Lysinibacillus sp. OF-1: NV349_00885
Help
Entry
NV349_00885 CDS
T10748
Name
(GenBank) cadherin domain-containing protein
Organism
lyo Lysinibacillus sp. OF-1
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Cadherin
SLH
Flg_new
Cadherin-like
Big_5
CopC
DNA_pol3_beta_3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WCH47982
LinkDB
All DBs
Position
170701..175287
Genome browser
AA seq
1528 aa
AA seq
DB search
MDLVSFIKTAVYKILITLTILAMVFSTLGIQPASASSTVPPLLPVAQLNALNDSNGNFEK
YINEGIYLDVSKTTDNKTRVAAVKFNNINTTKSIISANLILNVTNDNDNINDMPVSDLVI
RVGSSNWNDGSFPNNLDIPSEKVSVLKDTSGEPINVSIDVKELLKNPSAIDTQQITFLLS
SDAKNMVIVKSENPIAPELGPYLEITYGDVQNSAPTDITLSSTSVIESQPSGTKVGTLSA
ADPDAVSSFTYSLVGGSGSTDNSSFSIVGNELRTNSSFDYQAKNSYSVRIQVTDNGGLTF
EKIFTISVTKLNERPTDIVLSSLTVAENQPVGTVVGTFSATDPNVGETFTYSLVAGTGAT
DNSSFTVDGNQLKTAGIFDYEAKNNYSVRIQVSDSANNLYEKAFTINISDVNEAPTDISL
SPTSVEENQPSGTKVGTLSATDPDAGSSFTYSLVGGAGSTDNSGFSIAGDKLQTNSPFDY
ETKNSYSVRIRVTDQGDLSFEKVFTISVTDVNEVPIPTLVSTVPVNKMTNASINPTLTLN
FSKSVSGIAGKHLRIYDQDNNLIETIEATATNVTVNGSNVSIQLTNNLIKATTYYVLMDD
GTFVDTSNQGVAGITAKNIWSFTTLPPSNNAYLSNLVISPGSLSPNFTDSILDYQINVAH
NVENIGIMPTTANSSATLTVNGSSIASGLLNTIPLNVGSNTITIVVTAENGVATKTYTLT
VIRALPTLEQVDNVALSPSGIATWTDLTGESCYAVQLLKDGSPIGSIVDISADTTTHNFL
PAMRAAGVGTYTVTVTAKGDGLVYLDGVPSSHSNTQTVIKLASITNGLSWDGNIAKWQTI
PNALSYDVLLYKEGTAVGTAANVLAGNINEGVDFTTAFQTNSIGSYTFTVQPKGDELLIL
DGDQGVSSSAKIITPLTYTVLYNGNGSTGGTAPQDNATYSQNDNIIVAANGGYLVKIGHS
FIGWNTKADGTGTSYLPNETFKMAKENVTLFAQWTINHYTVSFDVAGGSVVSNQVVAHRG
KASQPTQVPTKAGYTFGGWYTSSAYTTPYTFDNVITANTVIYAKWISNNTGGGNTDPSPN
LEPGSAIPSTKVEEIVIDVESGDGNLVSKTTIKRTKNVDNTMKDEVTLTAESATETIKKL
KEQGNDTARVIIPDQKDQVNQVHVSIPNNVVTLLKTGAVHLEIVTDNVRIEVPKTSLEIF
NDDLYFRLVPIKELDKQLEIKERAKREIVVQQLVESAVVELLGRPMTIETNMQNRLVILT
LPLPTDLTDEQLAHLAIFIEHSDGSKEVVRGKVVEYQKGIAGLQFEVNKFSTFSILYVPE
KEDVKEPTTDAVTHTPYIQGYPDGTFRPNAPVTRAQMASMFARQLTGNAIPQARATYTDT
IQHDAKDAIEFAKDAGLFKGITETNFHPDGFITRAQMATVAVRWMERHCADSPNVEFCKS
TSQGMIFKDVSVNHWAVKAINAVNGLGIMNGMTVDIFNPDGYLSRAEAVKVLNDLFERQV
TTELQTPIFKDVLSNHWAFNEIQEAAKK
NT seq
4587 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggatttagtatcttttataaaaacagcagtatataaaatattaataactttaaccatt
ttggcaatggttttctcaaccttaggaatacaacctgcaagtgctagttctacagtaccg
ccgttacttccagtagcacagttgaatgcactaaacgatagtaatggcaacttcgaaaaa
tatattaacgaagggatttatttagatgtttcaaagactactgataataaaacacgtgta
gctgctgtgaaatttaataatattaatacaactaaaagcattatttcggctaaccttatt
ttaaatgttacaaatgataatgataatattaatgatatgccagtttccgatttagtaata
agagttggatcaagtaactggaacgatggtagttttccaaataatttagatataccttct
gaaaaagtatcggttttgaaggatacgtcaggcgagccaattaatgtatcaattgatgta
aaagagttattgaaaaatccctctgcaattgatacacaacagattacatttttactgagc
agcgacgctaaaaatatggtaattgtaaaatcagaaaatccaattgcacccgaattgggc
ccatacttagagattacgtatggtgatgtgcaaaatagtgcacctaccgacataacatta
agttcgacttcagtaatagaaagtcaaccatcaggaaccaaagtagggacattaagtgcc
gctgaccctgatgcagtttcctcttttacgtatagtctagtaggaggatccgggtcaaca
gataatagtagttttagcatagtaggaaatgaactacgaacgaatagttcatttgattat
caagcaaagaacagctatagtgttcgaattcaggtaacggataatggaggattaaccttt
gaaaaaatattcaccatttcggtgacaaaattaaatgagcgtccaactgatattgtgctg
agctcgctgacagtagcagaaaatcagccagtaggaacggttgttggtacatttagcgca
actgatccaaatgttggagaaacgtttacttacagtttagtggctggcacaggagctaca
gataacagtagctttaccgtcgatgggaatcagctaaaaacagcaggaatatttgattat
gaagcaaagaataattacagtgtgcggattcaagtatccgatagtgccaataatttatat
gaaaaagcattcactataaatatttcagatgtcaatgaagctccaacagatatttcatta
agcccaacatcagtagaagaaaatcaaccatcaggaaccaaagtgggtacattaagtgcc
actgatcctgatgcaggttcctcttttacgtatagtttagtaggtggtgctgggtcaaca
gataatagtggctttagtatagctggggataaactacaaacgaatagtccatttgattat
gaaacaaaaaatagctacagtgtacggattagggtgacagatcaaggcgacttatctttt
gaaaaagtgtttactatttcggtgacagatgtcaatgaagttccgattcccacactggta
tcaaccgtaccagttaacaagatgacaaatgcttctattaatcctacgctaacgctaaat
tttagcaagagtgtgagtggtattgcaggaaaacatcttcgtatctatgatcaagataat
aatttaatagaaacaatagaagccactgcaacaaatgtgacagtgaatggcagtaacgtg
tcaattcaattaacaaataatttaataaaagcaacaacttattatgtattgatggatgat
ggaactttcgttgatacatccaatcaaggtgtagctggcataacagcaaaaaatatatgg
agttttaccactttacctcctagtaataatgcctatttaagtaatttagttatttcacca
ggcagtttaagtccaaattttacagatagtatattggattatcagatcaacgtggctcat
aatgttgaaaatattggtataatgccaacaactgcaaatagtagtgcaactcttacagta
aatggttcctccattgcaagtgggctattgaacacaatacctctaaatgtaggcagtaac
acaattaccattgttgtgactgctgaaaacggagtagcaaccaaaacatatacccttacg
gtgataagagcattacctactctcgaacaagtagacaatgttgctttaagccctagtggt
attgcaacatggacagatttaacaggcgaatcttgctatgctgtgcagctcttaaaagat
ggctctccgattggtagtatcgttgacatatcagcagatacaacaacgcataatttctta
ccagcaatgcgtgcagctggagtggggacatatacagtaaccgtaactgccaagggagac
gggctagtatatttagatggagttccgtcaagccattccaatacacaaacggttattaag
ctagcaagcattacaaatggcttgagctgggatggaaatattgcaaaatggcagactatt
cctaatgcgttgagctatgatgtgcttctgtataaggaaggaacggcagttggaacagca
gcgaatgtattagctggaaatatcaatgaaggtgttgattttactaccgcgttccaaaca
aatagcataggaagctatacttttactgttcagccaaaaggtgatgaattactaatttta
gatggggatcaaggggtatcatcatcagcaaaaattataacacctttaacttatacggtt
ttatacaatggtaatggtagtacgggtggaactgcaccccaagataatgcaacatatagt
caaaatgacaatattattgtagctgcaaatggtgggtacctcgttaaaatagggcactct
tttataggctggaatacaaaggcggatgggacagggacttcttatttgccgaatgagacg
tttaaaatggctaaagagaatgtcacactttttgcacaatggacaattaatcattatact
gtgagctttgatgtagcgggaggaagtgtcgtttcaaatcaggtggtggcacatagagga
aaagcaagtcagccgacgcaagtgccaacgaaagctggctatacatttggtggctggtat
acgagtagtgcctacacaacaccatatacttttgataatgtaattacagcgaacacagtg
atctatgctaaatggattagtaataatacaggtggtggcaatactgatccatcaccaaat
cttgagccaggttcagcaataccttcaaccaaagtagaggaaattgtaatagatgttgag
tctggtgatggaaacctagtttctaaaacaacaataaaacgaacaaaaaatgtagacaac
actatgaaggatgaagtgacattaacagcagagagcgcaacagagacgattaaaaaatta
aaggaacaaggaaatgatacagcaagggtcatcattccagaccagaaggatcaagtaaat
caagttcatgtttccataccaaataatgtagtgacacttctaaaaactggtgcagttcat
cttgaaattgtcacagataacgttagaattgaagtgcctaaaacttcattggaaatattt
aatgatgacctctatttccgacttgttcctataaaagagctagataaacaactagaaatc
aaagaacgagccaaaagggaaatcgttgttcagcaattggtcgaaagtgcagttgttgag
ttgcttggtcgcccgatgacaattgaaacaaatatgcaaaaccgtcttgttattttaaca
ttgccgttgcctacagatttaacagatgaacaactagctcatttggcaatctttatcgag
catagtgatggctcaaaagaggttgtacgtgggaaggttgtagaatatcaaaaaggaata
gcaggcttacagtttgaggtaaataagttctctactttctctattctctatgtaccagaa
aaggaagatgtaaaggaaccaactactgacgctgttacacatacaccttatattcaaggc
tatccggatggtaccttccgtccgaatgcccctgttacaagagcacaaatggcaagtatg
tttgctcgtcaattaacaggtaatgcaattccccaagcgagggcgacatatacagataca
atacaacatgatgcaaaagatgcaatagaatttgcgaaggatgcaggtttatttaaaggc
attactgagacaaacttccatccagacggctttattacacgagcacaaatggcgacagta
gcagttcggtggatggaaaggcattgcgcagacagtccaaatgtagaattttgtaaatct
acctcacaaggtatgattttcaaagatgtgagcgtcaatcattgggctgttaaagcaatt
aatgctgtcaatggattgggcattatgaacggtatgacggtggatatatttaatccagat
ggttatttatcacgtgctgaagcggtcaaagtattaaatgacttgtttgagcgtcaagta
acaacagagcttcaaacgccaatatttaaagatgttctgagtaatcattgggcatttaat
gagattcaagaagcggcaaaaaaatga
DBGET
integrated database retrieval system