Yoonia vestfoldensis: LOKVESSMR4R_02367
Help
Entry
LOKVESSMR4R_02367 CDS
T04854
Symbol
rsaA
Name
(GenBank) S-layer protein
Organism
lvs
Yoonia vestfoldensis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
YbbR
GTP_EFTU_D4
PPDK_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ARU01671
UniProt:
A0A1Y0EE76
LinkDB
All DBs
Position
2358163..2360412
Genome browser
AA seq
749 aa
AA seq
DB search
MATVNVVRGDGTQSIKVDGAGVVNLENFALSSTNAAADVSLDFGATATTATIGLNKIVAG
ATAAVDDVTLVGAKLTTVNINVTGTKSVVEAIDTVAASAVNIDAAVALETNNLATTSSAA
TLTVSGVGKVDVGALDVGFTTVNASGNSGGLVAQIGTNDQTVLTGSSGDDVITASTTDAL
ASTDKLAVNAGAGNDTLIIAAAADVNTAADGARYTGFETVRVTENLDMSLIAGVTGIEVA
SAGGVYTNMTAAQLANITFLADNTTSTTFTLASATGLADTATIRLASATATSNVDVIGVS
VIGVETVNIIASTGTNTSGDSDFGFLANAADSVKAVNISGSADVDLNIVANTFDVVAVAI
NASGLTGTGHLEITGGVLVSGSTVVGSANGDTIVVSTTTGTAYSTGAGDDKITTAAASLA
QTGANDNSINGGDGTDTIHISDNGSTLTDNHFIGLSNVEKLSYDDGGAVSLTTGSAFSSA
FGSGVTITAAGMDDAATFTYAGGLFSGNATLAVTTAGVGNATGENITITTGGGTDSVTLT
AASWVGVAGDTSVIAITTNAGNDTISLSGYNLAANTTTIAIQIDAGTGADTITLSGDNGA
GATAYANFVINGGDSTIAAYDRITGFEVGDATNYSSALDFDGTSAKATAVTADGVAGYSS
AELTMTISAAGIVTFAGTSAAGLTATNVISILDAEITTSTHTAIWSDGTDSYVFNANSTG
DSVVMLVGLTGVDALVTSAGLGANDLFIA
NT seq
2250 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtggcaacggtaaatgttgtccgtggggatggtacgcagtcgattaaagtcgatggtgct
ggcgtagtaaatcttgagaatttcgctctatcgtcaactaatgcggcggctgacgtgtct
ctcgattttggcgcgactgctacaactgcaacaattggtctcaataaaattgttgctggt
gctaccgccgctgttgatgatgtaacgctagtgggcgcaaagctaaccaccgtgaatatt
aatgtcactggcaccaaatcagttgttgaggcgattgacactgtggctgcatcggctgtc
aacattgatgccgcagttgcgctcgagacaaacaaccttgccacaacttcttcggccgca
accctgacagtatctggcgttggcaaggtcgatgttggtgcgcttgatgtcggatttact
acagtgaacgcgtccggcaactcgggtggtttggtcgcgcagataggtaccaatgaccag
acagttctgacggggtcatctggcgacgacgttatcactgcatcaacaacagatgcatta
gcgtcgactgataagctagctgtgaatgcaggtgccggcaacgatacactgatcatagct
gcggcagctgacgtaaacaccgctgctgatggtgcaaggtataccggttttgaaacggta
cgagtaaccgaaaatctcgacatgtctttgattgctggcgttactggaattgaagttgcg
tccgctggtggcgtgtacaccaatatgacggccgctcaactggcgaacattacatttttg
gccgataacacaacaagcactacatttacactcgcgagcgcaactggacttgctgacact
gctactatccgtttggcttccgctacagccacgtcgaacgtagacgtgatcggtgtgtcc
gtgatcggtgttgagactgtaaacattatcgcctcgacaggcactaacacgtctggtgac
tctgactttggctttcttgctaatgcggcagactcggtaaaggctgtaaacatctcggga
tccgcagatgtggatctcaatattgttgctaatacttttgacgttgttgcagtcgcaatt
aatgcctcgggcctgactgggactggtcacctcgaaattacgggtggtgttttggtttcc
ggttctacggtggttggctcggcaaatggtgatacaattgtagtgtcgacaacaacaggt
accgcctatagcactggagcgggtgatgataaaatcacaactgcggcagccagcttggct
caaactggtgcgaacgacaacagcatcaacggtggtgacggtaccgatactattcatatc
tcggacaacggatcgacattgactgataaccattttatcgggttgtctaacgtcgaaaag
ctttcgtatgatgacggtggtgctgtttcacttactactggttctgctttcagttctgct
tttggtagtggcgtaacaattactgccgcgggtatggatgacgccgcgactttcacctac
gctggtggtctattctctggaaatgcaacgctggctgttacaacagccggtgtcggtaac
gcgactggtgagaacattacaatcaccactggcggtggcacagactcggtgacactaact
gcggcatcctgggttggcgtcgctggcgacacgtcagtgatcgctatcaccactaatgca
ggtaacgacaccatctcgttgtcgggctataatcttgcggcaaatacaaccacgatcgcg
attcagattgatgctggtacaggggctgatacgattacgttgtctggtgataacggtgct
ggggcaacggcttacgctaactttgtgatcaatggtggcgattcgacgatcgcagcatat
gataggattaccggctttgaggttggtgacgctacaaactattcaagcgcactcgacttc
gatggtacttctgcaaaagcgactgcggttacagctgatggtgttgccggttactcatcc
gctgaattgactatgaccatctctgctgcaggtatcgtaacctttgcaggaacgagtgcg
gccggacttactgctacgaatgtcatttcaattcttgacgcggagattaccacatctacc
cataccgcgatctggagtgatggtacggactcctatgtgttcaacgctaatagcactggg
gatagtgttgtgatgctcgttgggctgacaggagtggatgcattggtcacgagtgccggg
cttggtgcaaacgatctgttcattgcctaa
DBGET
integrated database retrieval system