Lacrimispora xylanolytica: OW255_16840
Help
Entry
OW255_16840 CDS
T08662
Name
(GenBank) collagen-like protein
Organism
lxa
Lacrimispora xylanolytica
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Collagen
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WAJ23215
LinkDB
All DBs
Position
complement(3612786..3617711)
Genome browser
AA seq
1641 aa
AA seq
DB search
MSNIALQIERVSSGAVAVNANVIFENIVFLSGNISYNTATGEITFNEPGRYVINWWVASQ
STQATNGVVFALASSQGDLLEGNSPIKTGEVVGFGVIEITSAPQTLSLINASNAEVFYAV
AVPLTATLVIVEDDNTGEGSTGPTGATGPTGPTGSTGATGSTGAIGPTGATGPTGPTGST
GTTGPTGPTGATGLTGTTGPTGATGPTGPTGTIGLTGATGPTGATGPTGSTGATGPTGPT
GATGPTGPTSDTGPTGPTGANGLTGPTGATGPTGPTSDTGPTGPTGATGPTGPTSDTGPT
GPTGPIGDTGATGPTGPTGATGGTGPTGITGPTGLTGATGPTGATGPTGITGPTGPTGII
GPTGPTGATGLTGATGPTGVTGATGPAGITGPTGLTGATGPTGATGPTGITGPTGATGAT
GPTSDTGPTGPTGATGPTGATGPIGPTSDTGPTGPTGATGPTGATGPTGPTSDTGPTGPT
GATGLTGPTGATGPTGPTSDTGPTGPTGATGPTGATGPTGPTSDTGPTGPTGDTGATGPT
GPMSDTGPTGPTGNTGATGPTGPTGATGPTGATGLTGPTGDTGATGPTGPTSDTGPTGPT
GNTGATGPTGPTGATGPTGPTSDTGPTGPTGDTGATGPTGPTSDTGPTGPTGPTGNTGAT
GPTGPTSDTGPTGPIGATGPTGPTGATGPTGPTSDTGPTGPTGDTGATGPTGPTGSTGST
GPTSDTGPTGPTGSTGPTGATGPTGATGDTGPTGITGSTGPTSPTGATGPTGTTGGTGPT
GITGPTGPTGPTGATGATGPTGPTGATGPLGSTGPTGPTSDTGPTGPTGSTGATGSTGST
GPTGATGGTGPTGITGSTGSTGSTGPTGPTGVTGPTGSTGPTGATGPTGITGSTGPTGPT
GPTGATGPTGATGDTGPTGITGPTGLTGATGPTGITGPTGLMGATGPTGATGDTGPSGIT
GPTGPTGITGPTGPTGATGPTGDTGPTGITGPTGPTSDTGPTGPTGPTGLTGATGDTGPS
GITGPTGATGPTGATGDTGPTGITGPTGATGATGATGDTGPTGITGPTGPTGPTGATGPT
GATGATGDTGPTGITGPTGPTGPTGATGDTGPTGITGPTGATGPTGVTGDTGPTGITGST
GPTGPTGATGDTGPTGITGPTGPTGPTGATGPTGATGATGATGDTGPTGITGPTGATGDT
GPTGATGPTGITGPTGLTGATGPTGITGPTGLMGATGPTGATGDTGPSGITGPTGPTGIT
GPTGPTGLMGATGDTGPTGPTGPTGATGPTGATGDTGPTGITGPTGPTGPTGVTGGTGPT
GITGPTGPTGPTGATGDTGSTGITGPTGLTGATGPTGDTGPTGITGSTGPTGSTGATGPT
GDTGPTGITGPTGPTGPTGATGPTGITGPTGPTGDTGATGGTGPTGITGPTGPTGPTGAT
GPTGATGGTGPTGITGPTGPTGPTGPTGPTGATGGTGPTGITGPTGATGPTGPTGATGST
GPTGATGPNGTGALAFSNTAGNIAVYPPLNTEVSVSTVSAALVLNNRVKVDSANSLSYAT
TANYSLSAESRLYRNGVLIESRPLNRSGSGAGTQSFTLSDTFVDTAPATATTTYEIRVIT
TAATNVTSGTASVRNINLLIF
NT seq
4926 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagcaatatagcattacaaatagaacgtgtttcatctggtgcagtagctgtaaatgct
aatgtgattttcgaaaatattgtttttttgtcaggaaatattagctacaatactgcaaca
ggtgaaataacatttaatgaaccagggagatatgtgataaactggtgggttgcatcccaa
tctacccaagcgacaaacggagtggtgtttgcattagcgtcatcacaaggagatttactg
gaaggcaattctccaattaaaacaggagaagtagttggttttggagttatagaaatcact
tctgcaccacagaccttatctttaattaacgccagcaatgctgaagtattctatgctgtc
gccgttcccttaactgctacacttgtcattgttgaagatgacaatactggtgaaggatca
acaggtccaacaggagccaccggcccgacgggtccgacgggtagtacaggagcgactgga
tcaaccggagccattggcccaacgggggcaaccggtccgaccggcccgacgggttcaaca
ggaaccaccggcccgacgggtccaacaggagccaccggactgacaggaaccacaggtcca
accggagctactggcccgaccggcccaacaggaaccatcggcctgacaggagccactggc
ccaacgggggcaaccggtccgacgggttcaacaggagccactggcccgacgggtccaaca
ggagccaccggcccgaccggcccaacgagtgacaccggcccgaccggcccaacgggagcc
aacggtctaactggcccgacaggagccaccggcccaaccggtccaacgagtgataccggc
ccaaccggcccgaccggagccactggtccgacaggtccaactagcgacaccggcccaacc
ggcccaactggcccaatcggagatacaggggccactggtcccaccggcccaactggagca
acgggaggcacgggcccaacaggaataaccggcccgacgggtctaacgggagccaccggt
ccaaccggagccacgggcccaacaggaataaccggcccgactggcccaacaggaataatc
ggcccaacgggtcctacgggagccacgggtctaacgggagccacgggtccaaccggagta
acaggagccaccggtccagcaggaataaccggcccgaccggtctaacgggagccaccggt
ccaaccggagccacgggcccaacaggaattaccggcccaactggagcaacaggagccaca
ggcccaacaagtgataccggtccgaccggcccaacgggagccacgggtccgaccggagcc
accggtccgataggtccaacgagtgacacaggtccaaccggtccaacaggagccactggt
ccgaccggagccactggtccgacaggtccaacgagtgacactggccctaccggcccaacg
ggagctaccggtctaactggcccgaccggagccaccggcccgaccggaccaacgagtgac
accggcccgaccggcccaacgggagccaccggcccgaccggagccaccggcccgaccggt
ccaacgagtgacaccggcccaaccggtccaaccggagatacaggagccactggtccgaca
ggtccaatgagcgacaccggcccaaccggcccaactggaaatacaggagccactggtccc
actggcccgaccggagccaccggcccgaccggagccaccggcctgaccggcccaacagga
gatacaggagccactggtccgacaggtccaacgagcgacaccggcccaaccggcccaact
ggaaatacaggagccactggtcccaccggcccgaccggagccaccggcccgaccggtcca
acgagtgacaccggcccaaccggcccaaccggagatacaggagccactggtccgaccggt
ccaacgagcgacaccggcccaaccggtccaacaggcccaacaggaaatacaggggccact
ggtcccacaggcccaacgagtgacaccggtccaaccggcccaataggagcaaccggccca
actggcccgaccggagccaccggtccgacaggtccaacgagcgacaccggcccgactggc
ccgaccggagatacaggagccactggtcccaccggcccaacgggatcaacaggatccaca
ggcccaacgagtgacacaggcccaactggcccaacaggatccacaggtccaactggagcc
acaggtccaaccggagcaactggagacacgggcccaacaggaattactggctcaaccggc
cctaccagtccaacgggagcgactggtccaacgggaacaaccggaggtacgggcccaaca
ggaattaccggtccaacgggtccgacaggtccaaccggagcaacaggagccaccggtcca
acgggtccaacaggagccactggtccattgggaagtacgggtcctaccggtccgacgagc
gacaccggcccgacgggccctaccggttcaacgggagcgaccggttcaacaggatccact
ggtccaaccggagcgacaggaggcaccggcccaacaggaattactggctcgaccggctcg
accggctcgactggcccaactggtccaacgggagtgacaggtccaacgggaagtacaggt
ccaaccggagcaactggcccaacaggaattactggctcaaccggccctaccggtccaact
ggtccaacgggagcgacgggtccaacgggagcaaccggagacaccggtccaacaggaata
accggcccgacaggtctaacgggagccaccggtccaacaggaataaccggcccgacaggt
ctaatgggagccaccggtccaacgggagcaaccggagacactggcccatcaggaataact
ggcccgactggcccaacaggaataaccggcccaacgggtccaacaggagccacaggtcca
acgggagatactggaccaacaggaatcaccggtcctaccggtccgacgagcgacaccggc
ccgactggcccgacaggtccaacgggtctaacgggagcaaccggagacactggcccatca
ggaattaccggtccaacgggagccacaggtccaacaggagcaactggagatacgggccca
acaggaattactggcccaacgggagcaacaggagctacaggagcaactggagacacgggc
ccaacaggaattactggcccaacgggccctacaggtccaacgggagcgacggggccaacg
ggagcaacaggagcaactggagacacgggcccaacaggaataaccggtccaacgggccca
accggtccaacgggagcaaccggagacaccggtccaacaggaattaccggtccaacggga
gccacaggtccaacaggagtaactggagacacgggcccaacaggaattactggctcgacg
ggccctacaggtccaacaggagcaactggagatacgggcccaacaggaattactggccca
acgggccctacaggtccaacgggagcgacgggtccaacgggagcaacaggagcaacagga
gcaactggagacacgggcccaacaggaataaccggtccaacgggagccaccggagacacc
ggtccaaccggagccacgggtccaacaggaataaccggcccgacaggtctaacgggagcc
accggtccaacaggaataaccggcccgacaggtctaatgggagccaccggtccaacggga
gcaaccggagacactggcccatcaggaataactggcccgactggcccaacaggaataacc
ggcccaacgggtccaacgggtctaatgggagcaacaggagacacgggcccaaccggcccg
actggcccaaccggagccacaggtccaacaggagcaactggagacacgggcccaacagga
attactggcccaaccggcccaacaggtcctacgggagtaacaggaggcacgggtccaaca
ggaataaccggtccaacgggccctactggtccaacaggagcaaccggagacaccggttca
acaggaattaccggcccaacaggtctaacgggagccaccggtccaactggagatactggc
ccaacaggaattactggctcgaccggccctaccggttcaacaggagccacaggtccaacg
ggagatactggcccaacaggaatcaccggtccaaccggcccgacgggtccaaccggagcc
acgggtccaacaggaataaccggcccgacgggtccaaccggagacacgggagcaaccgga
ggcactggtccaacaggaatcaccggtccaaccggccctacaggcccaacaggagccacg
gggccaacgggagcaaccggaggcacgggcccaacaggaattactggtccaacaggacct
actggtccaacaggacctactggtccaacgggagcaaccggaggcactggtccaacagga
attaccggtccaaccggagccactggtccaaccggaccaacaggagctacgggttctaca
ggaccaaccggagccaccggtcccaatggcacaggagcattggcatttagtaatactgca
ggaaatattgctgtttatccgcctttaaatacagaagtaagtgtatcaaccgtttctgcg
gctttggtattgaataatcgagtgaaggtagattccgcaaatagcttgtcatatgctact
acagctaactacagccttagtgctgaatctagattgtatcgtaatggggtattaattgaa
tcacgccctcttaatcgaagcggttcaggagcgggtactcagtcttttacattgtcagat
acttttgtagatactgctccggcgacggccactaccacttatgaaattcgtgttataaca
acagccgcaacaaatgtgacatctggaacagcttctgttcgaaatattaacttgctcatt
ttctag
DBGET
integrated database retrieval system
