Lactobacillus xylocopicola: KIM322_11240
Help
Entry
KIM322_11240 CDS
T09734
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
lxo
Lactobacillus xylocopicola
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DUF1542
SlpA
Collagen
KxYKxGKxW_sig
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BDR60863
LinkDB
All DBs
Position
complement(1174660..1184226)
Genome browser
AA seq
3188 aa
AA seq
DB search
MNRFKMIEEVKNTNYKMHKSKKGWLVSYSLLTFMLGGGAVLSQSTSSVSAQEVKATEIES
QSNQAGVDKSAQQKVDDQAVDEAKQNALNALGTAATSTKQRINGDQNLSTATKAKQVKAV
EALLSDAKDKVNAATDLAGIKTVLDKASAGITASYQAGVDRASLLRKADKSAKTKAAKPR
KLKVSSKKLKAKKSKAAAQGSLATFSGLNSFLKSSSSAASAKSSTSTKQSSRSADLLKSA
SKPASTSVNIPAAEIPTDVMDTSLSDDAATKPNNSNEVNSELEAKPRDIGVAGYDATKNV
TVGADPDSARDDFNKDVDKPAGSTPTSMNIATPDQITNPDKYKQKVVNVADFNSLAAAWT
DASVTYINITSDISYTGGTIGNRAAGASVVVNGNGHTIDLNRQTFSYVGVPYSNLTTVTI
TNGKFQQGFPGNDGDSSSLVYSSNGAGLKVNIDNVTLSSSTSNGYNPIHVLMANGSKITF
SGNNVFNISNEVTRGVGMIDFANNGHVTMNRTSNDIRFSEFYMSYVAPQASVGYGNQITM
GDGSSNTAYTYNGTPANYPAMYNNINGVTVGDNVKWTQTGFQYFLNGTQGGNSVAQYKFG
QNFNLSAPVTTQPNAIRLWGTQRAVFNAGTTFDINQRYNDSVIRVNDSSSVTFISPKQLH
LAIQDGNGNPVATGAGIISGAGTVSLNNSNIKTWLGNNSQTNSTAGDNTAKFAQMVVRNG
QATVTDLNGTTAVSNIVTPTTRELQTIAIPVGKVNVQYVDQNGKNVGGPVEVPLDKDAYI
GQYLPLITSDIVVKNMPKNYMWALGNQIFPGAKADAQSGGDPTNDNDNGDTYGQASVGLT
PMEGTTYTYKVYVYGTKQNVTYQYVDVNHKDRILTSPLSGQTGKEAVGGVTPANYGNTID
WTNKYYTEDNVPAGYHYAIGAANQPKTTLVSENNPIVTIYVEGNNQKINPTLQDTNGNRI
VPNSPFEIDGITGQIIKLPAAPDANNWALDHVIVNGQRKEVGSEFEFGNGTDEITYVYHP
LDVEKQAANTAIDAEATKVKGEIDADPTLDSAAKAKQKGDVDKAATTAKDNINKAVLPAQ
VDQAKQAGIAAIDAAHVAGIALDQQKKDYSKQIDDEATKIKGEIDADETLDDETKVKQKG
DVDKDAADAKAAINSATNIQAIKDATAAGIIKIDGDHIPGSVSLPDQKKAAIAAIDAEAT
KVKGEIDADSTLDDATKKKQKGDVDKDAADAKTAINNALNAQQVKNAKEAGIIKIDGDHV
PGNISLPDRKTNAIAAIDAEATKVKGEIDADVTLDTATKNKQKADVDRDAAAAKDKINSA
TTAQGVIDAKDEGIVKIDGDHVPGSISLPVQKTNAIAAIDAEATKVKAEIDADVTLDTAT
KNEQKANVDTDAAIAKANINSATNAQGVNDAKEAGIIKIDGDHIPGSISLPVQKTDAIAA
IDAEATKVKGEIDADVTLDTATKNEQKANVDKDAAAAKTNITNAKDAQGVKDAKEAGIIA
IDADHIPGNVSLPVQKADAIAAIENEATKVKGQIDADVTLNSKEKTAQKANVDKDAADAK
TAINAATNAQGVKDAKDAGIIKIDGDHIPGSVSLPDQKDAAKAAIDAEATKVKGEIDADE
TLDTATKAKQKGDVDKDAADAKAAINTAKDAQAVLDAKEAGIIKIDGDHVSGNISLPDQK
TNAIAAIDAEATKVKGEIEADVTLDTAAKDKQKANVDIDAAAAKTNIMNATNAQGVKDAK
DAGIIKIDGDHIPGSVSLPVQKANAQAAIDAEATKIKAEIDADATLDTATKNKQKGDVDT
DATIAKANINKATDAQGVNDARDAGIAKIDSDHVPGNISLPDQKTNAQAAIDAEAAKIKA
EIEADPTLDNAEKVVQKGNVDKDAAIAKNNISQATNAQGVNDAKNAGIIKIDGDHIPGSI
SLPDQKDAAKAAIDAEAAKIKKEIDADPTLDNVEKATQKTNVDADAADAKIKIEQAVNAQ
GVKDAKSAGIIKIDGDHIPNGTSLLAQKTNAQAIIDAEAAKIKAEIEADVTLDNAEKATQ
KNNVDKDASAAKLNISQATDAQGVKDATNAGIAKIDSDHVPNSISLPDQKKAAQAAIDAE
ATKVKGEIDADDTLDGTSKAAQKANVDKDATDAKNKIEQAINAQGVKDAKEAGIIKINGD
HIPNTVSLPEQKANAQKAIDDEAERVKAQINDDVTLDNATKAVQKANVDRDATAAKTSIS
QATDLKGITDAKELGISRINSDHIPGKALEDQKKAAQKAIDTEATRIKAEIDADDSLDDA
TKSKQKGAVDRDVLGAQNAIDQAVNAQAVIDARNDGIAKIDSEHVGNNVSLSDQKLAAYK
AIDQEATKVKTLIDNDPSLDSTAKNKQRTNVDTEVTRAKAAIDDASNAQEVKVARYNGIT
AIDAQYVSNAVTLQEQKDNAKQLINDEAAIVKTAISKDATLDDATKLQQTRAVDDEKQKA
LDTISQAIDAQGIQKAYNDGIVAIHAQYISAAELAKQKVDAITAIVQEANTIKDAINNDV
TLTTNAKKQQIANVEVESQKAQNAINRAILSQEVRDQLNAGIKAIDAQYVPGKSLDEQKA
DAIAAIDQAAQDAKDKVDKDKNKTDEEKQKEKDEIDKAASNAKDEINHSTTADGIEQAKD
KGTSNINQIVVDNNLDNQKVNANKEIDAAAAAAKDKVDKDPTKTDAEKQRDKAAIDAAAA
AAKDKVNNAKNKGEVDKAKQDGIDAINAIANTPGLEQQKTDANKEIDDAANAAKDKIDKD
KNKTDEEKQKEKDKIDQIASDAKDKVNNSNSKDEVDKAKQDAIDAINNVVNGNGSNGSNG
SNGSNGSGGSNGSNGSNGSGGSNGSNGSNGSNGSGGSNGSNGSNGSNGSNGSGGSNGSGG
SNGSNGSNGSGGSNGSNGSNGSNGSGGSNGSNGSNGSNGSGGSNGSNGTNGSNGSNGTNG
SNGNNGTNGSNGNNGTNGSNGSGGSNGSNGSNGTNGSNGNNGTNGTNGKLDRTNAASKVL
KHNAYFYNKEGKRANLLVAKKGSTITTYGTKSINGRDFYQVGENLYIAVHNVNSRKRTLK
KNAFVYNSKGKRVGKKLLKKKTRVSVYGDPVKIRGKYYYITANNRYVKARNFGSILIEAN
NVIAAGVSSNAELSQNSYVYDADGKRVDGYVILAGSKVIAGEAKSVNGQELVSIGDGYYV
AKNNVDKY
NT seq
9567 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgaacagatttaaaatgattgaagaagtcaaaaataccaactataagatgcataaaagt
aaaaagggctggctagtcagctactccctcttgacttttatgctaggtggaggagcggtg
ctctctcaatcgactagttcggtaagtgctcaagaagtaaaagctactgaaattgaaagc
caaagtaatcaggctggagttgataagtcggcccaacaaaaggttgacgatcaagcagta
gatgaagctaaacaaaatgctttaaatgccttgggcactgcagctactagtactaagcag
aggatcaatggagatcagaacttaagcactgctactaaggctaagcaggtaaaagcggtt
gaggctttacttagtgatgctaaggataaagttaatgcagcgactgatttagctggtatt
aagacagtattggacaaggctagtgctggtattacagccagttatcaagcaggtgttgat
cgggctagtttgctcagaaaagcggacaaatctgccaaaactaaagcagccaagcctaga
aagttaaaagtgagctccaagaagcttaaggctaagaagtcgaaagctgctgctcaaggt
agtttagcaactttttctggcctcaattcatttttgaagtctagttcaagtgctgctagt
gctaagagttctactagcacaaagcagagtagtcgatccgctgacttgttgaagagcgct
tcaaagcctgccagcacttcagttaacattcctgcagctgaaattccaactgacgtaatg
gatacgagtttatcagatgatgcggccactaagcctaataattcaaatgaagtcaactcg
gaacttgaagctaagccaagggacatcggagttgctggttatgatgctactaagaatgta
acggttggcgctgacccagacagcgcgcgtgatgactttaacaaggatgttgacaagcca
gcaggttcaaccccaacttcgatgaatattgccactcctgatcaaatcacgaatccggat
aagtataaacaaaaggtagtaaatgtagcggattttaatagtttagcagcggcctggact
gatgctagtgtaacctacattaatattactagtgacatcagttatacggggggaactatt
ggcaaccgtgctgctggggccagtgtagttgttaatggtaacggccatacgattgatttg
aataggcagactttctcctatgttggtgtgccatattctaacctgacaacggtgacgatt
actaacggaaaattccaacaagggttcccgggtaatgacggggactctagctcgctggta
tattcatcaaatggtgcagggcttaaagtaaacattgataatgtaactttgtccagcagt
acgtctaatggttataacccaattcacgttttaatggctaatggttctaagattaccttc
tcaggcaacaatgtctttaacatctcaaacgaggttacacgtggcgttgggatgattgac
tttgccaacaatgggcatgttactatgaatagaactagtaacgatattcggttctctgaa
ttttatatgtcatatgtggcaccgcaagccagtgtaggttacggtaatcagataaccatg
ggtgatggctcttctaacaccgcctatacttataacgggacaccagctaactacccagcg
atgtataacaacattaatggggtaaccgttggtgacaacgttaagtggacgcagactggt
ttccagtacttcttaaacggaacgcagggtggtaattcagttgcgcagtataagtttgga
caaaacttcaacttgtccgctcctgttacgacccaacctaatgcaattcgtctgtggggt
acacaacgggcagtattcaatgcaggcaccacctttgatattaaccaaagatataacgat
tcggtaattcgggttaatgactcgtccagtgttacctttatttcacccaagcagttgcac
ctggccattcaagatggtaatggtaacccagtcgcaactggtgcagggattatttctggt
gcagggacagtttccttaaacaactccaacattaagacgtggttaggaaataattcacaa
accaacagtactgcgggagacaatacagctaagttcgctcagatggtggttagaaatggt
caggccacggtcacggacttaaatgggaccacggcggtttccaatattgttacgccaact
acacgtgaattgcagacgattgcgattccagttggtaaggttaatgtgcaatacgttgac
cagaatggtaagaatgttggtggaccagtagaagttccgctcgataaagatgcctacatt
ggtcaatacctgcccctgattaccagtgatattgttgtcaagaatatgcctaagaactac
atgtgggcgctcggaaatcaaattttccctggagctaaagcagatgctcaaagtggtggt
gacccgactaacgacaatgacaatggtgacacatatggacaggcgtcggttggacttacc
ccaatggaaggtactacttatacttataaggtctatgtctacgggactaagcagaacgtt
acttaccaatacgttgatgttaaccataaagatcggattctgacttcaccgctatcaggt
caaaccggtaaagaagcagttggtggtgtaacaccggctaactatggcaacacgattgac
tggacaaacaagtactatactgaagacaatgtgccagctggttatcattatgcgatagga
gcagctaaccaacctaagaccactttagtatcagaaaataatccaatcgtaacgatttat
gtagaaggtaacaatcaaaagattaatccgaccctgcaagataccaatggcaaccggatt
gttcctaattcaccatttgaaattgacggtattaccggccaaataattaagctaccagca
gctccagatgccaataactgggccttagaccatgtgattgtgaacggtcagcggaaagaa
gttggctcagagtttgaattcggcaacggaacagatgaaatcacttatgtttaccacccc
ttagacgtagagaagcaggccgctaatacggccattgatgccgaagcgactaaggttaag
ggcgagatagatgcagatccaacgcttgatagtgcagctaaggccaagcaaaagggtgat
gtggacaaggcggccacaactgccaaagataatatcaataaggcagtattgccagcccaa
gttgatcaggccaagcaagctgggattgcagcgattgacgccgcccacgtagctgggatt
gcgcttgatcaacaaaagaaagattacagcaagcaaatcgatgatgaagccactaagatt
aagggtgaaatcgatgccgatgaaactttggatgatgaaaccaaggtaaaacaaaaggga
gacgttgataaagacgcagcggatgctaaggcagccatcaatagtgccactaatatccaa
gcgattaaagacgcaacggcagccgggattattaagattgatggtgaccacattccaggt
agtgtttccttgcctgaccaaaagaaggcagcgattgcggcgattgatgccgaagccacc
aaggtcaagggtgagatcgatgccgattcaaccttagatgacgccaccaagaagaaacaa
aagggtgacgttgacaaagacgcagcggatgcgaagacggcaattaataatgcccttaac
gctcaacaagtcaagaatgccaaggaagcggggatcatcaagattgatggtgaccacgtt
ccaggtaacatttcgctgcctgaccgcaagacaaatgcgattgcggcgattgatgccgaa
gcgactaaggtcaagggcgagattgatgcggatgtcactttagacacggccactaagaac
aagcaaaaggctgatgtcgatcgtgacgcggccgctgctaaagacaagatcaacagtgca
actacggctcaaggagtaatcgatgccaaggatgaagggatcgtcaagattgatggtgac
cacgttccaggcagcatttccttgccagtgcagaagacgaatgcgattgcggcgattgat
gccgaagctactaaggttaaggccgagattgatgcggatgtgaccttagacacggcgact
aagaatgagcaaaaggctaacgttgatactgatgcggcaattgccaaagcaaacattaac
agcgccactaatgctcaaggggttaacgatgccaaggaagcggggatcatcaagattgat
ggcgaccacattccaggtagtatctccctgccagtacagaagactgacgcgattgcagcg
attgatgccgaggctactaaggttaagggtgaaatcgatgccgatgtcactttagatacg
gccactaagaatgagcaaaaggctaatgtggataaagatgcggccgctgccaaaaccaac
atcactaatgccaaggatgcccaaggggtgaaggatgccaaggaagcggggattatcgca
attgatgcggaccatattccaggcaatgtttccctgccagtgcagaaggctgatgcgatc
gcggcgatcgagaatgaagccactaaggttaagggtcagattgatgcggatgtcacgctt
aatagtaaagaaaagaccgcgcaaaaggccaacgtggacaaggacgcagctgatgccaag
acagcgattaatgccgccactaatgcccaaggggtgaaggatgccaaggatgccgggatc
atcaagattgatggtgaccacattccaggtagtgtttccctgccagatcaaaaggatgcc
gctaaggcagcgattgatgcggaagccactaaggtcaaaggcgaaattgatgccgatgaa
acgttagacacggctactaaggccaagcaaaagggtgacgtggacaaggatgcggctgat
gcgaaggcagcgattaataccgctaaggatgcccaagctgtcctagacgctaaggaagcc
ggcatcatcaagattgatggtgaccacgtttcaggcaatatttccctgccagatcaaaag
actaatgcaatcgccgccattgatgcggaagcaactaaggttaagggtgagattgaagcc
gatgtgaccttagacacggcggctaaagacaagcagaaggctaacgttgacattgatgcg
gccgctgctaaaactaacattatgaacgccactaatgcccaaggggtgaaggatgccaag
gatgccgggattattaagatcgatggtgatcacattccaggtagtgtttccttgccagtg
caaaaggccaatgcgcaagcagccattgacgccgaagccactaagatcaaggccgaaatt
gatgcggatgcgaccttagacacggctactaagaataagcagaagggtgacgttgatacc
gacgcaacgattgccaaggcaaacattaacaaggcaactgatgctcaaggagttaatgat
gccagagatgccggaatcgctaagattgatagcgatcacgtcccaggcaacatttctcta
ccagatcaaaagaccaatgcccaagcagccattgatgcggaagctgccaagatcaaggcc
gaaattgaagccgatccaacgcttgataacgcagaaaaagtagttcaaaagggcaatgtt
gataaagatgccgcaattgctaagaataatattagtcaggcaaccaacgcccagggtgtt
aatgacgccaagaatgccggcattatcaagatcgatggtgaccacattccaggcagtatt
tccctaccagatcaaaaggatgcggctaaagcagcgattgatgcggaagcagctaagatt
aagaaagaaatcgatgccgatccaacgcttgataatgtagaaaaggcaacgcaaaagact
aacgttgatgcggatgccgctgacgctaagattaagattgagcaagcagttaatgcccaa
ggggtgaaggatgccaagagtgccgggatcatcaagattgatggtgaccacattccaaat
ggtacttcactattagcgcaaaagactaacgctcaagcaattattgatgccgaagctgct
aagattaaggcagaaatcgaagcggatgttacccttgataatgctgaaaaagcaacgcaa
aagaacaatgttgataaagacgcttcagcagccaagcttaatattagtcaggcaactgat
gcgcaaggcgtaaaagatgccactaacgcgggaattgccaagattgacagtgatcacgta
cctaatagcatctccttaccagatcagaagaaggcagctcaggcagccattgatgcggaa
gctaccaaggttaagggtgagatcgatgccgatgatacccttgatggaacttctaaggca
gcacaaaaggctaacgtcgataaagacgctacagatgccaaaaacaagattgagcaagca
attaatgcccaaggggtgaaggatgccaaggaagcggggatcatcaagatcaatggtgac
cacattccaaatacagtttcactccctgaacaaaaggctaatgcacaaaaagctatcgat
gatgaagctgaaagagttaaggctcaaatcaatgatgatgtgactttggataatgcaact
aaggcagtccaaaaggctaatgttgacagagatgccacagcggccaaaacaagcatcagc
caagcaactgaccttaagggcattaccgatgcaaaagaattgggaatttcgagaattaat
agcgatcatatcccaggtaaggcgttagaagatcaaaagaaggctgctcaaaaagccatt
gatactgaagcaactagaatcaaggccgaaattgatgccgatgactcattagacgatgca
actaaatctaaacaaaaaggtgccgtcgatagagatgtattgggtgcacaaaatgcaatt
gaccaagcagttaatgctcaagctgtcattgatgctagaaatgatggaattgccaagatt
gatagcgagcatgttggaaataatgtttctctatcagatcaaaagttagcagcctacaag
gccattgatcaagaagcaactaaagttaagactttaattgataatgacccaagtttagat
agtacagctaagaataagcaaagaactaatgttgatactgaggtaactagagccaaggca
gcaattgacgatgcaagtaatgcgcaggaagttaaagttgctcgttacaatggtattacg
gcaattgatgctcaatatgtatctaatgcagtaactttacaagagcagaaagataatgct
aagcaattaattaatgacgaagcagcaattgtcaaaactgctattagtaaggatgctacg
ctggatgatgccactaagttgcaacaaacccgtgcagtagacgatgaaaagcaaaaagca
cttgacacaattagtcaggcaattgatgctcaaggcatccaaaaggcctacaacgatggt
atagttgcaattcacgcacaatacatttctgctgctgaattagctaagcaaaaggttgat
gctattactgcaattgtgcaggaagccaatacaattaaggatgcaatcaataatgatgta
actttaactacaaatgctaagaagcaacaaattgctaatgtcgaagtagaatctcaaaaa
gcccaaaatgcaattaatcgtgcaatcctatctcaagaagttagggatcaactgaatgca
ggaatcaaagcaattgatgcacaatatgttcctggcaaatcacttgatgagcaaaaagcg
gatgccattgctgcaattgatcaggctgcccaagatgccaaagacaaggtagacaaggac
aagaacaagactgatgaagagaagcagaaggaaaaagatgaaattgacaaggctgcttcc
aacgctaaagatgaaatcaaccatagtacaactgctgatggaattgagcaagctaaggac
aagggaacatcaaatattaaccaaattgtagttgataataaccttgataaccaaaaagtt
aatgctaataaggaaatcgatgccgctgctgccgctgctaaggataaggttgataaagac
ccgaccaagacagatgctgaaaagcaaagagataaagcagccattgatgccgcagcagca
gcagcaaaggataaagtcaataatgccaagaacaagggtgaagttgacaaggccaaacaa
gatggtattgatgcaatcaatgctattgccaatactccaggtcttgaacaacaaaagact
gatgccaataaagaaatcgatgatgccgctaatgcagccaaagataagatagacaaagat
aagaataagaccgatgaagagaagcaaaaagaaaaagataagattgaccaaattgcttct
gatgctaaagacaaagtaaataactctaatagcaaggatgaggttgataaagccaagcaa
gacgctattgatgcaatcaataacgtcgtaaatggtaatggttctaacggctctaacggc
tctaacggctctaatggctccggtggttctaacggctctaacggttctaatggctccggt
ggttctaacggctctaatggttctaatggttctaatggctccggtggttctaacggttct
aacggttctaatggttctaacggttctaatggctccggtggttctaatggctccggtggt
tctaacggctctaatggttctaatggctccggtggttctaacggttctaacggttctaac
ggttctaatggctccggtggttctaacggttctaacggttctaatggctctaatggctcc
ggtggttctaatggctctaacggaactaacggttctaatggctctaacggaactaacggt
tccaatggtaataatggaaccaacggttccaatggtaataatggaaccaacggttccaat
ggctccggtggttctaacggttctaatggctctaacggaactaacggttccaatggtaac
aatgggactaacggaactaacggtaagcttgatagaacaaatgcggcttccaaagtgctt
aagcacaatgcttacttctacaacaaagaaggtaagcgtgccaacctattagtagctaag
aagggttcgacgattacaacgtacggtaccaagtctattaatggccgtgatttctaccaa
gttggtgagaatctttacatcgctgttcacaatgttaatagtcggaagcgtactttaaag
aagaatgcatttgtctataacagtaagggcaaacgtgttggtaagaaactcttgaagaag
aagaccagagttagcgtttacggtgacccagtgaagattcgtggtaagtattactacatc
actgctaataatcgttacgtcaaagcaaggaattttggttcaattttaattgaagctaat
aacgtgattgctgctggcgtaagctcaaatgctgaactttcacagaactcatatgtttat
gacgctgacggcaagcgcgtagacggctatgttattctagctggttctaaagtaatcgcc
ggtgaagctaagagcgttaacggccaagaactagtttcaattggtgacggatactatgtt
gcaaagaacaatgtggacaagtattaa
DBGET
integrated database retrieval system