaa
ggacctggagctgccggcaatagttttgttagcgctataaatgcaaccgcaggagattca
tattttattgttatagataggcctgttggtaatagtccatttagtttgcaatggacggga
actgctcaatttagtgatgcaccaacaagtgaaacagatccaacaggagatgctttagat
attactatttgtaatacaggaaactcatcagcatttaatttagaacaaaatacgccatta
attattggttcgcaaacagatattgatgtcgcatattatgaaaatgaaagtgacgcaaat
attggaacaaatgctctatctagtccttatccaaatctaaataatggtcaaactatttat
gcaactattacaaatacaattactaattgttttaccatacaagaatttaatcttttttta
gaagatagtccacaaattacctctttaacaagtaacactagtgtttgctctggccaagac
gccattttcaccattactggagacgcaggcaatgttgtagactacaatattaacggtggt
ggtacaatgcaagtaacactagatgcagcaggacaaggtgttgttaccgttgcaggagct
acagcagaccaaaccataactttagaagctgttaccaatccatctacaacatgtacaaca
acattaacagatactgaaacagttactattggagcaaatccaaccattacaagtttaaca
accaatacagatatttgttctggagcagacgctatattcactatagatgccactgccgat
gatgttatagactacactattaatggaggcgcaacacaacaagttgttgtagatgctaca
ggtcaagctattgtaaccattacagcagcaaccgtagaccaaactatagttttagaagct
attacaaacccaataactatgtgtagtagtatactaacagatacagacactgttacggta
atagctaacccaacagtagcattagcgagtaatgatcaagtatgtataggtgaagatgcc
gtatttactataaccggtacaccaggagatattgtagattacaatattaatggtggcggt
acagtacaagtaacacttgacgcagcaggagaatctgttattactatagcagcaccagca
gtagaccaagaaatgactttagaagctgtaaacaatccaactacaacgtgtacaagcctt
ttaacaacatctaatacagtggtagtaaattcactaccaacagtaataactccaacaacg
ctagaagcatgtgatgatgaaactttagatggttttacagaaataaatttaaatataaaa
aataatgaaattaccggaagcaatccagcctatgctgtaacctactatttaaatcaaaat
gatgctattaacgaaagtaatccacttgtaagtccttataccaatatctcaaatccacaa
attatttctgttcgcgtggaaaatgttaatactggatgttttgacataacaacattagag
ctagaagtcgttgaacctcctgtttcatttcctgttacatcattaagttattgtgatcca
gatagcgacggttttggtgaattctttttaaataatactgcaactcaagcttctggagga
gacacaaacttatcagttacttttcacgaaacaatggctgatgctcaaaacaatgttaat
gctattacaaatgaaccatataacaatatagtagccaatacacagactctttacattcgt
gttcaaagttctacagcatcaacaaattgtgcgagttacgaaacacttcaattaatcgtt
aacccagaaccacaaattattacaccagcaaatttaacaccattagaagtttgtgatgat
gatgccgatggatttgcaagtttcgatttaactgttaaagagccagaagtactaaatctt
ttagatggtgatgccactaacgatttagatccaacattatacaccattacttactaccaa
acacaagccaatgccgaggcaccaaacaatgccatagctacaccaaacgcttatgtaaac
accactgccgatatggacagtgtatggatacgtgtagaagacaatgctacaggttgctat
aaaaccatagagctagaacttatcgttaatccgttaccagtattagcacaagccgcatca
ttaaatttatgtgacgttaataatccaggagacgaggtagaagcctttacattagaagat
gctaatgccgatattttagcaggacaaaccggtatcaccttaacctattttagcacacaa
acaggcgcagaaaccaacgatccagccgaccaaatatttagtccatacacaaacactgca
aatgcacaaaccatttatgtattaggaacaaataatgtaacaggctgtagtagcattact
acttttgatattagagtaaacccactaccatcgccagtagcaatgccagcggtagtagaa
gaatgtgatgatgataacgatggatttgcactgttcgatttagacgcacaaacagtaata
atagagaacggagaaccagacgttaccacaacctattacgaaacgcaagacgatgccatg
aatggaatcaatccattaagtagcccgtatgccaatattgtacagtttaaccaaacggtt
tatacctttgtacaaaacgatttaaccagctgttacactatagtagaattaccattatcg
gtaataccatctccagtagtaccaatagcaattgaagattatgtaatttgtgatgccgat
aacgatggtactgctcaatttgattttgatgccgttatcaatccacaaatttttgcaaac
ggacaaacaccagcagatttcaccttaacataccacaccacacaagcaggagccgatagt
ggtaacaacccaatagtaaacacgagtaactataccaatgttaccaatccacaaaccatt
tacattcgcttagtaagcaatgctaatggctgtgttaccacaggaagttttgttattcgc
gtggaattcccaccagtaatcgatgctaattatgacaatttattatcacaatgtgatgat
ttagatgccgattatatggaagctaataatggtttcactttcttcgatttaacggtagaa
gatatagaaatcaccggaccaatgaatgtaagttggatagttacctattacgaaaccatg
gccgatgcgcaagccgatacgaatgccattccagatccaacagcgtaccagaataccatg
acaggtccacaaaccttatacgtaagagtgaccgataatgataccggttgtttcagtttt
acaaccgtaaccatccgtgtattaaacaatccatcaccaacaccagatccagaagattta
gaactgtgtgacgatgttgatattgtaggaccaaacgatatgctagagactttcgattta
acacaaaacgaagccactattattaatggagaattaggagtaaccgcaagttattaccta
tcacaagacgatgctattatgggtaacaatgctatagcagacccaagcatgcatattaac
gaagatccagcaaatccaggagttgctgttacaccacaaaccatttatgtgcgcttaacc
aacggtacagacccaacaggattaggcggtacaggatgctacagtttagtgagtttcaat
attattgtaaacccattaccagtagtaacaccagtagaagactatgtgatttgtgaatta
aatacagataacgttgcagactttgatttaacaacaatgacagcagccatattaaacggt
caagatccagccatcttcacggtaacctaccatgaaacacaagctgaagccgatgcaggt
attaatgatttagcaataagtggcgattacactaatactagtgatccacaaaccatttac
gttaatattaccaataccgtaaccggatgcgataccacagcacttacctttaatttagta
gtagacgaagcagcacaagccaatccagttggaggcccaattgtatacgaagcctgtgat
gacacaatggagtttgatggagacacgacaaacgacactactgttttcgatttaaccact
caaaacgcagatgtattagacggtcaagatccagcagattacactgtaacgtattacgaa
acacaagccgatgcagatgcaggtatcaatccattaccatttacttacactaacacggtt
aacccacaagttattattgtaagagtcgataatgatttaatgataaacgatcctgccaat
ccaggaacgatgatagacagttcatcatgttacgagactgcagaaattaccttacaggtt
aatccaatgccatcgtttatgttagacagtgcatacttattatgtattaacactaatggc
agcgaggttataaactcaccagtaatagataccggtttagatccttcacaatatactttc
gagtggactttagatggtgcagtattaccaaacgagacctcagaatttatagagccaaca
caaggcggaacttatggtgtagtggcgacagataatgctacaggatgttcaaacgacgaa
gtaaccactttagttaccgtaagcgagccaccagtattagaagcagaggtaacaacattg
gcctttgcagagcagcatgatattttagtaaccgcaacaggtactactagcacatctata
gccgaatacgaatttagtttagatggtggcgattgggaattaggcacacaaaacactgcg
ggtgcttatgtgtacaccttctctgatgttgcagcaggagaacatactataacagtaaga
gacacacaaggttgtggagaaagcacaacaacaataacagttatggattatccattgtac
tttacaccaaatgacgatggttaccatgacacgtggaatatttacgatataggccgtcag
gcagatgctgtaatctatatttttgatcgttatggtaaactcttaaaacagttaagtcca
ttaggcgaaggttggaatggtacttacaatggtaacccaatgccaactagcgattactgg
tttactgtagaatatagagaacctaataatcctacagttaagaaacagtttaaagcacac
tttactttaaaacgataa
DBGET
integrated database retrieval system