Lysinibacillus sp. YS11: LBYS11_02590
Help
Entry
LBYS11_02590 CDS
T05299
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
lys
Lysinibacillus sp. YS11
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Collagen_bind
SpaA
CarboxypepD_reg
bMG3
Ig_DR_A0283-like
Big_1
SdrD_B
Gram_pos_anchor
DUF5644
Presenilin
CarbopepD_reg_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AUS85279
LinkDB
All DBs
Position
551322..556811
Genome browser
AA seq
1829 aa
AA seq
DB search
MKKLNIAIIILLLVFQTVLSPISVFADESQPPVTPQNESSENTVIDSNGEVGNQNTTSEI
PSEDAAEVTTPEDETKSEEQTEGQPEEQPEEQPEGQQEEQPEEQQEEQPEEQQEGQQEGQ
PEEQQEEEQLENQPQLIMPLGAPVGYPVENMQADVTMSFSGLKLFSQGGALITNATDLAN
YSGPKPKKGDVVYLNYTFSLDPTIDYGIGSTFTFQLPANMIEEYTAGSFNQSRTLTDTGD
WLAYSSSYNSATKTVTVTIDSELEQGQSGSMNFEFMAKFDNFADESELEQSLIIPVLGGA
DVQLDFEFAPTGSGQLLTKNAGSITRDASGEVTIPWTVWVNTGGQKLESASLNDVPDTKH
ELAGNITVERYKIGLSGFNPNSPGAVDDTSNETSFPISLTDGYYAYKVTYNTVVTADPTA
SSMPYTNVATLTGTNIPANTTANGTQTVQYGPSLDKTRSGDKYNSTWTIKYNWLGQKIPA
DKAKLTDTLTGSSPTTGKHKIDYSSFEVYRVTLSNDGQTEQSSILLSEGQDYSFDSQNNY
NFIINFDHSTNTTGPAGEVTSAFKVVYDTELEDEFVTDANTGTITNTVTRGDSGSDTATL
DLASNIFNKARGAIDYVNKTITWTLTINAEKDLKNFVIEDDFTTTNKAGETLKHTLTPWN
GTDFYEVTGANGLTYTITDKGGSAPTIGNEGFKMEFSSDIPKDRTVTIRYKTKYDIKPNG
GVATAYINTADATWDGAIDSHNQALDRTANYTPDSTSPTNNNGYKKVVVDNQTQEFSWRI
GVNINKQDINSATLTDTLGAGHYIPVPDGQTLKDQITISKLNLTTEEGTKNGTLDPAKWT
VTETLTDNKVTGFEITFINLDPITDNNEAYLIEYKTKDADDIFGQNSTNAPRDYTNTATL
DTPHNGSYNYNATAKISNLANELIKKTATPVPASDIINWAVTVNASNSKLGNITLTDKPS
SNQKILTNTFKKQEIKLNANGTSQNIGSPITVDASEIVLNQDGSFSLNLGELNGKGYVVT
YSTFFMGDGNAGETISNSASIGYAGATAAGTSDHGGDSKTFKYSSSDTSASGVKGTLQLK
KYKVNPLTGKREEFAGVKFELWNKNNTIKLDEGTTDADGTLTFEQVRYGKYTLREESPAG
YIAIAPITITMGANIDITPGVDGKAYVIDNIEDVNLTNACPAFTLTVKDIDGNAIANKNV
KLIDSNGNAKYTGTTNAAGQVSDIKRPGTGGKEVQAGVYTLVDENDIPLGTVTVKYGTGE
CQDTVQPTNSCPNFKITVKNENGNPRPNVSVTLKDLSNTIIATGTTNSDGQFIIDKTTPA
GKYKLYEGTQYLGEVNVTYHNDNCQSELQLAPKCETFELTVYDVDGNLVADGTSVTVKNK
DTGNIIATKTTKDGVIELSDLEPGVYTVVVDGEEIDEFESNIDCKASVQPTPKCENFTVI
IKDNTGIIKPGNDVIIKDKSGKVISINKDKDGNLTFVSKTTPAGKYDVYDKNIYLGEIEV
SYASVPCEITLSIAPVCPAFTLTINNMFGQPRVGVKVTITGEDGIQVEDNGSTEFITDSK
GQITINNSIIKPGKYIVRENGKTIIGTVIVGNTCEAKIQPSLPVTPPTTNPGNPDPDPEK
PVDPNKPNPDPEKPVDPNKPNPDPEKPVDPNKPNPDPEKPVDPNKPNPDPEKPVDPNKPN
PDPEKPVDPNKPNPDPENPVEPNKPNTDSNNSANPGKTEGSKPSVQGVIDQGKNLPPYNP
TKATKDTLDAYKDFLNKYSQLTKEEQEAVAESLDINKIKSDAKRLEAQLKAQGKLPQTDG
ADQTALMLIGVALILGALYFLRRRNAEVK
NT seq
5490 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaattaaacatagcgataattatattgctacttgtatttcaaacagtactttca
ccaatttcagtgtttgccgacgagagtcaaccacctgtgactcctcaaaatgaatctagc
gaaaatactgtgattgattctaatggagaagtaggaaaccaaaatactacaagtgaaata
ccaagtgaagatgctgctgaagtgacaactccagaagatgaaacaaaatcagaagagcaa
acagaaggacagccagaagaacaaccagaagaacaaccagaaggacagcaagaagagcaa
ccagaagaacagcaagaagagcaaccagaagaacagcaagaaggacagcaagaaggacag
ccagaagaacaacaagaagaagagcagctagaaaaccagccacagttaataatgccatta
ggtgcgccagtaggttaccctgttgaaaatatgcaagcagatgtgacgatgtcatttagt
ggcttaaagctcttttcacaaggtggagcattaattacaaatgctacagatttagcaaat
tattcagggccaaaaccgaaaaagggtgatgtagtatatctaaactacacattctctttg
gatccaacaattgattatggaataggttctacgttcacattccaattacctgccaatatg
attgaagagtacacagcaggttcttttaatcaatcaagaacattaacagatactggtgat
tggttagcctattcgtcaagctataacagtgctacaaaaacagtaacagtcacaatagat
agtgaattagaacaagggcaatcaggtagtatgaactttgagtttatggcgaaatttgat
aattttgctgatgaaagtgaacttgaacaatcattaataatccctgtgcttggaggagca
gatgttcaactagactttgaatttgcacctacaggtagtgggcaattactaactaaaaat
gctggttctattacacgtgatgcaagtggtgaagtaacgattccatggacagtttgggtg
aatactggtgggcaaaaacttgaaagtgcaagtttgaatgatgtaccagatacaaagcat
gagctggcaggaaatattacagttgagcgatataaaataggtttgagtggatttaatcca
aacagcccaggtgctgtagacgatacaagcaatgaaacctcattccctatctcattgaca
gatggatactatgcatacaaagtaacatataacactgttgtaacagcagatccaactgca
tcaagtatgccctatacaaacgtagctactttgacagggacaaatatccctgctaacaca
acagccaatggaacacaaactgtacagtatggaccaagcttagataaaacaagaagtggc
gataaatataattcgacatggacaatcaagtataactggctaggtcaaaaaatacctgct
gataaagcgaaactaacagatacactaacaggctcgtcgccaacaactggtaagcataaa
attgattacagtagttttgaagtatatcgtgtaactttatcgaatgacggtcaaacggag
caatcttcaattctgttaagtgaaggtcaagattatagcttcgattcacaaaataattat
aattttataatcaactttgatcattcaacaaatactacaggtccagctggtgaggtgaca
tcagcgtttaaagttgtctatgatacagagctggaagatgaatttgttacagatgcaaat
acgggcacgattacaaatactgtaacaagaggagatagtggttcagacacagcaactcta
gacctggcttcaaacatctttaataaagcacgcggggcaattgactatgtaaacaaaaca
attacatggactttaaccattaatgctgagaaagatttgaaaaactttgtaatagaagat
gactttacaaccacaaataaagctggagaaacgttaaaacacactttaacaccatggaac
ggtactgacttctatgaggttactggtgcaaatggtttaacgtacacgattacagataag
ggggggagtgccccaactataggcaacgaaggttttaaaatggaattttcaagtgacatt
ccaaaagaccgcacagttactattcgatacaaaacaaagtacgatattaagccaaacgga
ggtgtagcaaccgcgtatattaatacggctgatgcaacatgggatggcgcaatagattct
cataaccaagcattagatagaactgctaattatacgccagattctacttctccaacaaac
aataatggctacaaaaaagttgtcgtagataaccagacacaagagttttcttggcgtatt
ggggttaatatcaataaacaagatataaatagtgctaccttaacagatacattaggtgcg
ggtcattatattcctgttccggatggtcaaacattaaaagatcaaattaccatatctaag
ctaaacttaacaacagaagagggaacaaaaaatggtacattagatcctgctaaatggact
gttacagaaacactaacagataacaaggttacaggttttgaaattacgtttattaaccta
gatccaattactgataacaacgaagcgtatttaattgaatacaaaacaaaagatgctgac
gatatttttggtcaaaactcaacgaatgctccaagagattacacaaatacagcgactcta
gatactccacacaatggaagctataattataatgcaacagcaaaaattagtaatcttgca
aatgagttaattaaaaaaacagcgacacctgttccagccagcgatattattaattgggca
gttacagtaaatgcttctaattcaaaattaggaaatattacattaacagacaaaccatca
agtaaccaaaaaatattaacaaatacgttcaagaaacaagagattaaactaaatgcaaat
gggacttctcaaaatataggatcccctattactgtggatgctagcgaaattgtcttaaat
caagatggtagttttagtcttaatttgggagaattaaatggcaaaggttatgttgttacg
tattccacattctttatgggggatggtaacgcgggtgaaacaatttctaatagtgcctct
attggttacgctggagcaacagctgcaggtacaagtgaccacggtggcgatagcaaaaca
tttaaatatagctcatctgatacaagtgcatcaggtgttaagggtacattgcaattaaaa
aaatataaagtaaatcctttaacaggtaaacgtgaagagtttgctggtgttaagtttgaa
ttatggaataaaaataacacaatcaaacttgatgaaggaacaacagatgcagatggcaca
ttgacatttgaacaagtgcgttacggaaagtatacgttaagagaggaatcaccagcgggc
tatattgcgattgcgccaatcacgattacaatgggagcaaatatagatattactccaggt
gtggatggtaaagcatatgttattgataacattgaggatgttaatttaacaaatgcctgt
ccagcattcacattaacagtgaaagacattgatggtaatgctattgctaataaaaatgtt
aaattaattgatagcaacggcaacgcaaaatacacgggtacaacaaatgctgcagggcaa
gtatcagatattaagcgacctggtacaggtggtaaagaagtccaagcaggcgtgtataca
ttagtggacgaaaatgacattcctttaggtactgttaccgttaaatatggtactggagaa
tgccaagatacagtccaacctacaaattcatgtcctaactttaaaattactgtaaaaaat
gagaatggaaatccacgtccaaatgtatcagttacacttaaagatctaagtaatactatt
atagctactggcacaacaaatagtgatggtcaattcatcattgataaaacaactccagca
ggaaaatataagctatatgagggtacccagtatttaggtgaagtaaatgttacgtatcac
aatgataattgccaaagtgaattacagttagcaccaaaatgtgaaacgtttgaattaact
gtctatgatgttgatggtaatttagttgcagatggtacttcagtaacggttaaaaataaa
gatacaggtaacattatagctacaaaaactacaaaagacggtgtaattgaattaagtgat
ttagagccaggtgtttacacagttgtagttgatggagaagaaattgatgagtttgaaagc
aatatcgattgtaaagcgagcgttcaaccaacaccaaaatgtgaaaacttcacagtaata
atcaaagataatactggcatcatcaagccaggtaacgatgtcattattaaagataaatct
ggaaaagtaatctcaataaataaggataaagatggaaatttaacatttgtatctaaaaca
actcctgcgggtaaatatgatgtatatgataaaaatatttacttaggtgagatagaagtt
tcttatgcgagtgttccttgtgaaattacattatcaattgcaccagtttgtccagccttt
acattgacaattaacaatatgtttggtcaaccacgtgtaggcgtaaaagtaacaataaca
ggtgaagatggtatacaggttgaagataatggttcaacagagtttataacagatagtaag
ggtcaaattacgatcaataattcaattattaagccaggtaagtatattgtaagagagaat
ggtaagacaattattggtacagttatcgtgggtaatacatgcgaggctaaaattcagcca
agtctaccagtaacacctcctacaactaatccaggaaatccagatccagacccagaaaaa
ccagtggatccgaacaaaccgaatccagatccagagaaaccagtggatccgaacaaaccg
aatccagatccagagaaaccagtggatcccaacaaaccaaatccagatccagagaaacca
gtggatccgaacaaaccaaatccagatccagaaaaaccagtggatccgaacaaaccaaat
ccagatccagaaaaaccagtggatccgaacaaaccaaatccagatccagagaatcctgta
gaaccaaacaaaccaaatacagattcaaacaattcggccaatcctggaaaaactgaggga
tctaaaccttctgttcaaggtgtcattgatcaagggaaaaacttaccgccttataatcca
actaaagctacaaaagatacactagatgcttataaggatttcttgaataaatatagtcaa
ttaactaaagaggaacaggaagctgttgcagaatcacttgatattaacaaaattaaatcg
gatgcaaaacgattagaagctcaattaaaagcacaaggtaaattacctcagacagatggt
gccgatcaaacagccctaatgctgattggagtagcacttattcttggtgcattatacttc
ttacgtcgccgcaacgctgaagttaaataa
DBGET
integrated database retrieval system