KEGG   Lysinibacillus sp. OF-1: NV349_00885
Entry
NV349_00885       CDS       T10748                                 
Name
(GenBank) cadherin domain-containing protein
Organism
lyo  Lysinibacillus sp. OF-1
SSDB
Motif
Pfam: Cadherin SLH Flg_new Cadherin-like Big_5 CopC DNA_pol3_beta_3
Other DBs
NCBI-ProteinID: WCH47982
LinkDB
Position
170701..175287
AA seq 1528 aa
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DBGET integrated database retrieval system