Lysinibacillus sp. YS11: LBYS11_04030
Help
Entry
LBYS11_04030 CDS
T05299
Name
(GenBank) Swarming motility protein SwrC
Organism
lys
Lysinibacillus sp. YS11
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ACR_tran
SecD_SecF_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AUS85550
LinkDB
All DBs
Position
complement(881075..884164)
Genome browser
AA seq
1029 aa
AA seq
DB search
MKGLVNFVLKNKLAVWLLTIIITVSGIYSGTRMKMESIPDISIPYLIVMGVYPGATPEQV
MNELSIPFEKSIESLEDVKAVYSTSSSNVAQVQVEYDYGIDMDEKKRQLEAALDNLKLPE
GAQEPTIMAISMNMMPVVALSVSSSKEDIVDLTSTVEEVLLPKIEKIDGVASATITGQHI
EQVSFKYDEEKMAALGLTEETVKQMIQASDMSLSLGLYQFTVGEQAVSVDGKVKSVDELK
DLLIPVTPSATNPSPFVRLGDIAKIEVEGKVQSVSRTNGQDAIAIQIVKGQDANTVTVVN
AVKDLMKDEEKRLDGLNVEISLDQGAPIEDSVFTMIEKAVFGGAIAVLIILLFLRDFKST
IISIISIPVSIFMALLLLNWMDITLNIMTLGAITVAIGRVIDDSIVVVENIYRRIHLKQE
KLTGRALIREATIEMFKPILSSTLVTVAVFAPLIFVGGMVGELFMPFALTMTFALGASLL
VAITIVPALSHFLFRKKLYGEKTESQHKEVGKLATWYKGVLEKVLNHKIITSVLAILLLV
GSLALTPLIGFSFMGSQEEKVMYLTYTPATGELADETAANVEKVEKELMKRKDVDILQVS
ITDAKNVDPSAMMMGGGAGGALMYLIFDPDMEDFPKARDEVEDYVFNIGQSGEWKSQNFT
SMSMSSNEVSYTLYSDDLDKLRDAVKQVEGALKEVDGLEDIKSDNEDPYVEHVLKVEQKN
VLQYGLTTAQIVMALNSNTSQEVLTTVKNDGKDIDVIVQRDAKAAATSLDDVLATEIKTA
LGTTMTIGELVDVEEGTTLNSLSRSKGEYFATVSGTIIGDDISKATTAADKKIDKLDLQK
GVTLGVAGVAADMQETFTKLGIAMLAAIAIVYFILVVTFGEGLAPFAILFSLPFAVIGAF
IGLFVTGQTISVSVMMGLLMLIGIVVTNAIVLVDRIIHMEHDGLAMREAILEAGATRLRP
ILMTAIATIGAMIPMALGTGGSGLISKDLAITVIGGLLSSTLLTLVVVPIVYEMLSKMLK
KNRKDIEEN
NT seq
3090 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgaaaggtttagttaatttcgtattaaagaacaaattggcagtgtggttattaacaatt
atcatcactgtctctggtatttattcgggtactaggatgaaaatggaatcgatacccgat
atttcgatcccgtatttaattgtcatgggcgtatatcctggcgcaacgcctgaacaagtc
atgaatgaactttccattccgttcgaaaaatccatagaaagtttagaagatgtgaaggct
gtttactcaacttcctcttccaacgtagcacaagttcaagtggaatacgactatggaatt
gatatggatgagaaaaaacgtcaattagaagcagctttagataatcttaaactacctgaa
ggtgctcaagagcctactattatggcaatcagcatgaacatgatgcccgtagtcgcttta
tctgtaagtagctctaaggaagatattgttgatttaacttcaacagtagaagaagtttta
ctgcctaaaatcgaaaagattgatggtgttgcatctgctaccatcacaggtcagcatatt
gaacaagtatcgtttaaatacgatgaagaaaaaatggcagcacttggtttaacagaggaa
actgttaaacaaatgattcaggcaagtgatatgtcactgtcacttggtttatatcaattt
actgtcggggaacaagccgtttcagtagatggtaaggtaaaatcagtggatgaactgaaa
gacttattaattccagttacaccttctgctacaaatccttcacctttcgttcgtctaggt
gatattgcaaaaattgaagtagaaggtaaagtgcaatctgtttcacgtacaaatggtcaa
gatgccattgctattcaaatcgtaaaaggccaagatgcgaatacggtaacagttgttaat
gcagtaaaagaccttatgaaggatgaggaaaaacgattagacggcttaaacgtagagatc
tctcttgaccaaggtgccccaattgaagattctgtatttacaatgatcgaaaaagcagtc
tttggcggcgcaattgccgtattaatcattttactattcttacgtgatttcaaatcaacg
attatttcaattatttctatcccagtttctatcttcatggcattactcctattaaactgg
atggatattactttaaacatcatgaccctcggcgcgattaccgtcgcaattggtcgtgtt
atcgatgactcaatcgtagttgtagaaaatatttaccgacgaattcacttaaaacaagaa
aaacttacaggtcgtgccctaattcgcgaagcaacaattgaaatgttcaaaccaattctt
tcttcaacattggtaacggtcgctgtattcgctcctcttattttcgtaggtggtatggta
ggcgaattattcatgccatttgcccttacaatgacatttgcattaggtgcatcgttatta
gttgcgatcacaatcgtacctgctttatctcactttttattccgtaaaaagttatacggt
gagaagactgaaagccaacataaagaagttggtaaacttgctacctggtacaaaggtgtc
ttagaaaaagtattaaatcacaaaattattacatctgtccttgcgattcttttacttgtt
ggttctcttgcattaacaccacttattggttttagttttatgggctcacaagaagaaaaa
gttatgtacttaacgtatacgcctgcaacgggagagctggctgacgaaacggcagcaaat
gttgaaaaagtagaaaaagaattaatgaaacgtaaagatgttgatattttacaagtttcc
attacagatgcgaagaatgtcgatccatcagcaatgatgatgggtggaggtgctggcggt
gccttaatgtaccttatctttgatccggatatggaagacttccctaaagctcgtgatgag
gttgaagactatgtatttaacatcgggcaatcaggagaatggaagtctcaaaacttcact
tctatgtcgatgtcatcaaacgaagtcagctatacactgtatagtgatgatttagataaa
cttcgagatgctgtgaaacaagtagagggtgctctaaaagaagtggatggcttagaagat
attaaatctgataatgaagatccatacgtagagcatgtgctaaaagttgaacaaaaaaat
gtccttcaatacgggttaacgacagctcaaatcgtgatggcattaaattcaaatacatcg
caagaagtattaactaccgtgaaaaacgatggtaaagatatcgatgtcatcgttcaacgc
gatgctaaagcagctgcgacttcacttgatgatgtcttagccactgaaattaaaacagca
ttaggtacaacaatgactatcggagaattagtagatgttgaggaaggtacaacacttaac
tcattatctcgttcaaaaggtgaatatttcgcaacagtatctggtacgattatcggtgac
gatatttcaaaagccactactgctgctgataaaaaaattgataaattagatttacaaaaa
ggtgtaacacttggtgttgctggtgttgctgcagatatgcaagaaacattcactaagctt
ggtattgcgatgttagcagccattgccattgtttacttcattctagtggtaacattcgga
gaaggtttagctccattcgctattcttttctcactaccattcgcagtaattggtgcattt
attggtttattcgttacagggcagactatttctgtatctgtcatgatgggtctattgatg
ttgattggtatcgtcgtaacaaatgccatcgtattagttgaccgtatcattcatatggaa
catgatggtcttgccatgcgtgaagcgatccttgaagcaggagcaacacgtttacgtcct
atcctgatgacagccatcgctacaattggtgctatgattccaatggcacttggtactggc
ggtagtgggttaatttccaaagacttagctattactgtaattggcggtttattatcttct
accctattaacactcgttgttgtaccaattgtttatgaaatgctatctaaaatgttaaag
aaaaaccgtaaagatattgaagaaaattaa
DBGET
integrated database retrieval system