Lysinibacillus sp. Ag94: MY533_16005
Help
Entry
MY533_16005 CDS
T10411
Name
(GenBank) type I polyketide synthase
Organism
lyq Lysinibacillus sp. Ag94
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UPW82240
LinkDB
All DBs
Position
complement(3453318..3458861)
Genome browser
AA seq
1847 aa
AA seq
DB search
MMTLKDNLIEPIAVIGIGCRFPGGVNSPESFWELLSNEVDAITEIPSDRWSISNFYSSNK
VNQGKSNSMWGGFLDNVDQFDASFFGISPREAALLDPQQRLLLEVCWEAMENSGQMQERL
AGTNVGVFMGAFTLDYKLLQFSESNRHLVDAHSATGAMMTLLANRISYTYDFRGPSITVD
TACSSSLVALHLACQSIRNGESTMAFAGGVNVMIKPEYFIAESKAGMLSADGRSKAFDSS
ANGYVRGEGAGVVLLKPLSQAIQDNDPIHAIIRGSGVNQDGNSQGITVPRAEAQKQLLCD
VYEKSGIKPNQVQYVEAHGTGTPVGDPIEANSLGSILGADRVPGDKCYIGSVKTNIGHTE
AAAGVAGLIKTILCLKNRQIPAHLHLKNANPDIDFEKLNIKVPTKLTAWPETDVAIASVN
SFGFGGTNAHVVLQEYVPNETIQDIEKTEDLQTIVLSARNTQALKDYAKDFKRAISDNKY
SLRDIGYNAITRRSHHSHRLAITTNSVDKLMEKLDVFLEDGKEAGIVSGVADNKKSPLSL
VFTGMGPQWWAMGRELLQKDDVFRKAVEQCDEIFKRLSGWSIIDAMLADELSSKMEETEV
AQPANFMLQVGLAELWKSWGITPDAIVGHSAGEVAAAYCAGVYSLEDAVKVIYHRSNLQQ
RTTGLGQMVAVGLSFEEARIEILDLDQISIAAINSPNAVTLAGAPESLDILIESLEKKKI
FYKYLNVKVPYHSHYMDPLKEDILNALKDIKVHKPHTPIYSTVTGKLMSNDDFTAYYWWK
NVRDSVLFAAAVNNMIEDGFYNFIEVGPHPVLANSISECLSLHNVQGLIIPSLRRKTVDK
EVLFESLGALYTKGYAINWDNIHKKADNTICLPTYPWQRERYWQESLISEQERLGTHVHL
LLGKKLNTPEPTWENDLDLNRLPYLCDHQIQGAYVYPGAAYVEMMLAASKELFGSTGFVC
GESVKFNKALFLTLGESVKLRLVYSVENSTVSIYSQPTGVSQDWTLHAEGQIRPNVSLKS
QNKELQVLKQRCTLQLSQEQCYLQFRKFGLEYGETFQGIETLWQGEQEALAKISLHEIIG
AQLDEYEIHPSILDLCFQVLAAALPFQEDEENTTVYMPVGVAKGALHQKVRLNTDLWIHA
SILNKTETSLEGDIHLFDSEGNIIMEILGCNAVSLKDTTSSNKSLGTQDIYELQWHTQVR
KEASEYSPVKNVSDKGYWIIFEDEQKIGHSVAEKLMKVGEHCYSVHPGVKYEKTNNIFTI
NPSNSEDFVILMDDILSDSAQCRGIIYGWALDNKVTDILNTNGLNRVEELGCVGLLHLVQ
SIVHKQLPDNVRLWVATTGAQQVGTDSLNNVAQSAVWGLAKAIGHQEHMNLWGGIIDLDD
SLSVEKNSNLLFEEIWNTDGEDHVAFRQGERFVVRLEEDVQLNKPLPIVFRPDASYLITG
GFGGLGLLTARWMIKKGARHLILMGRGKFHNRLDWDKVDIDSVEGKRITAIKELESLGAT
IHIATADVCNKSEIEKSLLQYSEAGWPEIRGVIHTAGVARPQLLYQMNQQQFTDVLRPKM
IGGWNLHEHFENQSLDFFVLYSSIASVVVMSGQANYSAGNAFLDGLAQYRRSRGMHGLSI
NWGPWLESGMATQLDLLNYFDNRGLYSMTNDQGLEALNQLLCQNRAQFSVVGADWPKVAD
KNYPLGNVPPIIAELVNKHRELQSHTDNSEDNSQDFLNSLLQLKDRKEQLSQLEAHIMEL
SCAVLRLNRTQIEVNVPLNAFGLDSMMAMELKNTIEASLQVTIAVVDLLRGVTSQELAIN
IMEMLDKKHNLIQDEEVEQIISDLGELSEDKINDIISLVAAGRDQVE
NT seq
5544 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatgacattaaaagataatttaatagaaccaattgcggtaataggtattggatgccgt
ttcccaggaggtgtaaactcaccagaatctttctgggagttattaagtaatgaagtggac
gctataactgaaattccaagtgatagatggagtatatcaaacttctatagttctaataag
gtaaaccaagggaaatcgaattctatgtggggtggatttttagacaatgtagatcaattt
gatgcctctttctttggtatatctcctagggaagcagctttattagatccgcaacaacgt
ttgcttctagaagtttgttgggaggctatggaaaattcaggtcaaatgcaggaacgttta
gcaggtacaaatgtaggtgttttcatgggtgctttcactttagattataaattattgcaa
ttttcggaatctaacagacatttagtagatgcacactcagctacaggcgcgatgatgacg
ttattggcaaaccgaatttcttacacatatgatttccgtgggccaagtattacggtggat
acagcatgttcttcatcccttgttgcgttacatttagcttgtcaaagtataaggaatggg
gaaagtacaatggcattcgcgggcggtgtcaatgtaatgattaagccagaatattttatt
gctgaatctaaagcagggatgttatcagctgatgggagatctaaagcatttgattcttct
gctaatggttatgtacgtggcgaaggagcaggagttgtattattaaaaccactttctcaa
gccattcaggataatgaccctatccatgcaattattagaggtagtggggttaatcaagat
ggtaattcccaaggtattactgtgccaagagcagaagcacaaaaacaattattatgtgac
gtttatgaaaagagtggtattaaacctaatcaagtacagtacgtagaagctcatggaaca
ggaacgccggttggagatcctatagaagcgaattcattaggaagtattttgggggctgat
agagttccaggggacaaatgttatatcggatcagttaagactaatattgggcatacggaa
gctgcagcaggtgtagcgggattaattaaaacaattctttgtttgaagaaccgtcaaata
ccggctcatcttcaccttaagaatgccaaccctgatatcgattttgaaaaactaaatatt
aaagttccaacaaaattaactgcttggccagaaactgatgtagcaattgctagtgttaat
tcatttggattcggtggaacaaatgcccatgtggttttacaagaatatgtacctaatgag
actattcaggacatagaaaaaacggaggatctccaaacaatagttttatctgcacggaat
actcaggcattaaaagactatgctaaagatttcaaaagagctatttctgataataaatac
tcattacgtgatattgggtataacgctattacaagacgtagccatcatagtcatcgatta
gctataactacaaattctgtggataaattaatggagaaattagatgtattcctggaagat
ggtaaagaagctggtattgtctcaggagtcgctgataataaaaaatcacctttaagttta
gtattcactggaatgggtcctcaatggtgggcaatgggtagagaacttcttcaaaaagat
gatgtgttccgtaaagccgtagagcaatgcgacgagatatttaaacgtctttcaggatgg
tcaataattgatgctatgctagctgatgaactatcatccaaaatggaggaaactgaagtt
gcacagccagctaattttatgctacaagttggtttggctgaattatggaaatcatgggga
ataacacctgatgctatcgtaggacatagtgctggagaagttgcagcagcttattgtgct
ggtgtttacagtttagaagatgcagtaaaggtaatataccatcgaagtaatctacaacaa
cgtactactggattaggtcagatggtagcggtgggattatcttttgaagaagccagaatt
gaaattctagatcttgatcaaatatctatagctgctattaatagtcctaatgctgtaacg
cttgctggggctcctgaatcccttgatatacttattgaatcactcgaaaagaaaaaaata
ttttataaatacctaaatgttaaagttccgtatcatagtcattatatggatcctttaaaa
gaagatattttaaatgctcttaaagatattaaagttcataaaccacacacgccaatctat
tctactgtaactggcaagttaatgagtaatgacgactttaccgcctactattggtggaaa
aacgtaagagattcagtactttttgcagcagcagtgaataacatgattgaagatggtttc
tataattttatagaagtaggcccacatcctgttttagctaattctatttcagaatgcttg
tcacttcataacgttcaaggactaataatcccttctttacgtcgcaaaaccgtagataag
gaggtattattcgaatctcttggtgccttatatacaaaagggtatgctattaattgggat
aacatacacaaaaaggcggataatacgatctgtttacctacttacccttggcagagagaa
cgctattggcaagagtctttaatatccgaacaagagcgactgggaacacatgtccattta
ttactcggaaaaaaattaaatacacctgagcctacttgggaaaatgatttagatttgaat
cgccttccttatttatgcgaccatcaaattcagggagcatatgtatatcctggggcggca
tatgttgaaatgatgttagcagcatctaaagaattatttgggtctactggtttcgtctgt
ggtgaaagtgttaagtttaataaagccttgtttttaacattaggagagtctgtaaaatta
agactggtttactcagtggaaaactcaacagtttctatttatagtcagcctacgggagta
agtcaggattggacattacatgctgaagggcagataagaccgaacgttagtcttaaatct
caaaacaaagaacttcaagtcttaaaacaacgttgtactttacaactttcccaggaacaa
tgttatttgcaattccgtaaattcggtcttgagtatggagaaactttccagggtattgaa
acactatggcaaggtgagcaagaagcattggcaaagataagtttacacgaaataattgga
gctcaattggatgagtatgaaatacatccttctatcttggatttatgtttccaagtactt
gctgctgcattgccattccaagaggacgaagagaatacgacagtttatatgcctgtaggt
gtagcaaagggagctttacatcaaaaagttcgtttaaatacagatttgtggattcatgct
tctattttgaacaaaacagaaacatcattagagggagatatacacctttttgattctgaa
ggaaatattattatggaaattttaggatgtaacgcagtttcattaaaggatacaacttca
tctaacaaatctttaggaacacaagatatatatgaattgcaatggcatacgcaagtaaga
aaagaagctagtgaatattctcctgtaaaaaacgtgtctgacaaagggtattggataatt
tttgaagacgaacaaaaaataggacattctgttgcagaaaagctaatgaaggtaggagag
cactgctattctgtgcatccaggagttaaatacgaaaaaacaaataatatatttactata
aacccttcaaattctgaagatttcgttatattaatggatgatatactttcagattccgct
caatgtcgaggaattatttatggttgggcactcgataataaagtaacagatattttaaac
accaatggcttaaatagagtggaagaattgggttgtgttggtttgcttcaccttgttcaa
tctattgttcataagcaacttccagataatgttcgtttatgggtagcaacaactggagca
cagcaagtaggtacggacagtttgaataacgtagctcaatcagctgtatgggggctagca
aaagcgattgggcatcaggaacatatgaatttatggggaggaattatagatttagatgat
tccttgtcagttgagaaaaatagtaatctattatttgaagagatttggaatacagatgga
gaagatcatgttgcctttagacaaggggaacgttttgttgttcggttagaagaagatgtt
caacttaataagccactcccaatagtattcagaccagatgcaagttacttaattactggt
ggttttggtggtttagggttattaacggctcgctggatgattaaaaaaggcgctaggcat
ttaattttaatgggccgtggaaaattccacaatcgtttagattgggataaagtagatatc
gatagtgtagaagggaagcgtattacagctataaaagagctagagtcgctgggagctact
atccatatagctactgctgacgtatgtaataagagtgaaatagagaaatctctgcttcaa
tattctgaagctgggtggccagaaatccgtggagtaatccatacagccggggtagctcga
ccacaattattatatcaaatgaatcagcaacaatttaccgacgttcttcgaccaaaaatg
attggcggatggaacttacatgaacattttgaaaaccaatcactagatttctttgttcta
tattcatccattgcatctgttgtagttatgagtggacaggctaattattcagcaggcaat
gcatttttagatggattggcacaatatcgaagatctcggggaatgcatggattaagtatt
aactgggggccatggctagaatctgggatggctacacagcttgatttgctaaattacttt
gataatcgcggtttatattcgatgacaaatgatcaagggcttgaggcactgaaccaatta
ttatgtcagaatagagcgcaattcagtgtagtaggagcggattggccaaaagtagccgat
aaaaactatcctcttggaaatgtacctcctatcattgccgaacttgttaataaacataga
gaattacaaagtcacacggataattcagaagataattcgcaagactttttgaatagttta
ttacaattaaaggatcgtaaggaacagctatcacaacttgaagcacacattatggaatta
tcttgtgccgtgttgcgtttaaatcgtacacagatagaagtaaatgtaccacttaacgct
tttggtttagattccatgatggcaatggagttgaaaaatacaattgaagcaagtcttcag
gttactattgctgttgtagatttattacgtggggtaacttcacaagagttagcaataaat
attatggaaatgctagataaaaagcacaacttaatccaagatgaagaagtagaacagatt
atttcggatttaggagaactttcagaagacaaaattaacgatattattagtttagtcgca
gctgggagggatcaagttgaataa
DBGET
integrated database retrieval system