Listeria weihenstephanensis: UE46_13870
Help
Entry
UE46_13870 CDS
T05637
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
lwi
Listeria weihenstephanensis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Endotoxin_C2
Big_6
Pectate_lyase_5
CBM_35_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AQY52005
UniProt:
A0A1S7FXE1
LinkDB
All DBs
Position
complement(2883415..2888079)
Genome browser
AA seq
1554 aa
AA seq
DB search
MSKKSKVLNKSLKLFLASAMVLTSISTLPVSSLATEGTTNPSVDAVGVYVSDWATFKSEL
QNTTTTDIYLQADLKMEGADFSIAIDEKNIHGEGYSLDMNTRNIRVTKANAKTSINNITI
KNSGTNGFLWSTIAGTHTINNATGEGNRAFARLEAGSIVFQGTNNITQLSGNNNYNVWAK
NIAIESGAVVNIDGGGYARDRGALHTTGGSVLTVATDAKLDVNSTTGQAIRLDGVNFTNN
GFVKATSSRDAIATYNTSTTTINSGATLDVKSTATDVQGAMFYNSSLFVKSGATLIAVSQ
GTSSTLTTGKELVIEDGANFSITNTRNGALGSEAAATTMVINSTIGVSTWERGKTTLEEP
TFSYQGPLEAKFTLSGYAGPKQTNLVTNNADITKNFDTSKVGRIEGGYFVKDPKQIEAED
KARVAVNNLFASQNPANNAKAGLTQAEIDAAQLLVDEVTDPKTKAALQADIDKAQQQVDA
LIAAEKAAIEKAAQDKARAAVNDLFTGKNPAGDAKTGLTQAEIDAAQALVDKVTDPTVKA
ALQADLNKAQDQLDSANAAELATQNAAREAVNKLFTNQDPTGDAKTGLTQAEIDAAQALI
DKVTDPAKKAALQADLNKAQDQLDAANAAELAAQNAAREAVNNLFANQNPTGDAKTGLTQ
AEIDAAQALIDAVTDPAKKAALQADLNKAQDQLDAANAAELAAQNAAQEAVNNLFANQDP
TGDAKTGLTQAEIDAAQALIDKVTDPAKKAELQASLDKAQAQLDADKAAQDKAREAVNNL
FANQNPTGDLKTGLTQAEIDAAQALIDQVTDPAKKAELQADLDKAQAKLDADKSAEQAAQ
DKARAAVNALFANQDPTGDAKTGLTQAEIDAAQALVDKVTDPTVKAALQADLNKAQDQLD
AVKAAEQAAQDKARAAVNALFAYQNPAGDTKIGLTQAEIDAAQALIDQVTDPAVKAALQA
DLDKAQTQLNANLVAPNAPTVNSVTAVDTKVTGKGQAGMTVVVKLADGTEKTGVVNANGD
FSIVIPAQAADSNIAVTLKNAYSVASEATTVTVVGLPQPVINPMTISDVTVTGTIDVSQF
PASKVKLIINGAPKTILTVGADGSFSYYTGNLAAGTTIEVQYVGPNGSYLTDSKYVGTTV
VTEESVALVLNEMTASDMYITGTTLADHRVRVSINGVLKATVTADAAGNFSYLSSYLVKG
DVVKAEVLLGANVAKTVSITVADAVATELVVNEMTIADNKVTGTATPNAKLRISINGAAK
AVVTADATGNYTYTTGTLVSGTEVKVEMRNSLTGAYDTSKSVVVSGEIPGLLLTLNDLKA
PEGLVSGEATAGYTVRISVNGVVKANTVATVDGKYSYNVGVLTGGDVVKVDVRVGTQYLL
ATEKIVKAEFSLNPILDTDRTITGKAPAGKTVRISINGVPKSVTVADAAGNYTYLIGLVA
TGDVIKIELRNTETGKYEDFVERTVISAADAGQVTINALTSADTMVTGKTIPSGKLRISV
DGKAKTVVTADAQGNYSYFISGVTVGQVIKVELKENSAYTSFAETTVTEAPAAE
NT seq
4665 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcaaaaaaatcaaaagtgttaaataagtcgttaaaattatttttagcgagtgcaatg
gtgctaacaagtattagtactttgccagttagttcactagctactgaggggactactaat
ccaagcgtggatgcagtaggtgtctacgtaagtgactgggctacgtttaagtcagagctt
cagaacacaacaacaacagatatttatctacaagcagatttaaaaatggaaggcgcggat
tttagtatagcaattgatgagaaaaacattcatggcgaaggctattctctggatatgaat
actagaaatattcgtgtgacaaaagcaaatgcaaaaacatcaataaataatatcacaatc
aaaaacagtggtacgaatggtttcctatggagtactatagctggaacgcatacgattaat
aatgcgactggtgaaggtaatagagcctttgcaagactagaggctggttctattgtcttt
caaggtacaaacaacattacgcaacttagtggtaataacaactacaacgtgtgggcaaaa
aatattgctatcgaaagtggcgcagtagtaaatatcgatggtggtggatatgccagagat
cgcggtgcacttcatacgacaggtggcagtgtcttaactgttgcgacggacgcaaaacta
gatgtaaattctactacagggcaagctattagattggatggagttaatttcaccaataat
ggttttgttaaagcaacatcatctcgtgatgctattgcgacatataatacaagtactacg
acaatcaattcaggtgctactttagatgttaaatcgacagctactgatgtgcaaggagcg
atgttctacaacagttccctttttgtgaaaagtggagcgacactgattgctgtctcacaa
ggaacttcttctactttgacaacaggtaaggagctagttattgaagatggtgccaatttc
tctattactaacacgagaaatggagcgttaggtagtgaagctgctgcgacaacgatggtc
atcaattctactatcggggttagcacatgggaacgtggaaagacaacacttgaagaacca
actttttcatatcaaggacctttagaagctaagttcacattaagtggctatgcaggacca
aaacaaacgaatcttgttacgaacaatgcagacatcacaaaaaactttgatacgagtaaa
gttggccgtattgaaggtggttattttgtaaaggatcctaagcaaatcgaagcggaagat
aaggcacgtgtagcagtaaacaacttgttcgctagccaaaatccagcaaacaatgcaaaa
gcaggattaacacaagctgaaattgatgcagcacaacttttggtggatgaagtaactgat
cctaaaacaaaggcggcattgcaagcggacattgataaggcgcaacaacaagtagatgca
ctcatagcagcagaaaaagctgctatcgagaaagcagcacaagataaagcgcgtgcagca
gtcaatgatctatttactgggaaaaacccagctggcgatgcgaaaacaggtttgacacaa
gcggaaatcgacgcggcacaagctttagtcgacaaagtaacagatccaacagtaaaagca
gcattacaagcagacttaaataaagcacaagaccaactagactcagcgaatgcagcagaa
ttagcaacacaaaacgcagctcgcgaagcagtaaataaattgttcacgaatcaagatcca
actggtgatgcaaaaacaggattaacacaagcagaaattgacgcggctcaagcgttgatc
gacaaagtaacagatccagcgaaaaaagcagcattgcaagcagacttgaataaagcgcaa
gaccaattagacgcagcaaatgcagcagaattagcagcacaaaatgcggcgcgcgaagca
gtaaataatttattcgcgaatcaaaacccaactggcgatgcaaaaacaggattaacacaa
gcggaaatcgatgcggcacaagcattaatcgatgcagtaacagatccagcgaaaaaagca
gcattgcaagcagacttaaataaagcacaagaccaactagacgcagcgaatgcagcagaa
ttagcagcacaaaacgcagcacaagaagcagtaaacaacttgtttgcgaaccaagatcca
actggggatgcaaaaactggtttaacacaagcggaaatcgacgcagcgcaagctttaatc
gacaaggtaacagatccagcgaaaaaagcagaactacaagcaagcttagataaagcacaa
gcacaactagatgcggataaggcagcacaagataaagcacgtgaagcagtaaacaactta
tttgctaaccaaaatccaactggtgatctgaaaacaggattaacacaagcggaaattgat
gcagcacaagctttaatcgatcaagtaacagatccagcgaaaaaagcagaactacaagca
gatttagataaagcacaagcgaaactagacgcagacaagtcagcagagcaagcggcgcaa
gataaagcacgtgcagcagtaaatgcactatttgcaaaccaagatccaactggcgatgca
aaaactggtttaacacaagcggaaatcgacgcggcacaagctttagtcgacaaagtaaca
gatccaacagtaaaagcagcattacaagcagacttaaataaagcacaagaccaactagac
gcagtaaaagctgcagaacaagcagcacaagataaagcacgtgcggcagtaaacgcccta
tttgcctatcaaaacccggctggtgatacgaaaatcggattgacacaagcggaaatcgat
gcggcgcaagctttaatcgatcaagtaacagatccagcagtaaaagcagcattacaagca
gatctagataaagcacaaacacaattaaatgctaatttagtagctccaaatgcaccaaca
gtaaacagcgtaacagcagtagacacaaaagttactggtaaaggtcaagctggtatgaca
gttgttgtcaaattagcagacggaacagagaaaactggtgtagtgaatgcgaatggcgat
ttctctatcgttatccctgcacaagcagctgattccaacattgcagtaacacttaaaaat
gcttatagcgtagcaagtgaagcaactacagtaaccgttgtcggtttaccacaaccggta
attaatccgatgacaatctctgacgttactgttacaggaacaatcgatgtgtcacaattc
ccagcgtctaaagtgaaattaattattaatggcgctcctaaaacaattttgacagttgga
gcagacggttcattctcctactacacagggaatttagcagctggaacaacgatcgaagta
caatatgttggaccaaacggttcttatttgacagatagtaaatatgtaggaacaactgta
gttacagaagaatcagttgcccttgttttaaatgaaatgacagcttcagatatgtatatt
actggaacaacgctagcagaccaccgtgttcgtgtaagtattaacggtgtattgaaagca
acagtaacagcagatgcagcaggtaattttagttacctaagtagctatttagtgaaaggt
gacgttgtaaaagcagaagtacttcttggtgccaatgttgctaaaacagtaagtatcaca
gtagcagatgccgtagcaacagaattagtagtcaatgaaatgacgattgctgataacaaa
gtaacaggaacagcaacaccaaatgcaaaattacgtattagcataaatggtgcagcaaaa
gcagttgtaacagcagatgcaacaggtaactacacgtatacaactggcacgttagtatct
ggaacagaagtgaaagtagagatgcgtaattccttgacaggagcttatgacacatcaaaa
tcagttgttgtttctggtgaaataccaggtcttctattgacactgaatgatttaaaagca
ccagagggccttgtttctggggaagctacagctggttataccgttcgtattagtgtgaat
ggtgtagtgaaagcaaatactgtcgcaactgttgatggtaagtattcttataacgtaggc
gttttaactggcggcgacgtggtgaaagtagatgtacgtgtaggtacacaatatctactt
gcaactgaaaaaattgtcaaagcagaattttcattgaacccaattttagatacagatcgt
acgattactgggaaagcaccagctggtaaaaccgttcgtattagtatcaatggtgttcct
aaatctgtcacagtagctgatgcagcaggtaattacacatatcttatcggccttgtagca
acaggggacgttattaaaatcgagctaagaaatacagaaacaggtaaatatgaagacttc
gtagaaagaacagtcatctcagcggcagatgctggtcaagtaacaatcaacgcgctaaca
agtgcagacacaatggttactggtaaaacaataccatctggtaagttgagaattagcgtt
gatggcaaagcgaaaacagttgtcacagctgacgcccaaggaaactacagctacttcata
agcggagtaacagtaggacaagtcatcaaagtagaactgaaagaaaacagtgcatatacc
tcattcgctgaaacaactgttacagaagctccagcggctgaataa
DBGET
integrated database retrieval system
