Lysinibacillus sp. BS3: AAJG31_17620
Help
Entry
AAJG31_17620 CDS
T11289
Name
(GenBank) collagen-like protein
Organism
lyi Lysinibacillus sp. BS3
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Collagen
C1q
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
XAO90664
LinkDB
All DBs
Position
complement(3563409..3566573)
Genome browser
AA seq
1054 aa
AA seq
DB search
MHFGNFIDRVCSKCHSFPCCCKTGPIPSCPIWPVKPTGPTGGITGPTGSTGVTGVTGATG
VTGTTGVTGATGATGATGVTGVTGSTGETGATGVTGATGVTGATGFTGGTGVTGATGATG
ATGATGATGATGATGATGVTGVTGATGTTGGTGATGVAGSTGATGVAGATGVTGSTGVTG
ATGVTGGTGGTGATGLTGSIGPTGATGVTGATGVTGAIGPTGVTGATGVTGVTGATGVTG
LTGATGVTGATGVAGSTGATGVTGATGVTGATGATGVTGATGVAGSTGATGVTGATGVTG
ATGVTGLTGATGVAGSTGATGVTGATGVTGATGVTGVTGATGVTGVTGATGVTGVTGATG
ATGVTGATGVTGAIGPTGATGVTGSTGTTGVTGAIGPTGATGSTGATGVTGATGVTGVTG
ATGATGVTGATGLTGAIGPTGLTGAIGPTGATGVTGATGVTGSTGETGATGVTGSTGTTG
VTGAIGPTGATGSTGATGVTGATGVAGATGETGATGVTGATGVTGVTGATGLTGAIGPTG
ATGVTGSTGTTGVTGAIGPTGATGSTGATGVTGVTGATGVTGVTGATGVTGVTGAIGVTG
VTGATGVTGVTGAIGVTGVTGAIGPTGATGVAGATGVTGVAGATGVTGVTGSTGVIGATG
STGVTGATGTTGVTGATGVAGATGVTGATGVTGSTGVTGATGATGSTGVTGATGATGVTG
ATGVAGATGAIGPTGVTGATGVAGVTGATGVTGSTGVTGATGSTGSTGVTGATGATGSTG
VTGATGTTGVTGATGVAGATGETGATGATGATGVTGAIGPTGTTGITGATGVTGAIGPTG
VTGAIGPTGVTGSTGTTGATGVTGSTGVTGATGVTGVTGATGVTGVTGATGATGPAFSEG
FSAFKNTLAVSGSTSITNWSVASPYFTTPAFNPTTGIFTVPTTGRYSFEATINYSTAAAI
TVTLGAGINPSFAIRQNATTNLISGLFPVLNVNVALVLTLRAVLGNGTITLAGEVNLNAG
DTIDLFYEANGLTISLTLGGANSGGIVWSCHRIS
NT seq
3165 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcattttggaaattttatagatagagtttgcagtaagtgtcattcatttccttgttgt
tgtaaaactggtcctattccaagttgtccaatttggccagtgaaacctacaggaccgact
ggggggataactggacctacaggtagtacaggtgtgactggcgttactggggctactggc
gttactgggactactggtgttactggtgctactggcgctactggggctactggggtaacc
ggcgttactggttctacgggtgagactggggctactggagtaaccggcgctactggggta
accggcgctactggctttactggcggtactggggtaactggggctactggggctactggg
gctactggggctactggggctactggggctactggggctactggggctaccggtgttact
ggagtaaccggcgctactggcactactgggggaactggggctactggtgttgctggttct
actggcgctaccggcgttgctggggctacgggtgttactggttctacgggtgtaaccggg
gctaccggcgttactgggggaactgggggaactggggctactggcttgactggttcaatc
ggacctactggcgctactggggtaaccggcgctactggcgtgactggtgcaatcggacct
actggagtaaccggggctaccggcgttactggggtaactggggctactggcgttactggg
ctaactggcgcgactggtgtaaccggggctaccggtgttgctggttctacgggcgctaca
ggtgtaactggcgctactggagtaaccggggctaccggcgctactggagtaaccggggct
accggtgttgctggttctacgggcgctacaggtgtaactggcgctactggagtaaccggg
gctaccggcgttactgggctaactggcgctaccggtgttgctggttctacgggcgctaca
ggtgtaactggcgctactggagtaaccggggctaccggcgttactggggtaaccggggct
accggcgttactggggtaacgggggctaccggcgttactggagtaaccggggctaccggc
gctactggggtaaccggcgctactggcgtgactggcgcaattggacctactggcgctacc
ggcgttactggttctacgggcactactggcgtgactggcgcaatcggacctactggcgct
actggttctaccggcgctaccggcgttactggggctaccggcgttactggggtaaccggg
gctaccggcgctactggggtaaccggcgctactggcttgactggtgcaatcggacctact
ggcttgactggtgcaatcggacctactggcgctactggagtaaccggggctaccggcgtt
actggttctacgggtgagactggggctaccggcgttactggttctacaggcactactggt
gttactggtgcaatcggacctactggcgctactggttctaccggcgctaccggcgttact
ggcgctaccggcgttgctggggctacgggtgagaccggcgctactggggtaaccggggct
accggcgttactggtgtaaccggcgctactggcttgactggcgcaatcggacctactggc
gctaccggcgtgactggttctacgggcactactggcgttactggtgcaatcggacctact
ggcgctactggttctaccggcgctaccggcgttactggggtaactggcgctaccggcgtt
actggagtaaccggggctaccggcgttactggggtaactggcgctatcggcgttactggg
gtaactggcgctaccggcgttactggggtaactggcgctatcggcgttactggtgtaact
ggcgctatcggacctactggcgctactggcgttgctggggctacgggtgtgactggcgtt
gctggggctacgggtgtgactggcgttactggttctacgggtgtgatcggcgctactggt
tctacgggtgtaaccggcgctactggcactactggcgttactggggctaccggcgttgct
ggggctacgggtgtgaccggcgctactggcgttactggttctacgggtgtaaccggggct
actggcgctactggttctacgggtgtaaccggggctactggcgctactggggtaactggg
gctaccggtgttgctggggctaccggcgcaatcggacctactggcgttactggagctacc
ggcgttgctggggtaactggggctactggcgttactggttctacgggtgtgaccggcgct
actggttctactggttctacgggtgtaaccggggctactggcgctactggttctactgga
gtaaccggcgctactggcactactggcgttactggagctaccggcgttgctggggctacg
ggtgagaccggcgctactggggctactggggctactggcgttactggtgcaatcggacct
actggcactactgggataactggggctaccggcgtgactggcgcaatcggacctactggc
gttactggcgcaatcggacctactggcgttactggttctacgggcactactggcgctact
ggggttactggttctacgggtgtaactggggctaccggtgttactggggtaaccggggct
accggcgttactggtgtaactggcgctacgggtgctactgggcctgcgttttctgaagga
ttctctgcctttaaaaacacgttggctgttagtggatctacttcaatcactaactggagt
gttgcttcaccatactttacaacacctgctttcaatccaacaactgggatattcactgta
ccaactacaggtaggtattcctttgaagcaaccattaactactccactgctgcggctatt
accgttactttaggagcaggaataaacccttcatttgcaattagacaaaatgctactaca
aatttaattagtggcttgttccctgtactaaacgtcaatgtggcgcttgtattaacttta
cgcgcagttcttggaaatggcacaatcactttagcaggagaagtgaatttaaatgctgga
gatacgattgatttgttctatgaagcaaatggattgactatctctcttacactaggcggc
gctaactctggtggtattgtttggtcatgtcatcgaatttcttag
DBGET
integrated database retrieval system
